Composante Des Acides Nucleiques Flashcards
Quel est le nom de la liaison entre les nucleotides dans l’adn
C’est une liaison phosphodiester
Difference nucleotide / nucleoside
Nucleoside = pentose + base Nucleotide = nucleoside + phoshate
Cite 5 exemples de fonction dès Nucleotides
- Composé structuraux des AN
- Composé structural des Coenzymes
- haut potentiel energetique
- second messager intra cell de signaux + mediateurs extra cell
- regulateur d’activités de proteines
Quels sont les noms des 2 cycles d’une purine
Cycle pyrimidine (6C) + Cycle imidazole (5C)
Position et nom des ramifications caractéristiques des deux purines
Adénine : -NH2 en C6
Guanine : =O en C6 + -NH2 en C2
Combien d’azote possede une pyrimidine
2 azotes
Position et nom des ramifications caractéristiques des trois pyrimidines
Cytosine: -NH2 en C4 + =O en C2
Uracile: =O en C2 ET en C4
Thymine: =O en C2 ET en C4 + CH3 en C5
Quels sont les 2 exemples de base modifiés dans l’adn/arn
Que subissent t’elles et où ça ?
L’adenine et la cytosine peuvent subir une methylation
Adénine methylation en N6
Cytosine methylation en C5
Qu’induit la methylation d’une cytosine
Signe négatif de l’expression des genes : induit une conformation qui empeche la fixation de facteur de transcription
Ou se trouve en particulier la N6-methyladenine
A quoi sert cette methylation
Elle se trouve chez les bacteries, elle permet aux enzymes de restriction de faire la différence entre leur propre ADN qui est donc methylé et un ADN étranger comme celui d’un virus
Quelles sont les deux types de dérivé retrouvées chez les pyrimidine dans les ARNt
Dérivé hydrogéné et dérivé souffré
Quelles sont les deux types de dérivé retrouvées chez les purines dans les ARNt
Localisation de leur groupe caractéristiques
Xanthine : =O en C2 et en C6
Hypoxanthine : =O en C6
Qu’est-ce que l’acide urique
L’acide urique est une xanthine avec un =O en C8 (8-oxyxanthine)
C’est le produit de dégradation des bases puriques
Il est peu soluble
Quelles pathologies associées a l’acide urique
son accumulation provoque des pathologies comme la goutte : cristallisation dans les articulations ou lithiase renale
Qu’est-ce que l’urate
= ac urique avec un H en -
=O en C8 devient — O- + H+
Cela le rend plus soluble => alcalinisation des urines
V/F: les bases azotées ont un caractère Basique du a la présence de leur groupement N(H) intracyclique
Faux : grace a leur groupement NH2 extracyclique
Quels sont les conséquences de la resonnance des cycles des bases
Molecules fortement stabilisé dans une configuration plane
+ existence de forme Tautomère
Quels sont les Tautomeres ceto et enol (nom structure + forme prépondérante a pH physio)
CETO(prépondérant) =Lactame= -NH-C=O
ENOL= Lactime= -N=C-OH
Quels sont les Tautomeres AMINE et IMINE (nstructure + forme prépondérante a pH physio)
AMINE -N=C-NH2 : prépondérante
IMINE -NH-C=NH
ABSORBANCE des bases ?
260 nm dans l’uv
L’aire d’absorption sous la courbe est plus importante pour les pyrimidine VF?
Faux plus importante pour purines
Pour quoi sont utilisés les propriétés spectrales des bases
DETECTION DOSAGE et Controle de Pureté
Quelle transformation chimique peuvent subir les bases
Que cela induit t’il
Quelles bases sont les plus touchées par ce phénomène
Lente desamination spontanée
Source de mutation
Les pyrimidine sont les plus touchés
Produit de la desamination d’une Cytosine
Uracile
L’hypoxanthine est le Produit de la desamination de quelle base ?
Adenine
La Thymine est le Produit de la desamination de quelle base ?
5-methyl cytosine
Produit de la desamination de la guanine ?
Xanthine
Que provoque l’irradiation UV des bases
Ouverture des liaison de deux bases superposées + formation d’une liaison covalente entre elle (dimere de thymine par exemple)
= PONT INTERBASE
Qu’est-ce qui provoque l’ouverture des cycles et leur rupture
Les radiations ionisantes ( rayon X ou Y)
Quels agents chimiques ont une action desaminante
Où les retrouve-t-on
On retrouve deux agents chimiques : ac nitreux et hydrogenosulfite de sodium dans les conservateurs alimentaires
Que provoque les ROS
Dommages oxidatifs
Le pentose des nucleosides est sous forme pyrane
L’ose en quetsion est un ribose
VF?
Faux le ribose est sous forme furane
Quel est le nom de la liaison entre le sucre et la base entre quoi et quoi
Il s’agit du liaison N osidique
Purine: C1’-β-N9
Pyrimidine : C1’-β-N1
Dans quelle configuration sont généralement les liaisons N osidique
L’autre conformation est possible que pour les purines ou pyrimidine ?
Généralement ANTI
Mais possible En SYN pour les purines
Qu’est-ce que la 5-adenosyl-methionine
Intermediaire du metabolisme des nucleotides= cofacteur de transfert de groupement methyl
Qu’est-ce la pseudo uridine
Presente dans les ARNt
NB: liaison C osidique
Comment s’appelle la liaison entre le phosphate et le ribose
Ou s’attche t’il
Liaison ester en 5’
Comment s’appelle la liaison entre deux phosphates
Liaison d’anhydride d’acide pyrophosphate ou ppi
= liaison riche en nrj
Ou retrouve t’on l’ADP
Elle appartient au couple ATP/ADP
Elle fait partie de 2 coenzymes redox NAD et FAD
VF? L’esterification du pentose peut concerner un autre OH que C5’
Vrai
Le groupe ester peut être engagé dans un autre type de liaison que le C3’ du nucleotide suivant : 2 exemples
Avec un autre type d’acide
Un autre hydroxyle par un 2 eme liaison ester
Que peuvent etre les dérivés de synthèse
A quoi servent t’il généralement
= analogues de bases,nucleotide, xTP
Ils sont reconnus par des enzymes et servent a inhiber leur activité
Cite deux applications des analogues
Outils analytique ou agents thérapeutiques
Quel outil analytique est utilisé pour le sequencage de l’adn
DidesoxyXTP
VF? Le 5-fluoroUracile est utilisé comme antitumoral dans les cancers digestif
Vrai
Qu’est-ce qu’une base AZA
Pour quoi sont ils utilisés
Il s’agit d’un base ou un C du cycle a été remplacé par un N
=antitumoral
VF? L’Acyclovir est un dérivé de l’adenine
Faux dervié de la guanine
VF? L’acyclovir inhibe la xanthine -oxydase
Cest un traitement contre la goutte
Faux il s’agit de l’ALLOPURINOL
Quel dérivé traite les herpès
L’acyclovir : antiviral
Comment s’appelle l’inhibiteur competitif de la reverse transcriptase du VIH
AZIDOTHYMIDINE
