Replication Flashcards
VF: la replication est conservative
Faux la réplication est semie conservative
Quel est le cofacteur de l’ADN polymerase
Mg2+
Vf: le brin d’ADN est toujours synthétisé dans le sens 5’-3’
Vrai mais brin matrice lu en 3’-5’
Vf : réplication est asymétrique
Vrai
VF: la synthese d’un brin d’adn est a la fois continue et discontinue
Vrai: il y a origine de réplication
Vers 5’ = continue
Vers 3’ = discontinue
VF: la synthese des amorces se deroule lors de l’élongation
Faux : synthes des amorces lors de l’initiation
Vf: l’adn procaryote est une double hélice d’adn circulaire
Vrai
Combien d’ORI pour la réplication procaryote
1
Combien de temps dure la réplication procaryote
20-100 min (=1000 base/s)
Cb de pb mesure la sequence ORIc des procaryotes
245 pb environ
Que contient en particulier l’ORIc des procaryotes
- 3 séquences répétées de 13pb avec séquence consensus
- 4 sites de fixation de protéines Dna A
Vf: Dna A est une proteine hexamerique
Faux : Dna A = proteine TETRAmerique
Vf: Dna A = facteur d’initiation de la transcription
Faux :Dna A =facteur d’initiation de la réplication
Qu’induit la fixation des Dna A sur les 4 sites de fixation
= complexe initial pour ouverture de la double helice
Fixation de Dna B
Quel est le role de Dna B
Activité helicase= ouvre l’oeil de replication = separation double brin en simple brin
Vf : DnaB est une proteine tetramerique
Faux :DnaB est HEXAmerique
Vf : SSB = proteine Tetramerique
Vrai
A quoi sert SSB
Maintient des brins ouvert
Vf : L’adn gyrase est une helicase: elle ouvre les brins d’adn
Faux: adn gyrase = Topoisomerase = annule le surenroulement derriere la fourche positive liée a l’ouverture par l’helicase dnaB
Que se passe t’il en fin d’initiation
DnaG se fixe sur l’helicase dnaB et forme ensemble le primosome qui synthétise les amorces d’ARN
VF: la synthese des amorces du brin continu se fait en même temps que celle du brin discontinue
Faux : on a d’abord synthese de l’amorce du brin continu puis dans un second temps synthese de l’amorce du brin discontinu
Il y a Trois types d’ADN pol chez les procaryotes, les quelles +roles
- ADN Pol I: elimine les amorces d’ARN lors de la réplication // reparation
- ADN Pol II: réparation de l’ADN
- ADN Pol III: réplication de l’ADN génomique
VF: ADN Pol I, II, III on toutes une activité polymerase 5’-3’
Vrai
Quels ADN Pol ont
- une activité exonuclease 3’-5’
- une activité exonuclease 5’-3’
-une activité exonuclease 3’-5’
ADN Pol I, II et III
- un activité exonuclease 5’-3’
Seulement ADN Pol I
VF: l’adn pol III est un holoenzyme d’une 10zaine de S-U se fixant sur l’extrémité 5’ de chaque amorces d’arn
Faux : L’adn pol III est un holoenzyme d’une 10zaine de S-U se fixant sur L’EXTRÉMITÉ 3’ de chaque amorces d’arn
De quoi est composé le replisome
Du Primosome (DnaG + Dna B) + ADN gyrase + ADN POL III
Dans l’ADN Pol III quelle SU a une activité polymerase (réplication)
La SU α a un e activité polymerase
VF: la SU β de l’ADN Pol III est responsable de la fonction d’édition (exo ncl 3’-5’) de l’enzyme
Faux : su β responsable de la processivité de l’adn pol III ( capacité a polymeriser sur une longue distance)
De quoi est responsable la SU ε de l’adn pol III
Responsable de la fonction d’édition de l’enzyme( exi nucl 3’5’)
De quoi est responsable la SU γ de l’ADN pol III
Responsable de la décharge et de la charge de la SU β
Fonctionnement de l’ADN pol III pour synthese du brin continu
- ajout d’un dNMP a l’extrémité 3’ de l’amorce
-avancement d’un cran
-verification du nt précédent
✅ ajout du dNMP suivant
❌ suppression du nt par l’activité exonuclease 3’-5´ (ε) + incorporation du bon nt
Taux d’erreur de ε (3’5’ exonuclease)
10^-2
Taux d’erreur d’incorporation de Pol III (su α)
10^-5
Donc 10^-7 avec ε
Pourquoi l’élongation est dite discontinue pour l’autre brin d’adn
Synthese 5’-3’ mais dans le sens opposé a celui de la propagation de la fourche
= formation de fragments d’adn = fragments d’okazaki
Cb de nt pour un fragment d’okazaki procaryote
1000-2000 nt
Par quoi se fait l’élimination des amorces d’arn chez les procaryotes
+ fonctionnement
Par l’ADN pol I = RNase H
* 5’3’ exo = enleve le 1er NMP de l’amorce
*5’3’ polym = ajout du nmp correspondant côté 3’ du frgmt d’okazaki
[…] répèté jusqu’au 5´ de l’autre fragment
** vérification + correction du NMP par 3´5’ exo
Par quoi se fait l’union des fragments d’okazaki
Par l’adn Ligase
Creation d’une liaison phosphodiester 3’ du dernier NMP ajouté (remplaçant l’amorce) et le 5’ de l’okazaki
Par quel mécanisme est créé la liason phosphodiester par l’adn ligase
Grace a la liaison pyrophosphate du NAD+ —> NMN+ AMP
Quel est la spécificité du site de terminaison de la réplication procaryote
Site de terminaison = TER= site de fixation de la proteine TUS
Complexe TER/TUS bloque les fourches = fin de la replication
Qu’est-ce qui sert à decatener l’adn pour le repartir entre les cellules filles
Il s’agit de la TOPOisomerase IV (classe III)
Combien de temps dure la réplication eucaryote
8h
Combié d’ORI y a t’il pour la réplication Eucaryote
5000 - 10000
200/ chromosome
Longueur des fragments d’okazaki pour eucaryotes
Env: 300
Taux d’erreur réplication eucaryote
10^-9
Concernant la pre Initiation Eucaryote
Spécificité des ORI
Régions associant des sequences nucleotidique particulieres + structure de la chromatine particulière
Vf la formation du complexe pre replicatif se deroule en phase S
Faux: formation du Complexe en Phase G1 et activation en S
Par quel complexe proteique est reconu ORI (Eucaryote)
Par ORC
Le complexe pre replicatif est formé de quoi ?
ORC : qui recrute 3 proteines dont 1 helicase
Quels sont les 5 types d’ADN polymerase Eucaryote
+ localisation
α β δ ε > nucléaire
γ> mitochondrie
VF: Toutes les ADN polymerases eucaryotes ont une activité 5’3’ exo
Faux : aucune n’a d’activité exo 5’3’
VF: Toutes les ADN polymerases eucaryotes ont une activité 5’3’ polymerase
Vrai
VF: Toutes les ADN polymerases eucaryotes ont une activité 3’ 5’ exo
Faux seulement δ ε γ
Quelles adn pol Eucaryote sont utiles pour la replication + expliquer leur role
α: associé a une primase = synthese des amorces
δ et ε: élongation
Quelle Adn pol (Eucaryote) est le moins fidele
β
Par quel mécanisme est activé le complexe pre replicatif
Par phosphorylation
Quelle spécificité ont les amorces des brins pour la réplication Eucaryote
Synthese d’amorce par l’adn pol α
Synthese d’ARN sur 10nt puis d’ADN sur 20-30nt
Quel est l’analogue de ssb chez les Eucaryotes
Prot RP-A = fixation aux regions simple brin pour eviter les reassociations
A quoi sert RF-C
Reconnaissance du complexe matrice/amorce (chargeur dechargeur)
A quoi sert PCNA
S’associe a pol δ/ε (pince coulissante)
Augmente la processivité
VF: l’élimination des amorces se fait en même temps que la synthese du brin discontinue par l’adn pol (Eucaryote)
Faux : elimination de l’amorce avant l’arrivée de l’adn pol
Par quoi se fait l’élimination des amorces (Eucaryote)
RNase H1
Mécanisme d’action de RNase H1
Enleve toutes les NMP de l’amorce sauf celui lié au 1er dnmp
Par quoi est éliminé le NMP lié au premier dNMP
Par l’exonucleade FEN1
VF : liaison des fragments d’okazaki Eucaryote par ADN ligase 3
Faux : par l’adn ligase 1
Adn ligase 3 intervenant dans les mécanismes de réparation BER pour breche courte
VF: Decatenation des chromosomes (Eucaryote) par la topoisomerase IV
Faux : ropoisomerase IV = procaryote
TOPOISOMERASE II
Qu’est-ce qu’un telomere
Courtes séquences répétitives riches En G
TTAGGG rajouté par les telomerases en 3’OH du brin matrice avant la replication
VF: la replication de l’adn mitochondrial a lieu en Phase S
Faux tout au long de l’interphase
Vf: ADN mt = taux de mutation 10x plus élevé que l’adn nucleolaire
Vrai
Si l’adn γ est tres precis par quoi sont causés les mutations dans l’adn mt ?
Par les ERO amplifiées par l’adn mt non protégé sans nucleosome
Vf : replication Mt bidirectionnelle + 1ORI
Faux unidirectionnelle et 2 ORI
Qu’est-ce que la cytopathie mitochondriale
Déficit enzymatique de la chaîne respi du aux mutations de l’adn mt
