Sistemática vegetal Flashcards
O que são plantas verdes?
Plantas verdes é um grande grupo de espécies que inclui as algas verdes e as plantas terrestres .
Quais são as características em comum das plantas verdes?
As plantas verdes têm como característica comum:
- a presença dos pigmentos fotossintetizantes clorofila a e b;
- dois flagelos anteriores em forma de chicote em algum momento do ciclo de vida;
- reserva de carboidrato (geralmente na forma de amido)
O que são embriófitas? Caracterize-as.
Embriófitas são um grupo de plantas terrestres (embora algumas viva na água). tem como grupo mais próximo as algas verdes (carófitas).
- apresentam história de vida com duas gerações: 1 esporófito diplóide e um gametófito haplóide.
- esporos de paredes espessas;
- um estágio embrionário no seu ciclo de vida;
- estruturas especializadas que protegem os gametas (arquegônio e os anterídios)
- cutícula;
- 3 grupos bem pequenos e (hepáticas, antóceros e os musgos) e as traqueófitas;
esses caracteres e caracteres de DNA, sustentam que o grupo é monofilético.
O que é sistemática? Qual seu objeto de estudo?
É a ciência da diversidade dos organismos. Envolve a descoberta, a descrição e a interpretação da diversidade biológica. ainda mais a síntese de informação sobre a diversidade, na forma de sistemas de classificação preditivos com o objetivo de reconstruir a história da separação das linhagens.
tentam reconstruir a crônica inteira dos eventos evolutivos, incluindo a separaçaõ das populações em linhages diferentes e quaisquer outras modificaçãoes evolutivas nas características dos organismos associados com estes eventos de divergência.
A sistemática também se ocupa da criação de um sistema de classificação não-ambíguo.
O que é o enfoque filogenético?
Filogenia é a história evolutiva das espécies. Enfoque filogenético faz referência à classificação dos organismos levando em consideração seus graus de parentescos com outros indivíduos.
Como são reconstruídas as filogenias?
Uma filogenia consiste em conjuntos simples de afirmações da seguinte natureza: os grupos A e B estão mais proximamente relacionados entre si do que qualquer deles o está com C.
Isso equivale a dizer que A e B compartilham um ancestral em comum mais recente do que aquele ancestral em comum com C.
As relações são representadas na forma de diagrama conhecido como árvore evolutiva (cladograma).
O que é a monofilia?
grupo monofilético é o grupo que contém um ancestral e todos os seus descendentes. Grupos monofiléticos também são denominados clados.
São reconhecidos pelos caracteres derivados compartilhados pelos seus integrantes (sinapomorfias)
Como são as atividades de sistemática vegetal?
As atividades de sistemática são divididas em três tarefas principais:
- a classificação: consiste em localizar uma entidade em um sistema (geralmente hierárquico) de inter-relações logicamente organizado.
- taxonomia: descrição e atribuição de nomes
- identificação: determinar a espécie de um indivíduo
Por que a sistemática é importante?
A sistemática estabelece um contexto histórico de compreensão para uma grande variedade de fenômenos biológicos: diversificação ecológica e especialização, relações coevolutivas entre parasitas e hospedeiros ou entre plantas e polinizadores, biogeografia, adaptação, especiação e taxas de evolução.
O que é sistemática biológica?
A sistemática biológica consiste na teoria e na prática de agrupar indivíduos em espécies, organizar tais espécies em conjuntos maiores e dar nomes a esses grupos, consequentemente gerando aquilo que é conhecido como uma classificação.
O que é caráter herdável?
qualquer aspecto da morfologia que pode ser transmitido geneticamente ao longo de um período de tempo evolutivo e que permaneça passível de reconhecimento.
Como podemos identificar duas estruturas como similares?
podemos considerar duas estruturas como similares se:
- elas se encontram em posição similar em ambos organismos;
- apresentam similaridade em nível de estrutura celular e histológica e/ou se;
-estão ligadas por meio de formas intermediárias dessas estruturas.
Estas 3 afirmações constituem os critérios de similaridade de Remane.
Qual o problema das medidas de caráter com sobreposição?
a sobreposição torna difícil a obtenção de informações confiáveis referentes a modificações gênicas subjacentes
Por qual motivo as árvores evolutivas devem ser enraizadas? Como acontece o enraizamento?
o enraizamento polariza as modificações nos caracteres, dando a elas uma direção específica. as árvores são enraizadas mediante o uso de um organismo aparentado ao grupo que está sendo estudado: um grupo-externo. quando selecionamos um grupo-externo, devemos assumir apenas que todos os integrantes do grupo-interno estejam mais intimamente relacionados entre si do que com grupo-externo. o ponto de fixação do grupo-externo é a raiz.
Como ocorriam as análises filogenéticas?
a maioria das análises filogenéticas era realizada manualmente até a décida de 1980. os caracteres são inicialmente divididos em estados de caráter, como em qualquer análise filogenética. A seguir, o estado de caráter do grupo-externo é assumido como sendo o ancestral. Em outras palavras, cada cárater é polarizado, ou direcionado. O estado de caráter derivado compartilhado, ou sinapomórfico, pode, então, ser utilizado como evidência de monofilia, e pode-se construir um cladograma baseado nos estados de caráter sinapomórficos. Esse tipo de raciocínio geralmente é útil em uma primeira formulação de hipóteses, por exemplo, para testar se grupos taxonômicos existentes são monofiléticos e, dessa maneira, nomeá-los adequadamente.
O que é homoplasia?
Homoplasia é o processo de formação de um conjunto de características morfológicas ou funcionais semelhantes em espécies que não são geneticamente próximas, como resultado de uma evolução por adaptação ao ambiente.
O que é um grupo polifilético?
Grupos polifiléticos possuem duas ou mais linhagens ancestrais nas quais estados de caracteres se desenvolvem paralelamente.
O que é navalha de Occam?
A navalha de Occam diz que não devemos desenvolver uma hipótese mais complexa do que a necessária para explicar os dados. A aplicação deste princípio de simplicidade, ou parcimônia, nos conduz a preferir a menor rede.
O que é o fenômeno chamado ‘atração dos ramos longos’?
Se existem grandes diferenças entre linhagens, de tal forma que algumas linhagens apresentam uma evolução muito mais rápida que outras, e se os caracteres possuem apenas um número limitado de estados de caracteres, então ramos muito grandes podem ser conectados a outros ramos longos em uma árvore, mesmo que não tenham uma verdadeira relação de proximidade.
problema particularmente agudo em dados de sequências de DNA.
A causa do fenômeno é que diversas modificações aleatórias, algumas das quais ocorrem em paraleo nas linagens que estão evoluindo rapidamente, superam as modificações que fornecem informações sobre a ancestralidade comum.
O que é o método da mínima distância?
é um método de reconstrução de filogenias que consistem em ao invés de escolher a árvore contendo menos modificações evolutivas, podemos converter a matriz de caráter x táxon para uma medida de similaridade ou dissimilaridade entre as plantas e então construir uma rede que minimiza a dissimilaridade.
O que é o método de máxima verossimilhança?
é um método de reconstrução de filogenias que utiliza as probabilidades de modificação de um estado de caráter em outro e então utilizar essas probabilidades para calcular a verossimilhança que um determinado diagrama ramificado vai levar a um determinado grupos de dados observados. A árvore que apresentar a mais alta verossimilhança é selecionada.
O que é o índice de consistência?
CI é um índice que avalia a homoplasia, o qual considera a quantidade mínima de modificação evolutiva possível (o número de modificações genéticas ) dividida pelo comprimento real da árvore (o número de modificações genéticas presentes na árvore)
Podem também ser calculados para caracteres individuais.
a rede ou árvore mais curta também apresentará o mais alto índice de consistência.
Quais os problemas enfrentados com o uso do CI?
Em primeiro lugar, um caráter que sofre modificação uma única vez em apenas um táxon apresentará um índice de consistência igual a 1, apesar de tal caráter não ser informativo em termos das relações existentes.
CI também é sensível ao número de taxa na análise. Muitos taxa tem CI mais baixo.
CI tem uma variação menor do que a esperada, 0 a 1.
O que é índice de retenção?
Como o RI corrige os problemas do CI?
O índice de retenção corrige o estreitamento da amplitude do CI comparando o número real de modificações no caráter com o número máximo possível de modificações.
O RI considera o comprimento máximo menos o comprimento efetivo, dividido pelo comprimento máxximo menos o comprimento mínimo:
(Lmax - Lefetivo)/(Lmax - Lmin)
Como o RI é calculado?
O RI é computado por meio do cálculo do comprimento máximo possível da árvore, que é o comprimento que ocorreria se o estado de caráter derivado se originasse independentemente em cada um dos taxa no qual ele está presente.
Quais métodos são utilizados para resumir árvores evolutivas?
Em vez de escolher uma entre as diferentes árvores, neste caso, os sistematas podem simplesmente identificar quais grupos são encontrados em todas as árvores mais curtas, ou que são formados pelo uso de todos os métodos de análise, ou que estão presentes em diferentes tipos de matrizes de caracteres. As informações em comum entre essas árvores podem ser resumidas em uma árvore de consenso.
- árvore de consenso estrito: contêm apenas grupos monofiléticos comuns a todas as árvores.
- árvore consenso de maioria: mostra todos os grupos que aparecem em 50% ou mais das árvores.
- árvore de consenso semiestrito indica todas as relações apoiadas por uma das árvores, ou por ambas, e não refutadas por qualquer uma delas.
o que é parcimônia de Wagner?
é uma análise filogenética, na qual todos os caracteres são tratados como caracteres ordenados
O que é parcimônia de Fitch?
é um método que consiste no tratamento de caracteres multiestado como não-ordenados.
O que é a lei de Dollo?
é uma lei que sugere que, no caso de caracteres muito complexos, a origem por paralelismo é bastante improvável, ao passo que a reversão pode ser relativamente fácil.
Podemos introduzir a lei de Dollo no processo de escolha de uma árvore fazendo com que o ganho de estruturas conte mais do que a perda.
Comente sobre o peso atribuído as caracteres nas análises filogenéticas
Determinados caracteres às vezes são pesados nas análises filogenéticas. Este peso reflete o pressuposto de que determinados caracteres deverão ser mais difíceis de alterar do que outros.
Tais decisões de peso relativo podem facilmente tornar-se subjetivas ou arbitrárias e corre-se o risco de que elas direcionem os resultados do estudo para a identificação de agrupamentos específicos.
Considerando-se a possibilidade de direcionamento, os sistematas geralmente tentam basear suas decisões de pesagem em critérios objetivos.
Outra abordagem consiste em basear os valores em informações relativas às bases genéticas que delineiam os caracteres.
De quais formas podemos avaliar uma árvore evolutiva?
O uso de um critéroi de otimização é uma das formas pelas quais podemos avaliar a árvore evolutiva: de todas as possíveis descrições da história, preferimos aquela que requer o menor número de passos, ou que possui a máxima verossimilhança, ou a distância mínima.
uma forma simples de avaliar o suporte para uma parte específica de uma árvore é pela análise do número de modificações genéticas que ocorrem em um ramo que leva a um determinado grupo, juntamente com os índices de consistência dos caracteres.
outra forma de avaliar é determinando se um grupo de interesse ocorre em outras árvores que sejam quase tão curtas quando a que está sendo observada.
comparar filogenias que tenham se baseado em diferentes conjuntos de caracteres.
O que é o índice de decaimento?
também conhecido como índice de bremer, e representa o número de passos extras necessários para encontrar árvores que não contenham um grupo determinado.
O que á a análise de bootstrap?
A análise de bootstrap aleatoriza os caracteres no que se refere aos taxa.
na árvore de consenso de bootstrap, um clado com valor de 95% estava presente em 95% das árvores geradas na análise de bootstrap.
O que são reconstruções igualmente parcimoniosas?
existem várias hipóteses igualmente boas para descrever a direção e o tempo de modificação do estado de caráter.
Qual a diferença entre DELTAN e ACCTRAN?
Diversos algoritmos foram desenvolvidos para designar modificações de estados de caráter a porções específicas de árvores. Dependendo do algoritmo utilizado, as modificações do estado de caráter podem ser direcionadas em prol de paralelismos (DELTRAN) ou de reversões (ACCTRAN).
Como ocorre a construção de classificações?
Uma classificação é um vocabulário comum desenvolvido para auxiliar na comunicação. Consequentemente, uma clasisficação deve ser estável, nomes que são frenquente alterados não são úteis em termos de comunicação. Além disso, uma classificação deve ser preditiva; ou seja, o nome de uma planta deve auxiliar a comrpeender melhor a planta e deve guiar na busca de literatura apropriada.
Classificaçãoes baseadas em grupos monofiléticos são mais preditivas e de maior valor heurístico do que aquelas baseadas em similaridades gerais ou em valorações subjetivas de caracteres específicos.
Considerando-se seu potencial preditivo, uma classificação filogenética pode direcionas a busca por genes, produtos biológicos, agentes de controle biológico e espécies com potencial para cultivo. A informação filogenetica é útil na tomada de decisões de conservação.
a construção envolve duas etapas: a primeira consiste na delimitação e nomeação dos grupos. Em uma classificação filogenética, esta etapa não apresenta controvérsias: grpos que recebem nomes devem ser monofiléticos. A segunda etapa envolve o ordenamento dos grupos e o posicionamento destes de acrodo com uma hierarquia. esta fase permanece problemática.
Por qual motivo nem todos os grupos são nomeados?
Qual o critério para nomear?
