Sequenciamento e árvores filogenéticas Flashcards
Quais as diferenças entre as técnicas de sequenciamento por síntese e
sequenciamento por molécula única?
O sequenciamento por síntese envolve a amplificação de fragmentos de DNA em uma
matriz, onde a sequência é determinada a medida que os nucleotídeos são incorporados.
Já o sequenciamento por molécula única permite a leitura de moléculas de DNA
individuais sem a necessidade de amplificação, o que pode resultar em uma maior
precisão e a capacidade de detectar variantes raras.
Em uma árvore filogenética, o que são os clados?
um clado é um grupo de organismos que inclui um ancestral comum e todos os
seus descendentes. Ou seja, representa uma linha evolutiva que se ramifica a partir de
um ponto específico na árvore, incluindo todas as espécies que compartilham um
ancestral comum.
O que são ramos?
os ramos da árvore filogenética representam as relações evolutivas entre os
diferentes grupos de organismos. Cada ramo conecta um nó a outro nó ou a um nó
externo (folha), indicando a divergência entre as linhagens ao longo do tempo.
O que são nodos internos e externos?
Nodos internos: os nodos internos são os pontos de ramificação na árvore que
representam ancestrais comuns hipotéticos. Cada nó interno indica um ponto em que
uma linhagem se dividiu em duas ou mais linhagens descendentes.
Nodos externos (ou folhas): os nodos externos, representam as unidades taxonômicas
operacionais (OTUs) na árvore, que geralmente são espécies ou grupos de espécies.
Esses nodos são as extremidades da árvore e não têm descendentes adicionais na árvore
filogenética.
O que é raiz?
A raiz é o nó mais alto da árvore, que representa o ancestral comum mais recente de
todas as unidades taxonômicas (nós externos) na árvore. A raiz estabelece a direção
evolutiva da árvore, indicando como as linhagens se divergem ao longo do tempo a
partir desse ancestral comum. A partir da raiz, os ramos se estendem para baixo,
mostrando as relações evolutivas entre os diferentes grupos de organismos.