Semaine 11 Flashcards
bref description de l’origine de l’enzymologie
étude des enzyme débute au 18-19e siècle par l’étude des sucs gastriques pour digestion de viande
Qui a démontré qu’un filtrat de levure est suffisant pour causer la fermentation alcoolique à la fin du 19e siècle
Eduard Buchner
Qui a proposé le mot enzyme en 1878
Wilhelm Friedrich Khune
V ou F
l’enzyme est un catalyseur bioogique et agit seulement au niveau biologique
F
c’et un catalyseur biologique mai agit sur l’aspect chimique
Quel est l’effet d,un catalyseur sur une rx chimique qui est spontanée
augmentation de rx
Un catalyseur peut il rendre spontanée (thermodynamiqueent favorable) une rx qui ne l’est pas?
NON!
Catalyseur accélère, mais ne peut psa changer l’état/résultat d’une rx.
La rapidité ne représente pas l’état spontané
Un catalyseur peut il modifier l’équilibre final d,une rx chimique?
NON!
Capable de changer la vitesse, mais pas l’équilibre
un catalyseur change t il la nature des produits de la rx
NON!
Un catalyseur est il lui meme transformé suite à la rx chimique qu’il catalyse?
Et en cours de réaction?
Suite à la réaction = non
en cours de réaction = oui/ c’est possible
c’est le même était à la fin qu’au début mais il est possible de produire des catalyseurs covalent en cours de route mais toujours retour à l’état final
V ou F
La majorité des enzymes sont des protéines
V
V ou F
Certains ARNs et ADNs ont aussi un activité catalytique (RNAzyme et DNAzyme)
V
V ou F
Une enzyme accélère grandement une rx (Kcat) par rapport à une rx non-catalyse (Knon) en diminuant l’énergie d’activation
V
V ou F
Une enzyme augment le Ea d’une réaction
F
elle diminue
Expliquez ce qu’en l’énergie d’activation (Ea)
qt d’énergie nécessaire pour former le complexe activé et atteindre l’état de transition (sommet du cheminement réactionnel illustré ci dessous)
Ea correspond à (DeltaG à la 0=) de la rx …. et rx ……
catalusée et non catalysée
V ou F
enzymes accélèrent les réactions en favorisant l’atteinte de l’état de transition
V
pour faire cela, elles doivent avoir plus d’affinité pour le sbstrat activé que le substrat non activé.
V ou F
enzymes destabilisent état de transition
F
elles stabilisent
V ou F
Taux accélération est un ratio
V
Comment obtient on le taux d’accélération?
Kcat/Knon
Que représente T1/2?
demi vie d’une rx
Dans quelle conditions fonctionnent les enzymes? Expliquez
en condition douces
Température ambiante ou raisonable
Pression atmosphérique
Milieu aqueux vs solvant organique
Quel est le procédé Haber-Bosh?
N2 + 3H2 = 2NH3
Expliquez ce qu’est le site actif des enzymes
Correspond à une faible fraction de l’enzyme dont la géométrie et les propriétés biophysiques sont complémentaires à celles du substrat ce qui permet de se lier et catalyser
Expliquez à quoi sert la région de spécificité et la région de rx (catalyse) au niveau du site actif des enzymes
région de spécificité = groupement polaire et non polaire de l’enzyme forment des interactions faibles avec le substrat (liaison hydrogènes, hydrophobe, ionique)
région de rx = groupements provenant de résidus d’acides aminés et de cofacteur/coenzymes participent à la rx chimique (proximité et orientation, catalyse acide/base, substitution nucléphile et catalyse électrophile
Quels sont les 3 résidus catalytiques compris au site actif de l’amylase
Asp197, Asp300, Glu233
Comment faisons nous pour mettre en évidence les résidus important pour la catalyse (ou liaison de substrat)
Par l’étude de mutants
V ou F
En ce qui concerne les site actifs de l’amylase, les résidus important sont habituellement perdus au cours de l’évolution
F
convervés!!
Combien de modéles de liaison du susbtrat y a t il? Nommez les
2
modèles clé-serrure de Fisher
Modèle de réarrangement induit de Koshland
Expliquez le modèles clé-serrure de Fisher
site actif est enssentiellement préformé, c’est à dire qu’il existe même en absence de substrat
Expliquez modèle de réarrangement induit de Koshland
liaison du substrat entraine un changement conformationnel de l’enzyme qui aligne correctement certains résidus importants pour la catalyse.
EX: gant s’adapte à la forme de la mains
V ou F
la spécificité enzymatique peut etre étroite
si V, donnez exemples
V
Fumarase n’hydrate que l’acide fumarique (trans) et pas l’acide maléique (cis)
enzyme reconnait et coupeut spécifiquement maltose en lien alpha mais pas en beta
V ou F
B-galactosidase hydrolyse TOUS les B-galactosides (toute molécule comportant un galactose lié à une autre molécule)
V
V ou F
spécificité large enzymatique est désavantageuse
F
utile, par exemple l’utilisation de substrat non-naturels pour suivre les rx enzymatiques en laboratoire
À quoi sert les substrats non naturels
analogue du substrat naturel utilisé our les essais enzymatiques afin de permettre le suivi de la rx
V ou F
essai enzymatique avec l’ONPG peut être réalisé IN VITRO, habituellement avec l’enzyme purifiée ou autrement avec un extrait protéique contenant la B-galactosidase
V
V ou F
L’ONPG ne pénètre pas la barrière cellulaire et ne peut donc être utilisé pour la détection de l’activité enzymatique IN VIVO à moins de lyser les cellules au préalable
V
Qui a découvert la premiè enzyme découverte et en quelle année
Payen ET Persoz
en 1833
Comment fonctionne la classification des enzymes et appelations?
noms d’enzymes sont formés généralement par l’ajout du SUFFIXE-ASE :
- au nom du composé sur lequel agit l’enzyme
- au nom de la substrance ajoutée ouenlevée
- au type de rx induite
Combien de classes sont énumérées par IUBMB, nommez les
7
-oxydoréductase
-transférase
-hydrolase
-lyase
-isomérase
-ligase
-translocase