Routage cellulaire

Question 1

Question : Quels sont les trois origines génétique possibles de synthèse des protéines ?

Answer 1

Génome mitochondrial

Génome chloroplastique

Génome nucléaire (90% des protéines)

Question 2

Question : Quels sont les deux modes de routage des protéines et leurs destinations associées ?

Answer 2

Routage post-traductionnel :
Cytosol, noyau, mitochondries, péroxysomes, chloroplastes, membrane plasmique (protéines extrinsèques de la face cytosolique uniquement).

Routage co-traductionnel :
RE, Golgi, endosomes, lysosomes, milieu extracellulaire, membrane plasmique (protéines transmembranaires et sécrétées).

Question 3

Question : Quel ribosome est utilisé selon le mode de routage des protéines ?

Answer 3

Routage post-traductionnel : Ribosomes libres.

Routage co-traductionnel : Ribosomes associés au RE.

Question 4

Question : Quelle est toujours la première étape du routage des protéines ?

Answer 4

Réponse : Le réticulum endoplasmique (RE).

Question 5

Question : Quels sont les types de signaux d’adressage ?

Answer 5

Signaux d’adressage ou de tri.

Signaux de rétention dans un compartiment.

Signaux d’ancrage pour les protéines membranaires.

Question 6

Question : Quelle est la nature des signaux d’adressage ?

Answer 6

Séquences d’acides aminés : régionales continues d’AA, clivées si en position terminale.

Régions tridimensionnelles : formées par repliement.

Modifications post-traductionnelles : exemple, mannose-6-phosphate pour les enzymes lysosomales.

Question 7

Question : Quelles sont les trois modes de transport intracellulaire ?

Answer 7

Transport à travers l’enveloppe nucléaire (TOC).

Transport transmembranaire (TTM).

Transport vésiculaire (TV).

Question 8

Nom signal transport nucléaire

Answer 8

NLS : Signal d’importation nucléaire (non clivé).

NES : Signal d’exportation nucléaire.

Question 9

Question : Quel est le rôle de Ran dans le transport nucléaire ?

Answer 9

Ran est une GTPase :
Associée à du GTP dans le noyau.

Associée à du GDP dans le cytosol.

Question 10

Question : Quelles sont les translocases impliquées dans le transport mitochondrial ?

Answer 10

TOM : Membrane externe, reconnaît le signal en N-ter ou interne.

TIM : Membrane interne, tri selon le signal (matrice, espace intermembranaire, membrane interne).

Question 11

Question : Quels sont les composants du système endomembranaire ?

Answer 11

Réponse : RE (lisse et granuleux), Golgi, endosomes, lysosomes, membrane plasmique, vésicules de sécrétion.

Question 12

Question : Quelle est la différence entre RE lisse (REL) et RE granulaire (REG) ?

Answer 12

REL : Synthèse des lipides, détoxification, stockage de calcium.

REG : Synthèse des protéines (sécrétées, membranaires, résidentes des compartiments endomembranaires).

Question 13

Question : Quelles sont les étapes du mécanisme d’importation vers le REG ?

Answer 13

Reconnaissance du peptide signal (N-ter) par la particule SRP.
= stop traduction

Liaison au récepteur SRP (GTPase).
= sous-unité alpha

Hydrolyse du GTP, ouverture du translocon.

Translocation et reprise de la traduction.

Question 14

Question : Quels types de signaux sont impliqués dans le REG ?

Devenir des protéine selon leur signal ?

Answer 14

Peptide signal clivable : pour protéines solubles ou membranaires de type I.

Signal interne non clivable : pour protéines membranaires de type II, III et IV.

Question 15

1. Question : Quand une séquence signal est-elle clivable ?

Answer 15

Réponse : Elle est clivable uniquement si elle est située à l’extrémité de la protéine.

Question 16

2. Question : Quel est le signal d’adressage des enzymes pour les lysosomes ?

Answer 16

Réponse : Les groupements de mannose-6-phosphate (M6P).

Question 17

4. Question : Quels sont les types de transport effectués selon la taille des protéines par le complexe du pore nucléaire ?

Answer 17

Réponse : Transport actif pour les molécules >40 kDa et diffusion pour les molécules <20 kDa.

Question 18

5. Question : Quelle est la taille maximale d’ouverture du complexe du pore nucléaire ?

Answer 18

Réponse : Jusqu’à 40 nm de diamètre, avec une ouverture de base de 9 nm.

Question 19

6. Question : Combien de bras radiaires possède le complexe du pore nucléaire ?

Answer 19

Réponse : 16 bras radiaires (8 nucléaires et 8 cytoplasmiques).

Question 20

7. Question : Quel est le rôle des karyophérines dans le transport nucléaire ?

Answer 20

Réponse : Elles agissent comme adaptateurs pour le transport nucléaire.

Question 21

8. Question : Quel facteur directionnel est impliqué dans le transport nucléaire ?

Answer 21

Réponse : Ran, une GTPase.

Question 22

10. Question : Comment le complexe RNP est-il formé ?

Answer 22

Réponse : Par l’association des ARN à des protéines pour leur transport.

Question 23

12. Question : Quelle est la destination d’une protéine mitochondriale avec un signal N-terminal ?

Answer 23

Réponse : La matrice mitochondriale.

Question 24

15. Question : Quel est l’ordre général de la voie de sécrétion ?

Answer 24

Réponse : REG → Appareil de Golgi → Vésicules → Exocytose.

Question 25

De combien et de quoi est composé le complexe du pore nucléaire ?

Answer 25

C’est un complexe avec plus de 50 protéines appelées nucléoporines, d’une masse molaire de 120 000 kDa.

Question 26

Question : Quelle est la structure du complexe du pore nucléaire ?

Answer 26

Anneau cytoplasmique (8 filaments côté cytosol). Anneau nucléaire (8 filaments côté nucléoplasme). Réseau central formé de 8 colonnes protéiques. Symétrie d’ordre 8.

Question 27

Question : Mécanisme de l’importation nucléaire ?

Answer 27

La protéine cible porte un signal NLS. L’importine α reconnaît le signal et forme un complexe avec l’importine β. Le complexe traverse le pore nucléaire. La GTPase Ran déstabilise le complexe pour libérer la protéine dans le noyau.

Question 28

Question : De quoi est composé le complexe d’importation nucléaire ?

Answer 28

Protéine cible avec signal NLS. Importine α (adaptateur). Importine β (récepteur).

Question 29

Question : Quelle est la composition du complexe d’exportation nucléaire ?

Answer 29

Protéine cible avec signal NES. Exportine. Ran-GTP.

Question 30

Question : Comment se déroule la translocation post-traductionnelle vers les mitochondries ?

Answer 30

Protéine dépliée (structure primaire). Utilisation de complexes TOM et TIM. TOM reconnaît le signal en N-ter ou interne. TIM détermine la destination selon le signal d’adressage.

Question 31

Question : Quelles sont les destinations des protéines mitochondriales selon le signal d’adressage ?

Answer 31

Signal interne : membrane interne ou espace intermembranaire. Signal en N-ter : matrice mitochondriale.

Question 32

Question : Comment les protéines solubles sont-elles adressées au REG ?

Answer 32

Signal en N-ter reconnu par SRP. Liaison au translocon. Clivage du peptide signal après translocation.

Question 33

Question : Quelle est la différence entre un peptide signal et un signal d’ancrage ?

Answer 33

Peptide signal : Clivable, permet l’entrée dans le REG. Signal d’ancrage : Non clivable, insère la protéine dans la membrane.

Question 34

Question : Quelles sont les caractéristiques des protéines membranaires de type I dans le REG ?

Answer 34

Possèdent un peptide signal clivable. Signal d’arrêt de transfert non clivable. Reste enchâssées dans la membrane

Question 35

Q : Quels sont les lieux de translocation pour les protéines selon leur routage ?

Answer 35

Routage co-traductionnel : vers le Réticulum Endoplasmique Granulaire (REG). Routage post-traductionnel : vers les mitochondries, péroxysomes ou chloroplastes

Question 36

Q : Que reconnaît la particule de reconnaissance du signal (SRP) ?

Answer 36

R : SRP reconnaît des signaux internes, comme des séquences signal ou des signaux de transfert.

Question 37

Q : Qu'est-ce qu'un signal d'arrêt de transfert ?

Answer 37

R : Une séquence d'acides aminés hydrophobes non clivée qui ancre une protéine dans la membrane.

Question 38

Q : Sur quel acide aminé se fait la N-glycosylation ?

Answer 38

R : Sur l'Asparagine dans la séquence Asn-X-Ser/Thr.

Question 39

Q : Quelle enzyme catalyse la N-glycosylation ?

Answer 39

R : L’oligosaccharide transférase.

Question 40

Q : Quels sont les rôles de BiP, Calnexine, Calréticuline et PDI ?

Answer 40

BiP : repliement ATP-dépendant. Calnexine/Calréticuline : repliement Ca-dépendant. PDI : création de ponts disulfures.

Question 41

Q : Que se passe-t-il si une protéine est mal repliée ou glycosylée ?

Answer 41

R : Elle retourne dans un cycle de maturation ou est dégradée par le protéasome.

Question 42

Q : Quels sont les rôles de l'appareil de Golgi ?

Answer 42

R : Maturation des protéines (O-glycosylation, modifications de la N-glycosylation) Tri et export des protéines. Synthèse de sphingolipides

Question 43

Q : Où se produisent la N-glycosylation et l’O-glycosylation ?

Answer 43

N-glycosylation : dans le REG. O-glycosylation : dans l'appareil de Golgi

Question 44

Q : À quoi sert l'enzyme EndoH ?

Answer 44

R : Elle enlève certains sucres lors de la modification de la N-glycosylation.

Question 45

Q : Que signifie TGN et quel est son rôle ?

Answer 45

R : Trans-Golgi Network Point de tri des protéines pour les lysosomes, les vésicules de sécrétion ou la membrane.

Question 46

Q : Quelles sont les voies de sortie du Golgi ?

Answer 46

R : Vers les lysosomes, la sécrétion constitutive, et la sécrétion régulée.

Question 47

Q : Quels types de vésicules sont impliqués dans la sécrétion constitutive ?

Answer 47

R : Des vésicules recouvertes de cavéoline ou de coatomères.

Question 48

Q : Que devient le contenu des vésicules constitutives ?

Answer 48

R : Il est sécrété dans la matrice extracellulaire ou intégré dans la membrane plasmique.

Question 49

Q : Quels types de vésicules sont impliqués dans la sécrétion régulée ?

Answer 49

R : Des vésicules recouvertes de clathrine.

Question 50

Q : Que devient le contenu des vésicules de sécrétion régulée ?

Answer 50

R : Il est libéré sous l'effet d’un signal spécifique, souvent dépendant du calcium. = exocytose

Question 51

Q : Que montrent les expériences de Palade ?

Answer 51

R : Le trajet des protéines dans les cellules exocrines du pancréas : REG → Golgi → vésicules → exocytose.