Retrovirus Flashcards
Nämn två genus där retrovirus ingår.
- Deltaretrovirus
- Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) - Lentivirus
- Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)
Nämn olika lager som ingår i HIV-1 partikel.
- Outer lipid membrane
- Matrix
- Kapsid
Vad ingår i Outer lipid membran HIV-1 partikel?
Cell lipid membrane + Viral glycoproteins (gp120 & gp41 i HIV-1)
Vad gör matrix i HIV-1 partikel?
Encloses a capsid containing retrovirus RNA
Vad finns i inuiti kapsif i HIV-1 partikel?
2 viral RNA copies + virus proteins
Beskriv HIV-1 genom.
- (ss)(+)RNA
- Ca 10 kb (1 copy)
- Diploid: 2 RNA copies/virion
- High mutation rate
Vilka gener ingår i retrovirus?
Alla retroviruses har
- Gag
- Pol och
- Env
Vad ingår i Gag gener?
- Matrix
- Kapsid
- Nukleokapsid
Vad ingår i Pol gener?
- Protease
- Reverse Transkriptas
- Integrase
Vad ingår i Env gener?
- Yt envelope protein (gp120 i HIV)
2. Transmembrane envelope protein (gp41 i HIV)
Nämn 8 steg i Retrovirus (HIV-1)
livscykel.
- Infection
- Uncoating
- Reverse transcription
- Integration
- Transcription/Splicing/Export/Translation
- Assembly
- Budding
- Maturation
Vad händer under infektions stadiet?
- Viruset kommer till cell som har CD4 receptor
- Mha sina yt- transmembranproteiner får kontakt med CD4 + ko-receptorer
- Transmembranproteiner konformationsändring (klubba->paprika) och lossnar från virus.
- Ytreceptorer konformations ändring -> membran fusion.
Vad heter yt- och transmembranproteiner hos HIV-1 virus?
Gp120 (SU)
Gp41 (TM)
Vad heter ko-receptorer som krävs för HIV-1 virus bindning till CD4?
CCR5
CXCR4
Antiretroviral drugs inhibiting HIV-1 infection:
Hur fungerar bindning inhibitor?
Maraviroc
- Binder CCR5 ko-receptor på makrofager
- Förhindrar interaktion med HIV-1 gp120 protein (SU)
Antiretroviral drugs inhibiting HIV-1 infection:
Hur fungerar fusion inhibitor?
Enfuvirtide
- Binder till HIV-1 på makrofager
- Förhindrar interaktion till gp41 protein (TM).
Vad gör Reverse transcription?
Syntes av DNA från RNA mha enzymet reverse transcriptase (RT).
U byts ut mot T
Beskriv (i korthet) förlopp mellan (+)ssRNA -> (+)ssDNA
(+)ssRNA –(RT*)–> (-)ssDNA –(RT**)–> (+)ssDNA
- RNA-directed DNA polymerization
- DNA-directed DNA polymerization
Hur fungerar Reverse Transcriptase (RT) inhibitors?
- NRTIs – Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors
- Block RT by competing with the natural nucleotides for incorporation into newly forming HIV DNA
(Metafor: fel flaska i pantmaskin -> maskinen stannar)
Efter RT, hur sker integration av HIV-1 virus?
- Enzymet Integrase
- Kärnimport
Kopplar till cellens genom
Integrase inhibitor används inom terapi
Vilka område i genomen integreras HIV-viruset?
- Actively transcribed genes
2. Regions with high G/C content
Hur sker Provirus transcription?
- Både ändar av provirus har LTR
- 5’ LTR activates
- 3’ LTR terminates HIV-1 provirus gene transcription
Hur sker Provirus mRNA splicing?
Vissa HIV-1 hela (Gag-Pol) medan andra splicas (Env, Vif, Rev mfl)
Alternativ splicing: många olika proteiner skapas
Vilka proteiner translateras från retrovirus RNA?
gag, pol, env ger upphov till
- Gag-Pol polyproteiner med protease
- Gag proteiner (lånad av Gag-pol protease)
Dessa proteiner klyvs till mindre proteiner
Hur sker assembly och budding?
Gag & Gag-Pol polyprotein ratio = 20:1
- Ribosomer skapar gag och gag-pol proteiner.
- Vesikel ytansport till membranet
- Budding struktur
- Avknoppning (med RNA och proteiner inuti)
Hur sker mognad efter budding?
- Sker utanför celler
- Proteaser klyver Gag och Gag-Pol polyproteiner
- Nu är virus infektiös
Vilken typ av LM är riktad mot mognad fasen?
Proteasinhibitorer
LM namn slutar på navir
(saquinavir mm)
Vad är HAART?
Highly active anti-retroviral therapy
Standardbehandlingen mot retrovirus
1. 2 NRTIs + 1 proteasinhibitor eller 2. 2 NRTIs + 1 NNRTI eller 3. 2 NRTIs + en integrasinhibitor
Vad innebär HIV-1 tropism?
Viruset infekterar celler med en CD4 receptor (makrofager, T- och myeloida celler)
HIV-virusets tropism förändras under infektionen
Vad är
M-tropism?
- CD4 har CCR5 som co-receptor
- Finns på makrofager.
Vad är T-tropism?
- CD4 har CXCR4 som co-receptor
- Finns på T-celler
Hur förändras HIV virus m-tropism til t-tropism? Beskriv olika steg.
Mutationer i env-genen förändrar tropismen
- Makrofager infekteras
- Mutationer sker
- Virusets receptor får affinitet för T-cellernas receptor
- Nya partiklar infektera T-cellerna istället
- T-celler död = slutstadiet av infektionen
Hur sker naturlig resistans mot HIV-1 infection?
Deletion in CCR5 gen
Vilka steg ingår i HIV-1 patogenes?
1) Acute Phase
2) Asymptomatic Phase
3) Symptomatic Phase
Beskriv aktufas inom HIV-1 patogenes.
Beroende på celler med CD4 receptor.
- HIV 1 -> makrofager i mukösa slemhinnor
- Virusinfekterade celler sprids i vävnaden (till lymfkörtlar osv)
- Immunförsvaret angriper infekterade celler
- I vissa celler kommer viruset utveckla latens och inte går att upptäcka
Hur länge är akutfas kvar?
VIlken tropism finns här?
1-2 mån
M-tropism.
Beskriv asymtomatisk fas inom HIV-1 patogenes.
- Switch sker från M-tropisk till T-tropisk
- Viruset replikerar sig långsamt och muterar
- Makrofagerna bygger upp reservoarer med massor av virus
Hur länge är asymtomatisk fas kvar?
6 mån – 15 år
Beskriv symtomatisk fas inom HIV-1 patogenes.
- Viruset aktiveras av någon anledning (tex annan infektion)
- Virus börjar sprida sig till andra celler
- AIDs = när T-celler börjar dö
- > risken för opportunistiska infektioner ökar
Hur länge är symtomatisk fas kvar?
6 mån – 5 år
Vad är Human T-cell leukemia viruses?
- Deltaretroviruses
- Finns 4 men endast HTLV-1 är pathogent
- Infekterar mest CD4+ T-celler
- Taz och hbz proteiner uttrycks
Hur sker Transition from HTLV-1-infected cell to transformed leukemic cell?
- Tax = ändrar cellsignallering vägar (NF-kB, AKT, etc) & cellcykel kontroll mekanismer.
- Hbz = inducerar genomisk instabilitet.
