Retrovirus Flashcards

1
Q

Nämn två genus där retrovirus ingår.

A
  1. Deltaretrovirus
    - Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1)
  2. Lentivirus
    - Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Nämn olika lager som ingår i HIV-1 partikel.

A
  1. Outer lipid membrane
  2. Matrix
  3. Kapsid
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad ingår i Outer lipid membran HIV-1 partikel?

A

Cell lipid membrane + Viral glycoproteins (gp120 & gp41 i HIV-1)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad gör matrix i HIV-1 partikel?

A

Encloses a capsid containing retrovirus RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad finns i inuiti kapsif i HIV-1 partikel?

A

2 viral RNA copies + virus proteins

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Beskriv HIV-1 genom.

A
  1. (ss)(+)RNA
  2. Ca 10 kb (1 copy)
  3. Diploid: 2 RNA copies/virion
  4. High mutation rate
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilka gener ingår i retrovirus?

A

Alla retroviruses har

  1. Gag
  2. Pol och
  3. Env
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad ingår i Gag gener?

A
  1. Matrix
  2. Kapsid
  3. Nukleokapsid
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad ingår i Pol gener?

A
  1. Protease
  2. Reverse Transkriptas
  3. Integrase
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad ingår i Env gener?

A
  1. Yt envelope protein (gp120 i HIV)

2. Transmembrane envelope protein (gp41 i HIV)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Nämn 8 steg i Retrovirus (HIV-1)

livscykel.

A
  1. Infection
  2. Uncoating
  3. Reverse transcription
  4. Integration
  5. Transcription/Splicing/Export/Translation
  6. Assembly
  7. Budding
  8. Maturation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad händer under infektions stadiet?

A
  1. Viruset kommer till cell som har CD4 receptor
  2. Mha sina yt- transmembranproteiner får kontakt med CD4 + ko-receptorer
  3. Transmembranproteiner konformationsändring (klubba->paprika) och lossnar från virus.
  4. Ytreceptorer konformations ändring -> membran fusion.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad heter yt- och transmembranproteiner hos HIV-1 virus?

A

Gp120 (SU)

Gp41 (TM)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad heter ko-receptorer som krävs för HIV-1 virus bindning till CD4?

A

CCR5

CXCR4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Antiretroviral drugs inhibiting HIV-1 infection:

Hur fungerar bindning inhibitor?

A

Maraviroc

  • Binder CCR5 ko-receptor på makrofager
  • Förhindrar interaktion med HIV-1 gp120 protein (SU)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Antiretroviral drugs inhibiting HIV-1 infection:

Hur fungerar fusion inhibitor?

A

Enfuvirtide

  • Binder till HIV-1 på makrofager
  • Förhindrar interaktion till gp41 protein (TM).
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad gör Reverse transcription?

A

Syntes av DNA från RNA mha enzymet reverse transcriptase (RT).

U byts ut mot T

18
Q

Beskriv (i korthet) förlopp mellan (+)ssRNA -> (+)ssDNA

A

(+)ssRNA –(RT*)–> (-)ssDNA –(RT**)–> (+)ssDNA

  • RNA-directed DNA polymerization
    • DNA-directed DNA polymerization
19
Q

Hur fungerar Reverse Transcriptase (RT) inhibitors?

A
  1. NRTIs – Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors
  2. Block RT by competing with the natural nucleotides for incorporation into newly forming HIV DNA

(Metafor: fel flaska i pantmaskin -> maskinen stannar)

20
Q

Efter RT, hur sker integration av HIV-1 virus?

A
  • Enzymet Integrase
  • Kärnimport
    Kopplar till cellens genom

Integrase inhibitor används inom terapi

21
Q

Vilka område i genomen integreras HIV-viruset?

A
  1. Actively transcribed genes

2. Regions with high G/C content

22
Q

Hur sker Provirus transcription?

A
  • Både ändar av provirus har LTR
  • 5’ LTR activates
  • 3’ LTR terminates HIV-1 provirus gene transcription
23
Q

Hur sker Provirus mRNA splicing?

A

Vissa HIV-1 hela (Gag-Pol) medan andra splicas (Env, Vif, Rev mfl)

Alternativ splicing: många olika proteiner skapas

24
Q

Vilka proteiner translateras från retrovirus RNA?

A

gag, pol, env ger upphov till

  1. Gag-Pol polyproteiner med protease
  2. Gag proteiner (lånad av Gag-pol protease)

Dessa proteiner klyvs till mindre proteiner

25
Q

Hur sker assembly och budding?

A

Gag & Gag-Pol polyprotein ratio = 20:1

  • Ribosomer skapar gag och gag-pol proteiner.
  • Vesikel ytansport till membranet
  • Budding struktur
  • Avknoppning (med RNA och proteiner inuti)
26
Q

Hur sker mognad efter budding?

A
  • Sker utanför celler
  • Proteaser klyver Gag och Gag-Pol polyproteiner
  • Nu är virus infektiös
27
Q

Vilken typ av LM är riktad mot mognad fasen?

A

Proteasinhibitorer
LM namn slutar på navir
(saquinavir mm)

28
Q

Vad är HAART?

A

Highly active anti-retroviral therapy

Standardbehandlingen mot retrovirus

1. 2 NRTIs + 1 proteasinhibitor
eller
2. 2 NRTIs + 1 NNRTI 
eller 
3. 2 NRTIs + en integrasinhibitor
29
Q

Vad innebär HIV-1 tropism?

A

Viruset infekterar celler med en CD4 receptor (makrofager, T- och myeloida celler)

HIV-virusets tropism förändras under infektionen

30
Q

Vad är

M-tropism?

A
  • CD4 har CCR5 som co-receptor

- Finns på makrofager.

31
Q

Vad är T-tropism?

A
  • CD4 har CXCR4 som co-receptor

- Finns på T-celler

32
Q

Hur förändras HIV virus m-tropism til t-tropism? Beskriv olika steg.

A

Mutationer i env-genen förändrar tropismen

  1. Makrofager infekteras
  2. Mutationer sker
  3. Virusets receptor får affinitet för T-cellernas receptor
  4. Nya partiklar infektera T-cellerna istället
  5. T-celler död = slutstadiet av infektionen
33
Q

Hur sker naturlig resistans mot HIV-1 infection?

A

Deletion in CCR5 gen

34
Q

Vilka steg ingår i HIV-1 patogenes?

A

1) Acute Phase
2) Asymptomatic Phase
3) Symptomatic Phase

35
Q

Beskriv aktufas inom HIV-1 patogenes.

A

Beroende på celler med CD4 receptor.

  1. HIV 1 -> makrofager i mukösa slemhinnor
  2. Virusinfekterade celler sprids i vävnaden (till lymfkörtlar osv)
  3. Immunförsvaret angriper infekterade celler
  4. I vissa celler kommer viruset utveckla latens och inte går att upptäcka
36
Q

Hur länge är akutfas kvar?

VIlken tropism finns här?

A

1-2 mån

M-tropism.

37
Q

Beskriv asymtomatisk fas inom HIV-1 patogenes.

A
  1. Switch sker från M-tropisk till T-tropisk
  2. Viruset replikerar sig långsamt och muterar
  3. Makrofagerna bygger upp reservoarer med massor av virus
38
Q

Hur länge är asymtomatisk fas kvar?

A

6 mån – 15 år

39
Q

Beskriv symtomatisk fas inom HIV-1 patogenes.

A
  1. Viruset aktiveras av någon anledning (tex annan infektion)
  2. Virus börjar sprida sig till andra celler
  3. AIDs = när T-celler börjar dö
    - > risken för opportunistiska infektioner ökar
40
Q

Hur länge är symtomatisk fas kvar?

A

6 mån – 5 år

41
Q

Vad är Human T-cell leukemia viruses?

A
  • Deltaretroviruses
  • Finns 4 men endast HTLV-1 är pathogent
  • Infekterar mest CD4+ T-celler
  • Taz och hbz proteiner uttrycks
42
Q

Hur sker Transition from HTLV-1-infected cell to transformed leukemic cell?

A
  1. Tax = ändrar cellsignallering vägar (NF-kB, AKT, etc) & cellcykel kontroll mekanismer.
  2. Hbz = inducerar genomisk instabilitet.