Retrovirus Flashcards
Nämn två genus där retrovirus ingår.
- Deltaretrovirus
- Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) - Lentivirus
- Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)
Nämn olika lager som ingår i HIV-1 partikel.
- Outer lipid membrane
- Matrix
- Kapsid
Vad ingår i Outer lipid membran HIV-1 partikel?
Cell lipid membrane + Viral glycoproteins (gp120 & gp41 i HIV-1)
Vad gör matrix i HIV-1 partikel?
Encloses a capsid containing retrovirus RNA
Vad finns i inuiti kapsif i HIV-1 partikel?
2 viral RNA copies + virus proteins
Beskriv HIV-1 genom.
- (ss)(+)RNA
- Ca 10 kb (1 copy)
- Diploid: 2 RNA copies/virion
- High mutation rate
Vilka gener ingår i retrovirus?
Alla retroviruses har
- Gag
- Pol och
- Env
Vad ingår i Gag gener?
- Matrix
- Kapsid
- Nukleokapsid
Vad ingår i Pol gener?
- Protease
- Reverse Transkriptas
- Integrase
Vad ingår i Env gener?
- Yt envelope protein (gp120 i HIV)
2. Transmembrane envelope protein (gp41 i HIV)
Nämn 8 steg i Retrovirus (HIV-1)
livscykel.
- Infection
- Uncoating
- Reverse transcription
- Integration
- Transcription/Splicing/Export/Translation
- Assembly
- Budding
- Maturation
Vad händer under infektions stadiet?
- Viruset kommer till cell som har CD4 receptor
- Mha sina yt- transmembranproteiner får kontakt med CD4 + ko-receptorer
- Transmembranproteiner konformationsändring (klubba->paprika) och lossnar från virus.
- Ytreceptorer konformations ändring -> membran fusion.
Vad heter yt- och transmembranproteiner hos HIV-1 virus?
Gp120 (SU)
Gp41 (TM)
Vad heter ko-receptorer som krävs för HIV-1 virus bindning till CD4?
CCR5
CXCR4
Antiretroviral drugs inhibiting HIV-1 infection:
Hur fungerar bindning inhibitor?
Maraviroc
- Binder CCR5 ko-receptor på makrofager
- Förhindrar interaktion med HIV-1 gp120 protein (SU)
Antiretroviral drugs inhibiting HIV-1 infection:
Hur fungerar fusion inhibitor?
Enfuvirtide
- Binder till HIV-1 på makrofager
- Förhindrar interaktion till gp41 protein (TM).
Vad gör Reverse transcription?
Syntes av DNA från RNA mha enzymet reverse transcriptase (RT).
U byts ut mot T
Beskriv (i korthet) förlopp mellan (+)ssRNA -> (+)ssDNA
(+)ssRNA –(RT*)–> (-)ssDNA –(RT**)–> (+)ssDNA
- RNA-directed DNA polymerization
- DNA-directed DNA polymerization
Hur fungerar Reverse Transcriptase (RT) inhibitors?
- NRTIs – Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors
- Block RT by competing with the natural nucleotides for incorporation into newly forming HIV DNA
(Metafor: fel flaska i pantmaskin -> maskinen stannar)
Efter RT, hur sker integration av HIV-1 virus?
- Enzymet Integrase
- Kärnimport
Kopplar till cellens genom
Integrase inhibitor används inom terapi
Vilka område i genomen integreras HIV-viruset?
- Actively transcribed genes
2. Regions with high G/C content
Hur sker Provirus transcription?
- Både ändar av provirus har LTR
- 5’ LTR activates
- 3’ LTR terminates HIV-1 provirus gene transcription
Hur sker Provirus mRNA splicing?
Vissa HIV-1 hela (Gag-Pol) medan andra splicas (Env, Vif, Rev mfl)
Alternativ splicing: många olika proteiner skapas
Vilka proteiner translateras från retrovirus RNA?
gag, pol, env ger upphov till
- Gag-Pol polyproteiner med protease
- Gag proteiner (lånad av Gag-pol protease)
Dessa proteiner klyvs till mindre proteiner