Replikace DNA + Transkripce Flashcards

1
Q

Chem. vazba mezi fosfáty v nukleotidu

A

= Anhydridová vazba

- v nuklotidu fosfáty až 3 za sebou - nukleosid monofosfát/difosfát/trifosfát

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Chem. vazba mezi fosfátem a cukrem

A

= fosfoesterová vazba

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Chem. vazba mezi nukleosidem a bází

A

= N-glykosidická vazba

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Purinové báze

A

= Adenin, guanin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Pyrimidinové báze

A

= Thymin, Uracil, Cytosin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Konec 5’ řetězce

A

= zpravidla fosfát

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Konec 3’ řetězce

A

= zpravidla -OH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Konformace DNA

A
  • nejčastější pravotočivá B (10 párů na závit)
  • Konformace A: levotočivá, 11 párů na závit, částečně denaturovaná, RNA-RNA
  • Konformace Z: levotočivá, 12 párů na závit, závislá na zvýšeném čísle GC párů
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Topoizomeráza

A
  • rozmotává nadobrátky při otevření DNA helikázou
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Kde se může opakovaně zahájit replikace na stejném počátku během jednoho buněčného cyklu?

A
  • u POLYTENNÍCH CHROMOZOMŮ

- např. v buňkách slinných žláz hmyzu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Přilehlé regulační oblasti genu u bakterií

A

= promotor a terminátor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

DNA dependentní RNA polymeráza

A
  • slouží k syntéze RNA
  • bakterie: 1
  • eukaryota: 3
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Sigma faktor

A
  • jen u prokaryota
  • polypeptid (součást RNA polymerázy), který rozpoznává signální sekvenci promotoru a váže tam RNA-polymerázu -> pak vypuštěn
  • první sepsaný nukleotid = +1 -> sigma sekvence = -10 a -35
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

DNA dependentní RNA polymeráza u eukaryota

A
  • jsou 3
  • RNA polymeráza I. - produkt rRNA, v jadérku
  • RNA polymeráza II. - produkt mRNA, snRNA, v kayroplazmě
  • RNA polymeráza III. - produkt 5S rRNA, tRNA, v karyoplazmě
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Prekurzory RNA v eukaryota

A
  • jsou upravovány než opustí jádro
  • Pre-mRNA (=hnRNA) - capping, splicing, polyadenylace, případně editing
  • Pre-rRNA (45S pre-tRNA) - štěpení na 28S; 18S; 5,8S rRNA a modifikace
  • Pre-tRNA - štěpení a modifikace, syntéza CCA (=3 báze, vždy tam jsou posttranskripčně připojeny) terminální nukleotidtransferázou
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Úprava hnRNA (pre-mRNA)

A
  • polyadenylace 3’ konce
  • methylguanosinová čepička na 5’ konci + methylace prvních dvou nukleosidů na C2
  • čepička je ochrana před rozdvojením RNAázou
  • uvnitř sekvence sestřihem vystřižením INTRONŮ
  • methylace uvnitř sekvence RNA
  • > úpravy hnRNA jsou KOTRANSKRIPČNÍ
17
Q

RNA polymeráza II.

A
  • má CTD (= C-terminální doména), na konci jedné podjednotky má pol. sekvenci AMK, která je tvořena HEPTAMERY (opakují se)
    = platforma na KOTRANSKRIPČNÍ MODIFIKACE
18
Q

Terminace RNA polymerázy II.

A
  • zatímco promotor poznáváme na úrovni DNA sekvence, místo terminace je rozpoznané až na úrovni nascendentně syntetizované RNA - RNA je přerušená a na 3’ konec je dosyntetizován polyA konec
19
Q

Co katalyzuje syntézu polyA sekvence

A

= Nukleotidyltransferáza

- substrátem je ATP