réparation de l'ADN Flashcards
quelles sont les sources de dommages à l’ADN
- Erreurs de réplication
- Radiations ionisantes
- Radicaux libres
- Réactifs génotoxiques
combien y a-t-il de bris par jour dans une cellule humaine
10^4 à 10^6 bris
quels sont les conséquences de l’accumulation de dommages dans l’ADN
- mort cellulaire (apoptose ou nécrose)
- sénescence
- formation de tumeurs
en quelles catégories peuvent être réparties les sources de dommage à l’ADN
- dommages endogène: causés par le métabolisme de la cellule et par des erreurs de réplication
- dommages exogènes: sources environnementales variées
Donner un exemple de bris causé par le métabolisme cellulaire
la dépurination spontanée causée par la chaleur dégagée par le métabolisme peut causer 10 000 pertes de nucléotides par jour
Nommer les types de dommages possible à l’ADN
- modification de bases
- perte de bases
- Lésions volumineuses
- Hydrolyse des bases
- Modification chimique par radicaux d’O2
- Hydrolyse du lien phosphodiester
quel est la différence entre une mutation et un dommage à l’ADN
Les dommages à l’ADN sont des anormalités physiques dans l’ADN tandis que les mutations sont des changements stables dans la séqeunce de deux brins d’ADN
bottomline: mutations ne sont pas réparables, les dommages le sont
Quelles sont les conséquences particulière de mutation dans des cellules germinales
Conséquences génétiques : les mutations sont transmises à la déscendance si la cellule est destinée à devenir un gamète ( ne s’appliquent pas aux 3 cellules sur 4 qui meurent pour produire une ovule)
Quelles sont les conséquences particulières de mutation dans les cellules somatiques
- empêcher le fonctionnement de la cellule s’il y a changement dans les protéines
- transformer la cellule saine en cellule cancéreuse
- accélérer le vieillissement
Combien de nucléotides échappent au systèmes de réparation sur l’ensemble des nucléotides qui sont endommagés
1 sur 2000
quel dommages sont réparés par le Direct repair mechanism
les guanine méthylé
Quels dommages sont réparés par le ‘‘Base excision repair mechanism’’
les bases hydrolysées ou déaminées
Quel dommages sont réparés par le Nucleotide excision repair mechanism
les lésions volumineuses
‘‘DNA protein adducts’’
Quel dommages sont réparés par le ‘‘mismatch repair mechanism’’
les bases mésaparriées
Quels dommages sont réparés par le ‘‘non-homologous end joining mechanism’’
les cassures doubles brin
Quels dommages sont réparés par le ‘‘homologous recombination mechanism’’
Les cassures doubles brin
Quels dommages sont réparés par le ‘‘single strand annealing mechanism’’
Les cassures doubles brin
Quel mécanisme de réparation peut être mis en plase lors de la réplication
La coupure de la base erronée oar l’activité exonucléase 3’ vers 5’ de certaines ADNpol
comment la cellule peut elle faire un renversement direct des dommages
- la méthyl guanine methyl transferase (MGMT/kamikaze protein)
- photolyase (réaction de photoréactivation)
Comment la methyl guanine methyl transferase (MGMT) fait elle pour réparer une base guanine alkylée et pourquoi n’est ce pas un mécanisme efficace
La MGMT retire le groupement méthyl de l’ADN en le prenant sur elle même. ce n’est pas un mécanisme efficace puisque la protéine ne peut accomplir cette fonction qu’une seule fois
Les humains peuvent ils réparer des dimères de C-C ou T-T
Non, cette enzyme n’Existe plus chez l’humain
nommer trois système de réparation des bases endommagées
BER (base excision repaire)
MMR (mismatch repair)
NER (nucleotide excision repair)
Comment les mécanismes de Base Excision Repair préviennent elles l’apparition de mutation dans l’ADN
Elles retirent une base erronées qui seraient répliqué incorrectement à la prochaine synthèse, (ex: un C aligné avec un A)
quelle est l’enzyme qui excise les bases incorrectes
Glycosylase
VF le MMR opère avant la réplication
f
comment fonctionne MMR
MSH2 et MSH? forment un dimère qui s’installe sur le mésappariement . (MutL) est ensuite recruté puis le brin fille est coupé par la nucléase de MutL. une hélicase et endonucléase viennent ensuite réparer la coupure
Comment MMR reconnait le brin mère du brin fille chez les procaryotes
Le brin mère est méthylé
Comment MMR reconnait le brin mère du brin fille chez les eucaryote
Le brin fille présente des ‘‘nicks’’ dans l’ADN qui sont absents du brin mère
qu’est ce qui peut causer des cassures double brin
Composé chimique
Radicaux libres
Problème pendant la réplication
Inhibition de la topo2 au mauvais moment
comment la réparation par recombinaison homologue peut-elle faire perdre de l’hétérozygotie
Si le brin donneur provient du chromosome homologue au lieu de la chomatide soeur, le nouveau fragment pourrait être mésapparié puis être réparé par MMR ou BER. si le mauvais nucléotide est excisé, il pourrait y avoir perte de la séquence qu’il y avait initialement sur le chromosome
Comprendre la jonction de Holliday
Voir diapo 48 du powerpoint 4. Les 2 chromosomes se mettent un à coté de l’autre et un bras de croise. la coupure peut se faire verticalement ou horizontalement
dans quelle phase opère les protéines de recombinaison non-homologue et pourquoi
durant la phase G1 puisqu’il n’y a pas de chromatides soeur durant la G1.
Durant quelles phases fonctionnent les mécanismes HR et NHEJ
Les phases S et G2
Comment fonctionne le le mécanisme NHEJ (non-homologous end-joining)
La protéine Ku se lie aux extrémités libre de l’ADN, la kinase DNA-PK recruté par Ku rapproche les brins cassés puis une ligase répare les brins
quel est le risque associé au mécanisme NHEJ (non homologous end-joining)
Perte de séquence pour la recombinaison de bouts cohésifs et combinaison entre les mauvais bouts si il y a plus d’une cassure
Quand est-ce que la cellule peut tolérer un dommage à l’ADN
Si une fourche de réplication rencontre une base modifiée ou manquante, aucun mécanisme ne fonctionne pour faire la réparation (BER nécessite une double hélice et MMR/NER ont besoin d’un brin matrice)
La cellule tolère le dommage jusqu’à la fin de la réplication au risque d’introduire des erreurs
quelles sont les voies de tolérance au dommage à l’ADN
TLS (synthèse de trans-lésions) : Des polymérases spécialisées polymérisent au travers du dommage
PRR: (réparation après réplication) Utilisation de la chromatide soeur pour réparer le dommage par d’autres mécanismes
la détection de dommage à l’ADN entraine une chaine d’événements de signalisation. Quel sont les 3 résultats de cette signalisation
- Retarder le cycle cellulaire
- Activer l’expression de la machinerie de réparation et recruter celle-co au site de dommage
- Déclencer l’apoptose si le dommage persiste
comment la cellule peut-elle utiliser les histones pour signaliser des dommages à l’ADN?
La phosphorylation de H2AX-Ser139 par des senseurs de dommages PI3-K indiquent la présence de domage à l’ADN
