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Biomol > régulation de la transcription > Flashcards

régulation de la transcription Flashcards

1
Q

nombre de nucléotides déroulés lors de la transcription

A

17 nt

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Q

Combien de molécules composent l’ARN pol d’un virus

A

1 molécule

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Q

Combien de molécules composent l’ARN pol d’un procaryote

A

1 molécule à 5 sous unités

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4
Q

Combien de molécules composent l’ARN pol d’un eucaryote

A

3 molécules à plus de 12 sous unités

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5
Q

Quelles sont les caractéristiques de transcription de l’ARNpol du virus t7

A

synthétise 200 nt/s et peut ajouter des bases modifiées en 5’

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6
Q

comment nomme-t-on la position du premier nucléotide transcrit sur une séquence génomique

A

La position +1

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7
Q

quelles sont les 5 sous unités de l’ARN pol procryote

A

alpha, beta, beta’ omega et sigma

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8
Q

Quelle sous unité de l’ARN pol procaryote ne fais pas parti de l’holoenzyme et donnez sa fonction

A

Sigma reconnait les séquences promotrices

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9
Q

quelle est la vitesse de transcription des ARNpol procaryote

A

20 à 80 nt/s

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10
Q

quelle est la fonction de la sous unité alpha dans l’ARNpol procaryote

A

intéragit avec des régulateurs

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11
Q

quelle est la fonction de la sous unité beta et beta prime dans l’ARNpol procaryote

A

l’élongation du brin d’ARN

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12
Q

quelle est la fonction de la sous unité oméga dans l’ARNpol procaryote

A

Stabilise l’holoenzyme

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13
Q

quels nucléotides sont majoritairement trouvés dans les régions ou la bulle de transcription s’ouvre et pourquoi

A

A et T puisqu’ils ont seulement 2 ponts hydrogènes à briser

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14
Q

quel nom est donné à la zone ou la bulle de réplication apparait

A

Boite de Pribnow

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15
Q

V/F la sous unité sigma reconnait plusieurs séquence et plusieurs boite de pribnow pour permettre à la polymérase de transcrire tout les gènes.

A

F il y a plusieurs sous unités sigma

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16
Q

comprendre l’opéron Lac

A

Le CAP protein se lie avec cAMP lorsque le glucose est faible ce qui permet à la polymérase de s’accrocher au promoteur si celui ci n’est pas bloqué.
Le promoteur de la lactase peut aussi être bloqué par une protéine répréssive qui est traduite lorsque le glucose est élevé.

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17
Q

3 Concepts importants de l’opéron lac

A

Les gènes sont régulés par d’autres gènes, les bactéries réagissent à leur métabolites et des protéines peuvent se lier à l’ADN pour réguler son expression

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18
Q

qu’est ce qu’une pause transcriptionnelle

A

une pause prise par l’ARNpol suite à certaines séquences

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19
Q

quelle est l’utilité de la pause transcriptionnelle

A

laisse le temps à l’ARN synthétisé de prendre une conformation spécifique comme la tige-boucle

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20
Q

comment fonctionne la terminaison de la trancription Rho indépendante

A

il y a formation dans l’ARN synthétisé d’une tige-boucle riche en GC suivi de plusieurs uracile répétées. Cela déstabilise l’ARNpol et le complexe se désasemble

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21
Q

Comment fonctionne la terminaison de la transcription Rho dépendante

A

l’hélicase Rho s’installe sur l’ARN transcrit puis déroule le simple brin d’ARN en direction de la polymérase. Lorsque la polymérase prend des pauses transcriptionnelles, l’hélicase se rapproche de celle-ci et finit par la rattraper et la décrocher.

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22
Q

combien y a-t-il de polymérases chez les eucaryotes et laquelle synthétise les ARNm

A

il y a 3 polymérase et la pol 2 produit des ARNm

23
Q

quelle est la vitesse de transcription des ARNpol eucaryotes

A

10-20 nt/s

24
Q

sur quelle ARNpol se trouve le domaine clapet et à quoi sert celui-ci

A

sur l’ARNpol eucaryote, il se referme sur l’ADN pour coincer celui-ci dans la polymérase

25
Q

qu’est ce que la processivité

A

La capacité de la polymérase à rester accrochée à l’ADN

26
Q

une polymérase seule peut elle amorcer une transcription?

A

non, elle a besoin de facteurs de transcriptions

27
Q

quel élément reconnait le facteur de transcription TFIIB

A

BRE (TFIIB response element)

28
Q

Quel(s) facteur(s) reconnaissent la boite tata

A

TBP, composante de TFIID

29
Q

quel facteur reconnait l’élément Inr (initiateur)

A

TFIID

30
Q

quel(s) facteur(s) reconnaissent les îlots CpG

A

SP1 et probablement beaucoup d’autres

31
Q

que signifie le nom de la protéine TBP

A

TATA Box binding Protein

32
Q

Quelle est la position de la TATA box par rapport à la séquence génomique

A

-25 à -30

33
Q

V/F la tata binding protein est sur tous les gènes, même ceux qui n’ont pas la boite tata dans leur séquence

A

V

34
Q

quelle est la taille des ilots CpG

A

entre 500 et 2000bp

35
Q

V/F les ilots CpG peuvent initier dans les 2 sens

A

V

36
Q

À quoi sert les méthylation des cytosines sur les ilots CpG

A

à silencer les gènes et les transposons

37
Q

pourquoi y a-t-il moins de doublet CpG dans le génome

A

La déamination spontanée d’une cytosine méthylée donne une thymine. ce dommage est très difficile à réparer pour la cellule

38
Q

comment expliquer que le syndrôme d’angelman et le syndrome de Prader willi (qui ont des conséquences très différentes) soient causé par la même mutation

A

La mutation est causée par la méthylation d’un gène dans le chromosome maternel ou paternel. selon le chromosome, un différent syndrome est obtenu

39
Q

V/F les amplificateurs/répresseurs peuvent agir sur plusieurs gènes si ceux ci ne sont pas séparés par des isolateurs ou des CTCF

A

F ils agissent sur 1 seul gène

40
Q

VF un amplificateur ou répresseur peut être en aval ou en amont du gène qui y est relié

A

V

41
Q

VF les activateurs ou represseurs doivent être à proximité du gène sur lequel ils agissent.

A

F

42
Q

à quoi servent les complexes de remodelage de la chromatine

A

modifier mécaniquement la structure de la chromatine

43
Q

Les complexes de remodelage de la chromatine servent seulement à exposer des éléments d’ADN masqués, par ex: un TATA box caché par un nucléosome

A

non, ils peuvent remodeler l’ADN pour augmenter l’accès à celui-ci ou réduire l’accès

44
Q

donner la route que prend une hormone liposoluble pour avoir un effet sur l’expression des gènes dans la cellule

A

il traverse la membrane cellulaire puis interragit avec un récepteur/activateur

45
Q

Donner la route que prend une hormone hydrosoluble pour avoir un effet sur l’expression des gènes dans la cellule

A

L’hormone se fixe à un recepteur transmembranaire, ce qui déclenche une cascade de signalisation intracellulaire qui finit éventuellement par rencontrer un activateur

46
Q

donner des exemples de cascade de signalisation causé par des récepteurs hydrosolubles

A

Voie des MAP-kinase
Cascade de phosphorylation
une des cibles est l’activateur Myc

47
Q

Décrire l’intéraction entre Myc, Max et Mad

A

Myc se dimérise avec Max lorsque Myc est abondant dans la cellule. Si myc n’est pas assez abondant, max se dimérise avec mad. Myc-max active la transcription alors de Mad-max la réprime

48
Q

comment Myc peut-elle être conservé assez longtemps dans la cellule pour activer des gènes.

A

La phosphorylation par ERK augmente la stabilité de myc. il y a donc plus de myc dans la cellule, ce qui permet à myc de former le dimère myc-mac

49
Q

quelle est la composition de la coiffe 5’ de l’ARNm

A

7-methyguanosine en lien 5’-5’ triphosphate

50
Q

Quelle est la fonction de la coiffe 5’ de l’ARNm

A

protéger l’ARNm de la dégradation et permettre la traduction de celui-ci

51
Q

comment les introns sont épissés de l’ARNpm

A

Formation d’un lassau dans l’intron pour rapprocher l’extrémité 3’ du premier exon à l’extrémité 5’ du deuxième exon. les exons sont ensuite connectés puis le lasso est détruit

52
Q

quelle est la fonction de la queue poly-a en 3’ des ARNm

A

Protéger l’extrémité 3’ de l’ARNm et permettre la traduction

53
Q

quelles molécules défont la tension qui s’accumule dans l’ADN lors de la transcription

A

la topoisomérase 1 et 2. la topo 1 faire une cassure simple brin alors que la topo 2 fait une cassure double brin

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