régulation de la transcription Flashcards
nombre de nucléotides déroulés lors de la transcription
17 nt
Combien de molécules composent l’ARN pol d’un virus
1 molécule
Combien de molécules composent l’ARN pol d’un procaryote
1 molécule à 5 sous unités
Combien de molécules composent l’ARN pol d’un eucaryote
3 molécules à plus de 12 sous unités
Quelles sont les caractéristiques de transcription de l’ARNpol du virus t7
synthétise 200 nt/s et peut ajouter des bases modifiées en 5’
comment nomme-t-on la position du premier nucléotide transcrit sur une séquence génomique
La position +1
quelles sont les 5 sous unités de l’ARN pol procryote
alpha, beta, beta’ omega et sigma
Quelle sous unité de l’ARN pol procaryote ne fais pas parti de l’holoenzyme et donnez sa fonction
Sigma reconnait les séquences promotrices
quelle est la vitesse de transcription des ARNpol procaryote
20 à 80 nt/s
quelle est la fonction de la sous unité alpha dans l’ARNpol procaryote
intéragit avec des régulateurs
quelle est la fonction de la sous unité beta et beta prime dans l’ARNpol procaryote
l’élongation du brin d’ARN
quelle est la fonction de la sous unité oméga dans l’ARNpol procaryote
Stabilise l’holoenzyme
quels nucléotides sont majoritairement trouvés dans les régions ou la bulle de transcription s’ouvre et pourquoi
A et T puisqu’ils ont seulement 2 ponts hydrogènes à briser
quel nom est donné à la zone ou la bulle de réplication apparait
Boite de Pribnow
V/F la sous unité sigma reconnait plusieurs séquence et plusieurs boite de pribnow pour permettre à la polymérase de transcrire tout les gènes.
F il y a plusieurs sous unités sigma
comprendre l’opéron Lac
Le CAP protein se lie avec cAMP lorsque le glucose est faible ce qui permet à la polymérase de s’accrocher au promoteur si celui ci n’est pas bloqué.
Le promoteur de la lactase peut aussi être bloqué par une protéine répréssive qui est traduite lorsque le glucose est élevé.
3 Concepts importants de l’opéron lac
Les gènes sont régulés par d’autres gènes, les bactéries réagissent à leur métabolites et des protéines peuvent se lier à l’ADN pour réguler son expression
qu’est ce qu’une pause transcriptionnelle
une pause prise par l’ARNpol suite à certaines séquences
quelle est l’utilité de la pause transcriptionnelle
laisse le temps à l’ARN synthétisé de prendre une conformation spécifique comme la tige-boucle
comment fonctionne la terminaison de la trancription Rho indépendante
il y a formation dans l’ARN synthétisé d’une tige-boucle riche en GC suivi de plusieurs uracile répétées. Cela déstabilise l’ARNpol et le complexe se désasemble
Comment fonctionne la terminaison de la transcription Rho dépendante
l’hélicase Rho s’installe sur l’ARN transcrit puis déroule le simple brin d’ARN en direction de la polymérase. Lorsque la polymérase prend des pauses transcriptionnelles, l’hélicase se rapproche de celle-ci et finit par la rattraper et la décrocher.
combien y a-t-il de polymérases chez les eucaryotes et laquelle synthétise les ARNm
il y a 3 polymérase et la pol 2 produit des ARNm
quelle est la vitesse de transcription des ARNpol eucaryotes
10-20 nt/s
sur quelle ARNpol se trouve le domaine clapet et à quoi sert celui-ci
sur l’ARNpol eucaryote, il se referme sur l’ADN pour coincer celui-ci dans la polymérase
qu’est ce que la processivité
La capacité de la polymérase à rester accrochée à l’ADN
une polymérase seule peut elle amorcer une transcription?
non, elle a besoin de facteurs de transcriptions
quel élément reconnait le facteur de transcription TFIIB
BRE (TFIIB response element)
Quel(s) facteur(s) reconnaissent la boite tata
TBP, composante de TFIID
quel facteur reconnait l’élément Inr (initiateur)
TFIID
quel(s) facteur(s) reconnaissent les îlots CpG
SP1 et probablement beaucoup d’autres
que signifie le nom de la protéine TBP
TATA Box binding Protein
Quelle est la position de la TATA box par rapport à la séquence génomique
-25 à -30
V/F la tata binding protein est sur tous les gènes, même ceux qui n’ont pas la boite tata dans leur séquence
V
quelle est la taille des ilots CpG
entre 500 et 2000bp
V/F les ilots CpG peuvent initier dans les 2 sens
V
À quoi sert les méthylation des cytosines sur les ilots CpG
à silencer les gènes et les transposons
pourquoi y a-t-il moins de doublet CpG dans le génome
La déamination spontanée d’une cytosine méthylée donne une thymine. ce dommage est très difficile à réparer pour la cellule
comment expliquer que le syndrôme d’angelman et le syndrome de Prader willi (qui ont des conséquences très différentes) soient causé par la même mutation
La mutation est causée par la méthylation d’un gène dans le chromosome maternel ou paternel. selon le chromosome, un différent syndrome est obtenu
V/F les amplificateurs/répresseurs peuvent agir sur plusieurs gènes si ceux ci ne sont pas séparés par des isolateurs ou des CTCF
F ils agissent sur 1 seul gène
VF un amplificateur ou répresseur peut être en aval ou en amont du gène qui y est relié
V
VF les activateurs ou represseurs doivent être à proximité du gène sur lequel ils agissent.
F
à quoi servent les complexes de remodelage de la chromatine
modifier mécaniquement la structure de la chromatine
Les complexes de remodelage de la chromatine servent seulement à exposer des éléments d’ADN masqués, par ex: un TATA box caché par un nucléosome
non, ils peuvent remodeler l’ADN pour augmenter l’accès à celui-ci ou réduire l’accès
donner la route que prend une hormone liposoluble pour avoir un effet sur l’expression des gènes dans la cellule
il traverse la membrane cellulaire puis interragit avec un récepteur/activateur
Donner la route que prend une hormone hydrosoluble pour avoir un effet sur l’expression des gènes dans la cellule
L’hormone se fixe à un recepteur transmembranaire, ce qui déclenche une cascade de signalisation intracellulaire qui finit éventuellement par rencontrer un activateur
donner des exemples de cascade de signalisation causé par des récepteurs hydrosolubles
Voie des MAP-kinase
Cascade de phosphorylation
une des cibles est l’activateur Myc
Décrire l’intéraction entre Myc, Max et Mad
Myc se dimérise avec Max lorsque Myc est abondant dans la cellule. Si myc n’est pas assez abondant, max se dimérise avec mad. Myc-max active la transcription alors de Mad-max la réprime
comment Myc peut-elle être conservé assez longtemps dans la cellule pour activer des gènes.
La phosphorylation par ERK augmente la stabilité de myc. il y a donc plus de myc dans la cellule, ce qui permet à myc de former le dimère myc-mac
quelle est la composition de la coiffe 5’ de l’ARNm
7-methyguanosine en lien 5’-5’ triphosphate
Quelle est la fonction de la coiffe 5’ de l’ARNm
protéger l’ARNm de la dégradation et permettre la traduction de celui-ci
comment les introns sont épissés de l’ARNpm
Formation d’un lassau dans l’intron pour rapprocher l’extrémité 3’ du premier exon à l’extrémité 5’ du deuxième exon. les exons sont ensuite connectés puis le lasso est détruit
quelle est la fonction de la queue poly-a en 3’ des ARNm
Protéger l’extrémité 3’ de l’ARNm et permettre la traduction
quelles molécules défont la tension qui s’accumule dans l’ADN lors de la transcription
la topoisomérase 1 et 2. la topo 1 faire une cassure simple brin alors que la topo 2 fait une cassure double brin
