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Biomol > régulation de la transcription > Flashcards

régulation de la transcription Flashcards

1
Q

nombre de nucléotides déroulés lors de la transcription

A

17 nt

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Q

Combien de molécules composent l’ARN pol d’un virus

A

1 molécule

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Q

Combien de molécules composent l’ARN pol d’un procaryote

A

1 molécule à 5 sous unités

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4
Q

Combien de molécules composent l’ARN pol d’un eucaryote

A

3 molécules à plus de 12 sous unités

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5
Q

Quelles sont les caractéristiques de transcription de l’ARNpol du virus t7

A

synthétise 200 nt/s et peut ajouter des bases modifiées en 5’

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6
Q

comment nomme-t-on la position du premier nucléotide transcrit sur une séquence génomique

A

La position +1

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7
Q

quelles sont les 5 sous unités de l’ARN pol procryote

A

alpha, beta, beta’ omega et sigma

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8
Q

Quelle sous unité de l’ARN pol procaryote ne fais pas parti de l’holoenzyme et donnez sa fonction

A

Sigma reconnait les séquences promotrices

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9
Q

quelle est la vitesse de transcription des ARNpol procaryote

A

20 à 80 nt/s

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10
Q

quelle est la fonction de la sous unité alpha dans l’ARNpol procaryote

A

intéragit avec des régulateurs

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11
Q

quelle est la fonction de la sous unité beta et beta prime dans l’ARNpol procaryote

A

l’élongation du brin d’ARN

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12
Q

quelle est la fonction de la sous unité oméga dans l’ARNpol procaryote

A

Stabilise l’holoenzyme

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13
Q

quels nucléotides sont majoritairement trouvés dans les régions ou la bulle de transcription s’ouvre et pourquoi

A

A et T puisqu’ils ont seulement 2 ponts hydrogènes à briser

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14
Q

quel nom est donné à la zone ou la bulle de réplication apparait

A

Boite de Pribnow

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15
Q

V/F la sous unité sigma reconnait plusieurs séquence et plusieurs boite de pribnow pour permettre à la polymérase de transcrire tout les gènes.

A

F il y a plusieurs sous unités sigma

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16
Q

comprendre l’opéron Lac

A

Le CAP protein se lie avec cAMP lorsque le glucose est faible ce qui permet à la polymérase de s’accrocher au promoteur si celui ci n’est pas bloqué.
Le promoteur de la lactase peut aussi être bloqué par une protéine répréssive qui est traduite lorsque le glucose est élevé.

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17
Q

3 Concepts importants de l’opéron lac

A

Les gènes sont régulés par d’autres gènes, les bactéries réagissent à leur métabolites et des protéines peuvent se lier à l’ADN pour réguler son expression

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18
Q

qu’est ce qu’une pause transcriptionnelle

A

une pause prise par l’ARNpol suite à certaines séquences

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19
Q

quelle est l’utilité de la pause transcriptionnelle

A

laisse le temps à l’ARN synthétisé de prendre une conformation spécifique comme la tige-boucle

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20
Q

comment fonctionne la terminaison de la trancription Rho indépendante

A

il y a formation dans l’ARN synthétisé d’une tige-boucle riche en GC suivi de plusieurs uracile répétées. Cela déstabilise l’ARNpol et le complexe se désasemble

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21
Q

Comment fonctionne la terminaison de la transcription Rho dépendante

A

l’hélicase Rho s’installe sur l’ARN transcrit puis déroule le simple brin d’ARN en direction de la polymérase. Lorsque la polymérase prend des pauses transcriptionnelles, l’hélicase se rapproche de celle-ci et finit par la rattraper et la décrocher.

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22
Q

combien y a-t-il de polymérases chez les eucaryotes et laquelle synthétise les ARNm

A

il y a 3 polymérase et la pol 2 produit des ARNm

23
Q

quelle est la vitesse de transcription des ARNpol eucaryotes

A

10-20 nt/s

24
Q

sur quelle ARNpol se trouve le domaine clapet et à quoi sert celui-ci

A

sur l’ARNpol eucaryote, il se referme sur l’ADN pour coincer celui-ci dans la polymérase

25
qu'est ce que la processivité
La capacité de la polymérase à rester accrochée à l'ADN
26
une polymérase seule peut elle amorcer une transcription?
non, elle a besoin de facteurs de transcriptions
27
quel élément reconnait le facteur de transcription TFIIB
BRE (TFIIB response element)
28
Quel(s) facteur(s) reconnaissent la boite tata
TBP, composante de TFIID
29
quel facteur reconnait l'élément Inr (initiateur)
TFIID
30
quel(s) facteur(s) reconnaissent les îlots CpG
SP1 et probablement beaucoup d'autres
31
que signifie le nom de la protéine TBP
TATA Box binding Protein
32
Quelle est la position de la TATA box par rapport à la séquence génomique
-25 à -30
33
V/F la tata binding protein est sur tous les gènes, même ceux qui n'ont pas la boite tata dans leur séquence
V
34
quelle est la taille des ilots CpG
entre 500 et 2000bp
35
V/F les ilots CpG peuvent initier dans les 2 sens
V
36
À quoi sert les méthylation des cytosines sur les ilots CpG
à silencer les gènes et les transposons
37
pourquoi y a-t-il moins de doublet CpG dans le génome
La déamination spontanée d'une cytosine méthylée donne une thymine. ce dommage est très difficile à réparer pour la cellule
38
comment expliquer que le syndrôme d'angelman et le syndrome de Prader willi (qui ont des conséquences très différentes) soient causé par la même mutation
La mutation est causée par la méthylation d'un gène dans le chromosome maternel ou paternel. selon le chromosome, un différent syndrome est obtenu
39
V/F les amplificateurs/répresseurs peuvent agir sur plusieurs gènes si ceux ci ne sont pas séparés par des isolateurs ou des CTCF
F ils agissent sur 1 seul gène
40
VF un amplificateur ou répresseur peut être en aval ou en amont du gène qui y est relié
V
41
VF les activateurs ou represseurs doivent être à proximité du gène sur lequel ils agissent.
F
42
à quoi servent les complexes de remodelage de la chromatine
modifier mécaniquement la structure de la chromatine
43
Les complexes de remodelage de la chromatine servent seulement à exposer des éléments d'ADN masqués, par ex: un TATA box caché par un nucléosome
non, ils peuvent remodeler l'ADN pour augmenter l'accès à celui-ci ou réduire l'accès
44
donner la route que prend une hormone liposoluble pour avoir un effet sur l'expression des gènes dans la cellule
il traverse la membrane cellulaire puis interragit avec un récepteur/activateur
45
Donner la route que prend une hormone hydrosoluble pour avoir un effet sur l'expression des gènes dans la cellule
L'hormone se fixe à un recepteur transmembranaire, ce qui déclenche une cascade de signalisation intracellulaire qui finit éventuellement par rencontrer un activateur
46
donner des exemples de cascade de signalisation causé par des récepteurs hydrosolubles
Voie des MAP-kinase Cascade de phosphorylation une des cibles est l'activateur Myc
47
Décrire l'intéraction entre Myc, Max et Mad
Myc se dimérise avec Max lorsque Myc est abondant dans la cellule. Si myc n'est pas assez abondant, max se dimérise avec mad. Myc-max active la transcription alors de Mad-max la réprime
48
comment Myc peut-elle être conservé assez longtemps dans la cellule pour activer des gènes.
La phosphorylation par ERK augmente la stabilité de myc. il y a donc plus de myc dans la cellule, ce qui permet à myc de former le dimère myc-mac
49
quelle est la composition de la coiffe 5' de l'ARNm
7-methyguanosine en lien 5'-5' triphosphate
50
Quelle est la fonction de la coiffe 5' de l'ARNm
protéger l'ARNm de la dégradation et permettre la traduction de celui-ci
51
comment les introns sont épissés de l'ARNpm
Formation d'un lassau dans l'intron pour rapprocher l'extrémité 3' du premier exon à l'extrémité 5' du deuxième exon. les exons sont ensuite connectés puis le lasso est détruit
52
quelle est la fonction de la queue poly-a en 3' des ARNm
Protéger l'extrémité 3' de l'ARNm et permettre la traduction
53
quelles molécules défont la tension qui s'accumule dans l'ADN lors de la transcription
la topoisomérase 1 et 2. la topo 1 faire une cassure simple brin alors que la topo 2 fait une cassure double brin

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