Reparación del DNA Flashcards
Tendencia del DNA a presentar mutaciones
Inestabilidad del DNA
Error de DNA delta y epsilon
1 en 100,000 a 1 en 10,000,000
La mutación es indispensable para:
La evolución
Tipos de daño al DNA (2)
Endógenos
Exógenos
Se detienen al encontrar alguna lesión en el DNA durante la replicación
DNA Pol d y e
Intervienen en lesión y hacen que DNA Pol d y e continúen:
Polimerasas de síntesis a través de lesión (TLS)
Las polimerasas de TLS realizan:
Síntesis del DNA en región dañada
Polimerasas TLS (7)
- Pol n
- Pol i
- Pol k
- REV1
- Pol z
- Pol v
- Pol 0
Existe cierto grado de especifidad entre:
Tipo de lesión y polimerasa TLS encargada de replicarlo
Si el daño persiste, entonces sucede:
Apoptosis (muerte celular programada)
Error replicativo (4)
- Tipo de error
- Proteínas involucradas
- Arreglo
- Endógeno
- DNA polimerasas incorporan nucleótido erróneo = mutaciones random
- Topoisomerasa = mal alinemiento de hebras
- Tirosil DNA fosfodiesterasa y endonucleasas lo arreglan
Desaminación espontánea de base (6)
- Tipo de error
- Factores involucrados
- Endógeno
- Pérdida de amino exocíclico
- Citosina → Uracilo
- Adenina → Hipoxantina
- Guanina → Xantina
- 5-metil citosina → Timina
Pérdida de bases (3)
- Tipo de error
- Factores involucrados
- Endógeno
- Hidrolización o DNA glicosilasa
- Se rompe enlace N-glucosídico
Daño oxidativo (9)
- Factores involucrados
- Tipo de daño
- Endógeno
- Especies reactivas de oxígeno (radicales libres)
a. O2- (superóxido)
b. H2O2 (peróxido de hidrógeno)
c. OH (radical hidroxilo) - Generan dobles enlaces
- Fragmentan purinas y pirimidinas
- Rotura de una sola hebra de DNA
- Forman 8-oxoguanina
Metilación del DNA
- Tipo de error
- Factores involucrados
- Endógeno
- Grupos metilo (-CH3) en una base nitrogenada
a. Metilguanina
b. Metiltimina
c. Metiladenina - Se inhibe la síntesis de DNA
Fenómeno habitual en metilación de DNA
Metilación de Citosina (5mC) en el DNA
Radiación ionizante
- Factores involucrados
- Reparación
- Tipo de error
- Exógeno
- Alfa, beta, gamma, neutrones y rayos X
- Rotura de una o dos cadenas de DNA
- Reparan:
a. endonucleasa
b. tirosil DNA fosfodiesterasa 1
c. Reparación homóloga
Radiación ultravioleta
- Tipo de daño
- Factores involucrados
- Exógeno
- UV-C: daño directo (rompe cadenas)
- UV-B y UV-A: daño indirecto (se generan r. libres)
- Enlaces covalentes entre pirimidinas y fotoproductos de pirimidinas
El DNA absorbe una longitud de onda de :
260 nm
UV-C: 190-290 nm
UV-B: 290-320 nm
UV-A: 320-400 nm
Agentes alquilantes
- Tipo de daño
- Factores involucrados
- Exógeno
- Adhiere grupos alquilos al DNA: metil, etil (cambian morf. del DNA)
a. Tabaco
b. Agentes mostaza nitrogenadas, nitrosureas (cisplatino, ciclofosfamida) - Formación de puentes cruzados
- Fragmentación del DNA
Agentes aromáticos
- Tipo de error
- Factores involucrados
- Exógeno
- Tabaco, carbón, pesticidas: necesitan activación metabólica por citocromo p450
- Sustituciones de bases
- Altera geometría de DNA
Reparaciones del DNA (5)
- Reparación por escisión de base (BER)
- Reparación por escisión de nucleótidos (NER)
- Reparación por mismatch (MMR)
- Recombinación homóloga (HR)
- Unión de extremos no homóloga (NHEJ)
Reparación por escisión de bases (BER) (5)
- Elimina nucleótidos alterados generados por reactivos químicos presentes en dieta o por metabolismo
a. DNA glucosilasas
b. Endonucleasa AP
c. DNA pol B
d. Ligasa - Desaminaciones
- Alquilaciones
- Especies rectivas de oxígeno
DNA glucosilasas (3)
BER
- 8 tipos diferentes
- Elimina la base dañada
- Hidroliza el enlace glucosídico entre base nitrogenada y azúcar
Endonucleasa AP
BER
Rompe enlace fosfodiester
Reparación por escisión de nucleótidos (5)
NER
- Reconocimiento del daño en secuencia del DNA
a. endonucleasa
b. helicasa
c. DNA pol delta y epsilon
d. ligasa - Dímeros
- Uniones interhebras
- Distorsión de la hebra
- Vía genómica global que corrige cadenas de DNA en el resto del genoma
Endonucleasa (3)
NER
- Hidroliza enlaces fosfodiester a cada lado y varios pares de base de distancia de la lesión
- 24 a 37 nt
Helicasa
NER
Rompe puentes de H correspondientes al fragmento escindido y se elimina fragmento de DNA
Reparación por mismatch (MMR) (8)
- Reparación de bases más apareadas
- Una base es muy susceptible de oxidación por especies reactivas de oxígeno
a. guanina → 8-oxoguanina (GO): en lugar de que se una citosina, se une adenina - DNA OGG1
a. reconoce adenina unida con GO - Metil-directed mismatch repair (mutM y mutY)
a. elimina adenina y la sustituye por citosina - MSH: reconoce basales mal apareadas
- Exonucleasas: Exo7 (5’), Exo1 y Exo10 (3’)
- DNA a
- Ligasa
Reparación por recombinación homóloga (5)
- Fase S o G2
- Activación del gen ATM (ataxia-telangiectasia mutado)
a. recluta complejo MRE11 (meiotic recombination 11)
b. exonucleasa 5’ - 3’ - Complejo MRN
a. MRE11, RAD50, NBS1 - RPA se une a cadena sencilla
- RAD51, RAD52, RAD54, BRCA2: permiten movilizar hebras para recombinación
Reparación no homóloga (3)
- DNA-PKcs (proteína cinasa dependiente de DNA
a. reconocimiento de cortes de DNA
b. Mantienen extremos cerca para su procesamiento - MRE11, NBS1, RAD50
a. actividad de nucleasa - XRCC4/ligasa
