Reparación del DNA

Question 1

Tendencia del DNA a presentar mutaciones

Answer 1

Inestabilidad del DNA

Question 2

Error de DNA delta y epsilon

Answer 2

1 en 100,000 a 1 en 10,000,000

Question 3

La mutación es indispensable para:

Answer 3

La evolución

Question 4

Tipos de daño al DNA (2)

Answer 4

Endógenos
Exógenos

Question 5

Se detienen al encontrar alguna lesión en el DNA durante la replicación

Answer 5

DNA Pol d y e

Question 6

Intervienen en lesión y hacen que DNA Pol d y e continúen:

Answer 6

Polimerasas de síntesis a través de lesión (TLS)

Question 7

Las polimerasas de TLS realizan:

Answer 7

Síntesis del DNA en región dañada

Question 8

Polimerasas TLS (7)

Answer 8

• Pol n
• Pol i
• Pol k
• REV1
• Pol z
• Pol v
• Pol 0

Question 9

Existe cierto grado de especifidad entre:

Answer 9

Tipo de lesión y polimerasa TLS encargada de replicarlo

Question 10

Si el daño persiste, entonces sucede:

Answer 10

Apoptosis (muerte celular programada)

Question 11

Error replicativo (4)

- Tipo de error
- Proteínas involucradas
- Arreglo

Answer 11

• Endógeno
• DNA polimerasas incorporan nucleótido erróneo = mutaciones random
• Topoisomerasa = mal alinemiento de hebras
• Tirosil DNA fosfodiesterasa y endonucleasas lo arreglan

Question 12

Desaminación espontánea de base (6)

- Tipo de error
- Factores involucrados

Answer 12

• Endógeno
• Pérdida de amino exocíclico
• Citosina → Uracilo
• Adenina → Hipoxantina
• Guanina → Xantina
• 5-metil citosina → Timina

Question 13

Pérdida de bases (3)

- Tipo de error
- Factores involucrados

Answer 13

• Endógeno
• Hidrolización o DNA glicosilasa
• Se rompe enlace N-glucosídico

Question 14

Daño oxidativo (9)

- Factores involucrados
- Tipo de daño

Answer 14

• Endógeno
• Especies reactivas de oxígeno (radicales libres)
  a. O2- (superóxido)
  b. H2O2 (peróxido de hidrógeno)
  c. OH (radical hidroxilo)
• Generan dobles enlaces
• Fragmentan purinas y pirimidinas
• Rotura de una sola hebra de DNA
• Forman 8-oxoguanina

Question 15

Metilación del DNA

- Tipo de error
- Factores involucrados

Answer 15

• Endógeno
• Grupos metilo (-CH3) en una base nitrogenada
  a. Metilguanina
  b. Metiltimina
  c. Metiladenina
• Se inhibe la síntesis de DNA

Question 16

Fenómeno habitual en metilación de DNA

Answer 16

Metilación de Citosina (5mC) en el DNA

Question 17

Radiación ionizante

• Factores involucrados
• Reparación

- Tipo de error

Answer 17

• Exógeno
• Alfa, beta, gamma, neutrones y rayos X
• Rotura de una o dos cadenas de DNA
• Reparan:
  a. endonucleasa
  b. tirosil DNA fosfodiesterasa 1
  c. Reparación homóloga

Question 18

Radiación ultravioleta

- Tipo de daño
- Factores involucrados

Answer 18

• Exógeno
• UV-C: daño directo (rompe cadenas)
• UV-B y UV-A: daño indirecto (se generan r. libres)
• Enlaces covalentes entre pirimidinas y fotoproductos de pirimidinas

Question 19

El DNA absorbe una longitud de onda de :

Answer 19

260 nm
UV-C: 190-290 nm
UV-B: 290-320 nm
UV-A: 320-400 nm

Question 20

Agentes alquilantes

- Tipo de daño
- Factores involucrados

Answer 20

• Exógeno
• Adhiere grupos alquilos al DNA: metil, etil (cambian morf. del DNA)
  a. Tabaco
  b. Agentes mostaza nitrogenadas, nitrosureas (cisplatino, ciclofosfamida)
• Formación de puentes cruzados
• Fragmentación del DNA

Question 21

Agentes aromáticos

- Tipo de error
- Factores involucrados

Answer 21

• Exógeno
• Tabaco, carbón, pesticidas: necesitan activación metabólica por citocromo p450
• Sustituciones de bases
• Altera geometría de DNA

Question 22

Reparaciones del DNA (5)

Answer 22

• Reparación por escisión de base (BER)
• Reparación por escisión de nucleótidos (NER)
• Reparación por mismatch (MMR)
• Recombinación homóloga (HR)
• Unión de extremos no homóloga (NHEJ)

Question 23

Reparación por escisión de bases (BER) (5)

Answer 23

• Elimina nucleótidos alterados generados por reactivos químicos presentes en dieta o por metabolismo
  a. DNA glucosilasas
  b. Endonucleasa AP
  c. DNA pol B
  d. Ligasa
• Desaminaciones
• Alquilaciones
• Especies rectivas de oxígeno

Question 24

DNA glucosilasas (3)

BER

Answer 24

• 8 tipos diferentes
• Elimina la base dañada
• Hidroliza el enlace glucosídico entre base nitrogenada y azúcar

Question 25

Endonucleasa AP

BER

Answer 25

Rompe enlace fosfodiester

Question 26

Reparación por escisión de nucleótidos (5)

NER

Answer 26

• Reconocimiento del daño en secuencia del DNA
  a. endonucleasa
  b. helicasa
  c. DNA pol delta y epsilon
  d. ligasa
• Dímeros
• Uniones interhebras
• Distorsión de la hebra
• Vía genómica global que corrige cadenas de DNA en el resto del genoma

Question 27

Endonucleasa (3)

NER

Answer 27

• Hidroliza enlaces fosfodiester a cada lado y varios pares de base de distancia de la lesión
• 24 a 37 nt

Question 28

Helicasa

NER

Answer 28

Rompe puentes de H correspondientes al fragmento escindido y se elimina fragmento de DNA

Question 29

Reparación por mismatch (MMR) (8)

Answer 29

• Reparación de bases más apareadas
• Una base es muy susceptible de oxidación por especies reactivas de oxígeno
  a. guanina → 8-oxoguanina (GO): en lugar de que se una citosina, se une adenina
• DNA OGG1
  a. reconoce adenina unida con GO
• Metil-directed mismatch repair (mutM y mutY)
  a. elimina adenina y la sustituye por citosina
• MSH: reconoce basales mal apareadas
• Exonucleasas: Exo7 (5’), Exo1 y Exo10 (3’)
• DNA a
• Ligasa

Question 30

Reparación por recombinación homóloga (5)

Answer 30

• Fase S o G2
• Activación del gen ATM (ataxia-telangiectasia mutado)
  a. recluta complejo MRE11 (meiotic recombination 11)
  b. exonucleasa 5’ - 3’
• Complejo MRN
  a. MRE11, RAD50, NBS1
• RPA se une a cadena sencilla
• RAD51, RAD52, RAD54, BRCA2: permiten movilizar hebras para recombinación

Question 31

Reparación no homóloga (3)

Answer 31

• DNA-PKcs (proteína cinasa dependiente de DNA
  a. reconocimiento de cortes de DNA
  b. Mantienen extremos cerca para su procesamiento
• MRE11, NBS1, RAD50
  a. actividad de nucleasa
• XRCC4/ligasa