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biomol ana q > Expresión génica > Flashcards

Expresión génica Flashcards

1
Q

Diferentes células en un orgnismo multicelular pueden:

A

Expresar grupos muy diversos de genes, aún conteniendo el mismo DNA

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Q

El grupo de genes expresados en una determinada célula es:

A

El grupo de proteínas y RNA funcionales que contiene

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Q

Forma por la cual una célula controla qué genes se expresan

A

Regulación génica

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4
Q

Controles de expresión génica (6)

A
  • Transcripcional
  • Procesamiento del RNA
  • Transporte y localización del RNA
  • Postraduccional
  • Degradación del mRNA
  • Actividad protéica
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5
Q

Regulación en cis

Regulación de expresión génica a nivel transcripcional

A

Secuencia contigua a un gen que tenga efecto regulador sobre la tasa de trasncripción de ese gen
- Potenciadores
- Silenciadores

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6
Q

Regulación en trans

Regulación de expresión génica a nivel transcripcional

A

La mayoría de secuencias reguladoras no pueden por sí solas modificar la velocidad de transcripción, necesitan proteínas reguladoras
- Factores de transcripción

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7
Q

Proteínas pueden reconocer DNA con gran afinidad por:

Reconocimiento del DNA por proteínas

A

Los dominios de unión al DNA

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8
Q

Las proteínas reconocen:

Reconocimiento del DNA por proteínas

A

La superficie del ácido nucléico para identificar la secuencia de nucleótidos

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9
Q

Sitio donde mejor se puede reconocer la secuencia de nucleótidos

Reconocimiento del DNA por proteínas

A

Surco mayor del DNA

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10
Q

Estructuras de los factores de trasncripción (motivos) (4)

A
  • Motivo hélice-giro-hélice (HGH)
  • Motivo dedos de ZN
  • Motivo zipper de Leucina
  • Hélice-asa-hélice (HLH)
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11
Q

Motivo hélice-giro-hélice (2)

Estructuras de los factores de trasncripción

A
  • Proteínas de dos alpha hélice conectadas por cadena corta de a.a
  • Desarrollo embriónico
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12
Q

Motivo dedos de Zn (2)

Estructuras de los factores de trasncripción

A
  • Alpha hélice unida a Beta hélice por Zn
  • Receptores de hromonas esteroideas
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13
Q

Motivo zipper de Leucina

Estructuras de los factores de trasncripción

A

2 alpha hélices

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14
Q

Motivo hélice-ala-hélice

Estructuras de los factores de trasncripción

A

Alpha hélice conectada por un asa a otra alpha hélice

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15
Q

Regiones controladoras de genes (4)

A
  • Promotor (cis)
  • Secuencias regulatorias
  • Potenciadores
  • Silenciadores (cis)
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16
Q

Promotor

A
  • Sitio donde los factores de transcripción y RNA pol se ensamblan
  • Reconocido por el activador
  • Cis
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17
Q

Secuencias regulatorias

A

Sitio donde proteínas reguladoras se unen para controlar proceso de ensamblaje en promotor

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18
Q

Potenciadores

A

Atraen, posicionan y modifican factores de transcripción, mediador y RNA pol II hacia promotor

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19
Q

Silenciador

A
  • Disminuyen la transcripción en vez de estimularla
  • Cis
  • Reconocido por el represor
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20
Q

Activadores

A
  • Actúan directamente con factores de transcripción y pueden regular actividad de RNA pol II
  • Trans
  • Activa al promotor
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21
Q

La unión de factores de transcripción específicos a potenciadores:

Activadores

A

Responsable del control de expresión génica
- Desarrollo
- Diferenciación
- Respuesta de células a hormonas y fact. de crecimiento

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22
Q

Represores

A
  • Se unen a secuencias específicas dentro del DNA (silenciadores) para inhibir transcripción
  • Trans
  • Reconocen silenciadores
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23
Q

Los represores pueden inhibir:

A
  • Transcripción
  • Unión de otros factores de transcripción al DNA
24
Q

Función importante de represores:

A

Inhibir expresión de genes específicos de un tejido en tipos celulares inadecuados

25
Q

La regulación de la transcripción por parte de represores y activadores es:

A

Un mecanismo que controla la expresión de genes eucariotas

26
Q

Los activadores y represores regulan la transcripción de eucariotas: (2)

A
  • Interactuando con factores de transcripción generales y otros componentes de la maquinaria transcripcional
  • Incuciendo cambios en la estructura de cromatina
27
Q

La ______ no es suficiente para convertir el DNA en una plantilla accesible para transcripción

A

Descondensación de cromatina

28
Q

Los genes permanecen:

A

Unidos a histonas y empaquetados en nucleosomas

29
Q

Problema al que se enfrentam los factores de transcripción y RNA pol

A

La interacción con cromatina y no con DNA desnudo

30
Q

Obstáculo para la transcripción

A

Enrollamiento de DNA

31
Q

El enrollamiento de DNA afecta: (2)

A
  • La capacidad de los factores de transcripción para unirse al DNA
  • La capacidad de RNA pol para transcribir
32
Q

Adición de grupo metilo al carbono 5 de citosina (5mC)

A

Metilación del DNA

33
Q

El grupo metilo siempre va en:

Metilación del DNA

A

Las citosinas que van después de una guanina

34
Q

5mC equivale a:

Metilación del DNA

A

1% del DNA

35
Q

La metilación del DNA confiere: (2)

A
  • Cambio conformacional en la doble cadena del DNA
  • Variación espacial y temporal en la cromatina
36
Q

Más metilación:

Metilación del DNA

A

Menos expresión génica

37
Q

La metilación de un promotor o de secuencias reguladoras:

Metilación del DNA

A

Interfiere en inicio de transcripción

38
Q

Actúan en secuencias C-G pareadas con secuencia C-G metilada

Metilación del DNA

A

Metiltransferasas

39
Q

Eucromatina (4)

Empaquetamiento de DNA

A
  • Ligeramente compactada
  • Regiones relativamente dispersas, poco condensadas que ocupan la amyor parte del núcleo
  • Alta acetilación
  • Cromatina activa transcripcional
40
Q

Heterocromatina (4)

Empaquetamiento de DNA

A
  • Regiones de cromatina densamente empaquetadas
  • Inactivas, no se expresan
  • Abundante en telómeros y centrómeros
  • Niveles altos de metilación
41
Q

Heterocromatina facultativa

Empaquetamiento de DNA

A

Se expresan durante desarrollo y/o diferenciación, posteriormente se silencian

42
Q

Heterocromatina constitutiva

Empaquetamiento de DNA

A
  • Siempre condensada y silenciada
  • Telómeros y centrómeros
43
Q

Dominios de histonas

Modificaciones de histonas

A
  • Unirse a otras histonas y DNA
  • Amino terminal fuera del DNA, sufre modificaciones
44
Q

Las histonas interaccionan con:

Modificaciones de histonas

A

Proteínas o complejos protéicos efectores o transductores

45
Q

Acetilación de histonas (6)

Modificaciones de histonas

A
  • Añade cargas negativas a histonas
  • Descompactación de cromatina
  • Facilita acoplamiento de factores de transcripción
  • Lisinas (H3K56)
    A. Acetiltransferasas de histonas (HAT): promueve transcripción
    B. Deacetilasas de histonas (HDAC): represores transcripcionales
  • Acetiltransferasas
  • Deacetilasas
46
Q

Fosforilación de histonas

Modificaciones de histonas

A
  • Serinas, treoninas y tirosinas
  • Incrementa carga negativa a histona
  • Favorece transcripción
    A. Cinasas
    B. Fosfatasas
47
Q

Metilación de histonas

Modificaciones de histonas

A
  • Metiltransferasas de lisina (HKMT)
    A. Lisina
    B. Puede activar o reprimir la transcripción de un gen
  • Metiltransferasas de Arginina
    A. Argininas
    B. Activación transcripcional
  • Demetilasas de histonas
48
Q

La epigenética abarca:

A

Procesos y mecanismos moleculares que afectan a la regulación y expresión de genes, y que son heredables de unos organismos a otros

49
Q

Mecanismos de regulación epigenética más comunes en humanos

A
  • Metilación del DNA
  • Modificaciones post-traduccionales de histonas (fosfo, metil, acetilación)
50
Q

Deacetilasas de histonas (HDAC)

A

Incrementan carga positiva
Clase I, II, III, IV

51
Q

Clase I (4)

Deacetilasas de histonas

A
  • Represión de transcripción
  • Regulación epigenética
  • Regulación del ciclo celular
  • HDAC 1, 2, 3, 8
52
Q

Clase II (5)

Deacetilasas de histonas

A
  • Regulan tráfico de proteínas
  • Adhesión
  • Mov. celular
  • HDAC II A 4, 5, 7, 9
  • HDAC II B 6, 10
53
Q

Clase III (4)

Deacetilasas de histonas

A
  • Formación de memoria
  • Represión de transcripción
  • Regulación epigenética
  • Sirtuinas
54
Q

Expresión aberrante HDAC 1

Deacetilasas de histonas

A

Cáncer de próstata, colon y mama

55
Q

Expresión aberrante HDAC 2 (5)

Deacetilasas de histonas

A
  • Carcinoma gástrico
  • Cáncer de cuello uterino
  • Carcinoma colorrectal
  • Displasia cervical
  • Sarcomas endometriales
56
Q

Expresión aberrante HDAC 8

Deacetilasas de histonas

A

Neuroblastoma y glioma

57
Q

Inhibidores de HDAC (4)

A
  • Vorinostat
  • Romidepsin
  • Belinostat
  • Panobinstat

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