Régulation de la transcription chez les eucaryotes Flashcards
Quelle est l’étape la plus sensible à la régulation de la transcription chez les eucaryotes?
L’initiation de la transcription
Qu’est ce qu’un enhancer (ou activateur) ?
Séquence d’ADN qui fixe des facteurs régulateur de transcription ce qui a pour conséquence d’augmenter la transcription des gènes situés en aval ou en amont.
Les enhancers peuvent-ils agir à une grande distance des gènes?
Oui!
Qu’est ce qu’un isolateur?
Élément spécifique d’ADN contrôlant l’action des activateur. Il inhibe l’activation du gène induit par l’activateur
Où est situé l’isolateur?
Entre un enhancer et un promoteur
À quoi peut être comparé un isolateur
À un mur!
Qu’utilise-t-on pour pouvoir élucider une séquence régulatrice?
Un gène rapporteur
Quelles sont les 3 conditions pour pouvoir utiliser un certain gène rapporteur?
- Le gène doit être étranger au génome de l’organisme modifié
- Le produit doit permettre une visualisation précise de l’expression des tissus
- Le résultat doit être quantifiable afin de mesurer l’activité du promoteur
Comment appelle-t-on les protéines utilisées comme tag ou marqueurs à une autre protéine?
Une protéine de fusion
Chez les eucaryotes, les activateurs et les inhibiteurs sont typiquement modulaires. Quels sont leurs domaines de liaison?
Un domaine liant l’ADN, et un domaine d’activation ou d’inhibition.
Quel est l’avantage d’une utilisation combinatoire des hétérodimères?
Augmentation de la complexité, on peut reconnaître plus de gènes!
Quel est le rôle du motif à doigt de zinc?
Stabilisation de la structure
Quelle conformation doit absolument adopter l’agrafe à leucine et l’hélice boucle hélice?
Dimères.
Comment peut-on définir les différents domaines activateurs?
Selon leur contenu en acides aminés. Leurs domaines sont nommés en fonction des caractéristiques des acides aminés présents.
Vrai ou faux. Les activateurs agissent en tout temps directement sur l’ARNpol.
Faux. C’est très rare. Ils recrutent généralement la polymérase indirectement à travers le complexe médiateur ou des facteurs généraux de la transcription.
Les répresseurs peuvent agir de plusieurs manières. Nommez en 3.
- Interférer avec l’activateur (compétition pour le site de liaison ou blocage)
- Interaction avec le complexe d’initiation (à travers le complexe médiateur) et bloquer la transcription.
- Compacter la chromatine et rendre les gènes inaccessibles.
Vrai ou faux. Plusieurs isolateurs sont connus chez les mammifères.
Faux. Un seul est connu : le CCCTC-binding factor (ou CTCF)
L’ajout d’un méthyle (CH3) provoque t’il une répression ou une activation de la transcription?
Une répression. La queue méthylée recrute des protéines responsables de la formation d’hétérochromatine.
L’ajout d’acétyl ou de phosphate a quel effet sur la transcription?
Ils activent la transcription. En effet, l’acétyl ou le phosphate ont un effet neutralisant sur l’histone, qui interagit moins bien avec l’ADN. L’ADN est déroulé plus facilement et on a un meilleur accès aux bases.
L’ajout d’acétyles sur les queues d’histones attire quelles molécules?
Les protéines contenant des bromodomaines.
Les complexes remodeleurs de la chromatines sont recrutés par quelles molécules? Ont-ils besoin d’ATP?
Ils sont recrutés par les facteurs de transcriptions. Ils ont besoin d’ATP.
Par quel processus certains gènes sont-ils rendus silencieux?
Par méthylation de l’ADN de leur région protomotrices
La méthylation de l’ADN est-elle maintenue dans les cellules en division?
Oui
Quelle est la différence majeure entre un locus et un opéron?
Dans un locus, chaque gène à son propre promoteur basal. Dans l’opéron, les gènes sont tous sous le signal du même promoteur.
Les RTK inactifs sont sous forme ________ et les RTK liés à leur molécule signal est sous forme de _______ et active son domaine ___________
monomérique/dimére/kinase
Qu’arrive-t-il lors de l’autophosphorylation de RTK?
Activation de la voie de signalisation Ras-MAPK
Quel est le but de la chaîne de phosphorylation de la voie MAPK?
Passer dans le noyau pour activer plusieurs facteurs de transcription.
Où sont localisés les récepteurs nucléaires hétérodimérique d’hormones stéroïdiennes?
Qu’arrive-t-il lorsque qu’ils sont en absence de leur hormone?
Dans le noyau.
En absence de leur hormone, ils agissent comme répresseurs.
Qu’arrive-t-il lorsque les récepteurs nucléaires homodimériques d’hormones stéroïdiennes sont liés à leur hormone?
Le complexe va se déplacer à l’intérieur du noyau et induire la transcription de gènes spécifiques