Regulação (moléculas) Flashcards
Qual o nome de AC e a sua função? Dê um exemplo de um estimulador e inibidor desta molécula.
Adenilato Ciclase
Catalisar a formação de cAMP
Estimulado por Gαs e inibido por Gαi
O que é que PKA tem de especial em relação a outras cinases?
É uma das poucas que é codificada em cinases diferentes, e tem uma subunidade catalítica e uma subunidade reguladora
O que acontece quando as subunidades catalíticas de PKA são libertadas?
Elas fosforilam vários substratos
O que é o CREB?
É um fator de transcrição regulado por PKA
AKAP é uma proteína scaffold que se liga a várias coisas, mas só se liga a uma cinase: PKA
Falso. Liga-se também a PKC e MAPKs
O que é que PLC tem de especial?
Ela é uma cinase de lípidos
Quantas subfamílias de PKC há?
3
cPKC, nPKC, aPKC
Qual é a diferença entre cPKC e nPKC?
nPKC só se consegue ligar a IP3 porque os locais de ligação a PMA e Ca2+ são defeituosos
Qual é a diferença entre cPKC e aPKC?
aPKC não necessita de Ca2+ para fazer a ligação
PKC é capaz de entrar e sair do núcleo, mas necessita de uma proteína transportadora. V/F?
Falso. PKC possui uma região NLS (Nuclear Localization Signal) para entrar no núcleo e NES (Nuclear Export Signals) para sair do núcleo.
Ca2+ é um segundo mensageiro, mas também pode ser substrato de uma proteína. V/F?
Verdade.
Quando Ca2+ se liga à calmodulina, ele altera a sua conformação e pode inibir ou ativar outras proteínas
Quando G-alfa se liga a GTP, a afinidade de GPCR para os seus ligandos diminui. V/F?
Verdadeiro
O que é que GRK faz?
Media a fosforilação de GCPRs e promove a ligação de β-arrestinas
Uma vez formados, os GPCRs nunca saem da superfície da célula. V/F?
Falso, são removidos da superfície da célula e degradados via inibição pelos GRK/β-arrestina
Com o que é que PKG interage?
cGMP
Dê o exemplo de uma desacetilase.
Sirtuinas
Dê o exemplo de uma acetiltransferase.
Proteína CBP/p300:
Quantos tipos de caspases existem? Dê um exemplo para cada.
2 tipos.
Iniciadoras (CASP2, CASP8, CASP9, and CASP10): Clivam pro-formas inativas das caspases efetoras, ativando-as
Efetoras (CASP3, CASP6, CASP7): Clivam outros subtratos proteícos na célula de modo a levar à apoptose.
Nas proteínas G, o resíduo de glicina 60 encontra-se no switch 2 e Treonina 35 no switch 1.
Verdadeiro
As proteínas G, no seu estado inativo, o grupo fosfato de GDP encontra-se ligado aos resíduos Glicina 60 e Treonina 35. V/F?
Falso. No seu estado ATIVO, possuem o grupo fosfato de GTP ligado aos resíduos Glicina 60 e Treonina 35.
Qual é o local mais conservado da superfamília Ras?
Os que ligam o GTP e GDP (função reguladora)
PTEN é uma fosfatase que amplifica o sinal de PI3
PTEN é uma fosfatase em equilíbrio com a cinase de lípidos PI3 já que catalisa a reação inversa
Indique 5 domínios proteícos, sendo que 2 dos 5 têm que ligar ao mesmo composto
SH2 and PTB bind to tyrosine phosphorylated sites
SH3 and WW bind to proline-rich sequences
PDZ domains bind to hydrophobic residues at the C-termini of target proteins
PH domains bind to different phosphoinositides
FYVE domains specifically bind to Pdtlns(3)P (phosphatidylinositol 3-phosphate)
Indique um domínio proteico e uma proteína que o contenha
Tirosina cinase (TK): Têm domínios SH2 para fazerem dimerização com proteínas fosforiladas e têm domínios SH3 para fazerem dimerização entre moléculas semelhantes.
STAT1: Fator de transcrição com domínio SH2 que permite STAT1 fosforilado ligar-se a uma região de DNA para transcrição de genes
Diga 3 proteínas adaptadoras
SH2, SH3, SAM, PTB e PH
As proteínas adaptadoras não têm atividade enzimática intrínseca. V/F?
Verdadeiro
As proteínas scaffold protegem moléculas sinalizadoras ativadas da inativação e/ou degradação. V/F?
Verdadeiro
A principal diferença entre proteínas adaptadoras e scaffold é que as adaptadoras podem atuar como reguladoras enquanto que as scaffold não são reguladoras da sinalização
Verdadeiro
Porque motivo é que SH2 é um domínio proteico com tanta afinidade para tirosina fosforilada
Liga o grupo fosfato num pocket com muita carga positiva
Tem uma região hidrófoba que permite uma melhor ligação com os próprios interatores
Uma proteína que contenha SH2 pode-se ligar a qualquer zona de um recetor tirosina cinase (RTK), desde que se ligue a um RTK fosforilado. V/F?
Falso. As proteínas que têm estes domínios ligam-se a determinados grupos fosfatos no recetor. O grupo P a que se ligam depende das sequências específicas que os rodeiam
Quantos domínios e quais são os domínios que Grb-2 tem?
1 domínio SH2 e 2 domínios SH3
Qual é a função de PAK1?
É um mediador que atua em várias vias de Ras, permitindo sinalização através de cross-talk. Pode amplificar um sinal ou impedir que um sinal seja amplificado.
O que é KSR?
É uma proteína scaffold/adaptadora na via de ERK que permite uma reação mais rápida e eficiente
Qual é a principal diferença entre os diferentes tipos de Ras
H-Ras, K-Ras, N-Ras; O tipo de tecido onde são expressas.
Indique três formas de inativar RTK.
- Antagonista ao ligando: O ligando desliga-se for some reason
- Antagonista ao recetor: PKC
- Fosforilação/Desfosforilação: PTMs
- Clivagem e endocitose do recetor: Perdem o domínio intracelular e deixa de poder fazer a transducção. Endocitados por vesículas de Clatrina. Pode ser feito para dar downregulate ao recetor, ou reposto na membrana mas tendo levado um reset (reciclado)
- Ubiquitinado e degradado: Marcada pela ubiquitina para ser degradado.
PI3K é uma cinase de lipidos. V/F?
Verdadeiro.
Como é que é regulada a quantidade de PIP-3?
Pelo equilíbrio entre a atividade de PI3K e PTEN
O que acontece quando se inativa PTEN?
Grande ativação de AKT
Qual é a função de PP2A? Indique uma proteína que faça o oposto desta.
Desfosforila proteínas reguladoras levando a que estas se desliguem do fator de transcrição permitindo a sua translocação para o núcleo. PROMOVE A APOPTOSE.
AKT
Indique que molécula inibe GSK3 e as consequências da sua inibição
AKT fosforila GSK3, inibindo-o.
GSK3 inibido promove a síntese proteíca.
Os ligandos Wnt provocam a migração de Beta-catenina para o núcleo, que, por sua vez, ativa vários fatores de transcrição do desenvolvimento celular. V/F?
Verdadeiro.
Os ligandos Wnt permitem que um complexo que contem axina, GSK3, APC e CK-1 se ligue a Beta-catenina, permitindo assim o seu transporte para o núcleo. V/F?
Falso. Wnt sequestram esse complexo para que Beta-catenina possa ir para o núcleo.
β-catenina regula a simetria dos organismos. V/F?
Verdadeiro.
Como é que mTORC1 tem função de detetor de nutrientes?
Em situações de baixa energia:
1. Aumento da concentração de AMP que estimula AMPK
2. AMPK fosforila os fatores TSC
3. TSC ajuda as Rheb a desfosforilar o GTP, levando à interrupção da ativação de mTORC1
Qual é a função de mTORC2?
Regular a actina no citoesqueleto
Um dos mTORCs pode ativar o outro. Qual ativa qual?.
mTORC1 pode ativar mTORC2
Qual a principal diferença entre Rho e Ras?
As Rho são normalmente prenilados por lípidos geranil-geranil enquanto que as Ras são preniladas com farnesil
Explique o modo de ativação da Rho-GDI
- Liga-se a RhoGDP, e transloca-o da membrana plasmática para o citosol
- RhoGDI-RhoGDP fica no citosol até aparecer o sinal correto
- RhoGDI retorna RhoGDP à membrana no alvo específico, convertendo-se em GTP.
Qual é a função das proteínas ERM
Cruciais para o crosslinking entre RhoGDI/RhoGTPase
A que se ligam as proteínas 14-3-3
Motivos específicos contendo Ser/Thr fosforiladas numa fenda anfipática