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Fisiologia e Genética Microbiana > Regulação genómica em eucariotas e procariotas > Flashcards

Regulação genómica em eucariotas e procariotas Flashcards

1
Q

A regulação da transcrição em eucariotas consiste em que fatores?

A

Promotores: TATA- promotor core; promotor upstream
Fatores de transcrição
Enhancers e Silencers

Promotores upstream ligam-se aos fatores de transcrição

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Q

Qual a mais complexa, a transcrição em procariotas ou eucariotas?

A

Eucariotas

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3
Q

A TATA box é um … … a jusante ou a montante do iniciador?

A

Promotor core antes do iniciador

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4
Q

Diferentes tipos de fatores de transcrição podem modificar …

A

a estrutura da cromatina

Transcrição possível: histonas acetildas; cromatina aberta; citosinas não metiladas

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5
Q

Os fatores de transcrição podem ser … ou … e regulam assim a transcrição. Um elemento basal promotor pode ser a … onde se ligam …

Ligam-se a que região do gene?

A

Ativadores … repressores.
TATA box… fatores de transcrição gerais

Região promotora

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6
Q

Os níveis de transcrição são regulados pela ação de um ou vários fatores de transcrição?

A

Vários

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7
Q

Diferentes tipos de fatores transciptacionais em eucariotas podem ser:

A
  • zinc fingers
  • helix-turn-helix
  • leucine zipper
  • helix loop helix
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8
Q

A regulação da transcrição em procariótas pode envolver operões?

A

Sim

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9
Q

Um operão é composto por:

O gene regulatório faz parte do operão?

A
  • genes
  • região controladora (operador + prometor)

Não

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10
Q

A regulação pós transcriptacional é linear?

A

Não, envolve muitos processos interligados (intricada)

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11
Q

Para além dos mecanismos regulatórios transcriptacionais e pós transcriptacionais os … … também regulam a expressão genética.

Exemplos podem ser:

A

estimulos ambientais

superfícies, fome, antibióticos, etc

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12
Q

Os estímulos ambientais são captados e “respondidos” através de:

Como funcionam?

A

Sistemas de dois componentes

Captando sinais do exterior e dando resposta no interior da célula (captador de sinal + regulador de resposta)

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13
Q

Os autoindutores são produzidos durante a fase …

A

estacionária

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14
Q

Os … do QS também modulam a … de genes alvo.

A

autoindutores…expressão genética

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15
Q

Os sistemas de trasndução de sinal por fatores de 2 componentes são constituídos por:

A
  • histidina quinase transmembranar (HK) -> sente mudanças no ambiente externo e transporta o sinal para dentro da cell
    Regulador de resposta (RR) -> media a resposta celular pela expressão diferencial de genes alvo
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16
Q

Para que o regulador de resposta do sistema de dois componentes regule a expressão génica é necessário:

A

alterar a conformação do terminal C para estimular a ligação ao DNA

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17
Q

Os reguladores de resposta podem reprimir ou ativar genes?

A

sim

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18
Q

O que envolve a transdução de sinal de um sistema de dois componentes?

A

A conversão de um sinal reconhecido pela cell a uma regulação genética ou outras respostas celulares-

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19
Q

Os sistemas de duas componentes são sempre iguais?

A

Não, são diferentes para:
* duplicação de genes
* transferencia lateral de genes

20
Q

Porque é que os sistemas de duas componentes devem ser altamente regulados?

A

Previnir que haja cross talk entre sistemas de duas componentes uma vez que são abundantes numa só célula.

21
Q

Os sistemas de duas componentes são mais diversos em bactérias que … uma vez que …

A
  • sofrem várias alterações ambientais
  • permite adaptarem-se
22
Q

Os sistemas de duas componentes são restritos ao reino das bactérias?

A

Não! Estão presentes em todos os reinos (bacteria, eucaria e archaea)

Não existem nos animais

23
Q

Porque é que o sistemta de duas componentes PhoQ-PhoP é pleiotrópico?

A

O mesmo sistema governa várias funcionalidades:
* virulência
* adaptação a ambientes pobres em magnésio
* regula várias atividades celulares em Gram -

24
Q

Que tipos de transdução de sinal existem em sistemas de dois componentes?

A
  • prototípico
  • híbrido/phosphorelay
25
Q

O phophorelay consiste numa…

está associado a que processo celular?

A

cascata de resposta onde o fosforil é passado entre recetores

formação de endoesporos

26
Q

A histidina quinase (HK) pode ser dividida em … grupos dependendo do modo como …

Que grupos são?

A

3 …o seu grupo fosforilo é transferido a outros domíninios

Clássico (direto ao RR); unortodoxo; híbrido

27
Q

Num sistema de duas componentes:
… sente o estímulo
… responde

A
  • Histidina Kinase
  • Regulador de Resposta
28
Q

As HK são bidirecionais?

A

Sim, quando não são estimuladas funcionam como fosfatases

29
Q

A estrutura das HK é composta por domínios … e …

A

Conservados … varáveis

30
Q

Domínios conservados de HK são:

A
  • DHp -> onde a resposta catlítica ocorre; local onde o domínio catalítico e RR se ligam
  • Domínio catalítico ligado a ATP -> fornece P para a reação
31
Q

Os domínios variáveis da HK são:

A
  • Domínio sensor
  • dominio transdutor de sinal -> transmição de sinal ao domínio catalítico; mais comum o HAMP
32
Q

Os reguladores de resposta são, tipicamente:

A

proteínas com multidomínios
* Terminal-N: regulatório; conservado
* Terminal C: efector; variável

33
Q

A maioria dos RR são … que ligam e desligam … em resposta aos sinais recebidos por HKs

A

reguladores de transcrição … genes

34
Q

O terminal N dos RR é o domínio … e interage com o domínio … da HK por recessão de …

A

recetor…DHp…fósforo

35
Q

O terminal C dos RR é o domínio… responsável por … e pode ser dividido em várias subfamílias:

Pode existir mais que um?

A

efetor…
* interagir com o alvo celular e ligar-se ao DNA

  1. DNA binding (+ comum)
  2. RNA binding
  3. protein binding
  4. enzimático

Sim

36
Q

Os sistemas de duas componentes podem regular:

A
  • patogenicidade
  • metabolismo do oxigénio
  • QS
  • osmoregulação
  • esporulção
  • Quimiotaxia (fugir ou aproximar de um químico)
37
Q

Exemplos de sistemas de duas componentes e a sua função:

A
  • PhoR-PhoB: concentração de fosfato no ambiente
  • Enz-OmpR: osmolaridade do ambiente (purinas)
  • PhoQ-PhoP: concentração de magnésio no ambiente
38
Q

O sistema EnvZ/OmpR em E. coli regula… através da expressão de proteínas transmembranares … e …
O operão ompB produz:

Que tipo de sistema de duas componentes se trata?

A

o stress osmótico … OmpF e OmpC
HK (EnvZ) e RR (OmpR)

prototípico

39
Q

A pH acidico há … osmolaridade. O que acontece à transcrição de ompF e ompC?

alta/baixa

A

Alta

A transcrição de ompF é reprimida e as purinas traduzidas pela ompC são dominantes -> poro mais pequeno -> menos fluxo

40
Q

Os quimiorecetores responsáveis pela quimiotaxia das bactérias são:

Que tipo de sistema se trata?

A

Sistemas de duas componentes

prototipico

41
Q

Os quimiorecetores envolvidos na quimiotaxia são compostos por:

A
  • Terminal N: presente fora da membrana
  • Terminal C: dentro da região citoplasmática; região HAMP
42
Q

Quando há estimulação, a propulsão flagelar dá-se:

Quando não há estimulação o que acontece?

A

No sentido contrário ao ponteiro dos relógios; a célula “corre” sem tropeços.

flagelos rodam no sentido dos ponteiros dos relógios, afastados entre si; a cell “tropeça”

43
Q

Dentro dos genes responsáveis pelo controlo da quimiotaxia em E.coli podemos encontrar os genes que codificam para:

A

HK e RR

44
Q

Em E. coli, o regulador central de quimiotaxia é a … que regula …

A

quinase CheA … movimento flagelar

45
Q

Em E. coli, para que o movimento flagelar seja ativado… (???)

A

CheA não é fosforilada
CheY (RR) não é fosforilado e não reprime o motor flagelar

46
Q

A virulência de MOs patogénicos, como a Salmonella é mediada por sistemas de dois componentes? O que promove a sua ativação? De que tipo é?

A

Sim, a deteção de pH ácido no interior dos macrófagos promove a ativação de um injetisssoma.
Por phosphorelay (cascata de reação)

47
Q

A formação de endosporos está dependente de que tipo de sistema de duas componentes?

A

Phosphorelay (cascata de de reação)

Fisiologia e Genética Microbiana (6 decks)

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