Fatores sigma e resposta ao stress Flashcards

1
Q

Stresses ambientais levam a respostas … e … por ativação de genes …

A
  • intracelulares
  • extracelulares
  • específicos
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2
Q

A regulação por resposta a stress é feita a nível de vários … a partir de um …

A
  • operões
  • regulão
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3
Q

Qual é a estratégia mais comum que as bactérias têm para regular a expressão genética?

A

Modificar a especificidade do promotor para a RNA polimerase através de fatores sigma alternativos

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4
Q

Em bactérias, a expressão genética é fortemente regulada a nível da …

(trancrição, tradução, duplicação…)

A

Transcrição

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5
Q

A iniciação da … é controlada por …

(1º - tradução, transcrição, …)

A
  • Trascrição
  • fatores sigma
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6
Q

Para além dos fatores sigma existem os fatores sigma … . Qual a sua função?

A
  • alternativos
  • Regulam a expressão genética por modificar a especificidade do promotor RNAp
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7
Q

ECF-sigma quer dizer …

A

Extra Cytoplasmic Function - sigma factors

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8
Q

Os ECF-sigma são o grupo mais abundante de …

A

Factores sigma mantidos inativos por fatores anti-sigma específicos

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9
Q

A regulação dos ECF-sigma é mais … que os fatores sigma.

A
  • fina
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10
Q

O invólucro celular bacteriano é constituído por:

A
  • parede celular
  • membrana celular
  • membrana celular externa de Gram -
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11
Q

Que tipos de stress está envolvido o invólucro celular bacteriano?

A
  • Físico
  • Químico
  • Biológico (infeções)
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12
Q

O invólucro celular bacteriano é uma estrutura vital? Quais são as suas funções?

A

Sim
* Respiração
* Adesão
* Secreção
* Transporte de nutrientes
* Manutenção pressão osmótica
* Manutenção da integridade celular

Manutenção da integridade e função do invólucro é essencial à sobrevivência

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13
Q

A síntese da parede celular faz-se em que sentido?

A

De dentro para fora da célula

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14
Q

A síntese da parede celular é feita pela ativação de um só gene?

A

Não, de vários genes (11)

slide 6

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15
Q

Em bactérias Gram …, o stress induz a sobrexpressão de … . No estado … estas induzem a atividade de …

A
  • Negativas
  • Purinas (OMP’s)
  • desenrolado
  • sigma E

Slide 7

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16
Q

Os fatores sigma são responsáveis importantes nos Mecanismos de Regulação …

A

Globais (GRM)

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17
Q

Existem … mecanismos responsáveis pelo reconhecimento de sinais externos. Quais são?

A

3
* Sistema de 1 componente
* Sistema de 2 componentes
* Fatores sigma com função extracitoplasmática

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18
Q

Os fatores sigma são responsáveis por recrutar … para a transcrição e apresentarem afinindade para com os …

A
  • RNA polimerase
  • promotores
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19
Q

O fator sigma 70 é considerado …. uma vez que é reconhecido pela … dos promotores.

A
  • house-keeping (regulação geral)
  • maioria
20
Q

Os fatores anti-sigma são … ou … sensíveis a estímulos ambientais

A
  • diretamente
  • indiretamente
21
Q

Descreve o que acontece quando os fatores ECF-sigma são ativados.

A
  • Fatores anti-sigma são libertados
  • ECF-Sigma liga-se à RNAp
  • EFC-Sigma reconhece determinados promotores
  • Dá-se a transcrição de determinados regulões
  • Estímulo de respostas adaptativas à sobrevivencia da cell.
22
Q

O ECF-sigma S é regulado em B. burgdorferi e S. typhimurium. Que MO apresenta uma cascata de fatores sigma mais complexa?

Slide 11

A

S. typhimurium

https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.0501417102

23
Q

O que depende a “escolha” do fator sigma a ser usado na transcrição?

A
  • Do gene a ser transcrito
  • Sinais ambientais necessário para iniciar a transcrição desse determinado gene.
24
Q

Os fatores sigma podem ser considerados … … que assistem a RNAp em ligar-se a determinados TSS(?). Depois desta ancoragem, o que acontece aos fatores sigma?

A
  • Fatores de iniciação
  • São libertados
25
Q

Uma holoenzima (RNAp) só tem esta designição quando … está a ela ligado.

A

Fator sigma

26
Q

Cada RNAp tem exatamente … subunidade(s) para fatores sigma

A

1

27
Q

Os fatores sigma são responsáveis pela ancoragem da RNAp a determinados …

A

promotores

28
Q

Os fatores sigma estão divididos em … grandes famílias:

A

2
* Sigma 70
* Sigma 54 (N)

29
Q

O sigma 70 é considerado um fator … uma vez que é responsável pela transcrição durante …

A
  • primário
  • crescimento
30
Q

O sigma 70 é dividido em … subfamílias:

A

2
* sigma 70
* sigma ECF

31
Q

O sigma 70 é constituído por … domínios conservados.

Estes domínios têm diferenças a nível … , … e …

A

4

filogenético, estrutural e funcional

32
Q

A que subgrupo pertencem os Sigma ECF? Que subunidade falta a este grupo e qual é a consequência disso?

A

IV
* Falta Sub 1
* Reconhecimento por nº menor de promotores em relação ao sigma 70 (grupos I, II, III)

33
Q

O fator sigma ECF apenas apresenta as subunidades … e … . Desta forma, a ativação de genes é mais …

A
  • 2 e 4
  • fina/específica
34
Q

O grupo … de fatores sigma 70 é mais …, enquanto que os grupos … têm funções mais …

A
  • 1
  • geral
  • 2-4
  • específicas
35
Q

Ao contrário do grupo … do fator sigma 70, os grupos … são controlados por …

A
  • 1
  • 2-4
  • fatores anti-sigma

Têm um controlo mais fino da sua atividade transcriptacional

36
Q

Os fatores sigma-ECF são responsáveis pela resposta a sinais em que partes da cell?

A que sinais respondem?

A
  • membrana celular
  • periplasma
  • ambiente extracelular

Misfolding das purinas (?), choque térmico, etc

37
Q

Os sigma-ECF regulam a síntese de ….

A

proteinas membranares/ secretadas

38
Q

Os fatores sigma ECF estão envolvidos em papeis biológicos como:

A
  • resposta a stress pelo invólucro
  • transporte de ferro
  • stress oxidativo
  • resposta geral ao stress
39
Q

Sigma E é sinónimo de Sigma …

A

ECF

40
Q

Sigma E está associado a que processo bacteriano?

Em que bactérias?

A

Virulência

M. tuberculosis, E. coli e S. typhimurium

41
Q

Na ausência de stress, como se encontra o fator sigma-ECF?

A

Inibido por fatores anti-sigma específicos.

42
Q

Na regulação do stress da sup. celular, os fatores sigma … são regulados por … . Onde se encontra a codificação para estes últimos?

A
  • ECF
  • anti-sigma específicos
    Nos mesmos operões que os fatores ECF-Sigma
43
Q

Em E. coli, o fator sigma …, é responsável por responder a distúrbios de …

A
  • E
  • Proteínas extramembranares (OMP) (misfolded/unfolded)
44
Q

Mutações em genes regulados por sigma E podem resultar:

A

Morte

Slide 21

45
Q

Sigma E transcreve para imensas … responsáveis por:

A

Enzimas
* Síntese e transporte de fosfolípidos, ácidos grodos, lipopolissacarídeos e oligossacarídeos
* proteínas do invólucro
* ativação de genes responsáveis pelo transporte e montagem de LPS e OMPs na membrana extracelular

46
Q

Descreve o mecanismo de regulação de sigma-E

A
  1. Stress na membrana extracelular
  2. OMP sofrem misfold -> aumento de terminais C no periplasma
  3. OMP misfolded ligam-se a proteases -> degradam RseA ligado a RseB
  4. libertação do RseA e sigma E (complexo)
  5. RseA-SigmaE é degradado libertando o Sigma-E

ppt 23

A libertação de anti-sigma é despoletada pelo aumento de terminais C

47
Q

RseA e RseB são exemplos de regulação … do sigma-E

A

negativa