Fatores sigma e resposta ao stress Flashcards
Stresses ambientais levam a respostas … e … por ativação de genes …
- intracelulares
- extracelulares
- específicos
A regulação por resposta a stress é feita a nível de vários … a partir de um …
- operões
- regulão
Qual é a estratégia mais comum que as bactérias têm para regular a expressão genética?
Modificar a especificidade do promotor para a RNA polimerase através de fatores sigma alternativos
Em bactérias, a expressão genética é fortemente regulada a nível da …
(trancrição, tradução, duplicação…)
Transcrição
A iniciação da … é controlada por …
(1º - tradução, transcrição, …)
- Trascrição
- fatores sigma
Para além dos fatores sigma existem os fatores sigma … . Qual a sua função?
- alternativos
- Regulam a expressão genética por modificar a especificidade do promotor RNAp
ECF-sigma quer dizer …
Extra Cytoplasmic Function - sigma factors
Os ECF-sigma são o grupo mais abundante de …
Factores sigma mantidos inativos por fatores anti-sigma específicos
A regulação dos ECF-sigma é mais … que os fatores sigma.
- fina
O invólucro celular bacteriano é constituído por:
- parede celular
- membrana celular
- membrana celular externa de Gram -
Que tipos de stress está envolvido o invólucro celular bacteriano?
- Físico
- Químico
- Biológico (infeções)
O invólucro celular bacteriano é uma estrutura vital? Quais são as suas funções?
Sim
* Respiração
* Adesão
* Secreção
* Transporte de nutrientes
* Manutenção pressão osmótica
* Manutenção da integridade celular
Manutenção da integridade e função do invólucro é essencial à sobrevivência
A síntese da parede celular faz-se em que sentido?
De dentro para fora da célula
A síntese da parede celular é feita pela ativação de um só gene?
Não, de vários genes (11)
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Em bactérias Gram …, o stress induz a sobrexpressão de … . No estado … estas induzem a atividade de …
- Negativas
- Purinas (OMP’s)
- desenrolado
- sigma E
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Os fatores sigma são responsáveis importantes nos Mecanismos de Regulação …
Globais (GRM)
Existem … mecanismos responsáveis pelo reconhecimento de sinais externos. Quais são?
3
* Sistema de 1 componente
* Sistema de 2 componentes
* Fatores sigma com função extracitoplasmática
Os fatores sigma são responsáveis por recrutar … para a transcrição e apresentarem afinindade para com os …
- RNA polimerase
- promotores
O fator sigma 70 é considerado …. uma vez que é reconhecido pela … dos promotores.
- house-keeping (regulação geral)
- maioria
Os fatores anti-sigma são … ou … sensíveis a estímulos ambientais
- diretamente
- indiretamente
Descreve o que acontece quando os fatores ECF-sigma são ativados.
- Fatores anti-sigma são libertados
- ECF-Sigma liga-se à RNAp
- EFC-Sigma reconhece determinados promotores
- Dá-se a transcrição de determinados regulões
- Estímulo de respostas adaptativas à sobrevivencia da cell.
O ECF-sigma S é regulado em B. burgdorferi e S. typhimurium. Que MO apresenta uma cascata de fatores sigma mais complexa?
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S. typhimurium
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.0501417102
O que depende a “escolha” do fator sigma a ser usado na transcrição?
- Do gene a ser transcrito
- Sinais ambientais necessário para iniciar a transcrição desse determinado gene.
Os fatores sigma podem ser considerados … … que assistem a RNAp em ligar-se a determinados TSS(?). Depois desta ancoragem, o que acontece aos fatores sigma?
- Fatores de iniciação
- São libertados
Uma holoenzima (RNAp) só tem esta designição quando … está a ela ligado.
Fator sigma
Cada RNAp tem exatamente … subunidade(s) para fatores sigma
1
Os fatores sigma são responsáveis pela ancoragem da RNAp a determinados …
promotores
Os fatores sigma estão divididos em … grandes famílias:
2
* Sigma 70
* Sigma 54 (N)
O sigma 70 é considerado um fator … uma vez que é responsável pela transcrição durante …
- primário
- crescimento
O sigma 70 é dividido em … subfamílias:
2
* sigma 70
* sigma ECF
O sigma 70 é constituído por … domínios conservados.
Estes domínios têm diferenças a nível … , … e …
4
filogenético, estrutural e funcional
A que subgrupo pertencem os Sigma ECF? Que subunidade falta a este grupo e qual é a consequência disso?
IV
* Falta Sub 1
* Reconhecimento por nº menor de promotores em relação ao sigma 70 (grupos I, II, III)
O fator sigma ECF apenas apresenta as subunidades … e … . Desta forma, a ativação de genes é mais …
- 2 e 4
- fina/específica
O grupo … de fatores sigma 70 é mais …, enquanto que os grupos … têm funções mais …
- 1
- geral
- 2-4
- específicas
Ao contrário do grupo … do fator sigma 70, os grupos … são controlados por …
- 1
- 2-4
- fatores anti-sigma
Têm um controlo mais fino da sua atividade transcriptacional
Os fatores sigma-ECF são responsáveis pela resposta a sinais em que partes da cell?
A que sinais respondem?
- membrana celular
- periplasma
- ambiente extracelular
Misfolding das purinas (?), choque térmico, etc
Os sigma-ECF regulam a síntese de ….
proteinas membranares/ secretadas
Os fatores sigma ECF estão envolvidos em papeis biológicos como:
- resposta a stress pelo invólucro
- transporte de ferro
- stress oxidativo
- resposta geral ao stress
Sigma E é sinónimo de Sigma …
ECF
Sigma E está associado a que processo bacteriano?
Em que bactérias?
Virulência
M. tuberculosis, E. coli e S. typhimurium
Na ausência de stress, como se encontra o fator sigma-ECF?
Inibido por fatores anti-sigma específicos.
Na regulação do stress da sup. celular, os fatores sigma … são regulados por … . Onde se encontra a codificação para estes últimos?
- ECF
- anti-sigma específicos
Nos mesmos operões que os fatores ECF-Sigma
Em E. coli, o fator sigma …, é responsável por responder a distúrbios de …
- E
- Proteínas extramembranares (OMP) (misfolded/unfolded)
Mutações em genes regulados por sigma E podem resultar:
Morte
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Sigma E transcreve para imensas … responsáveis por:
Enzimas
* Síntese e transporte de fosfolípidos, ácidos grodos, lipopolissacarídeos e oligossacarídeos
* proteínas do invólucro
* ativação de genes responsáveis pelo transporte e montagem de LPS e OMPs na membrana extracelular
Descreve o mecanismo de regulação de sigma-E
- Stress na membrana extracelular
- OMP sofrem misfold -> aumento de terminais C no periplasma
- OMP misfolded ligam-se a proteases -> degradam RseA ligado a RseB
- libertação do RseA e sigma E (complexo)
- RseA-SigmaE é degradado libertando o Sigma-E
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A libertação de anti-sigma é despoletada pelo aumento de terminais C
RseA e RseB são exemplos de regulação … do sigma-E
negativa
