Recombinación VDJ Flashcards
Para que sirve la secuencia señal de recombinación y donde se encuentran?
La secuencia señal de recombinación será la encargada de unir a los segmentos VDJ entre ellos
Se encuentran en los extremos internos del DNA de V y J y en ambos lados del segmento D
Que cosas contiene la secuencia señal de recombinación?
Un heptamero (7) - Secuencia variable de nucleótidos (23 o 12) - Nonamero (9)
Cuáles son las características del heptamero y del nonamero?
Es una secuencia especifica de nucleótidos y siempre sera la misma en toda la cadena de DNA donde la encontremos
Puede ir de 3’ a 5’ o de 5’ a 3’
Que segmentos (V, D o J) tienen la secuencia variable de nucleótidos de 23? y cuales tienen el de 12?
Segmentos V y J tienen el de 23
Segmento D tiene el de 12
Cual de los segmentos V, D y J se uniran primero?
Los primeros en unirse son D con J
Explica el proceso de union entre D y J
Es el mismo para V con DJ
Las secuencias señales de ambos segmentos se unen
Se genera un loop que servira para eliminar contenido en medio de los segmentos que queramos unir
Las enzimas Rag-1 y Rag-2 eliminan el Loop y su contenido
Los segmentos D y J se unen
Sigue unir al segmento V con DJ
Que es la diversidad combinatoria?
Son todas las combinaciones que existen (Alfa con Beta; Cadena pesada con ligera) para saber cuantos TCR o BCR puede tener cada persona
Que otro mecanismo puede generar variabilidad además de las múltiples combinaciones que se pueden hacer entre cadenas?
Diversidad de unión
Que es la diversidad de unión?
Son enzimas que se encargan de modificar o colocar nucleótidos en las uniones de VDJ para generar una mayor variabilidad
Como se le llaman a los nucleótidos que fueron cambiados o sumados en la cadena de DNA a partir de la diversidad de unión?
Nucleótidos N y P
es la especificidad antigénica del anticuerpo hacia un antígeno (gran cantidad de variaciones para diferentes anticuerpos para protegernos de los variados antígenos)
idiotipo
el idiotipo está determinado por ___
el terminal variable de los dominios inmunoglobulina de las cadenas
en las células B tenemos 4 mecanismos de diversidad
recombinación somática
emparejamiento de varias cadenas ligeras con cadenas pesadas
diversidad de unión (adición de nucleótidos a través del TDT)
hipermutación somática: mutación de un solo punto en el idiotipo del anticuerpo
la recombinación somática ocurre en células ____
somáticas
en las células B ____ tenemos el ADN que codifican para las cadenas del anticuerpo
progenitoras
locus de la cadena pesada está compuesto con __ regiones
3 (VJD)
tenemos 2 tipos de cadena ligera
Kappa y lambda
el locus de la cadena ligera contiene ___ regiones
2 (VJ)
Durante la maduración del linfocito B inmaduro a maduro naive ocurre ____
proceso de diversidad
reordenamiento y recombinación somática
el reordenamiento de VDJ ocurre en las células ____ para cadena pesada
Pro-B
reordenamiento de VJ ocurre en células ____ para cadena ligera
Pre-B
todavía después de la recombinación somática siguen siendo células B ____
inmaduras
después de que se traduce el ARNm a proteínas, es decir la formación de las 2 cadenas el linfocito B inmaduro pasa a ser _____
maduro naive
orden del proceso de reordenamiento
reordenamiento DJ
reordenamiento VDJ
reordenamiento VDJ-C
si hay algo incorrecto en el reordenamiento se detendrá la ____ por un codón de paro
traducción
a la combinación de segmentos se le denomina
reordenamiento productivo
las enzimas ___ son las encargadas de cortar el loop formado por RSS y el ADN intermedio innecesario
rag-1 y rag-2
RSS son
segmentos de señal de recombinación
para hacer la recombinación somática para unir los segmentos
la recombinación somática solo funciona si se cumple la regla de __
explica
12/23 del RSS de los dos segmentos que se unirán
dentro de las enzimas que participan en la recombinación somática tenemos a las TDT
que se encargan de agregar nucleçotidos NP en las uniones VDJ
a la adición de nucleótidos NP en las uniones de VDJ se les denomina
diversidad de unión
diversidad de unión ocurre durante _____
el proceso de reordenamiento de los segmentos del gen de la cadena
la diversidad de unión ocurre de manera ____ es decir sin ninguna secuencia complementaria
aleatoria
la ___ de manera funcional en los linfocitos B efectores se le denomina maduración de la afinidad
hipermutación somática
la hipermutación somática ocurre en la región ____
variable
el cambio de isotipo ocurre en la región ____
constante
cambio de isotipo ocurre en las células B ____
efectoras
el cambio de isotipo se le denomina de manera genética _____ y ocurre en el ____
recombinación dirigida
ADN
gracias al ___ la célula sabrá si el anticuerpo generado será secretado o estará anclado a la membrana
splicing alternativo
los RSS está formados por 3 elementos
heptámero (constantes)
nucleótidos variables (12 o 23)
nonámero (constantes)
los nucleótidos del heptámero y nonámero son constantes solo cambia la ____
direccionalidad 5’ o 3’
la caja V tiene (delante/detrás) el RSS
Cómo está conformado el RSS
delante
heptámero
23 nts
nonámero
la caja D tiene (detrás/delante) el RSS
cómo está conformado
detrás y delante
9-12-7 [D] 7-12-9
la caja J tiene (detrás/delante) el RSS
conformación
detrás
9-23-7
