Quiz Secuenciación Flashcards
¿Qué es la pirosecuenciación?
Método basado en monitorización a tiempo real de la síntesis de ADN
¿Cómo se llama el sistema de Roche para pirosecuenciación?
GS FLX
¿Cómo se fragmenta el DNA para pirosecuenciación?
Por nebulización
¿Modo de amplificación para pirosecuenciación
Por emulsión
A qué se refiere One Fragment?
A que en cada esfera creada se guarda una lectura de ADN
Ventajas de la pirosecuenciación
Puede secuenciar mucho más que Sanger en menor tiempo, no son necesarios los geles, marcadores fluorescentes o ddNTP’s
Desventajas de la pirosecuenciación
Existe perdida de precisión en regios homopoliméricas
¿En qué consiste Illumina?
Secuenciación por síntesis de arrays de una sola molécula con terminadores reversibles
¿Quienes crearon Illumina?
Shankar Balasubramian y David Klenerman
¿Cuando fue creado Illumina?
2007
¿Para que fue creado Illumina?
Para secuenciar genoma de pacientes africanos y asiaticos
Ventajas de Illumina
es muy rápido y barato, cuesta 0.001 por 1000 pb
¿Cómo se hace Illumina?
- Fragmentacion del DNA
- Seleccion de fragmentos
- Attachment of adapters
- Apply to flowcell
- Cluster generation
- Sequencing by synthesis
¿Qué es SOLiD?
Metodo de Life de gran precisión y exactitud, permite que se lean cientos de millones de billones de pequeñas secuencias
Ventajas de SOLiD
Costo reducido. 0.0001/base. Capacidad incrementada