Proteomik & Metabolomik Flashcards
Was ist ein Proteom?
gesamtes Set von Proteinen, das von einem Genom, Gewebe, einer Zelle oder eines Organismus exprimiert wird
Wodurch steigt die Komplexität des Proteoms?
- Alternative Promotoren
- Alternatives Splicing
- mRNA editing
- posttranslationale Modifikationen
- Transkriptionsfaktoren
- mRNA (in-)Stabilität
- Ribosomenaktivität
- Protolytischer Abbau
Welche Aminosäuren haben aliphatische (umpolare) Seitenketten?
Glycin, Alanin, Prolin, Valin, Leucin, Isoleucin, Methionin
Welche Aminosäuren haben ungeladenen, polare Seitenketten?
Serin, Threonin, Cystein, Asparagin, Glutamin
Welche Aminosäuren haben geladene, polare Seitenketten?
Lysin (+), Arginin(+), Histidin, Aspartat (-), Glutamat (-)
Welche Aminosäuren haben aromatische Seitenketten?
Phenylalanin, Tyrosin, Tryptophan
Wie entsteht eine Peptidbindung?
durch Kondensation zweier Aminosäuren (unter Energieaufwand)
Was ist und was bewirkt der partielle Doppelbindungscharakter?
N-Atom steht in Konjugation zur Carbonylgruppe
Einschränkung der Drehbarkeit um die C-N-Achse
Was ist die RNA-Prozessierung?
Introns werden herausgeschnitten, Exons miteinander verspleißt
Wofür codiert jeweils ein Exon?
für eine Proteindomäne
Welche posttransnationalen Modifikationen gibt es?
kovalente Modifikation der AS-Seitenketten
Umordnung des Peptidrückgrads
Proteinphosphorylierung (Signale)
Welche Histon-Modifikationen gibt es?
Phosphorylierung
Acetylierung
Methylierung
Welche Rolle spielt Ubiquitin?
Protein wird damit markiert, tritt somit in das Proteosom ein und wird abgebaut
Welche Färbemethoden gibt es zur Visualisierung von Proteinen?
Silberchlorid
Floureszenzfarbstoffe
Coomassie
Wie funktioniert ein Western Blot?
Proteine in SDS-Gel auf Membran
mit spezifischen primären Antikörpern
sekundäre Antikörper mit konjugiertem Enzym: dieses setzt Substrat zu Farbstoff/Lichtsignal um
hochsensitive Kameras
