Proteinkemi och bindningar Flashcards
Vilken typ av bindning utgör en vätebindning?
Dipol-dipol
Vilken typ av bindningar håller samman sekundärstrukturer i proteiner?
Vätebindningar
Naproxen är en så kallad non-steroid anti-inflammatory drug. Den är en karboxylsyra med ett pKa på 4.2 och har en löslighet i vatten vid pH 7 på 0.016 gram per liter. Om vi sänker pH från neutralt pH till pH 2.0, hur kommer gruppens löslighet i vatten då att påverkas?
Gruppens löslighet i vatten minskar om pH-värdet går från neutralt till 2.0
Hydrofoba ytor vill minska sin exponering mot vatten så långt det är möjligt vilket benämns den hydrofoba effekten. Vilken termodynamisk kraft driver den hydrofoba effekten?
Entropi
Proteiners sekundärstrukturer hålls samman av vätebindningar
Hur skapas dessa?
Dipol-dipol interaktionen mellan amidprotoner och karbonylsyran
Vad kallas reaktionen där en aminogrupp och en karboxylsyra reagerar och bildar en amid?
Kondensationsreaktion
Vilka av nedanstående påståenden är korrekta?
Fosfataser tar bort en fosfatgrupp
Disulfidbryggor är kovalenta
En fosforylering av ett enzym är alltid aktiverande
Lysiner kan acetyleras
Acetyleringar av histoner gör gener mer tillgängliga för transkription
Disulfidbryggor är kovalenta
Fosfataser tar bort en fosfatgrupp
Lysiner kan acetyleras
Acetyleringar av histoner gör gener mer tillgängliga för transkription
Disulfidbryggor är många gånger en viktig del för att ett protein ska bli funktionellt. Dessa bildas under oxiderande betingelser och skapas därför inte i cytosolen där miljön är reducerande. Vilken eller vilka av dessa aminosyror har möjligheten att bilda disulfidbryggor?
Cystein är den enda aminosyran som kan bilda disulfidbryggor.
Vilken typ av glukosylering använder aminosyrorna Serin, Threonin och Tyrosin?
O-glykosylering
I vilket av nedanstående proteiner är glycin och prolin vanligt förekommande?
Kollagen Myosin Glukokinas Lysosym Aktin
Kollagen
Vilka av nedanstående påståenden är korrekta?
Fosfataser tar bort en fosfatgrupp
Disulfidbryggor är kovalenta
En fosforylering av ett enzym är alltid aktiverande
Lysiner kan acetyleras
Acetyleringar av histoner gör gener mer tillgängliga för transkription
Disulfidbryggor är kovalenta
Fosfataser tar bort en fosfatgrupp
Lysiner kan acetyleras
Acetyleringar av histoner gör gener mer tillgängliga för transkription
Vilken typ av icke kovalenta interaktioner kan ske mellan följande par aminosyror (frågan avser dess sidokedjor).
Isoleucine och valin Glutamat och lysin Tyrosine och treonin Alanin och alanin Serin och threonin Arginine och aspartat
Isoleucine och Valin - Van der Waals (opolära, icke-laddade)
Glutamat och Lysin - Jonbindning (laddade)
Tyrosine och Treonin - Vätebindning (Har OH-grupper, gör vätebindningar)
Alanin och Alanin - Van der Waals (Sig själv)
Serin och Threonin - Vätebindning (Har OH-grupper, gör vätebindningar)
Arginine och Aspartat - Jonbindning (Laddade)
Vilken typ av glukosylering använder aminosyrorna Serin, Threonin och Tyrosin?
O-linkad glykosylering
Vilken laddning har följande aminosyrors sidokedjor vid neutralt pH?
Lysin Aspartat Histidin Valin Fenylalanin
Lysin - Positiv Aspartat - Negativ Histidin - Neutral Valin - Neutral Fenylalanin - Neutral
Vilken typ av icke kovalenta interaktioner kan ske mellan följande par aminosyror (frågan avser dess sidokedjor).
Isoleucine och valin Glutamat och lysin Tyrosine och treonin Alanin och alanin Serin och threonin Arginine och aspartat
Isoleucine och Valin - Van der Waals Glutamat och Lysin - Jonbindning Tyrosine och Treonin - Vätebindning Alanin och Alanin - Van der Waals Serin och Threonin - Vätebindning Arginine och Aspartat - Jonbindning
Jonbindningar - då de är laddade
