PROTEINI I AMINOKISELINE Flashcards

1
Q

Nabroji 5 uloga proteina.

A
  • strukturni elementi
  • katalizatori
  • prijenos i pohrana drugih molekula
  • prijenos impulsa
  • kontrola rasta i diferencijacija
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Koja su ključna svojstva proteina? (4)

A
  • građeni od monomera aminokiselina
  • funkcijske skupine (alkoholi, tioli, tioeteri…)
  • međusobno djelovanje ili djelovanje sa drugim biološkim makromolekulama
  • kruti ili fleksibilni
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Po čemu se međusobno razlikuju bočni ogranci aminokiselina? (5)

A
  • oblik
  • naboj
  • sposobnost stvaranja vodikovih veza
  • hidrofobnost
  • kemijska reaktivnost
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Koji je bočni ogranak glicina [Gly, G]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - atom vodika (alifatski)
  • najjednostavnija aminokiselina
  • optički neaktivan
  • akiralna molekula
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Koji je bočni ogranak alanina [Ala, A]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH3 (alifatski)
  • nepolarna
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Koji je bočni ogranak valina [Val, V]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH(CH3)2 (alifatski)
  • hidrofobnost
  • unutarnji dijelovi makromolekularnih struktura
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Koji je bočni ogranak leucina [Leu, L]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH(CH3)2 (alifatski)
  • hidrofobnost
  • izomer izoleucina
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Koji je bočni ogranak izoleucina [Ile, I]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH(H3C)CH2CH3 (alifatski)
  • dodatni stereogeni centar
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Koji je bočni ogranak metionina [Met, M]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH2SCH3
  • tioeterska skupina (- S -)
  • AUG kodon –> start za translaciju proteina s mRNA na ribosomima
  • N-terminalni kraj proteina tijekom translacije
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Koji je bočni ogranak prolina [Pro, P]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH2CH2- (alifatski)
  • alifatski bočni ogranak spojen je s alfa–ugljikovim atomom i s amino-skupinom
  • arhitektura proteina – ograničavanje konformacijskih mogućnosti
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Koji je bočni ogranak fenilalanina [Phe, F]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2-aromatski prsten
  • potpuno hidrofoban
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Koji je bočni ogranak tirozina [Tyr, Y]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2-aromatski prsten-OH
  • aromatski prsten s reaktivnom hidroksilnom skupinom
  • manje hidrofoban od fenilalanina
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Koji je bočni ogranak triptofana [Trp, W]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2- INDOLSKA SKUPINA- aromatski prsten
  • manje hidrofoban od fenilalanina
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Koji je bočni ogranak serin [Ser, S]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2OH (polarni nenabijeni)
  • hidrofilniji i reaktivniji od ala i val
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Koji je bočni ogranak treonina [Thr, T]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH(OH)CH3 (polarni nenabijeni)
  • hidrofilniji i reaktivniji od ala i val
  • dodatni aimetrični ugljikov atom
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Koji je bočni ogranak asparagina [Asn, N]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2C(O)NH2 (polarni nenabijeni)
  • amidna skupina
17
Q

Koji je bočni ogranak glutamina [Gln, Q]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH2C(O)NH2 (polarni nenabijeni )
  • amidna skupina
18
Q

Koji je bočni ogranak cisteina [Cys, C]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2SH (polarni nenabijeni )
  • spajanje tiolnih skupina: disulfidni mostovi
  • strukturno sličan serinu
19
Q

Koji je bočni ogranak lizina [Lys, K]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH2CH2CH2NH3+
  • hidrofilna aminokiselina baznih svojstava
    (pozitivno nabijena aminokiselina)
20
Q

Koji je bočni ogranak arginina [Arg, R]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH2CH2NHC(NH2+)NH2
  • hidrofilna aminokiselina baznih svojstava
    (pozitivno nabijena aminokiselina)
21
Q

Koji je bočni ogranak histidina [His, H]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2- imidazolska skupina
  • hidrofilna aminokiselina baznih svojstava
    (pozitivno nabijena aminokiselina)
22
Q

Koji je bočni ogranak asparaginske kiseline (ASPARTAT) [Asp, D]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2COO-
  • aminokiselina s kiselim bočnim ogrankom (negativno nabijena aminokiselina)
23
Q

Koji je bočni ogranak glutaminske kiseline (GLUTAMAT) [Glu, E]?
Koja su njegova svojstva?

A
  • BOČNI OGRANAK - - CH2CH2COO-
  • aminokiselina s kiselim bočnim ogrankom (negativno nabijena aminokiselina)
24
Q

Nabroji aminokiseline esencijalne za čovjeka. (9)

A
  • histidin
  • izoleucin
  • leucin
  • lizin
  • metionin
  • fenilalanin
  • treonin
  • triptofan
  • valin
25
Q

Koja su svojstva aminokiselina? (4)

A
  • dipolarna ionska struktura
  • nehlapljive kristalne tvari
  • dosta dobro topljive u vodi – donor ili akceptor protona: neutralizacija i baza i kiselina! => puferska svojstva
  • oblik aminokiseline u otopini ovisi o pH
    (stupanj ionizacije mijenja se obzirom na pH otopine)
26
Q

Što je izoelektrična točka?

A

Izoelektrična točka (pI) je pH otopine pri kojem je neto naboj molekule jednak nuli.

27
Q

O čemu ovisi neto naboj aminokiselina, peptida i bjelančevina?

A

pH vrijednosti otopine

28
Q

Koja su svojstva peptidne veze?

A
  • aminokiseline vezane peptidnom vezom (veza između alfa amino skupine jedne aminokiseline i alfa karboksilne skupine druge aminokiseline
    SVOJSTVA:
  • otporna na hidrolizu (proteini kinetički stabilni)
  • planarna jer veza C-N ima karakter dvostruke veze
  • svaka peptidna veza sadržava donor za vodikovu vezu (NH-skupinu) i akceptor za vodikovu vezu (CO-skupinu)
  • nije nabijena
29
Q

Što se događa sa aminokiselinom ako je pH ispod ili iznad pI?

A

Ispod izoelektrične točke aminokiseline adiraju protone i stvaraju katione, a iznad izoelektrične točke se pretvaraju u anione.

30
Q

Opiši primarnu strukturu proteina.

A
  • slijed aminokiselina u polipeptidnom lancu
31
Q

Što je sekundarna struktura proteina i koje pravilne strukture ovdje nalazimo nalazimo?

A
  • komformacije koje poprimaju lokalni dijelovi polipeptidnog lanca

Sekundarne strukture:
alfa uzvojnice
beta naborane ploče
omega omče
okreti

32
Q

Opiši alfa uzvojnicu i beta niti.

A

U alfa uzvojnici se polipetidni lanac zavija u čvrsto pakiranu nit unutar koje je CO- skupina svake aminokiseline povezana vodikovom vezom sa NH-skupinom svake četvrte aminokiseline.
Sve ALFA – uzvojnice u proteinima su desne.

U beta niti polipeptidni lanac je gotovo potpuno izdužen, dvije ili više ploča se udružuju sa vodikovim mostovima između NH i CO-skupina u beta listove, te niti mogu biti ANTIPARALELNE ili PARALELNE ili MIJEŠANE

33
Q

Opiši tercijalnu strukturu proteina.
Što su disulfidni mostovi i kako nastaju?

A
  • cjeloukupna trodimenzionalna komformacija nekog polipeptida
  • disulfidni mostovi - kovalentne disulfidne veze (S-S) koje povevezuje sulfhidrilne skupine cisteinskih ostataka
  • njihovo stvaranje uključuje oksidaciju cisteinskih sulfhidrilnuh skupina za što je potreban kisik
  • disulfidne veze stabiliziraju presavijenu komformaciju peptida
34
Q

Koja je razlika tercijalne strukture proteina topljivih u vodi i tercijalne strukture proteina koji se nalaze u hidrofobnoj okolini?

A

Proteini topljivi u vodi
- unutrašnjost–> hidrofobni bočni ogranci
- površina –> pretežno hidrofilne aminokiseline koje reagiraju sa vodenom okolinom

Kod proteina u hidrofobnoj okolini raspored je obrnut.

35
Q

Što je kvaterna struktura proteina?

A

Četvrta razina prostorne organizacije proteina koji imaju više polipeptidnih lanaca.
Polipeptini lanci nazivaju se podjedinice i kvaterna struktura se odnosi na prostorni razmještaj tih podjedinica i njihove interakcije.

36
Q

Opiši alfa keratin.

A
  • sastavni dio kose i vune (manji broj disulfidnih veza –> fleksibilnije) te kopita, rogova panđi (više S-S veza –> krute)
  • sastoji se od dviju desnih alfa uzvojnica uvijenih u lijevu superuzvojnicu ( alfa usukana uzvojnica)
  • međusobno povezane slabim interakcijama ( van der Walsove sile i ionske veze)
  • ## heptadno ponavljanje
37
Q

Opiši kolagen.

A
  • građevno i vezivno tkivo-koža, kosti, tetive, hrskavice, zubi
  • izvanstanični protein, štapićasta molekula
  • tri polipeptidna lanca; 1000a.k.; svaka treća aminokiselina je glicin
  • nema vodikovih veza duž lanca – stabilizacija steričkim odbijanjima bočnih ogranaka prolina i hidroksiprolina
  • po 3 spirale se smataju u trostruku uzvojnicu pomoću vodikovih veza