Proteine Flashcards
Care este procentul de proteine din greutatea uscata a celulelor?
50%
Care este impartirea proteinelor pe structura chimica?
proteine simple proteine conjugate
Ce grupari prostetice putem gasi in proteinele conjugate + ce proteine sunt alea?
Hem - hemoglobina, Mioglobina, citocromi, catalaza, peroxidaza Coenzime - succinat dehidrogenaza, transaminazele Metale - feritina, ceruloplasmina Acizi nucleici Lipide- lipoproteine Zaharuri- imunoglobuline, colagen
Clasificare proteine dupa marime si forma?
Proteine globulare Proteine fibrilare
Proprietati proteine globulare
forma sferica compacta de regula intracelulare ( citocromul C; HG, IG)
Proprietati proteine fibrilare
insolubile in apa extracelulare rol de sustinere miozina, colagen, elastina
Proteine cu rol de transport?
albuminele; hemoglobina transferina
In structura polipeptidica, legatura polipeptidica are caracter? Ce induce acest lucru?
caracter partial de dubla legatura -> se restrange numarul de conformatii pe care proteinele le pot adopta
Ce configuratie au cei doi atomi de carbon alfa?
trans -> aceasta conformatie se respecta si la O fata de H
Ce legaturi induc structura secundara a proteinei?
legaturile de H => proteina este cea mai stabila atunci cand dispune de cele mai multe legaturi de H ( atat inter cat si intra catenare)
Care sunt cele 2 structuri propuse de Pauling si Corey?
Structura de alfa helix Structura beta - foaie pliata
Cine formeaza structura de alfa helix a proteinei?
legaturile de H dintre CO si NH -> fiecare AA formeaza cel putin 2 legaturi de H
Cum sunt legaturile de hidrogen in raport cu axul moleculei/
Paralele
Care este sensul rasucirii in alfa helix?
de la stanga la dreapta -> elice dreapta
Care este pasul elicei in alfa helix proteic?
5.4 A -> 3.6 AA
Care este diametrul elicei in alfa helix proteic?
10.1 A
Cum sunt orientati radicalii aminoacizilor in cadrul helixului?
la exterior
Ce aa intrerup alfa helixul?
prolina si hidroxiprolina -> datorita rigiditatii nucleului glicina -> datorita flexibilitatii lanturilor polipeptidice
Ce aa destabilizeaza elicea?
Ile, Val, Leu -> prin volum Asp, Glu, Arg, Lys -> prin incarcare electrica
Care este singura proteina cu 100% alfa helix?
keratina
In ce consta structura Beta foaie plisata?
dispunere perpendiculara a legaturilor de hidrogen intre catene polipeptidice diferite? segmente ale aceleiasi catene, dispuse paralel
Care este cea mai stabila structura beta pliat?
antiparalela
Cum este stabilizata structura beta foaie plisata?
prin formarea de legaturi de hidrogen intre primul si al treilea aminoacid
Cum poate fi formata structura tertiara a aminoacidului?
Prin legaturi necovalente si legaturi covalente
Care sunt tipurile de interactiuni necovalente care se pot forma in structura tertiara?
legaturi ionice
legaturi de hidrogen
interactiuni hidrofobe
In ce consta interactiunile covalente in structura tertiara?
punti disulfurice intre resturile ce Cys
Cum se organizeaza proteinele globulare in cadrul structurii tertiare?
AA polari fara sarcina (Ser, Thr, Tyr, Cys, Asn, Gln) si cei incarcati electric (Asp, Glu, His, Arg, Lys) sunt orientati catre exterior, in contact cu apa, iar cei nepolari, hidrofobi, catre interiorul moleculei
Caror proteine este caracteristica structura cuaternara?
Cum se numesc acestea?
Proteinelor alcatuite din mai multe lanturi polipeptidice
acestea se denumesc proteine oligomere, lanturile individuale fiind denumite protomeri sau subunitati
Cum coopereaza protomerii intre ei?
Cum actioneaza factorii de denaturare a proteinelor?
temperatura, alcoolii, ureea, guanidina -> desfac legaturile de hidrogen
acizi tari, baze tari -> scindeaza legaturile ionice
Ce sunt hemoproteinele?
Proteine conjugate care contin in structura lor o grupare prostetica = HEM. legata de o parte proteica
Din ce este compus HEMUL B?
Fe 2+ legat coordonativ de protoporfina IX
Ce este protoporfina?
Un compus cu structura macrociclica, format din 4 nuclee pirolice, unite 2 cate 2 prin punti metinice, cu caracter aromatic ( confera culoarea rosie a sangelui)
Unde sunt pozitionati substituentii din cadrul protoporfirinei?
1,3,5,8 -CH3 (metil)
2,4 -CH2=CH2 (vinil)
6,7 -CH2-CH2-COOH (propionil)
Cum este protejat Fe din Hb?
De ce este protejat?
Aceasta este protejat pentru a nu permite oxidarea de la Fe 2+ la Fe 3+
Este protejat prin inconjurarea acestuia de o zona hidrofoba a lantului proteic
Care este valenta fierului in Hb?
Fe este pentacoordinativ in absenta oxigenului si hexacoordinativ atunci cand este prezent
Din ce este formata globina din mioglobina?
153 aa
75% structura alfa helix -> 8 regiuni helicoidale notate A,B,……..H separate de regiuni ne-elicoidale
Structura globinei din mioglobina?
structura extrem de compacta
la interiorul moleculei numai aa nepolari ( in mod evident cele doua exceptii sunt cele doua resturi de His)
Proprietatile metmioglobinei?
are o molecula de apa legata
oxigenarea si eliberarea acestuia se face fara modificarea valentei fierului
mai poate lega CO, NO, H2S
Ce aspect are curba de oxigenare a mioglobinei?
Presiune de semisaturare?
Presiune de saturare completa?
Ce greutate si cate molecule de Hb avem raportate la eritrocit?
34% din greutatea unui eritrocit
280 mil de molecule de Hb/ eritrocit
Ce structura are HbA1?
lant alfa = 141 aa
lant beta = 146 aa
Ce aspect are curba de oxigenare a hemoglobinei?
Presiune de semisaturare?
Presiune de saturare completa?
Care sunt cele 2 forme ale Hb si ce semnifica acestea?
forma tensionata - afinitate mica pentru O2
forma relaxata - afinitate mare pentru O2
Care sunt caracteristicile starii tensionate ale Hb?
Fe2+ se afla deasupra planului hemului cu 0.6 A
intre cele doua lanturi beta se afla o molecula de 2,3 BPG
intre cele 4 lanturi exista 8 legaturi ionice
Ce se intampla dupa legarea O2 de Hb?
Rotirea cu 15 grade a unui dimer alfa-beta, ceea ce induce rotatii/mutari ale tuturor lanturilor
expulzarea 2,3 BPG
Ce procent de CO2 este transportat sub forma de carbamat?
15% sub forma de carbamat
Ce enzima catalizeaza formarea de HCO3 ?
anhidraza carbonica
Cum se formeaza carbamatul?
Ce este efectul Bohr?
relatia dintre legarea O2, CO2 si H+
Cum va fi deplasata curba daca presiunea CO2 este mare?
curba de oxigenare va fi deplasata spre dreapta
Cum este deplasata curba hb in absenta BPG?
spre stanga, pierzandu-si aspectul sigmoidal
-> lucru evident in cazul HbF
P50 HbF = 20 mmHg
Ce procent de Hb este glicozilata?
In ce caz acest procent creste? CE reflecta aceasta crestere?
5-7% din Hb este glicozilata
Concentratia de Hb glicozilata reflecta concentratia de glucoza din urma cu 6-10 saptamani
Proprietati HbS?
inlocuire a restului de Glu din pozitia 6 a lantului beta cu Val
migreaza mai lent la electroforeza
HbS neoxigenata are solubilitate mica
moleculele de Hb se leaga formand fibre si deformeaza eritrocitul care capata aspect de secera
Ce sunt citocromii?
Hemoproteine care transporta e- prin schimbarea valentei fierului
Ce rol au citocromii mitocondriali?
asigura transportul de electroni prin lantul respirator, proces cuplat cu sinteza de ATP
Cantitate proteine plasmatice pe dl?
7-8 g/dl
Care este prima metoda de separare a proteinelor plasmatice?
salefierea- precipitarea cu saruri neutre (NaCl, Na2SO4, MgCl2, MgSO4)
Cum se separa proteinele la salefiere?
Globulinele la semisaturatie -> au mai putine regiuni hidrofile, deci mai putine molecule de apa de hidratare
Albuminele la saturatie -> au mai multe regiuni hidrofile
uita te si tu peste asta
Ce life span are albumina?
20 de zile
Ce cantitate de albumina gasim in organism?
3,4-3,7 g/dl
60% din total
Proprietati structurale ale albuminei?
585 AA
17 punti disulfurice
PI=5
Unde si in ce cantitate este sintetizata albumina?
in ficat -> 20g/zi
Unde este catabolizata albumina?
in toate tesuturile, mai ales in ficat, rinichi si GI
Cate locusuri de legare are albumina pentru substantele transportate?
10 locusuri de legare pentru substantele transportate, in mod normal fiind ocupate, in medie 7
capacitate de fixare a albuminei este ………………. si ………………….
competitiva
saturabila
Cum se mai numeste antigenul complet si care sunt proprietatile acestuia?
imunogen
Ag care declanseaza raspunsul imun si poate reactiona cu Ac
Cum se mai numeste antigenul complet si care sunt proprietatile acestuia?
haptena
Ag cu masa moleculara mica, care nu initiaza un raspuns imun decat daca este cuplat cu o molecula purtatoare, dar care poate reactiona cu Ac specific
Proprietatile antigenice ale compusilor organici?
proteine- cele mai antigenice
glucide si lipide- antigenice numai daca sunt legate de proteine
acizi nucleici- slab antigenici
Care este diferenta structurala dintre Ac produsi si receptori?
capatul C-terminal al lantului H
receptor: secventa hidrofoba
Ac: secventa hidrofila
Unde se duc plasmocitele ( in functie de ce Ac secreta acestea) >
IgM - raman in ganglionii limfatici si in splina
IgG- migreaza in maduva osoasa
IgA- migreaza in tesutul limfatic intestinal
ionice
hidrofobe
var der Waals
Prin ce legaturi se face complexul Ag-Ac?
Cati AA are un lant heavy?
440 de AA
Cati AA are un lant light?
220 AA
Cum se numeste enzima ce sectioneaza molecula Ac in 2 fragmente identice?
Cum se numesc cele doua fragmente?
papaina
Fab- fragment antigen binding
Fc- fragment cristalizabil
Unde se afla regiunea variabila a Ig-ului?
Cat ocupa aceasta din lant?
la capetele N-terminale ale celor 2 lanturi
cca 1/2 din lantul L
cca 1/4 din lantul H
Cate regiuni constante exista pe lantul L/H?
ce proprietati au acestea?
L -> o singura regiune constanta C -> aminoacizii Ig din aceeasi familie sunt identici
H -> 3 regiuni constante ->
- CH1
- CH2-> permite legarea moleculelor de oligozaharide (Ig sunt oligoproteine)
CH3-> permite legarea la suprafata macrofagelor, bazofilelor sau mastocitelor
Structura Ig uri?
Proprietati IgM?
3% din totalul de Ig plasmatice
raspunzatoare de raspunsul imun primar
predomina intravascular, regasindu-se in cantitati mici in secretii si colostru
5 (nu 10) situsuri de legare a Ag
traverseaza bariera vasculara, aparand in focarele inflamatorii
activeaza complementul
Proprietati IgG?
75-80% din totalul de Ig plasmatice
prezente in limfa, lichid interstitial
raspunzator de raspunsul imun secundar
incepand cu saptamanile 18-20 de sarcina sunt transportate activ prin placenta catre fat
activeaza complementul
Proprietati IgA?
7-15% din totalul de Ig plasmatice
prezente in sange si secretii (colostru)
pot fi monomeri/dimeri
nu activeaza complementul
Proprietati IgE (reagine)?
unele sunt circulante, altele sunt fixate de suprafata mastocitelor sau bazofilelor
implicate in alergii
mediaza raspunsul antiparazitar
sunt monomeri
nu activeaza complementul
Proprietati IgD?
0,2% din totalul Ig plasmatice
prezente pe suprafata limfocitelor B, in structura receptorilor
sunt monomeri
functie nu foarte bine cunoscuta
Ce procent este complementul din totalul proteinelor serice?
10% din totalul proteinelor serice
