Protein targeting and vesicular transport Flashcards
Action potential
nervimpulsen, färdas genom dendrit och axon
Depolarisering
Spänningsstyrd kanal öppnas, släpper in Na+ joner in i cellen, potentialen över membranet blir mindre negativ
Repolariserin
Spänningsstyrd kanal öppnas, släpper ut K+ ur cellen, spänningen blir negativ igen
Resting state (spänning)
ca -60 mV
Threshold potential
ca -40mV
Voltage gated Ca2+ channels
I nervterminal, översätter elektrisk signal till kemisk signal
Neurotransmitter/signalsubstans
Kemisk signal mellan neuroner (över synaps)
Transmitter-gated jonkanaler
Sitter på mottagarcellen, då neurotransmittorn binde rin till receptorn öppnas kanal för Ca2+ och Ca2+ strömmar in i cellen. Detta leder till förändring i membranpotential och nervsignal förs vidare.
Selective serotonin-reuptake inhibitors (SSRIs)
T ex antidepressiva, blockerar Na+-driven symport av serotonin, dvs att serotonin ej tas upp igen av presynaptic cell och mer serotonin hamnar kvar i synapsen
GABA
Lugnande transmittorsubstans
Benzodiazepines
Biner till GABAstyrda Cl- kanaler, kanalerna blir lättare att öppna av GABA. Neuronerna blir då mer känsliga för den lugnande transmittorsubstansen GABA
Protein signal sequence
Signalsekvens länkat på proteinet, tagg som visar vart proteinet ska. Fysiska egenskaper på sekvensen bestämmer var proteinet hamnar, tas ofta bort när det kommit fram förutom om det ska till nukleus .
Nuklear import receptor
Känner igen nukleär localization signal på väckta protein som ska in i nukleus och binder till proteinet. Rör sig mot cytosolic fibrils. När proteinet är färdigfraktat och inne i nukleus kan receptorn åka ut igen genom poren och återanvändas
Cytosolic fibrils
Interagerar med nuklear import receptor bundet till protein. Drar in receptor och väckat protein in i nukleus
Nuklear basket
På insidan av nuklear pore
Nuklear pore complex proteins
I poren, meshwork av olika proteiner som ger gelliknande struktur
Protein translocators
Vid transport genom (dubbel)membran
- Signalsekvens på oveckat protein binder till receptor på yttersta membranet
- Receptorn är kopplad till protein translator
- Receptorn och translocatorn flyttar sig längs yttermembranet tills translator på innermembranet hittas
- Proteinet transporteras genom båda membranen
- chaperoner veckar proteinet när det väl är inne i organellen och signalsekvens klipps bort
Signal recognition particle (SRP)
Binder till Er signalsekvens på protein som transltareas och ribosomen
- proteinsyntesen saktas ned och SRP binder in till SRP-receptor i (rough) ER-membran
- ribosomen flyttar sig till translatorn på ER-membranet och släpper SRP
- proteinsyntesen fortsätter men proteinet syntetiseras in i ER-lumen
- signalsekvens klyvs av (blir kvar i translatorn onär proteinet klyvs av och släpps in i ER-lumen, flyttas till membranet där det bryts ned)
Transmembranprotein (single pass)
Proteinet har en hydrofobisk stop-transfer sekvens någonstans i kedjan, denna fastnar i translokatorn. Proteinet syntetiseras klart och det färdiga proteinet flyttas från translokatorn till membranet. N-terminal hamnar i ER-lumen och C-terminal hamnar i cytosol.
Transmembranprotein (double pass)
Start-transfer-sekvensen är inte i början av proteinet utan någonstans i proteinkedjan. Denna hamnar först i translokatorn och proteinet fortsätter att syntetiseras in i ER tills stop-transfer-sekvens hamnar i translokatorn.
Vesicular transport
Vesiklar knips av från membran (från ER), fraktas till Golgi och fraktas sedan vidare till rätt organell eller ut ur cellen.
Viktigt att vesiklarna (och ämnena i) hamnar rätt, kan ske genom specifika membran på organell och vesikel.
cargo receptor
Sitter i membran, här kan proteinet som ska fraktas binda in.
Adaptin
Fäster på cargo receptor då protein bundit in till receptorn, hit kan sedan clathrin binda.
Clathrin
Proteinfamilj, binder till adaption på receptor, hjälper till att forma en vesikel och täcker sedan hela vesikeln då den knips av. Clathrin lossnar sedan då vesikeln är i cytosolen
