PROSIT 2 Flashcards

1
Q

Définie “métabolisme”.

A

Somme des réactions chimiques qui se déroulent dans un organisme vivant. Dégradation des nutriments et production de composés dans une cellule. Ces réactions chimiques fournissent l’énergie et créent des substances qui maintiennent la vie.

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2
Q

Quelles sont les 2 types de voies métaboliques ?

A

Cataboliques : Décomposition des macromolécules en éléments plus simples, ce qui crée de l’énergie.

Anaboliques : Production de macromolécules en combinant des éléments plus simples, ce qui demande de l’énergie.

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3
Q

Quelles réactions sont exergoniques ?

Quelles réactions son endergoniques ?

A

Exergoniques : Réactions cataboliques, car elles produisent + d’énergie qu’elles n’en consomment

Endergoniques : réactions anaboliques, car elles consomment + d’énergie qu’en produit.

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4
Q

Explique ce que fait l’anabolisme.

A

Elle utilise l’énergie (ATP) produite par le catabolisme pour la séparer en ADP + G + énergie.

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5
Q

Qu’est-ce qu’une voie métabolique ?

A

Dans une cellule, suite ordonnée de réactions chimiques catalysées par des enzymes.

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6
Q

Explique la théorie des collisions. (2)

Quels sont les facteurs qui déterminent si une collision déclenchera une réaction ou non ?

A
  • Il y a réaction chimique quand il y a liaisons chimiques formées ou rompues (atomes, ions ou molécules doivent entrer en collision).
  • Cette théorie explique comment les réactions chimiques se produisent et ce qui influencent la vitesse de leur déroulement.

FACTEURS :
- vitesse des particules qui entre en collision (+ vitesse de collision = + de chances de réactions)

  • énergie d’activation (chaque réaction demande un niveau minimum d’énergie)
  • configuration chimique spécifique (particules doivent être bien orientées les unes par rapport aux autres)
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7
Q

Qu’est-ce qu’un enzyme ?

de quoi sont-elles composées ?

A

Enzyme : molécule, généralement protéique, qui catalysent les réactions de molécules spécifiques appelées substrats qui est transformé en produits durant la réaction enzymatique.

Certaines sont entièrement composées de protéines, mais la plupart sont formées d’une partie protéique (apoenzyme) et d’une partie non-protéique (cofacteur)

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8
Q

Qu’est-ce qu’un catalyseur ?

A

Substance qui peut accélérer une réaction chimique sans être elle-même modifiée de façon permanente.

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9
Q

Décris les 5 étapes d’une réaction enzymatique.

A
  1. Zone déterminée de la surface du substrat entre en contact avec une région spécifique de la molécule d’enzyme active (site actif).
  2. Complexe enzyme-substrat (composé intermédiaire) se forme. Enzyme oriente substrat afin d’avoir + de probabilité de réaction + d’efficacité des collisions.
  3. Molécule du substrat transformée par réarrangement, dégradation ou combinaison à un autre substrat.
  4. Produits (molécules de substrat transformées) se détachent de l’enzyme.
  5. L’enzyme libre de catalyser une nouvelle réaction avec nouveaux substrats.
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10
Q

De quelles manières les enzymes peuvent-ils déclencher une réaction ? (2)

A
  • Enzymes accélèrent réactions chimiques en diminuant leur énergie d’activation (donc + vitesse car + de molécules ayant énergie d’activation)
  • Accélèrent les réactions sans modifier chaleur (ce qui pourrait être crucial pour les systèmes vivants).
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11
Q

Qu’est-ce qu’un coenzyme ?

A

molécule organique non protéique associée à une enzyme, quelle active.

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12
Q

Qu’est-ce qu’un apoenzyme ?

A

La partie protéique inactive d’une enzyme qui doit être activé par une coenzyme.

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13
Q

Qu’est-ce qu’un cofacteur ?

Qu’est-ce qui le différencie d’un coenzyme ?

A

Partie non-protéique d’une enzyme qui peut être un ion métallique ou une molécule organique nommée coenzyme.

Le cofacteur est la partie non-protéique de l’enzyme qui est composé d’une molécule organique qui est la coenzyme.

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14
Q

Qu’est-ce qu’un holoenzyme ?

A

Enzyme entière et active constituée d’une apoenzyme et d’un cofacteur.

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15
Q

Qu’est-ce qu’un substrat ?

A

Substance modifiée par une enzyme pour former un ou plusieurs produits.

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16
Q

Qu’est-ce qu’un produit ?

A

Molécules de substrat transformées par l’enzyme.

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17
Q

Qu’est-ce que la dénaturation d’une enzyme ?

A

modification de la structure moléculaire qui rend l’enzyme non-fonctionnelle.

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18
Q

Nomme 4 facteurs qui influencent l’activité enzymatique.

A
  • température
  • pH
  • concentration du substrat
  • présence ou absence d’inhibiteurs. co
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19
Q

En quoi la température influence l’activité enzymatique ?

A

L’activité enzymatique augmente en fonction de la température jusqu’à l’atteinte d’une température optimale. Au delà de celle-ci, l’enzyme est dénaturée et inactivée.

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20
Q

En quoi le pH influence l’activité enzymatique ?

A

L’activité enzymatique augmente en fonction du pH jusqu’à l’atteinte d’une pH spécifique. Au delà, la vitesse de la réaction tombe rapidement à zéro.

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21
Q

En quoi est-ce que la saturation de la concentration de substrat influence l’activité enzymatique?

A

Concentration du substrat : Au fur et à mesure que la concentration des molécules de substrat augmente, la vitesse de la réaction augmente aussi jusqu’à ce que les sites actifs de toutes les molécules d’enzyme soient occupées. La vitesse maximale de la réaction est alors atteinte (plateau).

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22
Q

Nomme 2 types d’inhibiteurs.

Différencie-les.

A

Inhibiteurs compétitifs : occupent le site actif de l’enzyme et sont ainsi en compétition avec le substrat normal pour ce site.

Inhibiteurs non-compétitifs : ne font pas concurrence au substrat, car ils agissent sur une autre partie de l’enzyme (pas le site actif).

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23
Q

Qu’est-ce qu’une inhibition allostérique ? (2)

A

L’inhibiteur se lie à un site sur l’enzyme qui n’est pas le site actif du substrat et qui porte le nom de site allostérique.

Cette liaison provoque une modification de la forme du site actif, le rendant ainsi non-fonctionnel. L’activité de l’enzyme est alors réduite.

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24
Q

Est-ce que l’activité de l’inhibiteur non-compétitif es réversible ?

A

L’effet peut être réversible ou irréversible, selon que le site actif est capable ou non de reprendre sa forme d’origine.

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25
Q

Qu’est-ce que la rétroinhibition ?

Quel inhibiteur font de la rétroinhibition?

A

Les inhibiteurs non-compétitfs le font.

  • empêche la cellule de produire plus de substances qu’elle en a de besoin (pas de gaspillage des ressources chimiques).
  • Processus qui ressemble à une chaine de montage. Chaque étape est catalysée par une enzyme différente, ce qui donne le “produit final”.
26
Q

Qu’est-ce qu’une réaction d’oxydoréduction ? (3)

A
  • Oxydation : réaction quand atome/molécule perd des électrons. Réaction qui produit de l’énergie.
  • Réduction : acquisition d’un ou de plusieurs électrons.
  • Oxydation et réduction toujours ensemble. (quand 1 substance est oxydée, une autre est réduite) CE QUI DONNE la réaction d’oxydoréduction.
27
Q

Qu’est-ce que la phosphorylation ?

Nomme 3 types de phosphorylation.

A

Phosphorylation : l’addition de P à un composé chimique est appelée phosphorylation

3 TYPES :

  • La phosphorylation au niveau du substrat : quand un p est transféré d’un substrat à une molécule d’ADP (ADP + P = ATP)
  • La phosphorylation oxydative : c’est la création d’ATP par l’oxydation des transporteurs d’électron dans la chaine de transport des électrons
  • La photophosphorylation : production d’ATP par une succession de réactions d’oxydoréduction amorcées par les électrons d’un pigment, tel que la chlorophylle. N’a lieu que dans les cellules photosynthétiques.
28
Q

Quel est le but du catabolisme des glucides ? (2)

A

La dégradation des molécules de glucide pour produire de l’énergie.

Le glucose est le plus souvent utilisé comme source d’énergie par les cellules.

29
Q

Nomme deux types de processus qui sont utilisés par les cellules pour produire de l’énergie à partir de glucose.

A
  • La respiration cellulaire

- La fermentation.

30
Q

Nomme les 3 étapes de la respiration cellulaire.

A
  • glycolyse
  • Cycle de krebs
  • chaine de transport des électrons.
31
Q

Décris la glycolyse. (6)

4 étapes + 02 + phase intermédiaire

A
  1. 2 molécules d’ATP sont utilisées pour diviser une molécule de glucose à 6 carbones en 2 composés de 3 carbones. (3-PG et DHAP)
  2. les 2 composés à 3 carbones sont oxydés en plusieurs étapes en acide pyruvique
  3. Durant ces plusieurs étapes (2.), 2 molécules de NAD+ sont réduites en NADH qui est directement envoyé à la chaine de transport des électrons.
  4. (suite de 3) et 4 molécules d’ATP sont formés par phosphorylation du substrat, dont 2 qui seront réutilisés pour oxyder un autre glucose. (donc gain net de 2 molécules d’ATP pour chaque molécule de glucose oxydée).
  5. La glycolyse peut avoir lieu avec ou sans O2.
  6. L’acide pyruvique est transformé en acétyl-CoA. (phase intermédiaire entre la glycolyse et le cycle de krebs).
32
Q

Décris le cycle de krebs (3)

A

Produit de l’ATP par phosphorylation au niveau du substrat,

Libère du CO2.

Les transporteurs de la glycolyse et du cycle de krebs (NADH et FADH2) fournissent des électrons à la chaine de transport des électrons.

33
Q

Décris la chaine de transport des électrons (5)

A
  • Plus d’ATP produit que pendant la glycolyse et le cycle de Krebs par phosphorylation oxydative
  • 3 classes de transporteurs moléculaires: Flavoprotéine, Cytochrome (accepteur final) et Ubiquinone
  • Le NADH et le FADH2 ne sont pas insérés au même endroit dans la chaine de transport. (NADH arrive avant)
  • Force proton motrice:
  • Transport des H+ à l’extérieur de la membrane
  • Création d’un gradient de concentration vers l’intérieur de la membrane
  • Force proton motrice = h+ qui passent dans l’ATP-synthase = synthèse d’ATP
  • Oxygène = dernier accepteur
34
Q

Différencie la respiration aérobique et la respiration anaérobique.

A

Respiration aérobique : l’accepteur final d’électrons est l’O2 (organisme aérobie)

Respiration anaérobique : l’accepteur final d’électrons est une molécule inorganique autre que l’O2 (organisme anaérobie).

35
Q

Explique la fermentation.

Peut-elle se produire en présence d’O2 ?

Nomme 2 types de fermentation et leur produit.

A
  • la fermentation libère par oxydation l’énergie contenue dans les glucides, ou autres molécules organiques.
  • ne produit pas d’O2, mais peut se produire en sa présence.

2 TYPES

  • fermentation lactique : le NADH réduit l’acide pyruvique pour donner de l’acide lactique.
  • fermentation alcoolique : le NADH réduit l’acétaldéhyde (acide pyruvique converti) pour produire de l’éthanol.
36
Q

Quel est le rôle des lipases ?

A

Dans le catabolisme des lipides et des protéines, les microorganismes produisent des enzymes extracellulaires appelées lipases qui dégradent les lipides simples en leurs composants.

37
Q

Nomme deux enzymes qui dégradent les protéines ?

Pourquoi en a-t-on besoin ?

A
  • protéases
  • peptidases

elles dégradent les protéines en acides aminés qui peuvent alors franchir la membrane, chose qu’elles ne pouvaient faire avant, car trop volumineuses.

38
Q

Nomme 4 facteurs physiques de croissance bactérienne.

A
  • température
  • pH
  • humidité
  • pression osmotique
39
Q

Qu’est-ce que la température …

  1. minimale de croissance
  2. maximale de croissance
  3. optimale de croissance.
A
  1. Minimale : la température la plus basse à laquelle l’espèce peut se développer.
  2. Maximale : la température la plus élevée à laquelle l’espèce peut encore se développer.
  3. Optimale : la température à laquelle l’espèce croit le plus rapidement.
40
Q

Nomme 5 types de bactéries selon leur taux de croissance selon la température.

Quel est le type le plus courant ?

A
  • Psychrophiles (entre 0 et 15oC)
  • Psychotrophes (entre 0 et 35oC)
  • Mésophiles (entre 25 et 40oC) ** le + courant **
  • Thermophiles (45oC et +)
  • Hyperthermophiles (température optimale de 80oC)
41
Q

En quoi est-ce que le froid affecte les bactéries ? (2)

A

Froid : le taux de reproduction des microorganismes est plus faible à basse température.

Le nombre d’individu diminue de plus en plus. Ils tombent aussi en dormance.

42
Q

Quel est le pH optimal des bactéries ?

Quel est celui des mycètes ?

A

bactéries : généralement entre 6,5 et 7,5

mycètes : entre 5 et 6.

43
Q

Que sont les acidophiles ?

A

qui tolèrent remarquablement bien l’acidité.

44
Q

En quoi l’humidité est importante pour la croissance bactérienne ?

En quoi la pression osmotique est-elle importante ?

A

Humidité : les Microorganismes ont besoin d’eau pour se développer. l’eau est essentielle pour dissoudre les nutriments et permettre un métabolisme cellulaire actif.

pression osmotique : les microorganismes tirent presque tous les nutriments dont ils ont besoin des eaux environnantes, où ces nutriments sont dilués. (concentration environnement vs concentration dans la cellule bactérienne.

45
Q

PRESSION OSMOTIQUE :

Qu’est-ce que la solution hypertonique fait à la cellule ?

Qu’est-ce que la solution hypotonique fait à la cellule ?

A

Hypertonique : Concentration des soluté plus élevé dans l’environnement que dans la cellule bactérienne. l’eau dans la cellule traverse la membrane plasmique pour rejoindre la solution à forte concentration en solutés. perte d’eau entraine la plasmolyse.

Hypotonique : concentration des solutés plus faible que dans la cellule bactérienne. L’eau entre dans la bactérie et la fait gonfler. Certaines peuvent même exploser, d’autres sont protégées de cette explosion.

46
Q

Comment appelle-t-on les organismes qui sont bien adaptés à des conditions élevées en sel ?

Comment appelle-t-on ceux qui ont besoin de sel pour se développer ?

Ceux qui n”ont pas besoin d’une concentration élevée en sel, mais qui peuvent se développer tant qu’elle ne dépasse pas 2%.

A
  • Halophiles extrêmes.
  • Halophiles strictes.
  • Halophiles facultatifs.
47
Q

Qu’est-ce que la plasmolyse ?

A

Rétrécissement de la membrane plasmique de la cellule après une perte d’eau, due à la concentration en solutés qu’il y avait dans l’environnement.

48
Q

Nomme 7 facteurs chimiques de croissance.

A
  • Carbone (C)
  • hydrogène (H)
  • Oxygène (O)
  • Azote (A)
  • Phosphore (P)
  • Soufre (S)
  • Les oligoéléments (fer, cuivre, zinc, …)
49
Q

En quoi est-ce que le … affectent la croissance bactérienne ?

a) Carbone
b) Hydrogène
c) Azote
d) Phosphore
e) Soufre

A

a) Carbone : indispensable à la croissance, squelette structural de la matière vivante (moitié de la biomasse sèche d’une cellule bactérienne typique est composée de carbone)
b) Hydrogène : élément chimique le plus important de la cellule –> sert aux réactions d’oxydoréduction.
c) Azote : ADN, ARN, ATP nécessite azote pour leur synthèse.
d) Phosphore : Pour synthèse des acides nucléiques et phospholipides de la membrane plasmique. + Aide liaison phosphate de l’ATP.
e) Soufre : aide à Synthèse des acides aminés renfermant soufre et vitamines.

50
Q

Pourquoi est-ce que les oligoéléments sont importants pour la cellule ?

A

essentiels au bon fonctionnement de certaines enzymes, souvent en tant que cofacteurs.

51
Q

Différencie les microorganismes anaérobie stricte et anaérobie facultatif et anaérobie aérotolérants.

A

Anaérobie stricte : incapable d’utiliser le dioxygène, il est toxique, voir mortel pour eux.

Anaérobie facultatif : Ils s’adaptent à la quantité de dioxygène présent. Peuvent l’utiliser si présent.

Anaérobie aérotolérant : ne peut utiliser le dioxygène, mais le tolère bien.

52
Q

Nomme les 4 dérivés réactifs de l’oxygène.

A
  • Dioxygène singulet
  • Radicaux superoxyde
  • anion peroxyde
  • radical hydroxyde
53
Q

Nomme 6 milieux de culture.

En quelles conditions sont-ils les plus appropriés ?

A
  • Milieux synthétiques : milieu de culture dont on connaît exactement la composition chimique, qualitativement et quantitativement.
  • Milieux complexes : milieux naturels avec une composition indéterminée.
  • Milieux anaérobies : contiennent des ingrédients qui réagissent (dissous ou élimine) avec l’O2.
  • Milieux sélectifs : conçus pour inhiber la croissance des bactéries indésirables et stimuler celles des microorganismes recherchés.
  • Milieux différentiels : conçus pour faciliter la distinction entre colonies du microorganisme recherché et les autres colonies qui se développent sur la même boite de Petri.
  • Milieux d’enrichissement : semblables aux milieux sélectifs, mais on augmente le nombre de microorganismes recherchés afin que ces derniers forment des colonies observables.
54
Q

Quelle est la différence entre un milieu de culture et une culture ?

A

milieux de culture : préparation nutritive destinée à la croissance de microorganismes en laboratoire.

culture : Les microorganismes qui se développent et se multiplient dans ou sur un milieu de culture.

55
Q

Qu’est-ce qu’un inoculum ?

A

prélèvement de microorganismes introduits dans un milieu de culture en vue de leur croissance.

56
Q

Nomme la méthode d’isolement d’une culture bactérienne la plus courante.

Nomme deux façons de conserver une culture bactérienne.

A
  • Isolement : La méthode des stries.

Conservations :

  • Surgélation : Placer la culture microbienne pure dans un liquide en suspension et refroidir rapidement à des températures entre -50 et -95oC. Permet de décongeler et de faire croitre la culture même après plusieurs années.
  • Lyophilisation : Congeler rapidement (-54 à -72o) tout en éliminant l’eau en faisant un vide poussé. Récipient scellé sous vide. Microorganismes lyophilisés forment une poudre qui se conserve durant des années. Possible de réanimer.
57
Q

Nomme 2 modes de reproduction bactérienne.

A
  • SURTOUT Scissiparité : division en 2 cellules filles identiques.
  • Bourgeonnement : bactérie produit excroissance (bourgeon) qui grossit jusqu’à se séparer de la cellule mère une fois presque la même taille,
58
Q

Qu’est-ce que le temps de génération ? (2)

A

le temps que met une cellule à se diviser.

Varie d’un microorganisme à l’autre et en fonction des conditions du milieu, notamment la température.

59
Q

Nomme les 4 phases de la croissance bactérienne.

A
  • Phase de latence : période où cellules ne se reproduisent pas.
  • Phase de croissance exponentielle : cellules commencent à se diviser. Période où la reproduction cellulaire est la plus intense.
  • Phase stationnaire : période d’équilibre entre le nombre de bactéries qui meurent et le nombre de nouvelles bactéries –> population se stabilise.
  • Phase de déclin : nombre de bactéries qui meurent dépasse nombre de nouvelles bactéries. Phase qui dure jusqu’à ce que toutes les cellules meurent.
60
Q

Qu’est-ce que le taux de croissance ?

Se rapporte-t-il à la grosseur ou au nombre de cellules ?

A

Déf : le nombre de divisions par unité de temps.

Se rapporte au nombre de cellules, pas à leur grosseur.

61
Q

Qu’est-ce qu’un biofilm ?

A

mince couche visqueuse qui recouvre des colonies de microrganismes.

62
Q

Qu’est-ce qu’une culture bactérienne pure ?

A

Une culture qui ne contient qu’un seul type de bactéries.