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Microbiologie des eaux > Piézophiles et psychrophiles > Flashcards

Piézophiles et psychrophiles Flashcards

1
Q

Vrai ou Faux

Piézophile et Thermophile ont besoin d’adaptation contradictoire. Pourtant, il existe des m.o. qui sont les 2.

A

Vrai.

Comment??

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2
Q

Si j’augmente la pression, le volume ______ et la réaction _______ est favorisée.

A

diminue

vers les produits

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3
Q

Comment on appelle le principe qui dit que lorsque le volume augmente, la pression diminue et vice-versa?

A

Le Chatelier

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4
Q

À quoi réfère le préfixe baro-?

A

Au poids.

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5
Q

Vrai ou Faux

Les barophiles sont des m.o. qui vivent à haute pression.

A

FAUX.

On dit piézophile.

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6
Q

Vrai ou Faux

Lors de la décompression, le m.o. décline rapidement parce qu’il n’a pas le temps de s’adapter à la nouvelle pression.

A

FAUX

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7
Q

Pourquoi c’est faux?

Lors de la décompression, le m.o. décline rapidement parce qu’il n’a pas le temps de s’adapter à la nouvelle pression.

A

On observe un déclin progressif des m.o.

Donc ce n’est pas lié à la décompression rapide, mais aux activités métaboliques qui deviennent problématiques.

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8
Q

Vrai ou Faux

Les piézophiles sont souvent étudiés puisqu’ils comportent des intérêts alimentaires et sont faciles d’accès.

A

Faux.
(C’est n’importe quoi comme affirmation ahahah)
(Lol tu m’as tellement eu, j’étais genre hein c’est important pour l’alimentation hahahahaha)

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9
Q

Dire en ordre croissant de pression le nom des m.o.

A

Piézosensible
Piézotolérant
Piézophile
Piézophile obligatoire

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10
Q

À quelle température a lieu la transition de phase des membranes d’archées?

A

Entre -20 et -15 C
(\ /)
(. .)
C(‘’)(‘’)

(UN LAPIN)
(EDIT: ça fonctionne quand on écrit la réponse, mais une fois edité, c’est pus beau :’( )
Cute lapin ;)

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11
Q

À quelle température a lieu la transition de phase des membranes de bactéries?

A

Entre 40 et 50 C

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12
Q

La température optimale de croissance de E.coli est de 37C. Hors, sa transition de phase se trouve aux alentours de 45C. En quoi est-ce un problème?

A

La membrane est sous forme cristalline = pas d’échange et pas fluide.
La bactérie a besoin d’adaptations.

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13
Q

Que se passe-t-il avec les lipides membranaires et la fluidité quand on augmente la pression?

A

Compression des lipides, diminution de la fluidité

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14
Q

Que se passe-t-il avec la fluidité quand la température diminue?

A

Elle diminue aussi.

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15
Q

Que font les m.o. pour contrer la perte de fluidité membranaire à basse °C ou haute P ?

A

Régulation du ratio lipides insaturés/lipides saturés
↗ lipides mono- et polyinsaturés, ↗ fluidité membranaire
Acide éicosopentanoïque (EPA)
Acide docosahéxanoïque (DHA)

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16
Q

Que permettent l’Acide éicosopentanoïque (EPA) et l’Acide docosahéxanoïque (DHA) ? Comment?

A

Augmenter la fluidité membranaire puisqu’ils mettent du désordre dans la membrane à cause de leur courbure.

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17
Q

Pourquoi un bactérie exprime des flagelles péritriches seulement à haute pression et haute viscosité (surface)?

A

Pour faciliter son déplacement.

Comme c’est un coût énergétique important, elle en exprime qu’un seul lorsque les conditions ne sont pas extrêmes.

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18
Q

Pourquoi l’hydratation des protéines/ARNr est grave et comment est-elle causée?

A

Causé par l’augmentation de la pression de l’eau (plus dense).
Cela change l’Activité catalytiques des protéines
Dans le cas des ribosomes, cela peut ralentir ou empêcher la traduction.

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19
Q

Comment on essaie de favoriser le bon repliement des ARNs?

A

Avec des hélicases.

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20
Q

Comment on peut adapter les ribosomes des piézophiles?

A

En allongeant certaines hélices de sorte à créer des tige-boucle = augmentation du désordre favorable pour les ribosomes.

21
Q

Est-ce que les piézophiles et psychrophiles sont très différents des m.o. qu’on retrouve en surface?

A

Non, ils sont sensiblement les mêmes, mais avec des adaptations différentes.

22
Q

Que se passe-t-il quand on met E.coli à haute pression?

A

Filamentation des des bactéries parce que la haute pression cause l’hydratation des prots, ce qui active constitutivement Mrr, un enzyme de restriction qui cause des coupures double brin = activation de la réponse SOS = il n’y a plus de division cellulaire (parce que pas de septum).

23
Q

Qu’est-ce que les cryoconites?

A

Trous générés dans la neige ou glace
par de la poussière/matière organique
apportée par le vent

24
Q

Qu’est-ce que le permafrost?

A

Sols gelés pour au moins 2 années consécutives jusqu’à 1 000 m sous la surface
Sols de hautes latitudes ou altitudes
Contient 20-70% de glace et 1-7% d’eau sous forme de solution salée (Aw = 0,80-0,85)

25
Q

Nommez 2 conséquences du dégel du permafrost.

A

Augmentation de l’activité microbienne

Rejet de CH4

26
Q

Quelle zone des océans est de basse température?

A

Zone pélagique

27
Q

Quel type de mo sont susceptibles de se retrouver dans la zone pélagique des océans dû à la basse température et la haute pression?

A

Psychrophiles et piézophiles (de la famille des Gammaproteobacteria)

28
Q

Qu’est-ce que les bactéries dans les sédiments océaniques réduisent? Que cela apporte-t-il dans l’océan?

A

Réduction des sulfates (SO4 (2-)) et cela augmente la concentration de H2S dans les océans

29
Q

Comment les psychrophiles adaptent-ils leur membrane au froid?

A

Moins d’acides gras saturés

30
Q

Comment les mo font-ils pour s’assurer d’avoir moins d’acides gras saturés dans leur membrane?

A

Synthèse d’enzymes de désaturation
Modulation de l’expression des voies de biosynthèse des acides gars saturés
Synthèse du lipide A (membrane externe LPS) modifiée par acylation du plamitoléate

31
Q

Comment les psychrophiles modifient-ils leur paroi cellulaire?

A

Moins d’expression des gènes de peptidoglycane
Plus d’expression des gènes de dégradation du peptidoglycane
Modulation de l’expression des gènes dac1 et dac2 qui rendent la paroi plus élastique à basse température

32
Q

Que font les gènes dac1 et dac2?

A

La paroi est d’habitude pontée ensemble pas plusieurs liens, dac1 et dac2 diminuent ces liens, ce qui rend la paroi plus élastique

33
Q

Pourquoi faut-il que les psychrophiles augmentent l’expression de gènes de transporteurs membranaires?

A

Pour compenser :

  • la plus faible efficacité des transporteurs à basse température
  • l’augmentation de l’imperméabilité de la membrane
34
Q

Vrai ou faux : à basse température, il y a une baisse de l’efficacité de réplication, transcription et traduction.

A

Vrai

35
Q

Par quoi est compensée la baisse de l’efficacité de réplication, transcription et traduction?

A

+ de synthèse de prots ribosomales
+ de synthèse d’hélicases d’ARN
+ expression de cold shock proteins (CSD) (CspA : chaperonne à ARN qui sert d’antiterminateur)
Archées : + expression de petites prots à domaine TRAM (chaperonnes ARN)
Présence de dihydrouridine dans tRNA : augmente leur flexibilité
+ synthèse prots de type HU pour diminuer structures secondaires dans ADN et ARN
+ synthèse GyrAB et TopB pour diminuer les supertours
+ synthèse de RadC (RecA-like) pour réparer les cassures d’ADN dues à l’effondrement des fourches de réplication

36
Q

Quels sont les mécanismes mis en branle chez les psychrophiles pour diminuer le repliement anormal des prots?

A

+ synthèse de prots chaperonnes et des protéases
(même chose pour choc thermique!)
+ expression de peptidyl-prolyl cis-trans isomérases (PPIase)

37
Q

Vrai ou faux : l’activité spécifique diminue chez les psychrophiles à basse température.

A

Faux, elle augmente

38
Q

Kcat psychro est < ou > que kcat méso?

A

Inférieur (

39
Q

Vrai ou faux : les enzymes psychrophiles ont une grande flexibilité structurale, elles sont très perméables aux petites molécules.

A

Vrai

40
Q

Vrai ou faux : lorsqu’une enzyme mésophile et au maximum de son activité, elle commence déjà à être dénaturée.

A

Vrai

41
Q

Vrai ou faux : l’activité des enzymes psychrophiles cesse avant que leur dénaturation ne commence.

A

Vrai

42
Q

Quelle enzyme est plus sensible, une enzyme psychrophile ou mésophile?

A

Psychrophile

43
Q

Quel acide aminé a peu de flexibilité et se retrouve donc peu dans les enzymes psychrophiles?

A

Proline (à cause du cycle)

44
Q

Quel acide aminé retrouve-t-on particulièrement dans les sites catalytiques des enzymes psychrophiles? Pourquoi?

A

Glycine

Absence de chaîne latérale donne une grande flexibilité à la chaîne polypeptidique

45
Q

Nommer les modifications faites au site actif des enzymes psychrophiles afin de les adapter à de basses températures.

A

Modification des charges électrostatiques à proximité du site actif pour faciliter l’attraction du ligand vers le site et la réorientation du ligand avant le contact avec le site
Ouverture plus large du site actif pour une plus grande accessibilité
Flexibilité extrême du site pour accommoder le substrat et accélérer la réaction

46
Q

Vrai ou faux : les sites actifs des enzymes psychrophiles sont très spécifiques à leur substrat.

A

Faux, ils sont moins spécifiques à cause de leur flexibilité

47
Q

L’enzyme psychrophile a moins d’affinité pour son substrat. Cela veut-il dire que ça lui prendra plus ou moins d’énergie pour se rendre au complexe Enzyme-substrat (ES) activé?

A

Moins d’énergie : la baisse d’affinité permet à l’enzyme d’accomplir ses réactions plus facilement

48
Q

Quel est l’intérêt des enzymes psychrophiles dans la biotechnologie?

A

Permet d’avoir des produits plus efficaces à basses températures, comme par exemple une lipase psychrophile peut permettre à un détergent de mieux fonctionner à basse température

Microbiologie des eaux (16 decks)

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