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Signalisation cellulaire > Phytohormones > Flashcards

Phytohormones Flashcards

1
Q

Quelles sont les 3 niveaux de régulation des voies de signalisation déclenchées par les hormones

A
  • Métabolisme et transport: Contrôle de la concentration de l’hormone via BIOSYNTHÈSE, DÉGRADATION et TRANSPORT local / longue distance
  • Perception et transduction: libération sous forme active de l’hormone, intéraction avec gènes cibles (expression récepteurs et gènes de réponse)
  • Réponse et modulation: Croisement entre voies de signalisation, rétroaction sur métabolisme, transport et transduction.
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Q

Nommez composants de la voie de signalisation de l’auxine

A

Hormone: Auxine
Récepteurs: TIR1, AFB (fbox)
Régulateurs:
(+): ARF
(-): Aux/IAA
FT: ARF

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3
Q

Nommez 3 auxines naturelles + 2 auxines synthétiques

A

Naturelles:
- IAA
- IBA
- 4Cl-IAA
Synthétiques:
- NAA
-2,4-D

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4
Q

4 niveaux de régulation de l’auxine

A

Biosynthèse
Conjugaison
Inactivation / dégradation
Transport polaire
—> régulation de la transcription

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5
Q

Ou se fait la synthèse de l’auxine

A
  • méristèmes
  • apex de la tige
  • jeunes feuilles
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6
Q

Comment se fait la biosynthèse de l’auxine

A

Tryptophan —CYP79B–> IAOx –> auxine
*chez les brassicacées

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7
Q

Décrire conjugaison de l’auxine

A

IAA - Glc (entreposage / transport)
IAA - Asp/Glu (Dégradation)
IAA - Ala/Leu (entreposage)

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8
Q

De quoi dépend le patron de distribution de l’auxine dans la plante

A
  • du stade de développement
  • du tissus en question
  • de la cellule
    ***formation du patron dépend du bon fonctionnement du transport polaire de l’auxine
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9
Q

2 types de transport de l’auxine

A

Rapide (longue distance): Phloème
Lent (cellule-cellule): Transporteurs

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10
Q

Quel transporteur permet l’import de l’auxine dans la cellule

A

AUX/LAX

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11
Q

Quel transporteur permet l’export de l’auxine hors de la cellule

A

PIN

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12
Q

Quel transporteur permet à la fois l’import et l’export de l’auxine

A

ABCB
*sont non polarisés

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13
Q

Quel processus affectent les inhibiteurs de transport polaire

A
  • formation axes dans l’embryogénèse
  • initiation des racines latérales
  • initiation des organes aériens
  • bon développement des faisceaux vasculaires
  • bon développement du RAM
  • Élongation de l’hypocotyl
  • réponse au tropisme
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14
Q

Nommez 3 inhibiteurs du transport polaire

A

NPA, TIBA, HFCA

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15
Q

Comment se fait l’import de l’auxine via AUX1/LAX

A

AUX/LAX sont protéines transmembranaires qui possèdent domaine similaire à certaines perméases
Fonctionnent selon mécanisme de pompe à protons (fait entrer IAA- et H+ en même temps)
Exprimées de manière tissus spécifique

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16
Q

Quelle forme d’auxine passe librement à travers la membrane

A

IAAH et NAA

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17
Q

Pourquoi des transporteurs si auxine peut diffuser au travers la membrane

A

IAAH est seulement 15% de l’auxine disponible, quand besoin, besoin de tout

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18
Q

Décrire l’effet de l’auxine à haute et basse concentration selon la localisation (tige vs racine)

A

Basse concentration:
- Racine –> stimule croissance
- Tige –> aucun effet
Haute concentration
- Racine –> inhibe croissance
- Tige –> proumouvoit croissance

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19
Q

Comment est localisé AUX1 à la membrane

A

asymétrique, dépend du type cellulaire, stade de développement et de l’auxine elle-même

20
Q

Quel est le rôle des transporteurs ABCB

A

homéostasie; sont transporteurs à ATP avec une distribution stable à la membrane, permet le transport de l’auxine contre gradient si nécessaire

21
Q

phenotype abcb

A

défaut transport longue distance et élongation cellulaire (littéralement pas d’élongation de l’hypocotyl)

22
Q

Combien de membres de la famille des PIN et comment on les classe

A

8;
longue loop: membrane plasmique
courte loop: membrane intracellulaire (RE)

23
Q

phénotype pin1

A

aucune floraison

24
Q

3 niveaux de régulation de la polarité des PIN

A
  1. trafic vésiculaire
  2. phosphorylation
  3. Auxine elle-même
25
Q

Quelles protéines sont impliquées dans la régulation du trafic vésiculaire des PIN

A

ARF-GEF (GNOM); clathrine et retromers

26
Q

Pourquoi utiliser BFA

A

Bloquer la fusion des endosomes de recyclage avec la membrane plasmique, permet de révéler que GNOM se situe dans les endosome si on bloque fusion

27
Q

phénotype gnom

A

*perte maintenance du RAM
*perte des racines latérales
*perte veine centrale, perte faisceaux vasculaires
–> GNOM nécessaire au positionnement des PIN lors initiatio des racines latérales

28
Q

fonction de PID

A

phosphoryle les PIN de manière séquence spécifique

29
Q

fonction de PP2A

A

phosphatase non spécifique, dans contexte de PIN, antagoniste de PID

30
Q

Qu’arrive-t-il si on remplace les acides aminés phosphorylables de PIN par des alanines ou acide aspartique

A

alanine: non phosphorylable, PIN reste basal
Aspartate (-) : Phosphomimic, monte en haut

31
Q

phénotype pp2a

A

pin toujours phosphorylé et à la membrane apicale

32
Q

comment déterminer que PID et GNOM ne font pas partie de la même voie

A
  • faire un mutant non phosphorylable et essayer d’inhiber GNOM (mutant non phosphorylable insensible à la BFA)
  • faire un mutant phosphomimic et tester avec BFA (non sensible)
33
Q

phénotype PID gain fonction

A

même phénotype que gnom
- perte RAM
- Problèmes développement des tissus vasculaires
- perte des racines latérales

34
Q

Affinité de PIN pour la voie PID ou GNOM dépend de

A

sa phosphorylation; PIN-P peut être recyclé à la membrane apicale
PIN non-P a une plus grande affinité pour la voie GNOM (basale)

35
Q

2 voies régulant la localisation des PIN PAR L’AUXINE

A

-voie TIR1-indépendant: empêche internalisation en inhibant les clathrines; maintient la polarisation de PIN quand établie
-voie TIR1 dépendant: régule expression des PIN

36
Q

Décrire le complexe de réponse à l’auxine

A

Régulateurs (-): Aux/IAA
FT: ARF (auxine response factor)
Élément de réponse: AuxRE (présent dans le promoteur des gènes impliqués dans la réponse à l’auxine)

37
Q

qu’arrive-t-il quand la concentration d’auxine est au niveau basal

A

AUX/IAA bloque transcription des gènes de réponse à l’auxine en liant ARF et en l’empêchant d’activer la transcription des gènes impliqués dans la réponse à l’auxine

38
Q

Les ARF sont-ils activateurs ou inhibiteurs

A

les 2, majorité sont activateurs, certains possèdent un domaine inhibiteur de la transcription

39
Q

si mutant simple ARF, quel phénotype

A

à cause de la redondance, devrait pas avoir un phénotype marqué.
Certains ont un appariement spécifique avec certains AUX/IAA

40
Q

Rôle du complexe SCF

A

E3 ubiquitine ligase

41
Q

Quel protéine perçoit directement l’auxine

A

Fbox de SCF (TIR1, AFB1 à 3); peut alors lier AUX/IAA

42
Q

Comment fonctionne la dégradation de AUX/IAA

A

lorsque Fbox (TIR1 ou AFB) lie auxine, complexe peut alors lier Aux/IAA et lui ajoute des ubiquitines

43
Q

Comment les gènes de réponse à l’auxine sont exprimés quand la concentration d’auxine augmente

A

En dégradant Aux/IAA via SCF, ARF sont libres et peuvent permettre l’expression des gènes impliqués dans la réponse

44
Q

Nommez les protéines du complexe SCF

A

E2, RBX1, Cullin, SKP1, Fbox

45
Q

Nommez les protéines Fbox permettant l’ubiquitination de Aux/IAA

A

TIR1, AFB1,2,3

46
Q

phénotype mutant simple TIR1

A

aucun à cause de la redondance des Fbox

47
Q

Quel genre d’essai je peux faire pour tester la spécificité d’un récepteur

A

Pulldown (prot radioactive)

Signalisation cellulaire (3 decks)

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