Phytohormones Flashcards
Quelles sont les 3 niveaux de régulation des voies de signalisation déclenchées par les hormones
- Métabolisme et transport: Contrôle de la concentration de l’hormone via BIOSYNTHÈSE, DÉGRADATION et TRANSPORT local / longue distance
- Perception et transduction: libération sous forme active de l’hormone, intéraction avec gènes cibles (expression récepteurs et gènes de réponse)
- Réponse et modulation: Croisement entre voies de signalisation, rétroaction sur métabolisme, transport et transduction.
Nommez composants de la voie de signalisation de l’auxine
Hormone: Auxine
Récepteurs: TIR1, AFB (fbox)
Régulateurs:
(+): ARF
(-): Aux/IAA
FT: ARF
Nommez 3 auxines naturelles + 2 auxines synthétiques
Naturelles:
- IAA
- IBA
- 4Cl-IAA
Synthétiques:
- NAA
-2,4-D
4 niveaux de régulation de l’auxine
Biosynthèse
Conjugaison
Inactivation / dégradation
Transport polaire
—> régulation de la transcription
Ou se fait la synthèse de l’auxine
- méristèmes
- apex de la tige
- jeunes feuilles
Comment se fait la biosynthèse de l’auxine
Tryptophan —CYP79B–> IAOx –> auxine
*chez les brassicacées
Décrire conjugaison de l’auxine
IAA - Glc (entreposage / transport)
IAA - Asp/Glu (Dégradation)
IAA - Ala/Leu (entreposage)
De quoi dépend le patron de distribution de l’auxine dans la plante
- du stade de développement
- du tissus en question
- de la cellule
***formation du patron dépend du bon fonctionnement du transport polaire de l’auxine
2 types de transport de l’auxine
Rapide (longue distance): Phloème
Lent (cellule-cellule): Transporteurs
Quel transporteur permet l’import de l’auxine dans la cellule
AUX/LAX
Quel transporteur permet l’export de l’auxine hors de la cellule
PIN
Quel transporteur permet à la fois l’import et l’export de l’auxine
ABCB
*sont non polarisés
Quel processus affectent les inhibiteurs de transport polaire
- formation axes dans l’embryogénèse
- initiation des racines latérales
- initiation des organes aériens
- bon développement des faisceaux vasculaires
- bon développement du RAM
- Élongation de l’hypocotyl
- réponse au tropisme
Nommez 3 inhibiteurs du transport polaire
NPA, TIBA, HFCA
Comment se fait l’import de l’auxine via AUX1/LAX
AUX/LAX sont protéines transmembranaires qui possèdent domaine similaire à certaines perméases
Fonctionnent selon mécanisme de pompe à protons (fait entrer IAA- et H+ en même temps)
Exprimées de manière tissus spécifique
Quelle forme d’auxine passe librement à travers la membrane
IAAH et NAA
Pourquoi des transporteurs si auxine peut diffuser au travers la membrane
IAAH est seulement 15% de l’auxine disponible, quand besoin, besoin de tout
Décrire l’effet de l’auxine à haute et basse concentration selon la localisation (tige vs racine)
Basse concentration:
- Racine –> stimule croissance
- Tige –> aucun effet
Haute concentration
- Racine –> inhibe croissance
- Tige –> proumouvoit croissance
Comment est localisé AUX1 à la membrane
asymétrique, dépend du type cellulaire, stade de développement et de l’auxine elle-même
Quel est le rôle des transporteurs ABCB
homéostasie; sont transporteurs à ATP avec une distribution stable à la membrane, permet le transport de l’auxine contre gradient si nécessaire
phenotype abcb
défaut transport longue distance et élongation cellulaire (littéralement pas d’élongation de l’hypocotyl)
Combien de membres de la famille des PIN et comment on les classe
8;
longue loop: membrane plasmique
courte loop: membrane intracellulaire (RE)
phénotype pin1
aucune floraison
3 niveaux de régulation de la polarité des PIN
- trafic vésiculaire
- phosphorylation
- Auxine elle-même
Quelles protéines sont impliquées dans la régulation du trafic vésiculaire des PIN
ARF-GEF (GNOM); clathrine et retromers
Pourquoi utiliser BFA
Bloquer la fusion des endosomes de recyclage avec la membrane plasmique, permet de révéler que GNOM se situe dans les endosome si on bloque fusion
phénotype gnom
*perte maintenance du RAM
*perte des racines latérales
*perte veine centrale, perte faisceaux vasculaires
–> GNOM nécessaire au positionnement des PIN lors initiatio des racines latérales
fonction de PID
phosphoryle les PIN de manière séquence spécifique
fonction de PP2A
phosphatase non spécifique, dans contexte de PIN, antagoniste de PID
Qu’arrive-t-il si on remplace les acides aminés phosphorylables de PIN par des alanines ou acide aspartique
alanine: non phosphorylable, PIN reste basal
Aspartate (-) : Phosphomimic, monte en haut
phénotype pp2a
pin toujours phosphorylé et à la membrane apicale
comment déterminer que PID et GNOM ne font pas partie de la même voie
- faire un mutant non phosphorylable et essayer d’inhiber GNOM (mutant non phosphorylable insensible à la BFA)
- faire un mutant phosphomimic et tester avec BFA (non sensible)
phénotype PID gain fonction
même phénotype que gnom
- perte RAM
- Problèmes développement des tissus vasculaires
- perte des racines latérales
Affinité de PIN pour la voie PID ou GNOM dépend de
sa phosphorylation; PIN-P peut être recyclé à la membrane apicale
PIN non-P a une plus grande affinité pour la voie GNOM (basale)
2 voies régulant la localisation des PIN PAR L’AUXINE
-voie TIR1-indépendant: empêche internalisation en inhibant les clathrines; maintient la polarisation de PIN quand établie
-voie TIR1 dépendant: régule expression des PIN
Décrire le complexe de réponse à l’auxine
Régulateurs (-): Aux/IAA
FT: ARF (auxine response factor)
Élément de réponse: AuxRE (présent dans le promoteur des gènes impliqués dans la réponse à l’auxine)
qu’arrive-t-il quand la concentration d’auxine est au niveau basal
AUX/IAA bloque transcription des gènes de réponse à l’auxine en liant ARF et en l’empêchant d’activer la transcription des gènes impliqués dans la réponse à l’auxine
Les ARF sont-ils activateurs ou inhibiteurs
les 2, majorité sont activateurs, certains possèdent un domaine inhibiteur de la transcription
si mutant simple ARF, quel phénotype
à cause de la redondance, devrait pas avoir un phénotype marqué.
Certains ont un appariement spécifique avec certains AUX/IAA
Rôle du complexe SCF
E3 ubiquitine ligase
Quel protéine perçoit directement l’auxine
Fbox de SCF (TIR1, AFB1 à 3); peut alors lier AUX/IAA
Comment fonctionne la dégradation de AUX/IAA
lorsque Fbox (TIR1 ou AFB) lie auxine, complexe peut alors lier Aux/IAA et lui ajoute des ubiquitines
Comment les gènes de réponse à l’auxine sont exprimés quand la concentration d’auxine augmente
En dégradant Aux/IAA via SCF, ARF sont libres et peuvent permettre l’expression des gènes impliqués dans la réponse
Nommez les protéines du complexe SCF
E2, RBX1, Cullin, SKP1, Fbox
Nommez les protéines Fbox permettant l’ubiquitination de Aux/IAA
TIR1, AFB1,2,3
phénotype mutant simple TIR1
aucun à cause de la redondance des Fbox
Quel genre d’essai je peux faire pour tester la spécificité d’un récepteur
Pulldown (prot radioactive)
