Défense Flashcards
Quel type de cellule peut initier une réponse contre les pathogènes chez la plante
toutes les cellules
caractéristiques d’un bon système immunitaire
- haute spécificité
- tolérance / reconnaissance soi vs non-soi
- mémoire immunitaire
Première ligne de défense chez les plantes
déposition de callose dans la paroi cellulaire (empêche le pathogène de sortir de la cellule infectée / le ralentit)
Décrire généralement la différence entre PTI / ETI
PTI: non spécifique, reconnait les éliciteurs des pathogènes non adaptés
ETI: spécifique, reconnait les molécules effectrices produites par les microorganismes
donnez exemples de substrats reconnus par les PRR
chitine (champignons pathogènes)
flagelline bactérienne
Ef-Tu (facteur d’élongation traduction procaryote)
LPS (bactérie gram-)
peptidoglycan
Quels sont les récepteurs de l’immunité par PTI
PRR (pattern recognition receptors)
décrire les 2 classes de PRR
- RKs (récepteurs kinases transmembranaires)
—-> environ 610 chez arabidopsis - RLP (récepteur like protein, sans domaine intracellulaire)
—-> 54 membres chez adabidopsis
que reconnaissent les PRR
les éliciteurs
Quel domaine permet aux PRR de lier leur substrats
LRR (leucine rich repeat)
chez environ 200 membres RKs
comment fonctionne l’activation des PRR
par transphosphorylation suite à la dimérisation
Comment fonctionne l’activation de FLS2
FLS2 lie flagelline 22, qui intéragit ensuite avec BAK1 (forme hétérodimères), transphosphorylation permet:
- accumulation des ROS
- activation des canaux ioniques
- activation des voies MAPK
- modifications transcriptionnelles
phénotype bak1
insensible à l’ajout exogène de flg22 –> diminution marquée de la production de ROS
c’est quoi un mutant T-DNA
insertion aléatoire d’ADN dans le gène en question, peut former un kockout ou knockdown dépendant de l’endroit de l’insertion
décrire le phénotype d’une plante ou il y a des niveaux de ROS augmenté
blanchiment + diminution de la croissance
Si je voulais savoir quel protéine lie directement flg22, quel genre d’essai je ferais
immunoprécipitation d’une protéine et je regarde si l’autre est présente quand j’ajoute le ligand.
peut aussi faire un mutant knockout d’une protéine et voir si l’intéraction se produit toujours (avec ligand radioactif)
peut faire un pulldown chez WT et mutant perte de fonction chez une protéine
Quel genre d’essai je peux faire pour trouver à quel partie de la protéine se lie un ligand
mutagénèse dirigée
C’est quoi MBP
substrat phosphorylable universel des MAPK
Comment je fais pour vérifier quel MAPK s’active suite à la liaison d’un ligand avec son récepteur
mutants récepteur non fonctionnel et sauvetage phénotype en ajoutant un plasmide exprimant le gène non fonctionnel du mutant tout en regardant quelle MAPK s’active par essai kinase
peut aussi vérifier que c’est bien la MAPK active qui est vu par ajout de MKP1 (phosphatase spécifique à MPK1)
phénotype de mpk4
réponse immunitaire intensifiée: pas de croissance + accumulation de ROS
Décrire les composantes de la voie PTI activée par la flagelline 22
Ligand: flg22
Récepteur: FLS2
corécepteur: BAK1
MAPKKK: MEKK1
MAPKK: MKK4/5
MAPK: MPK3/6
FT: WRKY22, WRKY29
réponse: mort cellulaire programmée, augmentation de la résistance aux bactéries, transmission signaux hormonaux aux autres plantes, expression des gènes de résistance R
phénotype mkk1/2
identique à MPK4: Plantes naines, accumulation de H2O2
Comment fonctionne BiFC
complémentation d’un fluorochrome quand 2 prot viennent à intéragir entre-elles
Quelle est la cible des molécule effectrices
La voie PTI (majoritairement)
Comment les pathogènes délivrent les molécules effectrices
VIA T3SS
De quelle manière agissent les effecteurs
Bloquer:
- formation du complexe du récepteur
- Désactivation ou protein turnover du récepteur
- les MAPKs
- Les facteurs de transcription
- l’ARNpol II
Nommez 2 effecteurs de Pseudomonas syringae
AvrPto
AvrPtoB
Quelle est la cible de AvrPto
lie directement complexe FLS2-BAK1 (le cible pour la dégradation)
Quelle enzyme fait partie de l’effecteur AvrPtoB
E3 ligase
De quelle classe fait partie des récepteurs de l’ETI
récepteurs intracellulaires NB-LRR (nucléotide binding et leucine rich repeat)
3 stratégies de récepteurs de l’ETI et description de chacune
- interaction directe
-> récepteur interagit directement avec l’effecteur, haut polymorphisme (si mut de l’effecteur, c’est tout le récepteur qui doit muter) - guard / decoy
-> intéraction effecteur avec une protéine accessoire qui change de conformation suite à la liaison, permettant la liaison avec le récepteur NB-LRR - bait
->Intéraction entre une protéine accessoire et l’effecteur, le complexe prot-effecteur est ensuite reconnu par le récepteur NB-LRR
Décrire l’ETI déclenchée par AvrPto
- kinase : Pto
- récepteur NB-LRR : Pfr
