Physiologie Bactérienne Flashcards
Quels sont les besoins nutritionnels de la bactérie ?
Énergie,
carbone,
azote,
eau,
minéraux,
facteurs de croissance
Où est stockée l’énergie dans une bactérie ?
Dans les molécules synthétisées (ATP)
Citer les 2 sources d’énergie possibles
Lumineuse
Chimique (organique/minérale)
Qu’est ce qu’une bactérie phototrophe ?
Une bactérie dont la source d’énergie est la lumière
Qu’est qu’une bactérie chimiotrophe ? Citer les 2 types possibles
Source d’énergie chimique
Chimio-organotrophe
Chimio-lithotrophe
Quelles sont les 2 sources de carbone ? Donner un exemple pour chaque
Organique : décomposition matière organique
Inorganique : CO2
Qu’est ce qu’une bactérie hétérotrophe ?
Dont la source de C est organique
Qu’est-ce qu’une bactérie autotrophe ?
Dont la source de C est inorganique
Quelles sont les sources d’azote possibles ?
L’atmosphère
Substances organiques et inorganiques azotées
En quoi l’azote est-il essentiel pour une bactérie ?
Il est nécessaire à la synthèse de protéines
En quoi les minéraux sont-ils nécessaires à la bactérie ?
Nécessaires à la synthèse de molécules de structure/enzymatiques
Quel est le rôle des minéraux dans le métabolisme énergétique ?
Ils sont accepteurs final d’électrons
Quel minéral est nécessaire à la synthèse de l’ATP
Phosphore
Citer des minéraux cofacteurs enzymatiques
Fe, Zn, Cu
Quel est le rôle du chlore pour une bactérie ?
Permet des échanges transmembranaires
Qu’est que la water activity?
La quantité d’eau libre dans un milieu
Quelle water activity est nécessaire pour le développement des bactéries ?
0,9
Définir les facteurs de croissances ?
Composés organiques non synth. par la bactérie
Qu’est ce qu’une bactérie prototrophe ?
Une bactérie qui se développe sans facteur de croissance
Qu’est ce qu’une bactérie auxotrophe ?
Qui se développe avec un ou plusieurs facteurs de croissance
Définir la syntrophie
Développement de colonies “satellites” autour d’une colonie qui produit le facteur de croissance
Que sont les molécules anti-métabolites ?
Des molécules analogues aux facteurs de croissance, capable de rentrer en compétition avec eux, et pouvant inhiber la croissance bactérienne
Qu’est ce qu’une bactérie phototrophe ?
Dont la source d’énergie est la lumière
Qu’est-ce qu’une bactérie chimiotrophe ?
Dont la source d’énergie est chimique
Qu’est ce qu’une bactérie chimio-organotrophes ?
Dont la source d’énergie est chimique organique
Qu’est ce qu’une bactérie chimio-lithotrophe ?
Dont la source d’énergie est chimique et minérale
Qu’est ce qu’une bactérie autotrophe ?
Dont la source de carbone est inorganique ?
Comment appelle t on une bactérie dont la source de Carbone est inorganique?
Autotrophe
Comment appelle t-on une bactérie dont la source de carbone est organique ?
Hétérotrophe
Comment appelle t on une bactérie se développant avec un ou plusieurs facteurs de croissance ?
Auxotrophe
Quelle est la rentabilité de la fermentation ?
Inférieure à 2% - 2 molécules ATP pour 1 mole de glucose
Quel est le composé de base de la fermentation ?
Le pyruvate issu de la glycolyse
Quels sont les accepteurs finaux d’électrons dans la fermentation ?
Le produit final de la réaction
La fermentation est-elle aérobie ou anaérobie ?
Anaérobie
Quelle réaction chimique a lieu au niveau du substrat lors de la fermentation ?
La phosphorylation
Quel est le/les produits d’une fermentation homolactique ?
L’acide lactique
Citer un exemple d’utilisation de la fermentation homolactique
Le yaourt
De quelle fermentation l’acide lactique est-il l’unique produit obtenu ?
Homolactique
Quels sont les produits obtenus lors de la fermentation hétérolactique ?
Acide lactique
Éthanol
Acide acétique
CO2
Citer un exemple d’utilisation de la fermentation hétérolactique
Le roquefort
De quelle fermentation sont issus l’acide lactique, l’éthanol, l’acide acétique et l’O2?
Hétérolactique
Quel est le produit obtenu de la fermentation alcoolique
L’ethanol
Quels micro organismes peuvent être utilisés lors d’une fermentation alcoolique ?
Les levures
Citer un exemple d’utilisation de la fermentation alcoolique
Le vin
Quelle fermentation permet d’obtenir le vin ?
Alcoolique
Quelle fermentation permet d’obtenir le roquefort ?
Hétérolactique
Quel est le produit obtenu de la fermentation acétique ?
L’acide acétique
Quel produit peut-on obtenir par fermentation acétique ?
Le vinaigre
De quelle fermentation est issu le vinaigre ?
Acétique
Quels sont les produits obtenus de la fermentation propionique ?
Acide propionique
CO2
Quel produit peut-on obtenir par fermentation propionique ?
l’Emmental
De quelle fermentation est issu l’Emmental ?
Propionique
Quels produits sont obtenus de la fermentation butyrique ?
L’acide butanoïque
Le CO2
Dans quelles utilisations la fermentation butyrique peut servir ?
Certains fromages
Citer les 5 types respiratoires d’une bactérie
1) Anaérobie stricte
Aero-anaérobie (2) aérobies facultative + 3) anaérobie facultatives (aéro tolérante)
4) Micro aérophile
5) Aérobie stricte
Quelle est la relation avec l’oxygène des bactéries anaérobies strictes ?
Ne se développent qu’à l’abri de l’air/en l’absence d’oxygène
Comment appelle t-on les bactéries pouvant se développer aussi bien en présence qu’en absence d’O2?
Les aéro anaérobies
Quelle est la caractéristique respi des aérobies facultatives?
Elles utilisent la respiration et la fermentation
Quelle est la caractéristique des bactéries anaérobies facultatives ?
Utilisation de la fermentation uniquement, mais elles ne sont pas gênées par la présence d’oxygène
Quel est l’autre nom des anaérobies facultatives
Aéro tolérantes
Quelle est la relation avec l’oxygène des bactéries micro-aérophiles ?
Elles ne tolèrent qu’une faible présence d’oxygène
Quelle est la relation avec l’oxygène des aérobies strictes ?
Elles ne se développent qu’en présence d’O2
Quelles types de relations les bactéries peuvent-elles avoir entre elles / avec les autres organismes vivants ?
Relations sur le plan nutritionnel
Spatial
Temporel
Décrire les 4 relations possibles sur le plan nutritionnel
Saprophytisme
Symbiose
Parasitisme
Commensalisme
Définir une relation de saprophytisme
Les bactéries se nourrissent de substances organiques en décomposition, donc aucune interférence entre les bactéries et leur hôte ou d’autres organismes vivants.
Définir la relation de symbiose
Nutrition : Sources indépendantes ou identiques
Les 2 organismes bénéficient de fonctions métaboliques complémentaires, ce qui les rend indispensables l’un à l’autre
Définir la relation nutritionnelle de parasitisme
Nutrition: à partir de molécules appartenant à l’hôte
A terme relation nuisible pour l’hôte/mortelle
Définir la relation nutritionnelle de commensalisme
Nutrition: molécules organiques provenant de l’hôte mais sans bénéfices ni risques pour lui
Sur le plan temporel, qu’est ce qu’une flore résidente ?
Ensemble bactérie présente chez un même individu
- sur les mêmes surfaces/territoires
- Avec une structure constante dans le temps
Barrière contre la prolifération d’autres esp potentiellement pathogène
Citer des exemples de flore résidente
Cutanée
Digestive
Respiratoire
Génitale
Sur le plan temporel, qu’est-ce qu’une flore transitoire ?
- Flore de contamination
- dont le développement transitoire = défaillance de la flore résidente du territoire colonisé
Comment appelle t-on une contamination par la flore hospitalière ?
Une infection nosocomiale
Qu’est-ce qu’une infection nosocomiale
Une contamination par la flore hospitalière
Quels sont les rôles de la flore digestive ?
*Barrière défensive
*Dégradation sels biliaires/bilirubines/substance exogènes
*Principale source de vitamine K
*Participe à la formation des selles
Quelles sont les différentes flores spatiales ?
Digestive
Cutanée
Respiratoire
Génitale
Dans quelle flore la prolifération d’espèces opportunistes est fréquente ?
La flore respiratoire
Quel est le pH optimal pour les espèces de la flore génitale
Acide (espèces acidophiles)
De quels types peuvent être les flores de contamination de la flore génitale ?
Bactérien/ Mycotique
Qu’est-ce qu’un porteur sain ?
Un individu possédant des germes pathogènes au sein de sa flore commensale, sans aucune manifestation observable d’infection
En quoi les porteurs sains peuvent être problématique en Hygiène Alimentaire ?
Ils peuvent contaminer des aliments lors de leur manipulation et transmettre des agents pathogènes à d’autres individus. Cela peut provoquer des effets indésirables
Quelles sont les 2 phases de la vie bactérienne ?
- Végétative : vie cellulaire en dehors de la division
- La division par scissiparité
Comment s’appelle le mécanisme de division cellulaire ?
La scissiparité
Que permet d’obtenir la scissiparité ?
2 cellules filles “clones” issues d’une même cellule mère
Quelles sont les étapes de la scissiparité ?
- Élongation de la cell / dédoublement du X
- Attachement du X à la membrane + réplication du X + Allongement cell et division en 2
- Formation du septum
- Séparation des cellules filles
- Croissance des cellules filles
Quels sont les impacts de la croissance bactérienne sur ses caractéristiques ?
- Augmentation du volume cellulaire
- Diminution de la concentration du milieu en elts nécessaires à la croissances
Quels peuvent être les facteurs limitants au développement d’une colonie
- Le substrat nutritionnel
- l’accumulation de déchets métaboliques
Citer les 2 types de milieu de croissance bactérienne possibles
Milieu renouvelé/ non renouvelé
Quelles sont les caractéristiques de la croissance en milieu renouvelé ?
- Ajout régulier de substrat
- élimination constante des déchets métaboliques
Dans quel type de croissance bactérienne le substrat est-il ajouté régulièrement et les déchets métaboliques constamment éliminés ?
La croissance en milieu renouvelé
Quel est le profil de développement de la population en milieu renouvelé ?
De manière continue et exponentielle
De quoi dépend le nombre de bactéries en milieu renouvelé ?
- Du nombre initial de bactéries apportées (= conta initiale)
- Du temps
Combien de bactéries obtient-on au bout de n générations à partir d’une bactérie ?
2^n
Quels sont les facteurs influençant la courbe de croissance bactérienne ?
Le rapport contamination/prolifération
Le couple t/T
Quelles sont les phases de la croissance bactérienne ?
- Latence (facultative)
- Accélération (facultative)
- Croissance exponentielle
- Ralentissement
- Stationnaire/plateau
- Decroissance/déclin
Décrire la phase de latence (croissance en milieu non renouvelé)
- Adaptation au milieu
- Production d’enzymes
- Modif param ambiants (pH)
- Le nombre de bactéries n’augmente pas
- peut être longue voir impossible (=croissance non débutée)
Dans quelle phase considère t on que l’adaptation des bactéries au milieu est réussie et que débutent les divisions bactériennes ?
Phase d’accélération
Quelles sont les caractéristiques de l’étape de croissance exponentielle (croissance en milieu non renouvelé) ?
- croissance importante
- abondance substrat
- Pente est fortement dépendante des conditions du milieu (T, pH)
Dans quelle phase débute l’épuisement en substrat ?
La phase de ralentissement
Quelles sont les caractéristiques de la phase stationnaire ? (croissance en milieu non renouvelé)
- maintien de la pop bact (nb morts cell=nb de divisions)
- il n’y a plus d’accroissement
Dans quelle phase le nombre de morts cellulaires est égal au nombre de divisions
La phase stationnaire/plateau
Quelles sont les caractéristiques de la phase de décroissance ? (croissance en milieu non renouvelé)
- substrat insuffisant
- augmentation nb morts cell (> divisons)
- population décroît et peut s’éteindre
- sporulation pour les espèces capables
Quel facteur peut relancer la phase de croissance exponentielle ?
L’ajout de substrat
Quels facteurs peuvent causer une diminution de la population voire une disparition ?
La modification des paramètres du milieu (T, pH)
Quels sont les facteurs influençant le développement bactérien ?
- Aw
- T
- pH
- concentration en substrat/P osmotique
- Présence/absence O2
- facteurs de croissance
- pression amb
Quel facteur d’influence du dvt bactérien peut servir de paramètre de contrôle du stockage/conservation des denrées ?
Aw
Qu’est-ce qu’une bactérie thermophile ?
- Se développant entre +25 et +90°C
- T optimale 50/55°C
Quel type de bactérie a une température de développement entre 25 et 90°C ?
Thermophiles
Quel type de bactérie a une T dvt optimale à 50/55°C ?
Thermophile
Qu’est ce qu’une bactérie mesophile ?
T dvt entre 10 et 45°C
T opt = 37°C
Quel type de bactérie a une T dvt entre 10 et 45°C ?
Mésophile
Quel type de bactérie a une T opt de 37°C ?
Mésophile
Citer un exemple de bactérie thermophile
Bactéries fermentatives dans l’IAA
Citer un exemple de bactérie thermophile
Bactéries fermentatives dans l’industrie AA
Qu’est-ce qu’une bactérie cryophile ?
T dvt entre -10 et 25°C
T opt +4°C
Quel type de bactérie a une T dvt entre -10 et 25°C?
Cryophile
Quel type de bactérie a une T opt de 4°C ?
Cryophile
Quel est l’autre nom des bactéries cryophiles ?
Psychrophiles
Qu’est ce qu’une bactérie psychrotrophe ?
- Groupe intermédiaire entre méso/cryophile
- T dvt < 7°C
- “mesophile capable de se dvp à basses T”
Citer un exemple de bactérie psychrotrophe
Les bactéries resp de TIAC et d’altération alimentaire
Pour quel aspect de l’hygiène alimentaire les bactéries psychrotrophes sont-elles un facteur limitant ?
Pour la conservation de produits réfrigérés
Quel est le pH de dvp de la plupart de bactéries ?
Neutre
pH optimale croissance = 7
Citer une bactérie à tolérance pH large et sa plage de prolifération
- E.coli
- Entre 4,4 et 9
Avec quoi ne faut il pas confondre le pH optimal de croissance ?
La capacité de résistance aux variations de pH (via capsule/sporulation)
Que peut induire une présence excessive de substrat ? Selon quel mécanisme ?
- Une inhibition du dvp bact
- Utilisation de l’eau libre
- Diminution Aw
- Augmentation P osmotique
Qu’est-ce qu’une bactérie halophile ?
Une bactérie capable de se développer lorsque P osmotique est augmentée par l’ajout de sel
Qu’est ce qu’une bactérie osmophile ?
Une bactérie capable de se développer lorsque P osmotique est augmentée par l’ajout de sucre
Quels critères peuvent servir à l’identification des bactéries ?
- Aspect (grappe, chaînette..)
- Couleur (doré pour Staphylocoques)
- Mobilité (présence flagelle)
- Activité métabolique (étude du métabolisme glucidique - fermentation -> acidification. Indicateur pH)
Citer les 2 systèmes automatisés d’identification bactérienne
- Hybridation in-situ
- Antibiogramme
Expliquer la méthode d’identification d’hybridation in-situ
Identification spécifiques d’ARN bactérien
Expliquer la méthode d’identification par antibiogramme
Etude de la sensibilité des bactéries aux principales classes d’antibiotiques.
Quel est le but du dénombrement bactérien
Déterminer la concentration en bactéries d’un produit ou d’une surface
Citer les 3 méthodes de dénombrement bactérien
- Dilution décimale
- Turbidimétrie
- Test de conta fécale
Expliquer la méthode de dénombrement par dilution décimale
- Dilution du produit initial à 1/10
- On effectue des dilutions suffisantes pour permettre le comptage des germes
- On dénombre le nombre de colonies générées, en partant du principe que chaque cellule bactérienne isolée donne naissance à une colonie (méthode UFC)
Expliquer la méthode de dénombrement par turbidimétrie
Mesure du degré de trouble du milieu par spectrophotométrie
Expliquer la méthode de dénombrement par contamination fécale
Atteste de la présence de bactéries en provenance du tube digestif humain selon des germes spécifiques
Quels sont les germes spécifiquement recherchés dans le test de contamination fécale ?
- Coliformes totaux
- Coliformes thermo-tolérants
- Streptocoques fécaux
- Anaérobies sulfito-réducteurs
