Pharmacogénomique Flashcards
phénotype
est le trait observable chez une
personne résultant de l’expression des allèles.
phénotype de bb
yeux bleus
génotype de bb
bb
exemple de phénotype
Ex: couleur des yeux, taille, diabète, TA,
réponse à un médicament
un facteur qui influence le phénotype/ expression du génotype
environnement (épigénétique)
Le génotype représente …
la constitution d’une paire d’allèles.
quantité de SNPs : Single Nucleotide Polymorphisms ou
polymorphismes nucléotidiques simples
10 millions
def Modification du promoteur:
Altèrent (ou suppriment) la fixation des facteurs de
transcription:
effet de Modification du promoteur:
augmente ou diminue la transcription, sans affecter
la séquence codante.
Abolition, création, ou modification de sites
d’épissage:
Mutation présente en bordure des bordures intro
exon qui engendre généralement des modifications
importantes de la séquence du transcrit mature.
Les mutations qui affectent la transcription d’une
séquence codante intacte
Modification du promoteur et Abolition, création, ou modification de sites
d’épissage
Décalentes (frameshift)
Toute insertion ou délétion de base(s) qui n’est pas
un multiple de 3.
Mutations modifiant la longueur de l’ARN m
Décalentes frameshift et Délétion ou duplication d’un exon complet
mutation synonyme
Pas de modification de
la séquence d’acides aminés. Ex:
mutation faux-sens
Mène à la substitution d’un acide aminé par un autre.
mutation non-sens
Mène à la substitution d’un acide aminé par un autre.
Avantage approche par gènes candidats
Puissance statistique supérieure (ajustement pour un
nombre moindre de stats
Limites Approche par gènes candidats
Limites: Se limite aux mécanismes connus, nbre limité de gènes/
SNP étudiés.
avantage études pangénomiques
Avantages: Aucune hypothèse a priori, pas limité aux connaisances
actuelles des mécanismes potentiels.
limites études pangénomiques
Coût plus élevé, nécessitent plusieurs patients pour avoir
puissance statistique adéquate.