Pharmacogénomique Flashcards

1
Q

phénotype

A

est le trait observable chez une
personne résultant de l’expression des allèles.

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Q

phénotype de bb

A

yeux bleus

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3
Q

génotype de bb

A

bb

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4
Q

exemple de phénotype

A

Ex: couleur des yeux, taille, diabète, TA,
réponse à un médicament

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5
Q

un facteur qui influence le phénotype/ expression du génotype

A

environnement (épigénétique)

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6
Q

Le génotype représente …

A

la constitution d’une paire d’allèles.

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7
Q

quantité de SNPs : Single Nucleotide Polymorphisms ou
polymorphismes nucléotidiques simples

A

10 millions

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8
Q

def Modification du promoteur:

A

Altèrent (ou suppriment) la fixation des facteurs de
transcription:

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9
Q

effet de Modification du promoteur:

A

augmente ou diminue la transcription, sans affecter
la séquence codante.

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10
Q

Abolition, création, ou modification de sites
d’épissage:

A

Mutation présente en bordure des bordures intro
exon qui engendre généralement des modifications
importantes de la séquence du transcrit mature.

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11
Q

Les mutations qui affectent la transcription d’une
séquence codante intacte

A

Modification du promoteur et Abolition, création, ou modification de sites
d’épissage

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12
Q

Décalentes (frameshift)

A

Toute insertion ou délétion de base(s) qui n’est pas
un multiple de 3.

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13
Q

Mutations modifiant la longueur de l’ARN m

A

Décalentes frameshift et Délétion ou duplication d’un exon complet

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14
Q

mutation synonyme

A

Pas de modification de
la séquence d’acides aminés. Ex:

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15
Q

mutation faux-sens

A

Mène à la substitution d’un acide aminé par un autre.

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16
Q

mutation non-sens

A

Mène à la substitution d’un acide aminé par un autre.

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17
Q

Avantage approche par gènes candidats

A

Puissance statistique supérieure (ajustement pour un
nombre moindre de stats

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18
Q

Limites Approche par gènes candidats

A

Limites: Se limite aux mécanismes connus, nbre limité de gènes/
SNP étudiés.

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19
Q

avantage études pangénomiques

A

Avantages: Aucune hypothèse a priori, pas limité aux connaisances
actuelles des mécanismes potentiels.

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20
Q

limites études pangénomiques

A

Coût plus élevé, nécessitent plusieurs patients pour avoir
puissance statistique adéquate.

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21
Q

Approche par séquençage gènes candidats , exome, génome avantage

A

Variants rares et uniques , pas limité aux connaissances
actuelles .

22
Q

Approche par séquençage gènes candidats , exome, génome limites

A

Limites: Coûts très élevés, beaucoup de données/d’information,
travail bioinformatique important, interprétation de l’impact des
mutations rares est parfois difficile.

23
Q

De quoi est issu la séquence de référence du génome humain

A

humain est issue du consensus provenant de plusieurs individus
différents

24
Q

mutation germinale va à

A

ta descendance

25
Q

mutation somatique va à

A

toi seulement

26
Q

Modifications épigénétiques:

A

Modifications de la structure de la chromatine n’affectant pas la séquence de l’ADN.

27
Q

Modifications épigénétiques: comment

A

Modifient l’expression génique par des modification
de la structure de la chromatine qui est sous le
contrôle d’une série de protéines.

28
Q

les modifications épigénétiques les plus fréquentes

A

Méthylation de l’ADN (des cytosine des dinucléotides CpG)

Modification des histones:
Ex: méthylation et acétylation des résidus lysine

29
Q

Pénétrance

A

La pénétrance représente le pourcentage des individus avec un
génotype donné qui ont aussi le phénotype associé.

30
Q

calcul pénétrance

A

Pénétrance =
n. individus avec phénotype/
n. individus avec génotype

31
Q

maladies à déclenchement tardif

A

Certaines tares génétiques ont une apparition phénotypique tardive
chez les porteurs de la mutation.

Exemples: Chorée d’Huntington, rétinopathies dominantes,
ataxies, maladie de Parkinson

32
Q

Maladies mendéliennes

A

L’expression de la maladie est
sous le contrôle d’ un gène à
forte pénétrance

33
Q

Maladies complexes
(ex: hypertension)

A

Plusieurs facteurs génétiques et environnementaux conférant un faible risque sont impliqués.

34
Q

Caractéristiques des maladies génétiques Simples, mendéliennes

A

maladies rares,
mutations rares, forte pénétrance, mutations
monogéniques et suffisantes
ex:
dystrophie musculaire , fibrose kystique

35
Q

Caractéristiques des maladies génétiques complexes

A

maladies communes, variations
génétiques communes à faible pénétrance,
mutations ni suffisantes ni nécessaires, facteurs
environnementaux importants
ex:
diabète de type 2, infarctus du myocarde, cancer
de la prostate

36
Q

L’étude génétique de traits complexes vise
principalement à identifier les gènes contribuant à quoi

A

principalement à identifier les gènes contribuant à
la maladie dans le but de mieux comprendre les
mécanismes biologiques menant à l’apparition de la
maladie

37
Q

Pharmacogénétique/génomique

A

L’étude de la relation entre les variations génétiques et la
variabilité dans l’effet des médicaments.

38
Q

potentiel de la pharmacogénomique

A

différencier les Répondeurs sans prédisposition à un effet indésirable (rx/dose habituels) et Non répondeurs, hyper-répondeurs et répondeurs
“toxiques” (Traiter avec autre Rx ou autre dose)

39
Q

Métaboliseur ultrarapide

A

: Plus de deux allèles fonctionnels (pointage d’activité>2,0).

40
Q

Métaboliseur rapide

A

: deux allèles fonctionnels ou
avec fonction réduite; ou un allèle fonctionnel et un
allèle non fonctionnel ou un allèle avec fonction
réduite (pointage d’activité 1,0 2,0) (la majorité des gens)

41
Q

Métaboliseur intermédiaire

A

un allèle avec fonction réduite et un allèle non fonctionnel (pointage
d’activité = 0,5)

42
Q

Métaboliseur lent

A

Aucun allèle fonctionnel (pointage d’activité =0)

43
Q

Validité analytique d’un test génétique

A

Habilité d’un test de mesurer de façon exacte et précise le génotype d’intérêt dans un laboratoire.
•Sensibilité analytique
•Spécificité analytique
•Fiabilité du test (reproductibilité)
•Robustesse du test

44
Q

validité clinique en génomique

A

Habilité d’un test génétique à prédire de façon précise et fiable un état clinique ou un phénotype.
• Ex: association d’un marqueur avec un phénotype, une maladie ou la réponse à un traitement.

45
Q

utilité clinique

A

Ensemble des évidences démontrant une amélioration des évènements cliniques (bénéfices vs risques) d’un test génétique, ainsi que son utilité et sa valeur ajoutée à la prise en charge standard d’un patient.

46
Q

Une association (pharmaco)génétique hautement
statistiquement significative confirme-t-elle une utilité clinique

A

NON

47
Q

Qu’est ce que l’utilité clinique de la pharmacogénomique

A

Quelques exemples:
•Amélioration diagnostique ou pronostique
•Spécificité, sensibilité, ROC curves , reclassification, autres

•Identification des individus les plus susceptible de bénéficier d’un traitement
•Augmentation du bénéfice absolu (ex: Number needed to treat ), spécificité, sensibilité, autres

•Identification des individus les + à risque d’un effet indésirable:
•Réduction du risque absolu (ex: Number needed harm ), spécificité, sensibilité, autres

48
Q

Médicaments: si tu l’élimine vite=

A

-efficace=dose++

49
Q

Promédicament: métabolisme +

A

=+efficace=dose-

50
Q

Def promédicament

A

C’est un médicament que pour qu’il soit actif, il faut qu’il soit métabolisé (activé par la chimie de notre corps)