Peptides Flashcards
Peptides ayant un rôle biologique
- Hormones peptidique
- immunité : Peptides antimicrobiens (PAM)
- Inflammation : Bradykinine
- Neuropeptides
- Equilibre redox
- Toxines
Charge d’un peptide
Groupements ionisables
Extrémité N-Ter : pKB
Extrémité C-Ter : pKA
R ionisable : pKaR
Séquençage:
Le réactif d’Edman
Séquençage complet dune chaîne polypeptidique
Détermination de l’ordre exact des AA
Peptide signal
Signal d'adressage (16 à 30 AA) En N-Ter des protéines: - résidentes du RE, Golgi, endosomes - sécrétées hors de la cellule - insérées dans les membranes cellulaires Région hydrophobe Clivé par une signale peptidas; au niveau du RE
Outils chimiques:
BrCN
Coupe après Met
Outils chimiques:
NTCB (acide-2-nitro-5-thiocyanobenzoïque)
Coupe avant Cys
Outils chimiques:
Hydroxylamine
Coupe entre Asn et Gly
Outils biologiques
Exopeptidases
Aminopeptidase
Carboxypeptidase
Outils biologiques:
Enzymatiques
Trypsine
Chymotrypsine
OB
Exopeptidases
Aminopeptidase
Coupe l’AA en N-Ter
OB
Exopeptidases
Carboxypeptidase
Coupe l’AA en C-Ter
OB
Enzymatiques
Trypsine
Coupe après Lys ou Arg sauf si suivie de Pro
OB
Enzymatique
Chymotrypsine
Coupe après les AA aromatiques (phe, tyr, trp)
Liaison peptidique
Liaison amide (entre la fonction COOH d'un AA et la fonction NH2 du AA suivant) Rigide et plane
Spectrométrie de masse
Séparation des peptides selon le rapport m/z