Peptides Flashcards
Peptides ayant un rôle biologique
- Hormones peptidique
- immunité : Peptides antimicrobiens (PAM)
- Inflammation : Bradykinine
- Neuropeptides
- Equilibre redox
- Toxines
Charge d’un peptide
Groupements ionisables
Extrémité N-Ter : pKB
Extrémité C-Ter : pKA
R ionisable : pKaR
Séquençage:
Le réactif d’Edman
Séquençage complet dune chaîne polypeptidique
Détermination de l’ordre exact des AA
Peptide signal
Signal d'adressage (16 à 30 AA) En N-Ter des protéines: - résidentes du RE, Golgi, endosomes - sécrétées hors de la cellule - insérées dans les membranes cellulaires Région hydrophobe Clivé par une signale peptidas; au niveau du RE
Outils chimiques:
BrCN
Coupe après Met
Outils chimiques:
NTCB (acide-2-nitro-5-thiocyanobenzoïque)
Coupe avant Cys
Outils chimiques:
Hydroxylamine
Coupe entre Asn et Gly
Outils biologiques
Exopeptidases
Aminopeptidase
Carboxypeptidase
Outils biologiques:
Enzymatiques
Trypsine
Chymotrypsine
OB
Exopeptidases
Aminopeptidase
Coupe l’AA en N-Ter
OB
Exopeptidases
Carboxypeptidase
Coupe l’AA en C-Ter
OB
Enzymatiques
Trypsine
Coupe après Lys ou Arg sauf si suivie de Pro
OB
Enzymatique
Chymotrypsine
Coupe après les AA aromatiques (phe, tyr, trp)
Liaison peptidique
Liaison amide (entre la fonction COOH d'un AA et la fonction NH2 du AA suivant) Rigide et plane
Spectrométrie de masse
Séparation des peptides selon le rapport m/z
Maturation par clivage
Activation des facteurs de coagulation
Maturation de l’insuline
Mécanisme de la coagulation
Activation des facteurs de la coagulation par protéolyse (activation en cascade)
- formation du caillot de fibrine:
Clivage du fibrinogene en fibrine soluble (thrombine)
Formation de fibrine insoluble
Maturation de l’insuline
1) Formation de proinsuline dû au clivage du peptide signale
2) Formation de ponts disulfures (2 entre chaînes A et B et 1 sur chaîne A)
3) Clivage du peptide C par la pro-convertase 1
4) Maturation final de la chaîne B par la carboxypeptidase E
Insuline
Hormone hypoglycémiante
Diabète
Type 1= défaut de synthèse de l’insuline (destruction des cellules bêta du pancréas)
Type 2 = résistance à l’insuline (obésité)
Hormones : Glucagon
1) Lieu de synthèse
2) précurseur
3) mode d’action
1) Cellule alpha
2) proglucagon (maturation par clivage différentiel en fonction des tissus : pancréas = production du glucagon et intestin = production de peptides importants pour la satiété
3) hormones hypoglycémiante
Hormones LH et FSH
Gonadotrophine hypophysaires (glycoprotéine)
Action périphérique sur testicule et ovaire
》synthétisé par l’adenohypaphyse
》variation de concentration de ces hormones (cycle menstruel): pic de LH lors de l’ovulation et pic de FSH lors de la maturation du follicule
Neuropeptides : ocytocine
Polypeptide de 9 AA avec 1 pont disulfure
Synthèse par la neurohypophyse
Action sur les muscles lisses: de l’utérus (accouchement) et des glandes mammaires (allaitement)
Neuropeptides : vasopressine
Polypeptide de 9 AA et 1 pont disulfure
Synthèse par la neurohypophyse en cas de diminution de la volemie et augmentation de l’osmolarité
Hormones antidiurétique
Réabsorption d’eau par le rein
Inflammation: Bradykinine
- Nonapeptide, synthétisé à partir du kininogène
- Action vasodilatatrice ( diminue la pression artérielle)
- Dégradé par l’enzyme de conversion (inhibiteur de l’angiotensine –> bloquent la dégradation de la Bradykinine et utilisé dans le traitement de l’hypertension artérielle)
PAM
Entre 12 et 50 AA
Amphiphile : phase chargée/ phase hydrophobe
Lieu de synthèse chez l’homme (glandes sous muqueuses et épithélium/ immunité inné –> polynucléaires neutrophiles et macrophages)
Reponse immunitaire innée (formation de pores transmembranaires)
Redox : Glutathion
Tripeptide : gama-L-glutamyl-Lcystéinylglycine
Régulateur majeur du potentiel redox (détoxification et élimination des espèces réactives de l’O2)
Propriété anti-oxydantes
Toxines : venins de serpent
Mélange complexe de toxines peptidiques
Toxines : venins de serpent
Principales classes de toxines peptidiques
Cardiotoxines Hemotoxines Myotoxines Neurotoxine Toxines vasoactives
Toxines : venins de serpent
Application clinique
Source importante de molécules pharmacologiquement actives
Captopril (inhibiteur de l’enzyme de conversion)
