P9: Clonación de un producto de PCR Flashcards

1
Q

¿Qué son los plásmidos?

A

Material extracromosomal que se encuentra en algunas bacterias y tienen muchas copias.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

¿Por qué los plásmidos pueden replicarse muchas veces?

A

Porque tienen origen de replicación distinto al de los cromosomas.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

¿Qué permite esa característica de extensa replicación de los plásmidos?

A

Aprovecharlo para hacer clones de un fragmento de ADN (copias idénticas)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

En nuestras células, ¿cuantos origenes de replicación hay?

A

Muchísimos, y cad uno puede usarse sólo una vez por cada ciclo celular.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

¿Qué pasaría si en nuestras células el origen de replicacioń se usara más de una vez cada ciclo celular?

A

podría ocurrir una mutación

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

¿A qué se le conoce como plásmido recombinante?

A

Al plásmido que tiene un segmento de ADN que originalmente no tenía, es decir que lo insertamos.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

¿Cómo se identifica el ARNm?

A

por la cola poli A.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

¿Cómo puedes extraer el ARNm aprovechando su cola poli A?

A

Poniendo una columan que tenga secuencia TTTT, para que se quede dentro de la columna.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

¿Para que sirve la transcriptasa reversa?

A

Para sisntetizar DNA a a partir de RNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

¿Cómo podemos hacer una transcripción reversa de todos los RNA que tengamos en una muestra?

A

Utilizando un oligo dT, es decir, que tenga una secuencia TTT…T para que se una a las colas poli A.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Si usamos un oligo dT, ¿cuántos productos tendremos?

A

Tantos como RNA tengamos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

¿Qué error comete la Taq polimerasa?

A

Que les agrega en los extremos una A a los productos que amplifica.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

¿Qué ventaja tiene la clonación por medio de productos de PCR de la Taq polimerasa?

A

Que podemos usar un vector que tenga extremo T, así se une al producto de PCR de manera complementaria.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

¿Qué papel tienen las enzimas de restricción en un plásmido recombinante?

A

Estas enzimas reconocen secuencia específica de DNA y cortan ahí. En este caso “abren” al plásmido y lo vuelven lineal.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

¿Qué hace una terminal tranferasa?

A

adiciona lo que le indiques, por ejemplo al poner Timinas y esa enzima se adicionan T en los extremos.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

¿Qué importancia tiene subir la temperatura hasta 94°C al inicio de cada ciclo de PCR?

A

Desnaturalizar al DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

¿Por qué se baja la temperatura como segundo paso en cada ciclo de una PCR?

A

Para que los oligos se unan a sus secuencias blanco. La T depende de los oligos.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

¿Por qué se pone en 72°C en cada ciclo de la PCR?

A

Para que la Taq polimerasa comience la síntesis de ADN.

19
Q

Tres principales pasos de la PCR

A
  1. Desnaturalización de ADN
  2. Unión de oligos
  3. Síntesis de ADN (Taq)
20
Q

¿Qué hace la ADN ligasa?

A

Une las dos hebras para ligarlas por enlace fosfodiester, y que ahora el plásmido sea recombinante.

21
Q

¿Qué es la tranformación por choque térmico?

A

Una forma de que entren los plásmidos a la bacteria. Son competentes porque se encuentran en un medio de cationes que neutraliza, y al dar el choque favorece la entrada del vector hacia la célula.

22
Q

¿La transfección y la tranformación son lo mismo?

A

Si, solo que tranfección es en células eucariotas y la tranformación no.

23
Q

Menciona las características comunes de los vectores:

A
  • origen de replicación
  • sitio múltiple de clonación
  • sitio que les da resistencia a antibiótico
24
Q

¿Qué es un sitio de reconocimeinto de enzimas de restricción?

A

secuencias reconocidas por las enzimas de restricción, para que hagan el ADN lineal y poder incertar ADN exógeno.

25
Q

¿Qué da la coloración azul a las colonias de bacterias?

A

X- Gal.

26
Q

¿Para que se usa X-Gal?

A

Para detectar la inserción de ADN extraño en la región lacZ del plásmido.

27
Q

¿Qué pasa si sí se inserta el ADN exógeno en el plásmido con X-Gal?

A

Veremos colonias blancas, porque el ADN exógeno se inserta en el gen de la beta galactosidasa (colonias recombinadas)

28
Q

¿Qué tipo de células son las colonias azules marcadas con X-Gal?

A

Células que no insertaron el ADN exógeno en el gen (no recombinadas), entonces la beta galactosidasa si se expresa.

29
Q

¿Qué característica les brinda a las células del vector la resistencia al antibiótico?

A

Que tienen una región que codifica para la beta lactamasa, la cual degrada sus anillos beta lactámicos.

30
Q

¿Qué nos indica que la célula es resistente al antibiótico?

A

la expresión de beta lactamasa

31
Q

¿Qué nos indica que la célula integró la secuencia exógena de ADN?

A

La ausencia de expresión de la beta galactosidasa. Aquí es donde se verán blancas las colonias.

32
Q

¿Por qué se pone X-Gal?

A

Porque cuando hay beta galactosidasa y se rompe, X Gal da coloración azul.

33
Q

La beta ___________ esla que determina la resitencia-

A

lactamasa

34
Q

¿Qué característica tiene un vector universal y puede usarse para el vector que usamos?

A

Que se une a una secuencia del VECTOR, cercana al sitio donde se inserta el ADN exógeno, por lo que independientemente de lo que se inserte se va a amplificar.

35
Q

¿Qué hace la ADN ligasa?

A

crea enlace covalente entre el fosfato del 5’ y el hidroxilo 3’ de las dos secuencias. Ahora tendremos un plásmido recombinante.

36
Q

¿Qué hemos usado como molde para la PCR?

A

ADNc, cadena de DNA de cyka, DNA de cola, ahora vamos a usar cultivo.

37
Q

¿Qué es la transformación?

A

Método por el cual se introduce material genético externo a bacterias.

38
Q

¿Qué es la tranfección?

A

método por el cual se introduce material exógeno genético a células eucariotas.

39
Q

¿Qué es X Gal?

A

enzima que corta al sustrato artificial, es sustrato de la beta galactosidasa

40
Q

¿Qué es el IPTG?

A

Un inductor (se une al represor del operón de lactosa), entonces ahora hay expresión de la beta lactamasa –> entonces hay resistencia al antibiótico.

41
Q

V/F

Para que se produzca la beta lactamasa es necesario que la bacteria no tenga disponible glucosa.

A

Verdadero, porque para que se sintetice la beta lactamasa debe tener expresión del operón de lactosa (el cual tiene un represor cuando sí hay glucosa)

42
Q

V/F

El IPTG está involucrado en la resistencia de la célula a antibióticos.

A

Verdadero, es un inductor que se une al represor del operón de lactosa.

43
Q

X gal está involucrado en la detección de células que tengan el ADN exógeno.

A

Verdadero. Es azul cuando no se inserta y blanco cuando si (pq interrumpe la expresión de la beta galactosidasa)