organizmi na vajah

Question 1

s katerimi organizmi se bomo srečevali na vajah?

Answer 1

bakterijo Escherichia coli
bakterijo Salmonella Typhimurium
bakteriofagom P22
glivami kvasovkami

Question 2

kdo in kdaj je odkril E. coli in kako jo je poimenoval

Answer 2

1885
Theodor Escherich
Bacerium coli commune

Question 3

kako se zdaj imenuje in zakaj + v katero družino sodi

Answer 3

Escherichia coli, zaradi skladnosti poimenovanja (dvojna nomenklatura - rod, vrsta)
sodi v družino Enterobacteriaceae

Question 4

opiši E coli

Answer 4

paličasta
gram -
velika 1,1-1,5 X 2,0-6,0 mikrometra
fakultativen anaerob
kemoorganotrof
raste pri 37 stopinjah
živi v prebavilu ljudi in živali - del črevesne mikrobiote. POMEN: sintetizira vitamin K, vitamine skupine B in varuje ekološko nišo

Question 5

kaj povzroča E. coli

Answer 5

• drisk in griž
  – obolenj mokril
  – pljučnice
  – vnetja možganskih ovojnic
  – septikemije

Question 6

opiši genom E. coli

Answer 6

• v celoti posekvenciran
• objavljeno zaporedje genoma seva K-12
  okoli 4 miljoni baznih parov, geni za proteine, za stabilne RNA, nekodirajočo DNA in geme za uravnavanje

Question 7

kakšni so genomi patogenih sevov?

Answer 7

večji

Question 8

kaj so virulentni dejavniki

Answer 8

dejavniki ki omogočijo bakteriji da postane patogena

Question 9

naštej virulentne dejavnike

Answer 9

toksini: za poškodbe
adhezini: omogočijo kolonizacijo, pritrditev
kapsula: ščiti bakterijo pred IS
fimbrije: omogočijo kolonizacijo, pritrditev
plazmidi: dodatne info ki imajo pogosto virulentne zapise
sideroforji: omogočajo privzem železa

Question 10

katere 2 skupini patogenih sevov poznamo

Answer 10

črevesni patogeni (IPEC)
zunajčrevesni patogeni sevi (ExPEC)

Question 11

Virulentni dejavniki
zunajčrevesnih patogenih
sevov E. coli (ExPEC)

Answer 11

adhezini
toksini
sideroforji
kapsula

Question 12

patotipi/virotipi IPEC

Answer 12

enterotoksigene E. coli
enteropatogene
enteroagregativne
enteroinvazivne
nekrotoksigene
enterohemoragične

Question 13

patotipi/virotipi ExPEC

Answer 13

uropatogene
meningitis povzročajoča E. coli
sepso povzročajoča E. coli

Question 14

virulentni dejavniki za IPEC

Answer 14

adhezini
toksini

Question 15

katere proteine sintetizira E. coli

Answer 15

bakteriocine - zavirajo rast drugih sorodni bakterij

Question 16

kako imenujemo bakteriocine E. coli

Answer 16

kolicini

Question 17

kaj so bakteriocini

Answer 17

bakteriocini so toksini, ki
delujejo na celice sorodne
celici proizvajalki

Question 18

lastnosti kolicinov

Answer 18

proteini
1500-90.000 Da
zapisani na plazmidih (morajo imeti zapis za sintezo, za zaščito pred lastnim kolicinom in za sproščanje)

Question 19

naštej dele kolicina in njihove vloge

Answer 19

N-terminalni del: z N delom se veže na proteine transportnega sistema (Ton in Tol) in prenese skozi bakterijsko membrano –> PRENOS SKOZI MEMBRANO

osrednji del: veže se na receptorsko molekulo tarčne celice –> VEZAVA

C-terminalni del DELOVANJE na tarčno celico

Question 20

kako kolicini delujejo na tarčno celico

Answer 20

– tvorijo ionske kanalčke: iztečejo K in Mg ioni, poruši se memb. potencial in celica propade
– razgradijo NK
– inhibirajo sintezo proteinov .. delujejo kot encimi

Question 21

oblike zaščite pred bakteriocini

Answer 21

imunost: celica je zaščitena če ta kolicin sama proizvaja
rezistenca: okvarjeni receptorji na katere se kolicin veže
toleranca: okvarjeni transportni sistemi ki jih kolicini up. za vnos v celico

Question 22

kdo in kdaj je odkril Salmonello Typhimurium in kako jo je poimenoval

Answer 22

1892
Friderich Loeffler
Bacillus typhimurium

Question 23

opiši Salmonello Typhimurium

Answer 23

paličasta
gram -
0,7-1,5 X 2-5 mikrometra
fakultativni anaerob
kemoorganorof
raste pri 37 stopinjah
ni del normalne črevesne mikrobiote (patogena)

Question 24

kaj povzroča salmonela

Answer 24

 drisk (zastrupljenje s hrano)
 gastroenteritisa
 tifoidne vročice

Question 25

opiši genom salmonele

Answer 25

posekvencirali sev LT2
okoli 4 milijone baznih parov

Question 26

opiši bakteriofag P22

Answer 26

 temperiran bakteriofag
 ikozaedrična glava
 kratek rep z bodcami (receptorji ki določajo patogenost)
 prvič opisana transdukcija
po morfologiji podoben fagu T4 po fiziologiji pa fagu lambda

Question 27

opiši genom bakteriofaga P2

Answer 27

dvoverižna DNA
podvajanje krožno, dvosmerno iz 1 začetka

Question 28

opiši Saccharomyces cerevisiae

Answer 28

 evkariontski organizem (5-10 mikrometrov; kroglaste, cilindrične, ovalne; heterotofi; brstenje/nespolno ali spolno razmnoževanje)
 glive kvasovke
 biotehnološko uporabna: kruh, vino, pivo
zelo malo patogenih (bele obloge na sluznici - candida)

Question 29

opiši genom

Answer 29

16 kromosomov
12.000 baznih parov
nastal je s podvojitvijo celotnega genoma prednika, ki so ji sledile obsežne delecije in prerazporeditve genoma