Od DNA do białka Flashcards
Co to chromatyna?
DNA związane z białkiem.
Na co nawinięte DNA w jądrze komórkowym?
Co tworzą?
Oktamer histonowy, osiem białek. Tworząc strukturę nazywaną nukleosomem.
Dalsze nawijanie DNA po nukleosomie.
- Włókna nukleosomalne (nukleofilamenty) - 7 razy skrócenie DNA
- Solenoid (włókno hcromatynowe.) - tworząc 3. Zrąb chromatyny
- Superhelisa
- Chromosom
Skład nukleosomu?
- jest 8 cząsteczek histonów + H1
- histony oktameru H2A, H2B, H3, H4 o ładunku “+”
- DNA ładunek “-“ przez grupy fosforanowe
- H1 białko utzrymujące DNa na oktamerze
Podział na rodzaje chromatyny?
a) heterochromatyna
zwartą i nieaktywna genetycznie
b) euchromatyna
luźna, aktywna genetycznie
Budowa chromosomy?
- telomer (chronią przed skracaniem podczas podziału)
- centromer (miejsce połączenia chromatyd)
- ramiona chromosomu
- chromosom metafazowy (bardziej skondensowana chromatyna) składa się z2 siostrzanych chromatyd
Chromosomy podział?
- chromosom metacentryczny
(długość ramion dość podobna) - chromosom submetacentryczny
(zróżnicowana długość ramion) - chromosom akrocentryczny
(zróżnicowana długość ramioni posiada grudek chromatyny zwanych satelitami) - chromosom telocentryczny
(jeden typ ramienia , nie występuje w kariotypie człowieka)
Opisz kariotyp (garnitur chromosomowy) człowieka?
- allosomy (chromosomy płci)
- autosomy ( występują u wszystkich osobników)
- 22 pary autosomów 1 para allosomów
- szereg numeracji zależy od wielkości
Cykl komórkowy.
4 fazy zwane interfaza to
-G1 przerwa między M i S
-S to synteza DNA
-G2 przerwa między S i M i synteza białek
- G0 faza spoczynkowa
dalszym etapem jest faza M oznaczająca mitozę albo mejozę dzieli się ona na :
-kariokineza podział jądra komórkowego
- cytokinezę podział cytoplazmy
oraz mamy fazę G) zwaną spoczynkową następuje ona wtedy gdy komórka zatrzymała swoje podziały
Cechy mitozy?
Jest to podział komórki w którem z jednej komórki tworzą się dwie identyczne genetycznie , zachowują identyczną liczbę chromosomów.
Fazy mitozy:
-profaza to kondensacja chromatydy i zanik błony jądrowej
- metafaza (medial) ułożenie się na środku i podział cenromerów)
- anafaza wrzeciona mitotyczne ciągną chromatynę do przeciwnych biegunów komórki
- telofaza odtworzeni błony jądrowej
Mejoza cechy?
- może być typu I lub II
- cechują się redukcją chromosomów i rekombinacją
- powstają tak komórki płciowe
Mejoza I opisz.
- Interfaza.
- Profaza I:
- leptoten (dwie przylegające cienkie, nitki tworzone przez chromosmy homologiczne)
- zygoten (przyłączenie nitek)
- diploten (crossing-over wymiana fragmentów chromatyd chromosomów homologicznych) takie chromosomy w których nastąpił crossing-over nazywa się zrekombinowanymi - Metafaza I umiejscowienie się chromosomów homologicznych na środku płaszczyzny
- Anafaza I wędrówka do przeciwnych biegunów
Mejoza II
Następuje po zakończeniu mejozy I podobny do podziału mitotycznego.
Cechy genu?
- informacja o kodowanym białku lub RNA
- eksony (fragmenty kodujące)
- introny (fragmenty niekodujące)
Opisz proces replikacji DNA.
- Rozplecenie DNA (miejsca inicjacji replikacji) miejsca ori, powstaje oczko replikacyjne ograniczone widełkami.
- Topoizomeraza usuwa skręty zpodwójnej nici DNA przez przerywanie i łączenie jedenj lub obu nici.
- Helikaza rozrywa wiązania wodorowe.
- Prymaza syntetyzuje startery, a egzonukleaza usuwa je.
- Polimeraza DNA przyłącza kolejne nukleotydy zgodnie z zasadą komplementarności.
- Ligaza uzupełnia brakujące wiązania fosfodiestrowe.
(Do tego systemu można zaliczyć białka stabilizujące)
Jedna nić wiodąca jest komplementowana w sposób ciągły, druga zaś nić opóźnionajest za pomocą odcinków Okazaki.
Cechy replikacji wymień:
- zachodzi w jądrze komórkowym
- kierunek 5’ do 3’
- powstają kopie macierzystego DNA
- replikacja semikonserwatywna zawiera nić starą (rodzicielską) nić nową
- naprawiane błędy są przez samą polimerazę DNA czy systemy naprawcze
- można podzielić na inicjację, elongacje, terminację
Wymień cechy procesu transkrypcji:
- zachodzi w jądrze komórkowym
- kierunek 5’ do 3’
- przepisanie informacji genetycznej z DNA na RNA
- transkrypcji ulega nić matrycowa
- zamiast tyminy uracyl
- zawiera etap elongacji, inicjacji, terminacji
Etap inicjacji transkrypcji DNA.
- białka transkrypcyjne wiążą się z promotorem
- polimeraza łączy się dopiero z białkami i kwasu nukleinowego tworząc kompleks inicjacji
- punkt startu ATG
- czasem występuje kaseta TATA z którą łączy się białko TBP
Etap elongacji i terminacji DNA.
- elongacja wydłużenie powstałej nici
- terminacja zakończenie procesu syntetyzacji sekwencji AAUAAA
- produkt końcowy pre-mRNA (zawiera introny i egzony)
Jakie modyfikacje następują po transkrypcji?
- dołączenie czapeczki na końcu 5’ (zachodzi w jądrze chroni przed zniszczeniem przez nukleazy oraz jest miejscem przyłączania czynników inicjujących translację w cytoplazmie)
- dołączenie ogona poli-A na końcu 3’
(inaczej poliadenylacja służy przed degradacją oraz zwiększa wydajność RNA jako matrycy do translacji) - splicing (przecięcie pre-mRNA na granicy intronów i egzonów i złożeniu nici bez intronów i zachodzi dzięki kompleksowi białkowo-nukleoproteinowego zwanego spliceosomem, który rozpoznaje odpowiednią sekwencje 5’ do 3’ intronu, przecina zapetla ją tworząc lasso)
Co to splicing alternatywny?
Nie włączenie danego egzonu powoduje wytworzenie różnych białek.
Cechy translacji:
- zachodzi w cytoplazmie
- kierunek 5’ do 3’
- synteza białka na podstawie RNA
- ## potrzebuje rybosomów, matrycy, aminokwasów, tRNA i energi
inicjacja procesu translacji:
Złożenie maszynerii translacyjnej oraz rozpoznanie kodonu AUG kodonu start na nici mRNA.
Połączenie rybosomu z metopnylo-tRNA i z czapeczką , rybosom przesuwa się po cząsteczce mRNA aż trafia na AUG czyli miejsce inicjacji translacji, w procesie translacji biorą udział kompleksy białkowe.
Elongacja procesu translacji.
Wydłużenie sekwencji łańcucha peptydowego. Cząsteczki tRNA z aminokwasem łączą się dzięki miejscom A, P i E. W miejscu A przyłącza się kolejna cząsteczka z aminokwasem, której antykodon odpowiada kolejnemu kodonowi mRNA. Między metionina a aminokwasem tworzy się wiązanie peptydowe, a metionina odłącza się od tRNA a rybosom przesuw się o jedno miejsce.
W miejscu P nowo przyłączony tRNA.
W miejscu E opuszcza rybosom.
