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Microbiologie > Observations microscopiques (Chapitre 2) > Flashcards

Observations microscopiques (Chapitre 2) Flashcards

1
Q

En quel point, les lentilles convexes focalisent les rayons?

A

Foyer

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Q

Distance entre foyer et centre de la lentille?

A

Distance focale

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3
Q

De quoi dépende la puissance d’une lentille?

A

Distance focale

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4
Q

Plus la distance focale est courte…?

A

plus la lentille agrandit l’objet

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5
Q

Définition réfraction?

A

Déviation d’un rayon lumineux (d’une onde) lors de son passage d’un corps transparent à un autre.

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6
Q

Définition indice de réfraction?

A

Une grandeur qui caractérise la capacité d’un milieu transparent à ralentir et dévier la lumière. Il est défini comme le rapport de la célérité (vitesse) de la lumière dans le vide par la célérité de la lumière dans ce milieu.

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7
Q

Comment fonctionne la dérivation de la lumière par un prisme?

A

Quand le rayon lumineux pénètre le prisme, il dévie vers la première normale et lorsqu’il quitte, il s’écarte de la deuxième normale

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8
Q

Quels sont les 5 types de microscopes les plus utilisés?

A
  • à fond clair
  • à fond noir
  • à contraste de phase
  • à fluorescence
  • confocal
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9
Q

Qu’est-ce que microscope composé?

A

un microscope à deux jeux de lentilles (oculaire et objectifs)

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10
Q

Est-ce que tous les microscopes modernes sont des microscope composés?

A

Oui

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11
Q

Définition de l’objectif?

A

La lentille la plus proche de l’échantillon

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12
Q

Pourquoi dit-t-on microscope à fond clair?

A

L’image est foncé, sur un fond clair

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13
Q

Microscope à fond claire, les 12 composantes?

A
  • Oculaire
  • Corps d’assemblage
  • Potence
  • Porte objectifs
  • Objectifs
  • Plateau mécanique
  • Contrôle de l’ouverture du diaphragme
  • Condensateur sous plateau
  • Base avec source lumineuse
  • Boutons de réglage du plateau
  • Potence
  • Contrôle de l’intensité lumineuse
  • Bouton d’ajustement grossier
  • Bouton d’ajustement fin
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14
Q

Quel est le rôle du bouton d’ajustement grossier et du bouton d’ajustement fin

A

Déplacer le plateau et le porte objectif pour permettre la mise au point de l’image

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15
Q

Quel est le rôle du condensateur?

A

Diriger les faisceaux de lumières vers la lames porte-objet

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16
Q

Nom d’un microscope à deux oculaires

A

Binoculaire ( pour les deux yeux )

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17
Q

Qu’est-ce qu’un microscope compensateur ou parfocal?

A

Un microscope qui garde l’image au même point lorsqu’on change d’objectifs. L mise au point reste la même.

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18
Q

Comment calculer le grossissement total?

A

Grossissement objectif x grossissement oculaire

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19
Q

Définition résolution (limite de résolution)?

A

La capacité d’une lentille de séparer ou distinguer des petits objets proche l’un de l’autre

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20
Q

Formule de Ernest Abbé, distance minimal entre deux objets permettant de les discerner?

A
  • d = 0.5 x (lambda) / n sin (têta)
    où n sin(têta): l’ouverture numérique, n: indice de réfraction, têta: la moitié de l’angle de du cône de lumière qui rentre dans l’objectif
  • Plus d diminue, plus la résolution augmente
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21
Q

Résultat cône de lumière étroit dans l’objectif?

A

Faible résolution, car sépare mal les rayons lumineux

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22
Q

Résultat cône de lumière large dans l’objectif?

A

Haute résolution, car sépare bien les rayons lumineux

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23
Q

La résolution est un facteur limitant, sur quel facteur peut -on intervenir pour réduire ce facteur limitant

A
  • Longueur d’onde
  • Indice de réfraction du milieu (objectifs à plus fort grossissement)
  • L’angle du cône de lumière
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24
Q

Mise à part la limite de résolution, quel est un facteur limitant à l’image du microscope?

A

Le constrate

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25
Q

Définition du contraste?

A

Capacité de distinguer une structure de son environnement.

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26
Q

Aucune lentille ne peut avoir une ouverture numérique supérieure à 1…?

A

1

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27
Q

Quel est le moyen pratique pour augmenter l’ouverture numérique d’une lentille supérieure à 1?

A

Utiliser de l’huile à immersion, donc il a de l’huile à l’immersion à la place de l’aire entre l’objectif, donc l’indice de réfaction est élevé (indice de réfraction du verre et de l’huile = la même)

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28
Q

Qui est derrière le microscope à fond claire ?

A

Köhler

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29
Q

Qu’est-ce qui augmente lorsque l’ouverture numérique augmente?

A

La résolution

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30
Q

Quel est la distance de travail?

A

Distance entre surface inférieur de l’objectif et de l’échantillon

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31
Q

Quel est l’ouverture numérique d’un condensateur?

A

Enrte 1.2 et 1.4

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32
Q

Microscope à fond claire peur séparer deux points d’une distance de… ?

A

0,2um

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33
Q

Point faible du microscope à fond claire?

A

Les cellules vivantes non pigmentées ne sont pas clairement visible à cause de la faible différence de contraste entre les cellules, les structures cellulaires et l’eau

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34
Q

Comment fonctionne un microscope à fond noir?

A

Il fournit des images détaillés des cellules et des organismes vivants non colorés en modifiant simplement la façon dont ils sont éclairés

Le microscope à fond noir peur révéler des structures internes dans les plus grands microorganismes eucaryotes.

Utilisé pour identifier des bactéries telles que Treponema pallidum, l’agent infectieux de la syphilis

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35
Q

Dans un microscope à fond claire comment augmenter le contraste?

A

La coloration

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36
Q

Qu’est-ce que la coloration simple

A

Juste un colorant

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37
Q

Exemple de colorant

A

Bleu de méthylène

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38
Q

Dans un microscope à contraste de phase, que signifie le sondes sont déphasées?

A

Les ondes déviées sont ralentis par rapport au ondes non déviées (ondes déviées ralenti de 1/4 longueur d’onde.

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39
Q

Dans un microscope à contraste de phase, quels sont les rayons non déviés?

A

Ceux de l’environnement

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40
Q

Dans un microscope à contraste de phase, quels sont les rayons déviés?

A

Ceux de la bactérie

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41
Q

Quel est le fonctionnement du microscope à contraste de phase?

A
  • Lumière déviée
  • Lumière non déviée
    Les deux sont manipulées et combinées pour former une image.
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42
Q

Quels sont les deux composants du microscope à contraste de phase permettant son fonctionnement (séparation de lumière)

A
  • Anneau du condensateur
  • Lame de phase
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43
Q

Quel phénomène se déroule lorsque les deux types de rayons se combinent à la fin pour former une image? (contraste de phase différentiel)

A

Interférence destructive

44
Q

Quels sont les trois types d’utilisation du microscope à contraste de phase?

A
  • étudier la mobilité bactérienne
  • déterminer la forme des cellules
  • détecter des constituants bactériens
45
Q

Quel est le rôle des endospores bactériens?

A

Il s’agit d’une stratégie de survie (quand ila des conditions extrêmes, l’endospore pousse autour du cytoplasme pourb la protéger)

46
Q

Les microscopes à contrastes de phase et à contraste d’interférence différentielles sont utilisés pour regarder quel type d’échantillons?

A

Échantillons transparents

47
Q

Les microscopes à contraste d’interférence différentielles permet de voir l’échantillon de quelle manière?

A

En trois dimensions (pseudo-relief 3D) avec des couleurs vives

48
Q

Comment fonctionne la microscopie en fluorescence?

A

Un échantillon est excité avec une lumière ayant une longueur d’onde spécifique et forme une image avec une lumière spécifique.

Lampe à mercure produit un rayon lumineux qui passe à travers un filtre d’excitation.

49
Q

Dans la microscopie en fluorescence, l’échantillon est éclairé par le bas ou par le haut?

A

Contrairement aux autres, par le haut.

50
Q

Dans la microscopie en fluorescence, l’échantillon est traité avec des molécules colorantes nommées…?

A

Fluochrome

51
Q

Qui est derrière le microscope à contraste d’interférence différentielle?

A

Nomarski

52
Q

Dans une microscope à contraste d’interférence différentielle, comment sont contrôlée les lentilles?

A

Les lentilles polarisantes sont contrôlées par ordinateur (informatique)

53
Q

Quels sont les avantages du microscopes à contraste d’interférence différentielle?

A
  • Visualisation de structures très fines sans coloration ni fixation (cellules vivantes)
  • Absence de halo de diffraction (autour du microorganisme)
54
Q

Vrai ou Faux. Avec le microscope à épifluorescence, il est possible de distinguer les cellules vivantes de celles des mortes

A

Vrai, avec un colorant spécial, cellule verte = vivant, rouge = mort

55
Q

Vrai ou Faux, avec le microscope à épifluorescence, il a une source de UV au dessus de l’échantillon?

A

Vrai

56
Q

Vrai ou faux. Avec le microscope à épifluorescence, on peut identifier des bactéries pathogènes.

A

Vrai, avec de la coloration à fluorochrome ou avec marque spécifique avec des anticorps

57
Q

Vrai ou faux. Avec le microscope à épifluorescence, il est possible de déterminer si un organisme est vivant ou mort sans faire de culture.

A

Vrai.

58
Q

Qu’est-ce que l’immunofluorescence?

A

Utilise des anticorps ainsi que des fluorochromes. L’immunofluorescence permet de révéler une protéine spécifique directement dans la cellule, par émission de fluorescence. Elle permet donc de déterminer non seulement la présence, ou l’absence d’une protéine, mais aussi sa localisation dans la cellule, ou le tissu analysé.

En gros, immunofluorescence = diagnostique

59
Q

Comment on quantifie, avec épifluorescence, les proportions de cellules mortes ou vivantes ou l’identification des différence espèces spécifiques?

A

Analyses informatiques d’image

60
Q

Quel est le principe du microscope confocal?

A

Image très claire et détaillée de plusieurs plans permettant une reconstruction tridimensionnelle
Vue de l’échantillon sur trois angles

61
Q

Qu’est-ce que la fluorescence in situ? (FISH)

A
  • Avec hybridation
  • Sonde ADN fluorescentes spécifiques
  • Il est possible de différencier ls espèce en fonction des différents fluorochromes.
62
Q

Applications microscope confocal?

A

Études de biofilms qui se forment sur plusieurs surfaces

(une communauté multicellulaire plus ou moins complexe, souvent symbiotique, de micro-organismes (bactéries, microchampignons, microalgues ou protozoaires), adhérant entre eux et à une surface, et marquée par la sécrétion d’une matrice adhésive et protectrice. Il se forme généralement dans l’eau ou en milieu aqueux)

Biofilms importants dans domaine médicale, car entraine infections difficiles à traiter

63
Q

Définition fixation

A
  • Conservation des structures internes et externes
  • Inactivation des enzymes qui peuvent détruire la morphologie cellulaire
  • Durcit les structure pour quelle ne se modifie pas durant la coloration
64
Q

Deux types de fixation?

A
  • Fixation à la chaleur
  • Fixation chimique
65
Q

Définition fixation chimique?

A
  • Protège structures intercellulaires et morphologie
  • Pour microorganisme plus grand et plus délicats (protistes)
  • Pour protistes
66
Q

Définition fixation à la chaleur?

A
  • Pour bactérie et archées
  • Détruit protéines qui modifient apparence
  • ## Inactive enzyme
67
Q

Définition coloration?

A
  • Colorés grâces à liaisons ionique, covalent ou hydrophobe des GROUPEMENTS CHROMOPHORES
  • Ionique plus courant
68
Q

Deux types de colorants?

A
  • Basique (milieu basique = colorant basique)
  • Acide (même chose)
69
Q

Coloration simple?

A

Un seul agent de coloration

70
Q

Méthode de coloration de l’ADN?

A

Feulgen (liaison covalente avec désoxyribose, après traitement de l’acide chlorhydrique)

71
Q

Colorant, noir Soudan?

A

Colore sélectivement les lipides parce qu’il est liposolubles

72
Q

Deux exemple de colorants basique?

A

Bleu de méthylène, carbolfuschine,
- Détermine la forme, l’arrangement et la taille des cellules bactériennes et archéennes

73
Q

Étape de coloration de Gram (exemple de coloration différentielle)

A
  • Colorant primaire (exemple cristal violet)
  • Rinçage
  • Mordant (favorise interaction entre colorant et molécules cibles)
  • Rinçage
  • Alcool (10 à 30 secondes)
  • Rinçage
  • Contre colorant (exemple safranine)

Résultat final : bactérie gram + = violettes, bactéries gram - = roses

74
Q

Rôle principales de coloration de gram?

A
  • Distinguer les bactérie gram + et -
75
Q

Nommez cinq types de coloration?

A
  • Coloration de gram
  • Coloration acido-alcoolo-résistante
  • Coloration des endospores
  • Coloration de capsules
  • Coloration des flagelles
76
Q

Coloration acido-alcoolo-résistante?

A
  • Identification des Mycobacterium tuberculosis et M. leprae
  • Pour identifier tuberculose et lèpre
  • Parois de ces bactéries ont beaucoup de lipides qui empêchent la fixation du colorant
  • Dans le fond il résistent au colorant, les autres sont décolorées
77
Q

Coloration des endospores?

A
  • La chaleur force l’entrée du colorant dans les endospores, structure exceptionnellement résistante aux conditions extrême, dans la bactérie parentale
  • Endospores se colorent pas facilement, mais une fois colorées résistance +++ à la décoloration
78
Q

Coloration de capsules?

A
  • Révèle la présence de capsule
  • Coloration la plus simple (par encre de Chine ou negrosine)
  • Coloration négative, car colorant va pas dans capsule
79
Q

Capsule définition?

A

L’enveloppe qui peut entourer la paroi de certaines bactéries. Elle est généralement de nature polysaccharidique. Néanmoins, certaines capsules sont de nature protéiques. EN gros, elle protège la bactérie

80
Q

Coloration des flagelles?

A
  • Relève présence et type de flagelles pour bactéries et archées
81
Q

Définition flagelle?

A

Organite de locomotion, invisible au microscope électronique, pour les voir on es épaissis avec une substance comme acide tannique, alun de potasse.

82
Q

Nommez des techniques de coloration?

A
  • Technique d’ombrage (vaporisation de métaux, angle précis)
  • Coloration négative ( acide phosphotungstique, accumulation dans les creux, creux = sombre, bosses et claires, pour relief et structures des virus)
  • Cryodécapage (La cryofracture est une méthode utilisée pour la recherche en biologie. Elle permet l’observation d’une coupe cellulaire formée à partir d’un échantillon congelé + fracture au zone de faiblesses + suivie de la technique d’ombrage -> Utilisé pour intérieur des cellules)
  • Immuno- localisation (immuno= utilisation d’anticorps comme outils, on couple les anticorps avec du Fer ou de Or, localisation d’une structure de protéine par anticorps spécifiques, anticorps invisible, là ou il a or a anticorps)
83
Q

Différence entre shadow casting et coloration négative?

A
  • Coloration négative = creux = sombre
  • Shadow casting = élévation = sombre
84
Q

Protéine SARS-cov2 ?

A

Protéine Spike

85
Q

Quel est le principe le la technique d’ombrage (shadow casting)?

A

Recouvre l’échantillon de métaux, création d’ombre, bille témoin dont on connait la grandeur, comparaison avec la bille témoin pour déduction de la grandeur

86
Q

Vrai ou faux. Les électrons, lorsqu’ils sont absorbés, il a une structure sombre?

A

Vrai, lorsque les électrons passent à travers, cela créé une structure claire

87
Q

Vrai ou faux, les microscopes optiques ont une meilleur résolution que ceux électroniques?

A
  • Faux, les microscopes optiques permettent d’observer des microorganismes avec moins de résolutions
  • Bactéries oui, mais virus non, trop petits
  • Électronique = résolution 1000x meilleur (grossissement jusqu’à 400 000 X)
88
Q

Vrai ou faux, pour les microscopes optiques, plus la longueur d’onde est petite plus la résolution est augmentée

A

Vrai, petites longueurs d’ondes = meilleure résolution

89
Q

Microscopes électroniques à transmission?

A
  • Filament de tungstène chauffé = faisceau d’électrons, centré sur l’échantillon grâce au condensateur
  • Électrons traversent pas lentilles de verres (bloqué), donc lentilles magnétiques (électro-aimants)
90
Q

Début du microscope électronique? Année?

A

1931, Ruska

91
Q

Quelles sont les longueur d’ondes visibles?

A

400 à 700nm

92
Q

Comment fait-on pour voir les longueurs d’onde du microscope électronique si leurs longueurs d’onde sont des picomètre?

A

On regarde sur :
- Écran fluorescent
- Plaque photographique
- Détecteur numérique
(on est à l’extérieur du visible)

93
Q

Pourquoi les microscopes électroniques sont souvent dans un sous-sol?

A

Pour éviter de subir des vibrations

94
Q

Vrai ou faux, les électrons voyagent dans le vide?

A

Vrai, les échantillons sont soumis au vide à l’intérieur du microscope (ils deviennent donc morts sous microscope électronique)

95
Q

Qu’est-ce que le microscope électronique à balayage?

A

Balayage de la surface de l’échantillon

96
Q

À l’examen, différencier image microscope transmission et balayage. À regarder sur internet.

A

ok

97
Q

Différence entre microscope électronique à transmission vs à balayage?

A

Balayage = on voit la surface (détail de surface plus pâle)
Transmission = on voit en transparence (détail plus noir)

98
Q
A
99
Q
A
100
Q

Croyélectromiscroscopie et cryotomographie électronique?

A
  • Par tomographie (image de strates de l’échantillon)
  • Sans production de coupe
  • Reconstruction informatique 3D (système de traitement d’image)
  • Ils sont en amélioration constante
101
Q

Différence croyélectromiscroscopie et cryotomographie électronique?

A

(Figure 3.39)

102
Q

Définition microscope à fluorescence

A
  • PHOTONIQUE
  • Illumination par laser UV
  • Utilisation des fluorochromes
  • Détection de la fluorescence, uniquement du plan au foyer
  • Élimination de la fluorescence hors foyer
  • Plus gros contraste, moins grosse interférence
103
Q

Avanatage, microscope confocal à balayage laser?

A
  • Mettre en évidence des interactions protéiques
  • Colocalisation de deux protéines qui réagissent ensemble
  • Croissance et développement de tissus/phénomènes dans le temps (exemple poisson) –> 4 dimensions, 3D + temps
  • Analyse des cellules mortes et vivantes en fonction du temps
104
Q

Définition, microscope à balayage de sonde (récent) ?

A
  • Sonde balaie la surface
  • Mesure le déplacement vertical/horizontale et le courant entre les nuages électroniques
  • Grossissement 10 exp8
  • Liens intermoléculaires
  • OBSERVATIONS EN MILIEU AQUEUX
105
Q

Type de microscope à balayage de sonde?

A
  • À effet tunnel
  • À force atomique
    (nanotechnologie, biomatériaux)
106
Q

Microscopie électronique en 3D (relief) correspond à quel type?

A

Transmission, 3D = balayage

107
Q
A

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