NÜKLEİK ASİTLER Flashcards
1
Q
DNA’ya dayanıklılık sağlayan madde?
A
Deoksiriboz şeker
2
Q
Nükleotidden şekeri ayıran enzim?
A
Nükleozid Fosforilaz
3
Q
Nükleotidden fosfatı ayıran enzim?
A
5’nükleotidaz
4
Q
DNA ve RNA’ya asit özelliği veren madde?
A
Fosfat
5
Q
Pürin nükleotitlerinde şeker ile baz arasındaki bağ?
A
N-Glikozid Bağı
(Pürin 9.pozisyondaki atom -N9- ile)
6
Q
Primidin nükleotitlerinde şeker ile baz arasındaki bağ?
A
N-Glikozid Bağı
(Primidin 1.pozisyondaki atom -N1- ile)
7
Q
Pürin Halkası?
(5 C ve 4 N)
A
Glutamin
Aspartat
N10-formil THF ve N5N10-metenil THF
CO2
Glisin
8
Q
De nova pürin sentezinde hem C hem de N kaynağı?
A
Glisin
9
Q
Pürin döngüsü ve TCA’yı birleştiren?
Anaplöretik Reak. nedir?
A
Fumarat
Pürin nükleotid döngüsünde oluşan fumarat egzersiz anında enerji üretmek için TCA’yı besler=Anaplöretik Reax.
10
Q
IMP oluşumu reak. tipi? ve enzimi?
A
Dehidrasyon
IMP siklohidrolaz
11
Q
IMP——-AMP oluşumu için gerekli maddeler?
A
Aspartat
GTP
12
Q
IMP——–GMP oluşumu için gerekli maddeler?
A
Glutamin
ATP
NAD
13
Q
Oluşan ilk pürin nükletoidi?
A
IMP=İnosinmonofosfat
14
Q
Denova pürin sentezi nereden gelen hangi madde ile başlar?
A
HeksozMonoFosfat yolundan gelen;
Riboz-5-Fosfat ile başlar
15
Q
Riboz-5-Fosfat————->PRPP
reak.nunda görevli enzim ve harcanan enerji?
A
Enzim:PRPP sentetaz
1 ATP /2 Fosfatbağı harcanır (ATP—AMP)
16
Q
Riboz 5 Fosfattan IMP’ye gelene kadar harcanan enerji miktarı?
A
5 ATP
17
Q
Bir molekül IMP sent. için kaç yüksek enerjili fosfat bağı maaliyeti vardır?
A
6
18
Q
Pürin sentezi inhibitörleri?
A
Diazanorlösin
Azaserin
PABA
Metotreksat
Mikofenolik Asit (İMP dehidrog. inhbt.)
Merkaptopürin
19
Q
Pürin sent.de yan yol=kurtarma yolu=salvaj’da görevli enzimler?
A
APRT (adenin fosforibozil transferaz)
HGPRT (hipoksantin-guanin fosforibozil transferaz)
20
Q
Pürin/salvage=kurtarma yolu reak.ları?
A
Hipoksantin—–HGPRT—–>IMP
Guanin————HGPRT—–>GMP
Adenin————APRT——–>AMP
21
Q
Kurtarma yolunda kullanılan aktif şeker?
A
PRPP
22
Q
Pürin salvage yoldaki HGPRT enzim eks. ile karakterize sendrom? ve belirtileri?
A
Lesch-Nyhan Sendromu
Hiperürisemi
Zeka geriliği
Nörolojik belirtiler
Kendine zarar verme potansiyeli
23
Q
Pürin salvage yoldaki APRT enzim eksikliğinde idrarda artan madde?
A
2.8-dihidrooksiadenin
böbrek taşları oluşur bu madde rutin analizde üratla karışabilir
24
Q
Pürin katabolizması ortak ara ürünü?
A
Ksantin
25
Pürin katabolizması sonucu oluşan son ürün?
Ürik Asit
26
Ksantin;ksantin oksizdaz için önce bir ürün sonra da bir substrattır. Reak.lar?
Hipoksantin---->Ksantin---->Ürik Asit
Hipoksantşn--->ksantin reak.da H2O2 açığa çıkar.
bütün bu reak.ları ksantin oksidaz gerçekleştirir
27
Ksantin oksidaz yapısı?
Kofaktörü?
Flavoprotein yapılı bir enzim
Molibden
28
Fe-S içerenler?
K1 (sistein)
K2 (sistein)
K3 (sistein)
Ksantin oksidaz (sistein+histidin) =rieske
Akonitaz (sistein)
29
H2O2= Hidrojen Peroksit açığa çıkaran enzimler?
SOD=Süperoksit Dismutaz
Ksantin Oksidaz
Protoporfirojen Oksidaz
30
Primer renal GUT'TA problem?
Ürik asit atılımı azalmıştır
31
Primer metabolik GUT'ta problem?
Ürik asit üretimi artmıştır
32
Primer metabolik GUT mekanizması?Kalıtım şekli?
X'e bağlı kalıtılır
PRPP sentetaz enzimi mutasyona bağlı hiperaktiftir , aşırı kontrolsüz çalışır ve hiperürisemi=GUT görülür.
33
Von Gierke'de görülen enzim eksikliği? Klinik?
Glukoz-6-fosfataz eksikliği
Hiperürisemi görülür
34
Hiperürisemi nedenleri?
1.PRPP artışı
(Lesch nyhan send. ve PRPP Sentaz hiperaktivitesi)
2.Von Gierki Hastalığı
3.Fruktoz alımının artması
35
Hiperürisemi ve GUT tedavisinde kullanılan ilaçlar?
Rasbürikaz
Allopurinol
Kolşisin
Sülfinpirazon ve Probenesid
36
İnsanda tdv amaçlı kullanılarak ürik asidi suda çözünür hale getiren rekombinant ürat oksidaz enzimi?
Rasbürikaz
Tümör lizis send. tedavisinde de kullanılır
37
Ürik asit ölçümünde kullanılan asit?
Fosfotungustik asit
38
Ürik asit atılımını arttıran ilaçlar?
Sülfinpirazon
Probenesid
Aynı zamanda tofüs oluşumunu engeller
39
Ürik asit oluşumunu azaltan hipoksantin analogu ilaç?
Allopurinol
40
İskemi-reperfüzyon hasarında hasara neden olan enzim?
Ksantin oksidaz
(H2O2 ve süperoksit üretir)
41
ADA (adenozin deaminaz) ve
PNP (pürin nükleozit fosforilaz)
eksikliği mekanizması?
ADA: dATP artar
PNP: dGTP artar
bu artan maddeler RİBONÜKLEOTİT REDÜKTAZI inhibe eder.
DNA sentezi ve hüc. bölünmesi engellenir
42
ADA (adenozin deaminaz) enzimini inhb. ederek etki gösteren kemoterapötik ajan?
Pentostatin
43
Ksantin oksidaz eks.de neler görülür?
Hipoksantin--->ksantin--->ürik asit
Ksantin artar (yan yoldan geldiği için)
Hipoksantin artar
Ürik asit azalır
İdrarla ksantin (ksantin taşı oluşur) ve hipoksantin atılır
hipoürisemi görülür.
44
Primidin halkasını oluşturan C ve N kaynakları? (4 C ve 2 N)
Glutamin
Aspartat
CO2
45
Su kullanarak fosfatları yapıdan ayıran, nükleotidi nükleozit haline çeviren enzim?
Nükleotidaz
46
Nükleozit (şeker+baz) yapısından şekeri ayıran enzim?
PNP= Pürin nükleotid fosforilaz
47
ADA enziminin gerçekleştirdiği reak? ve eksikliğinde görülen klinik?
Adenozin---->İnozin
Eks.de B ve T lenfosit kombine bozuklukları ve immun yetmezlik görülür.
48
PNP enziminin yapıdan uzaklaştırdığı madde? ve eksikliğinde görülen klinik?
Şeker=riboz-1-fosfat
Nörolojik sempt.lar +
immun yetm. (T) + hemolitik anemi
49
Kofaktörü molibden olan enzimler? ve Molibden eks.de görülen klinik?
Ksantin Oksidaz
Sülfid Oksidaz (bilat. lens dislokasyonu)
Molibden eksde. HİPOÜRİSEMİ görülür.
50
Ksantin oksidaz inhbt.leri?
Allopurinol
Febuxostat
51
Primidin sentezinde hem C hem N kaynağı bileşik?
Aspartat
52
Primidin sentezi nasıl başlar?
2 ATP+Glutamin+2CO2--->Karbomoil Fosfat
53
Primidin sent.de hız kısıtlayıcı enzim?
Karbomoil Fosfat Sentetaz-2
54
Pürin sent. nerede gerçekleşir?
Sitoplazmada
55
Primidin sent. nerede gerçekleşir?
Sitoplazmada (1basamak hariç, o basamak mitokondride)
56
Mitokondride gerçekleşen primidin sentez basamağı?
Dihidrooratat------------> Orotik asit
Mitokondriyal enzim:
DİHİDRO ORATAT DEHİDROGENAZ
57
Karbamoil Fosfat Sentetaz 1 nerede ve hangi metabolik yolda bulunur? Azot kaynağı nedir?
Mitokondri
Üre döngüsü
Amonyak
58
Karbamoil Fosfat Sentetaz 2 nerede ve hangi metabolik yolda bulunur?
Sitoplazma
Primidin sentezi
59
Karbamoil Fosfat-2'nin inhibit. ve aktivatörleri?
İnhbt: UTP
Aktvt: ATP ve PRPP
60
Primidin sentezindeki mitokondrial enzim ve inhibitörü?
Dihidrooratat dehidrogenaz
Leflunomid
61
CAD gen ürünleri?
Carbamoil Fosfat Sentetaz-2
Aspartat Transkarbomoilaz
Dihidroorotataz
62
Carbamoil Fosfat Sentetaz-2 ve
Aspartat Transkarbomoilaz 'ın inhibtörleri?
KPS-2 inhb: UTP
ATK inhb: CTP
63
Primidin sentezinde yapılan ilk primidin türevi?
Orotik Asit
64
Primidin sentezinde yapılan ilk primidin nükleotidi?
OMP
65
Tip 1 Orotik asidüride görülen enzim eksiklikleri?
Orotat fosforibozil transferaz
OMP dekarboksilaz=orotidilat dekarboksilaz
66
Tip 2 Orotik asidüride görülen enzim eksiklikleri?
OMP dekarboksilaz = orotidilat dekarboksilaz
67
Primidin nükleotidleri yıkım ürünleri?
Beta-Alanin
Beta-Aminoizobütirat
Karbondioksit
Amonyak
Süksinil-KoA
Asetil-KoA
68
Urasil/sitozin yıkımında son ürün?
B-alanin
69
Timin yıkımında son ürün?
B-Aminoizobütirat
70
pH ve ısı değişikliklerine karşı dayanıklı olan DNA bağı?
Fosfodiesteraz
71
DNA heliks yapısının yarısını açıldığı ısı?
DNA'nın erime derecesi
72
DNA denatürasyonu; DNA çözeltisinin kaç nm'deki absorbansı ölçülerek izlenir?
260 nm
73
Mitokondriyal DNA sentezinden sorumlu olan enzim?
DNA polimeraz gama
74
Mitokondriyal DNA tarafından kodlanmayıp tamamen nükleer DNA tarafından kodlanan ETZ birimi?
Kompleks 2
75
DNA sentezinde yeni sentezlenen sarmallar kalıp sarmala uygun olarak sentezlenir. Böylece yeni oluşan çift sarmallarda bir yeni bir de eski zincir bulunur. Bu olaya ne denir?
Semikonservatif replikasyon
76
DNA Replik başlangıç bölgesi hangi bazdan zengindir?
Adenin ve Timin
77
Replikasyon başlangıç bölgesi ne ile işaretlenir?
dna A
78
dna A ile işaretlenen DNA bölgesindeki H bağları ne ile kesilir?
Helikaz (dna B)
79
Açılan çift sarmal yapının kapanmamasını açık kalmasını sağlayan prot?
Çift sarmal yapının tekrar oluşmasını önleyen prot?
Tek sarmallı DNA bağlayan prot.ler (SSBPs/TSB)
80
DNA sentezinde okuma yönü?
3' 5'
81
DNA sentezinde sentez yönü?
5'3'
82
DNA Polimeraz 3 nereye bağlanır?
3' uca bağlanır
83
Lider zincir?
Kesiksiz zincir
Tek bir primeri vardır
84
Kesikli zincir?
Birçok primer vardır
Okazaki fragmanları bulunur (okazaki fragmanı başına birer primer vardır)
85
Ökaryotlarda primer zincir sentezi?
DNA Polimeraz Alfa (DNA Primazın alt sınıfı)
86
Prokaryotlarda kısa RNA parçaları sentezleyen özgün RNA polimeraz?
DNA primaz=DNA G
87
DNA replikasyonu sırasında DNA çift sarmalının açılması ve primerlerin yerleşmesini sağlayan protein kompleksi?
Primozom
88
Primozomun yapısı?
DNA helikaz + DNA primaz
89
DNA replikasyonunda bir nükleotit eklemek için kaç yüksek enerjili fosfat bağı hidrolize olur?
2
dATP--------------->dAMP (zincirde bulunan)
90
DNA replikasyonunun doğruluğunu sağlayan enzim? (Lipincott)
DNA polimeraz 3
91
DNA replikasyonun esnasındaki kontrolü sağlayan enzim? (Harpers)
DNA polimeraz2
92
DNA polimeraz 3 ve 1'in yaptıkları zinciri FOSFODİESTER bağı ile birleştiren enzim?
DNA Ligaz
93
DNA'nın üç boyutlu yapısını sağlayan enzim?
DNA Topoizomeraz
94
Tip 1 Topoizomeraz inhbt.leri?
Topotekan
İrinotekan
95
Tip 2 Topoizomeraz inhibt.leri?
Etoposit
Teniposit
96
DNA zincirinin uzamasından esas sorumlu enzim?
Lider (kesintisiz) zincir uzamasını sağlayan enzim?
Okazaki fragmanlarının uzamasını sağlayan enzim?
DNA Polimeraz III
DNA polimeraz epsilon
DNA polimeraz delt
97
RNA primeri hangi enzimle uzaklaştırılarak yerine aynı enzimle uygun nükleotidler yerleştirilir?
DNA Polimeraz I
98
DNA Polimeraz III'ün fonksiyonları?
5'3' polimeraz (DNA parçası koydu)
3'5' ekzonükleaz (hatalı DNA parçası çıkardı)
99
DNA Polimeraz 1'in
100
DNA'nın nükleusta paketlenmesi ve uygun şekilde katlanmasını sağlayan proteinler?
Histon proteinleri
101
Histon proteinlerinin özellikleri?
Çok miktarda lizin ve arjinin içerir
Pozitif yüklü
Bazik
102
(+) yüklü / bazik histon proteinler DNA ile nasıl bağ kurar?
Negatif yüklü fosfat grubu ile İYONİK bağ kurar
103
Histon+kromatin ne oluşturur ve kromozoma nasıl dönüşür?
Nükleozom>nükleoflaman>kromozom
104
Nükleozom merkezinde bulunmayan ve DNA'dan en kolay ayrılan histon proteini?
H1
105
Histon proteinlerinin yapısında hangi aa sayesinde asetil grubu eklenir?
Lizin
106
Histon proteinlerine asetil grubu ekleyen ve asetil grubunu ayıran enzim?
Histon Asetiltransferaz (asetil ekler)
Histon Deasetilaz (asetil koparır)
107
Histon deasetilaz inhibitörleri?
Vorinostat
Valproik Asit
108
DNA metilasyonu ne üzerinden olur? Ve katalizleyen enzim?
CpG bölgesindeki sitozin kalıntıları ile
Metil transferaz
109
DNA metiltransferaz inhibisyonu?
5-azadeoksisitidin
Desitabin
110
Histon metilasyonu etkileri?
DNA'yı susturur
(gen ekspresyonunu azaltır)
111
Kor (53,H4) Histon proteinlerinin asetilasyonunun etkileri?
Geni aktive eder
(gen ekspresyonunu arttırır)
112
Histonların ADP-ribozilasyonun etkileri?
DNA tamiri
113
Çekirdek histon proteinlerinin asetilasyonunun etkileri?
Replikasyon sırasında kromozom oluşması
114
DNA Onarım mekanizmaları?
1.Direkt onarım ya da hasarın geri döndürülmesi
2.Eksizyon (kesip-çıkarma) onarımı
3.DNA çift zincir kırıklarının onarımı
4.SOS onarımı
115
Acil cevap sistemi olduğu için hataya meyilli DNA onarım mekanizması olarak bilinen mekanizma?
SOS Onarım
116
DNA'nın yapısında en fazla bulunan prot?
Histon proteinleri
117
Kromozom 3'ucunda bulunan telomerde en çok bulunan bazlar? ve tekrar dizesi?
T ve G'den zengin
TTAGGG
118
Yapısında protein ile birlikte RNA molekülü de bulunan enzim?
Telomeraz (ribonükleoprotein)
119
DNA Tamir mekanizmalarının etkisiz kaldığı durum?
Kromozom translokasyonu
120
Missmatch nükleotidlerin tamirinde görevli enzim?
DAM metilaz
121
İnsanda missmatch tamir sisteminde bozukluk sonucu ortaya çıkan sendrom?
Lynch sendromu
122
RNA bağımlı DNA polimeraz aktivitesi olan ve insanda bilinen tek revers transkriptaz?
Telomeraz
123
DNA Baz eksizyon tamirinde hasarlı bazı çıkaran enzim? ve uygun nükleotidi ekleyen enzim?
DNA glikozilaz (hasarlı bazı çıkarır)
DNA polimeraz 1 (uygun nükleotid ekler)
124
DNA direkt onarım mekanızmasında onarımda kullanılan maddeler?
Fotoliyaz ile onarım
O-6-metilguanin'in onarımı
(O-6-metilguanin alkilleyici ajanlar varlığında oluşur, çok mutajeniktir. DNA metil transferaz enzimi ile tamir edilir)
125
UV ışınları etkisi ile oluşan siklobütan pirimidin dimerlerinin tamirinde görev alan DNA onarım mekanizması?
Nükleotit eksizyon tamiri
126
Sigara dumanı etkisi ile oluşan benzopiren-guanin gibi hasarların tamirinde görev alan DNA onarım mekanizması?
Nükleotit eksizyon tamiri
127
Nükleotit eksizyon tamirinde kullanılan enzimler?
1.UV'ye özgün ABC ekzinükleaz (nükleotidi çıkarır)
2.DNA polimeraz 1
(uygun nükleotidi takar)
3.DNA helikaz
4.DNA ligaz
