NÜKLEİK ASİTLER Flashcards

1
Q

DNA’ya dayanıklılık sağlayan madde?

A

Deoksiriboz şeker

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Nükleotidden şekeri ayıran enzim?

A

Nükleozid Fosforilaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Nükleotidden fosfatı ayıran enzim?

A

5’nükleotidaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

DNA ve RNA’ya asit özelliği veren madde?

A

Fosfat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Pürin nükleotitlerinde şeker ile baz arasındaki bağ?

A

N-Glikozid Bağı
(Pürin 9.pozisyondaki atom -N9- ile)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Primidin nükleotitlerinde şeker ile baz arasındaki bağ?

A

N-Glikozid Bağı
(Primidin 1.pozisyondaki atom -N1- ile)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Pürin Halkası?
(5 C ve 4 N)

A

Glutamin
Aspartat
N10-formil THF ve N5N10-metenil THF
CO2
Glisin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

De nova pürin sentezinde hem C hem de N kaynağı?

A

Glisin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Pürin döngüsü ve TCA’yı birleştiren?
Anaplöretik Reak. nedir?

A

Fumarat

Pürin nükleotid döngüsünde oluşan fumarat egzersiz anında enerji üretmek için TCA’yı besler=Anaplöretik Reax.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

IMP oluşumu reak. tipi? ve enzimi?

A

Dehidrasyon
IMP siklohidrolaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

IMP——-AMP oluşumu için gerekli maddeler?

A

Aspartat
GTP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

IMP——–GMP oluşumu için gerekli maddeler?

A

Glutamin
ATP
NAD

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Oluşan ilk pürin nükletoidi?

A

IMP=İnosinmonofosfat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Denova pürin sentezi nereden gelen hangi madde ile başlar?

A

HeksozMonoFosfat yolundan gelen;
Riboz-5-Fosfat ile başlar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Riboz-5-Fosfat————->PRPP
reak.nunda görevli enzim ve harcanan enerji?

A

Enzim:PRPP sentetaz

1 ATP /2 Fosfatbağı harcanır (ATP—AMP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Riboz 5 Fosfattan IMP’ye gelene kadar harcanan enerji miktarı?

A

5 ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Bir molekül IMP sent. için kaç yüksek enerjili fosfat bağı maaliyeti vardır?

A

6

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Pürin sentezi inhibitörleri?

A

Diazanorlösin
Azaserin
PABA
Metotreksat
Mikofenolik Asit (İMP dehidrog. inhbt.)
Merkaptopürin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Pürin sent.de yan yol=kurtarma yolu=salvaj’da görevli enzimler?

A

APRT (adenin fosforibozil transferaz)
HGPRT (hipoksantin-guanin fosforibozil transferaz)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Pürin/salvage=kurtarma yolu reak.ları?

A

Hipoksantin—–HGPRT—–>IMP
Guanin————HGPRT—–>GMP

Adenin————APRT——–>AMP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Kurtarma yolunda kullanılan aktif şeker?

A

PRPP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Pürin salvage yoldaki HGPRT enzim eks. ile karakterize sendrom? ve belirtileri?

A

Lesch-Nyhan Sendromu

Hiperürisemi
Zeka geriliği
Nörolojik belirtiler
Kendine zarar verme potansiyeli

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Pürin salvage yoldaki APRT enzim eksikliğinde idrarda artan madde?

A

2.8-dihidrooksiadenin

böbrek taşları oluşur bu madde rutin analizde üratla karışabilir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Pürin katabolizması ortak ara ürünü?

A

Ksantin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Pürin katabolizması sonucu oluşan son ürün?

A

Ürik Asit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Ksantin;ksantin oksizdaz için önce bir ürün sonra da bir substrattır. Reak.lar?

A

Hipoksantin—->Ksantin—->Ürik Asit

Hipoksantşn—>ksantin reak.da H2O2 açığa çıkar.

bütün bu reak.ları ksantin oksidaz gerçekleştirir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Ksantin oksidaz yapısı?
Kofaktörü?

A

Flavoprotein yapılı bir enzim
Molibden

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Fe-S içerenler?

A

K1 (sistein)
K2 (sistein)
K3 (sistein)
Ksantin oksidaz (sistein+histidin) =rieske
Akonitaz (sistein)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

H2O2= Hidrojen Peroksit açığa çıkaran enzimler?

A

SOD=Süperoksit Dismutaz
Ksantin Oksidaz
Protoporfirojen Oksidaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Primer renal GUT’TA problem?

A

Ürik asit atılımı azalmıştır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Primer metabolik GUT’ta problem?

A

Ürik asit üretimi artmıştır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Primer metabolik GUT mekanizması?Kalıtım şekli?

A

X’e bağlı kalıtılır

PRPP sentetaz enzimi mutasyona bağlı hiperaktiftir , aşırı kontrolsüz çalışır ve hiperürisemi=GUT görülür.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Von Gierke’de görülen enzim eksikliği? Klinik?

A

Glukoz-6-fosfataz eksikliği
Hiperürisemi görülür

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Hiperürisemi nedenleri?

A

1.PRPP artışı
(Lesch nyhan send. ve PRPP Sentaz hiperaktivitesi)
2.Von Gierki Hastalığı
3.Fruktoz alımının artması

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Hiperürisemi ve GUT tedavisinde kullanılan ilaçlar?

A

Rasbürikaz
Allopurinol
Kolşisin
Sülfinpirazon ve Probenesid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

İnsanda tdv amaçlı kullanılarak ürik asidi suda çözünür hale getiren rekombinant ürat oksidaz enzimi?

A

Rasbürikaz

Tümör lizis send. tedavisinde de kullanılır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Ürik asit ölçümünde kullanılan asit?

A

Fosfotungustik asit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Ürik asit atılımını arttıran ilaçlar?

A

Sülfinpirazon
Probenesid

Aynı zamanda tofüs oluşumunu engeller

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Ürik asit oluşumunu azaltan hipoksantin analogu ilaç?

A

Allopurinol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

İskemi-reperfüzyon hasarında hasara neden olan enzim?

A

Ksantin oksidaz
(H2O2 ve süperoksit üretir)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

ADA (adenozin deaminaz) ve
PNP (pürin nükleozit fosforilaz)
eksikliği mekanizması?

A

ADA: dATP artar
PNP: dGTP artar

bu artan maddeler RİBONÜKLEOTİT REDÜKTAZI inhibe eder.

DNA sentezi ve hüc. bölünmesi engellenir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

ADA (adenozin deaminaz) enzimini inhb. ederek etki gösteren kemoterapötik ajan?

A

Pentostatin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Ksantin oksidaz eks.de neler görülür?

A

Hipoksantin—>ksantin—>ürik asit

Ksantin artar (yan yoldan geldiği için)
Hipoksantin artar
Ürik asit azalır

İdrarla ksantin (ksantin taşı oluşur) ve hipoksantin atılır
hipoürisemi görülür.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Primidin halkasını oluşturan C ve N kaynakları? (4 C ve 2 N)

A

Glutamin
Aspartat
CO2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Su kullanarak fosfatları yapıdan ayıran, nükleotidi nükleozit haline çeviren enzim?

A

Nükleotidaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Nükleozit (şeker+baz) yapısından şekeri ayıran enzim?

A

PNP= Pürin nükleotid fosforilaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

ADA enziminin gerçekleştirdiği reak? ve eksikliğinde görülen klinik?

A

Adenozin—->İnozin

Eks.de B ve T lenfosit kombine bozuklukları ve immun yetmezlik görülür.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

PNP enziminin yapıdan uzaklaştırdığı madde? ve eksikliğinde görülen klinik?

A

Şeker=riboz-1-fosfat

Nörolojik sempt.lar +
immun yetm. (T) + hemolitik anemi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

Kofaktörü molibden olan enzimler? ve Molibden eks.de görülen klinik?

A

Ksantin Oksidaz
Sülfid Oksidaz (bilat. lens dislokasyonu)

Molibden eksde. HİPOÜRİSEMİ görülür.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

Ksantin oksidaz inhbt.leri?

A

Allopurinol
Febuxostat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

Primidin sentezinde hem C hem N kaynağı bileşik?

A

Aspartat

52
Q

Primidin sentezi nasıl başlar?

A

2 ATP+Glutamin+2CO2—>Karbomoil Fosfat

53
Q

Primidin sent.de hız kısıtlayıcı enzim?

A

Karbomoil Fosfat Sentetaz-2

54
Q

Pürin sent. nerede gerçekleşir?

A

Sitoplazmada

55
Q

Primidin sent. nerede gerçekleşir?

A

Sitoplazmada (1basamak hariç, o basamak mitokondride)

56
Q

Mitokondride gerçekleşen primidin sentez basamağı?

A

Dihidrooratat————> Orotik asit

Mitokondriyal enzim:
DİHİDRO ORATAT DEHİDROGENAZ

57
Q

Karbamoil Fosfat Sentetaz 1 nerede ve hangi metabolik yolda bulunur? Azot kaynağı nedir?

A

Mitokondri

Üre döngüsü

Amonyak

58
Q

Karbamoil Fosfat Sentetaz 2 nerede ve hangi metabolik yolda bulunur?

A

Sitoplazma

Primidin sentezi

59
Q

Karbamoil Fosfat-2’nin inhibit. ve aktivatörleri?

A

İnhbt: UTP

Aktvt: ATP ve PRPP

60
Q

Primidin sentezindeki mitokondrial enzim ve inhibitörü?

A

Dihidrooratat dehidrogenaz

Leflunomid

61
Q

CAD gen ürünleri?

A

Carbamoil Fosfat Sentetaz-2
Aspartat Transkarbomoilaz
Dihidroorotataz

62
Q

Carbamoil Fosfat Sentetaz-2 ve
Aspartat Transkarbomoilaz ‘ın inhibtörleri?

A

KPS-2 inhb: UTP
ATK inhb: CTP

63
Q

Primidin sentezinde yapılan ilk primidin türevi?

A

Orotik Asit

64
Q

Primidin sentezinde yapılan ilk primidin nükleotidi?

A

OMP

65
Q

Tip 1 Orotik asidüride görülen enzim eksiklikleri?

A

Orotat fosforibozil transferaz
OMP dekarboksilaz=orotidilat dekarboksilaz

66
Q

Tip 2 Orotik asidüride görülen enzim eksiklikleri?

A

OMP dekarboksilaz = orotidilat dekarboksilaz

67
Q

Primidin nükleotidleri yıkım ürünleri?

A

Beta-Alanin
Beta-Aminoizobütirat
Karbondioksit
Amonyak
Süksinil-KoA
Asetil-KoA

68
Q

Urasil/sitozin yıkımında son ürün?

A

B-alanin

69
Q

Timin yıkımında son ürün?

A

B-Aminoizobütirat

70
Q

pH ve ısı değişikliklerine karşı dayanıklı olan DNA bağı?

A

Fosfodiesteraz

71
Q

DNA heliks yapısının yarısını açıldığı ısı?

A

DNA’nın erime derecesi

72
Q

DNA denatürasyonu; DNA çözeltisinin kaç nm’deki absorbansı ölçülerek izlenir?

A

260 nm

73
Q

Mitokondriyal DNA sentezinden sorumlu olan enzim?

A

DNA polimeraz gama

74
Q

Mitokondriyal DNA tarafından kodlanmayıp tamamen nükleer DNA tarafından kodlanan ETZ birimi?

A

Kompleks 2

75
Q

DNA sentezinde yeni sentezlenen sarmallar kalıp sarmala uygun olarak sentezlenir. Böylece yeni oluşan çift sarmallarda bir yeni bir de eski zincir bulunur. Bu olaya ne denir?

A

Semikonservatif replikasyon

76
Q

DNA Replik başlangıç bölgesi hangi bazdan zengindir?

A

Adenin ve Timin

77
Q

Replikasyon başlangıç bölgesi ne ile işaretlenir?

A

dna A

78
Q

dna A ile işaretlenen DNA bölgesindeki H bağları ne ile kesilir?

A

Helikaz (dna B)

79
Q

Açılan çift sarmal yapının kapanmamasını açık kalmasını sağlayan prot?
Çift sarmal yapının tekrar oluşmasını önleyen prot?

A

Tek sarmallı DNA bağlayan prot.ler (SSBPs/TSB)

80
Q

DNA sentezinde okuma yönü?

A

3’ 5’

81
Q

DNA sentezinde sentez yönü?

A

5’3’

82
Q

DNA Polimeraz 3 nereye bağlanır?

A

3’ uca bağlanır

83
Q

Lider zincir?

A

Kesiksiz zincir

Tek bir primeri vardır

84
Q

Kesikli zincir?

A

Birçok primer vardır

Okazaki fragmanları bulunur (okazaki fragmanı başına birer primer vardır)

85
Q

Ökaryotlarda primer zincir sentezi?

A

DNA Polimeraz Alfa (DNA Primazın alt sınıfı)

86
Q

Prokaryotlarda kısa RNA parçaları sentezleyen özgün RNA polimeraz?

A

DNA primaz=DNA G

87
Q

DNA replikasyonu sırasında DNA çift sarmalının açılması ve primerlerin yerleşmesini sağlayan protein kompleksi?

A

Primozom

88
Q

Primozomun yapısı?

A

DNA helikaz + DNA primaz

89
Q

DNA replikasyonunda bir nükleotit eklemek için kaç yüksek enerjili fosfat bağı hidrolize olur?

A

2

dATP—————>dAMP (zincirde bulunan)

90
Q

DNA replikasyonunun doğruluğunu sağlayan enzim? (Lipincott)

A

DNA polimeraz 3

91
Q

DNA replikasyonun esnasındaki kontrolü sağlayan enzim? (Harpers)

A

DNA polimeraz2

92
Q

DNA polimeraz 3 ve 1’in yaptıkları zinciri FOSFODİESTER bağı ile birleştiren enzim?

A

DNA Ligaz

93
Q

DNA’nın üç boyutlu yapısını sağlayan enzim?

A

DNA Topoizomeraz

94
Q

Tip 1 Topoizomeraz inhbt.leri?

A

Topotekan
İrinotekan

95
Q

Tip 2 Topoizomeraz inhibt.leri?

A

Etoposit
Teniposit

96
Q

DNA zincirinin uzamasından esas sorumlu enzim?
Lider (kesintisiz) zincir uzamasını sağlayan enzim?
Okazaki fragmanlarının uzamasını sağlayan enzim?

A

DNA Polimeraz III

DNA polimeraz epsilon

DNA polimeraz delt

97
Q

RNA primeri hangi enzimle uzaklaştırılarak yerine aynı enzimle uygun nükleotidler yerleştirilir?

A

DNA Polimeraz I

98
Q

DNA Polimeraz III’ün fonksiyonları?

A

5’3’ polimeraz (DNA parçası koydu)

3’5’ ekzonükleaz (hatalı DNA parçası çıkardı)

99
Q

DNA Polimeraz 1’in

A
100
Q

DNA’nın nükleusta paketlenmesi ve uygun şekilde katlanmasını sağlayan proteinler?

A

Histon proteinleri

101
Q

Histon proteinlerinin özellikleri?

A

Çok miktarda lizin ve arjinin içerir
Pozitif yüklü
Bazik

102
Q

(+) yüklü / bazik histon proteinler DNA ile nasıl bağ kurar?

A

Negatif yüklü fosfat grubu ile İYONİK bağ kurar

103
Q

Histon+kromatin ne oluşturur ve kromozoma nasıl dönüşür?

A

Nükleozom>nükleoflaman>kromozom

104
Q

Nükleozom merkezinde bulunmayan ve DNA’dan en kolay ayrılan histon proteini?

A

H1

105
Q

Histon proteinlerinin yapısında hangi aa sayesinde asetil grubu eklenir?

A

Lizin

106
Q

Histon proteinlerine asetil grubu ekleyen ve asetil grubunu ayıran enzim?

A

Histon Asetiltransferaz (asetil ekler)

Histon Deasetilaz (asetil koparır)

107
Q

Histon deasetilaz inhibitörleri?

A

Vorinostat
Valproik Asit

108
Q

DNA metilasyonu ne üzerinden olur? Ve katalizleyen enzim?

A

CpG bölgesindeki sitozin kalıntıları ile

Metil transferaz

109
Q

DNA metiltransferaz inhibisyonu?

A

5-azadeoksisitidin
Desitabin

110
Q

Histon metilasyonu etkileri?

A

DNA’yı susturur
(gen ekspresyonunu azaltır)

111
Q

Kor (53,H4) Histon proteinlerinin asetilasyonunun etkileri?

A

Geni aktive eder
(gen ekspresyonunu arttırır)

112
Q

Histonların ADP-ribozilasyonun etkileri?

A

DNA tamiri

113
Q

Çekirdek histon proteinlerinin asetilasyonunun etkileri?

A

Replikasyon sırasında kromozom oluşması

114
Q

DNA Onarım mekanizmaları?

A

1.Direkt onarım ya da hasarın geri döndürülmesi
2.Eksizyon (kesip-çıkarma) onarımı
3.DNA çift zincir kırıklarının onarımı
4.SOS onarımı

115
Q

Acil cevap sistemi olduğu için hataya meyilli DNA onarım mekanizması olarak bilinen mekanizma?

A

SOS Onarım

116
Q

DNA’nın yapısında en fazla bulunan prot?

A

Histon proteinleri

117
Q

Kromozom 3’ucunda bulunan telomerde en çok bulunan bazlar? ve tekrar dizesi?

A

T ve G’den zengin

TTAGGG

118
Q

Yapısında protein ile birlikte RNA molekülü de bulunan enzim?

A

Telomeraz (ribonükleoprotein)

119
Q

DNA Tamir mekanizmalarının etkisiz kaldığı durum?

A

Kromozom translokasyonu

120
Q

Missmatch nükleotidlerin tamirinde görevli enzim?

A

DAM metilaz

121
Q

İnsanda missmatch tamir sisteminde bozukluk sonucu ortaya çıkan sendrom?

A

Lynch sendromu

122
Q

RNA bağımlı DNA polimeraz aktivitesi olan ve insanda bilinen tek revers transkriptaz?

A

Telomeraz

123
Q

DNA Baz eksizyon tamirinde hasarlı bazı çıkaran enzim? ve uygun nükleotidi ekleyen enzim?

A

DNA glikozilaz (hasarlı bazı çıkarır)

DNA polimeraz 1 (uygun nükleotid ekler)

124
Q

DNA direkt onarım mekanızmasında onarımda kullanılan maddeler?

A

Fotoliyaz ile onarım
O-6-metilguanin’in onarımı

(O-6-metilguanin alkilleyici ajanlar varlığında oluşur, çok mutajeniktir. DNA metil transferaz enzimi ile tamir edilir)

125
Q

UV ışınları etkisi ile oluşan siklobütan pirimidin dimerlerinin tamirinde görev alan DNA onarım mekanizması?

A

Nükleotit eksizyon tamiri

126
Q

Sigara dumanı etkisi ile oluşan benzopiren-guanin gibi hasarların tamirinde görev alan DNA onarım mekanizması?

A

Nükleotit eksizyon tamiri

127
Q

Nükleotit eksizyon tamirinde kullanılan enzimler?

A

1.UV’ye özgün ABC ekzinükleaz (nükleotidi çıkarır)
2.DNA polimeraz 1
(uygun nükleotidi takar)
3.DNA helikaz
4.DNA ligaz