Nucleus Flashcards
נוקלאוטידים
אבני הבניין של הדנ״א
מכילים קבוצת זרחה בעלת מטען שלילי
סוכר - דיאוקסיריבוז
בסיס חנקני - שונה בין הסוגים
קבוצות בסיסים
פירמידנים - בעלי טבעת אחת (C,T)
פורינים - בעלי 2 טבעות משושה ומחומש)A,G)
A נקשר לT
G נקשר לC
מבנה הדוגדילי
הדנ״א מורכב משני גדילים אנטי פרללים
גדיל אחד בכיוון 5׳ ל3׳ והשני הפוך
נוצרים קשרי מימן בין הבסיסים בין טי לאיי 2 קשרים ובין ג׳י לסי 3 קשרים
זיווג הבסיסים מייצב את המולקולה
אריזה של דנ״א
נוקלאוזום - דנ״א מלופף סביב היסטונים
כרומטין - שרשרת של נוקלאוזומים שמוצבים זה לצד זה כמו חרוזים על שרשרת ניתן לראות אותם בהוספת צבע
כרומטידה - המצב הדחוס ביותר
כרומוזום - כרומוטידה שהשתכפלה לקראת חלוקת התא
ישנם בתא גוף 46 כרומוזומים
דנטורציה של דנ״א
הפרת גדילים באמצעות חימום - פירוק קשרי מימן
ככל שיהיו יותר קשרי G-C ככה יש יותר קשרי מימן לפרק וטמפ ההתכה גבוהה יותר
התהליך ההפוך הוא רנטורציה - הגדילים מתחברים מחדש (מאוד עמידים)
אנזימי הגבלה
מאפשר חיתוך של הדנ״א לרצפים גדולים וידועים
לא קיימים באופן טבעי אצל בני אדם אבל כן בחיידקים
סוגים: קצוות דביקים - אם נפגיש בין מקטעי הדנ״א החתוכים הם יתחברו מחדש
קצוות חלקים - חותך כך שנוצרים שתי קצוות שלא יתחברו מחדש
שיטות לבידוד וזיהוי מקטעי דנ״א
אלקטרופורזה בג׳ל - מקטעי דנ״א מסתדרים לפי אורך (טביעת אצבע)
היברידיזציה - לגלות רצף נוקלאוטידים מסוים (בדיקת אבהות) דנטורציה של הדגימה ואז רנטורציה יחד עם מקטעים ידועים - רצפים זהים התחברו - ניתן לבדוק הומולוגיה מלאה על ידי התכה
צ׳יפ - איתור מחלות על ידי בדיקת רצפים של דנ״א - שמים מקטע משלים למקטע שמכיל מוטציה ואז בודקים מדגמים אם הם מתאימים
מנגנונים של שכפול דנ״א
קונסרבטיבי- לכל גדיל קיים יבנה גדיל חדש - תא אחד יקבל את החדשים תא שני את הישנים
סמי-קונסרבטיבי - כל תא יקבל גדיל אחד חדש ואחד ישן
דיספרסיבי - כל תא יקבל מקטעים ישנים וחדשים לסירוגין
ניסוי סטאל ומסלסון
מנגנון שכפול הדנ״א
קורה במקביל בכמה מקומות
נפתח הקשרים בין הגדילים במזלג השכפול
מזלגי השכפול הולכים ומתרחבים עד לחיבור יחד ומתקבל גדיל חדש נוסף
דנ״א פולימראז 3
אחראי על השכפול - מוסיף נוקלאוטידים בהתאם לסיווג בסיסים לקצה 3׳ (הבנייה היא מ5׳ ל3׳)
פרימאז
מוסיף פריימר - רצף נוקלאוטידים רנא ומאפשר לפולימראז להוסיף נוקלאוטידים
גדיל משתהה וגדיל מוביל
גדיל משתהה - נבנה כל הזמן במקטעים ונוצרים מקטעי אוקאזאקי
גדיל מוביל - נבנה באופן רציף מ5׳ ל 3׳
ליגאז
אנזים שמאחה את מקטעי אוקוזאקי
דנ״א פולימראז 1
משלים את מקטעי הנוקלאוטידים אחרי שהפריימר מסולק
הליקאז
אנזים שפורם את הגדילים
טופאוזומראז
מיישר את הגדילים
SSB
Single strand binding proteins
מונעים התלפפות של הדנ״א מחדש
PCR
שכפול דנ״א במבחנה - צריך נוקלאוטידים, טאק פולימראז (שלא יעבור דנטורציה בחום), פריימרים
מחממים את המבחנה כדי לגרום לדנטורציה של הדנ״א, ונבנים מיליוני דגימות דנ״א מהגדיל הישן
ריצוף דנ״א
שיטה לקביעת רצף נוקלאוטידים בתא - שיטת סנגר
שימוש בנוקלאוטידים פגומים כדי לעצור את הרצף בנקודה מסוימת
טלומרים
רצפי נוקלאוטידים בקצוות הגדילים אשר אינם מקודדים לגנים
כך בשכפול הגדול מתקצר ולא נאבד האינפורמציה
טלומראז
מוסיף טלומר לקצה הגדיל
נמצא באופן פעיל בתאים שמצריכים חלוקה מרובה (כדי שלא יגמרו הטלומרים) כמו תאים עובריים, תאי זרע, תאי סרטן
