mutationer och reparation 2 Flashcards
mismatch-repair
fel basparning. av mismatch-enzym. även små oparade loopar som ger INDELS korrigeras. repeats som bildar sekundärstrukturer känns inte igen, i e coli skiljer man på ny och gammal sträng genom metylgrupper, i eukaryota celler vet man inte hur det skiljs. enzymerna klipper ut några nukleotider på ny sträng och hålet fylls igen av polymeras och ligas.
direct repair
återställer nukleotiderns normala form utan att byta ut dem. tex i e coli finns fotoreaktivering av enzym fotolyas som använder ljusenergi för att bryta den kovalenta bindningen i pyrimidindimerer.
base-excision repair
modifierad nukleotid byts ut. enzym DNA glykosylas som känner igen och klipper bort kvävebas. enzym AP endonukleas klipper bort resten av nukleotiden. vissa AP har proofreading. eftersom ett annat polymeras används som inte har proofreading. tex uracil i DNA
nucleotide excision repair
korrigerar bulkiga fel som stör dubbelhelixen. finns i alla organismer. strängarna separeras och SSB proteiner stabiliserar. klyvs på båda sidor om skadan. DBA polymeras och ligas
non homologous end joining
proteiner känner igen lösa ändar och binder ihop dem. kagar dsb. används ofta i G1 när det inte finns systerkromatid för homolog rekombination. leder ofta till INDELS.
intragenisk suppression
mutation i samma gen som återställer vildtyp. Antingen en nukleotid i samma kodon som ger samma aminosyra (ej samma nukleotid för då är det reversion) eller genom insertion efter deletion som ändrar reading frame till vildtyp. Kan också ske på andra sätt tex ändra tillbaka till rätt veckning av proteinet genom två missensmutationer som tar ut varandra.
intergenisk suppression
mutation i annan gen. Tex gen för tRNA som bildar tRNA vars antikodon kan para med ett stoppkodon. Detta kallas intergenisk nonsenssuppression. Gör att translationen kan fortsätta förbi ett stoppkodon. tRNA tävlar med RF. Dessa tRNA interfererar ofta med translation av andra gener vilket gör att det blir för långa proteiner och att dessa stammar växer långsamt. Kan också ske i gen för protein som samverkar eller bildar protein tillsammans.
