bakteriers genreglering 1 Flashcards
strukturella gener
kodar för proteiner som används för cellens olika processer
regulatoriska gener
styr strukturella gener. kodar för DNA-bindande proteiner som kan vara repressorer eller aktivatorer
konstitutiva gener
regleras inte, uttrycks alltid i samma mängd. ofta housekeeping genes som alltid behövs
inducerbara operon
repressor binder vanligtvis dvs gen är normalt av. induktor tex allolaktos binder till repressorn och ändrar konformation så att den ej kan blockera RNA-p. genen uttrycks alltså när induktorn är närvarande, tex som lac-operonet. styr ofta katabola processer som slåt på genen när ämnet är induktor
represserbara operon
repressorn är normalt inaktiv och binder inte till genen som då är aktiv. ko-repressor kan aktivera repressorn och inaktivera genen. styr ofta anabola processer då höga halter produkt aktiverar repressorn. genen blir alltså inaktiv när korepressorn är närvarande. tex tryptofan operonet.
positiv kontroll
när promotorn är svag kan aktivatorprotein binda in och bilda en extra kontaktyta med RNA-p som ökar affiniteten och gör att genen transkriberas mer.
katabolitrepression
kan anpassa sig till en mer föredragen energikälla. tex e coli som inaktiverar lac-opeonet när glukos finns tillgängligt då det är mer effektivt.
negativ kontroll lac-operonet
repressor binder vanligtvis men induceras av allolaktos. därmed bildas genprodukterna när laktos (allolaktos) finns tillgängligt eftersom repressorn är inaktiv då.
positiv kontroll lac
cAMP bildas endast när halten glukos är låg. cAMP bildar komplex med CAP som binder till lac-operonet som ett aktivatorprotein.
samverkan positiv och negativ kontroll av lac
när det finns laktos i mediet induceras repressorn. om även glukos finns kommer inget aktivatorprotein bildas men genen kommer ändå att uttryckas lite då det inte finns repressor men promotorn är svag. om glukos inte finns kommer cAMP+CAP binda som aktivatorprotein och genen vara aktiv.
in cis
kan påverka genuttryck endast på närliggande gener dvs samma DNA-molekyl. kan påvisas genom partitiella diploider med lac-operon i plasmid där man kan se om olika mutationer på plasmid och kromosom kan komplettera varandra.
in trans
kan påverka genuttryck på andra DNA-molekyler
lac I
bildar repressorprotein, regulatorisk gen. verkar in trans. mutant I- bildar repressor som inte kan binda till operatorn och därmed uttrycks genen oavsett närvaro av laktos. om en funktionell I finns på plasmid kan den bilda fungerande repressor för kromosomala genen också därmed in trans.
andra mutationer i I bildar repressorprotein som inte kan induceras och alltid binder till operatorn så att genen är inaktiv oavsett.
lac Z
strukturell gen för beta-galaktosidas som bryter ner laktos. mutanten Z- bildar ett ofungerande protein
lac Y
strukturell gen för permeas, transport.
lac O
mutation i operatorn som gör att repressorn inte kan binda. Oc har ett konstitutivt uttryck av operonet eftersom det inte kan represseras. påverkar endast generna i samma operon, in cis
lac P
mut i promotorn som gör att RNA-p inte kan binda och genen aldrig uttrycks. också in cis.
