Morphologie Flashcards
Quelle est la particularité des cellules eucaryotes au niveau de l’ADN?
Elles sont constituées d’un vrai noyau qui est protégé par une membrane nucléaire
Quelles organelles cytoplasmiques retrouve-t-on que chez les eucaryotes?
On retrouve des mitochondries et des chloroplastes qui ne sont pas présentes chez les procaryotes
comment sont les structures membranaires intracytoplasmiques chez les eucaryotes?
Elles sont élaborées, on retrouve l’appareil de golgi, le réticulum endoplasmique et autre… En gros, les structures membranaires intracytoplasmiques sont élaborées.
Particularité des cellules procaryotes au niveau de l’ADN?
Il y’a absence de noyaux, mais comporte cependant du matériel génétique qui n’est pas entouré d’une membrane.
Particularité des procaryotes au niveau des organelles cytoplasmiques?
Il y’a absence d’organelles cytoplasmiques. On ne retrouve pas de mitochondries ou de chloroplaste
Particularité des procaryotes au niveau des structures membranaires intracytoplasmiques?
Les structures intracytoplasmiques sont peu élaborées.
Comment peut-on donc décrire le cytoplasme?
On dit qu’il est uniforme
Quelles sont les deux groupes de procaryotes?
D’un côté, on a les eubactéries (majorité des bactéries étudiées) et de l’autre les archéobactéries
Dans quel environnement se retrouve les archaebactéries?
Dans des environnements extrêmophiles comme ceux qu’on retrouvait sur la Terre primitive
Les bactéries et archaebactéries ont-elles des structures cellulaires équivalente? Où se trouve la différence?
Au niveau des structures cellulaires, les deux ont des fonctions similaires dû aux structures cellulaires équivalentes. Cependant, la différence se trouve au niveau des compositions biochimiques assez différentes. En effet, il y’a une divergence il y’a 10^9 années
Quelles sont les différentes formes des cellules bactériennes?
- Sphères : coques, cocci, coccus (font beaucoup d’associations différentes)
- Batonnets : bacilles, cocobacilles
- Bâtonnets incurvés : vibrions (virgules ou spirale incomplète)
- Spirale : spirilles qui vont être rigide, spirochètes qui vont être flexibles et vont avancer en rampant dans des environnements avec de grosses densité en déformant la cellule
- Pléomorphes qui vont avoir plusieurs formes dépendamment des conditions de croissance
- Hyphes (longues cellules filamenteuses qu’on retrouve chez les mycètes (eucaryote) ou streptomyce pour les procaryote)
- Appendices : une genre de queue qui permet de s’accrocher à une surface et permet l’absorption par la prosthèque une fois couplé à un crampon
Quelle est la taille de manière générale des bactéries?
- Elles ont un diamètre de 0,5 à 1,5 micron + une longueur de 1-10 micron. Cependant, il peut exister des extrêmes.
Quelle taille fait Mycoplasma pneumoniae?
100 nm
Quelle taille font les nanobactéries? Existent-elles?
Les nanobactéries ont une taille allant de 50-200 nm. Il existe encore des divergences en sein de la communauté scientifique concernant leur existance
Quelle taille fait Epulopiscium fishelsoni?
600 microns
Quelle taille fait Thiomargarita namibiensis?
750 à 1000 microns
Chez les cellules bactériennes, quelle est la masse, le volume et le rapport surface-volume chez E.Coli? Qu’est ce que ce rapport implique? Taille?
Masse : 10^-12g
Volume : 1,15 x 10^-15 L
Rapport: Il est très grand, ce qui implique que la surface d’échange est efficace
Taille : 665 femtograms
Les bactéries sont-elles des organismes unicellulaires ou multicellulaires?
Il s’agit d’organismes unicellulaire
Quelles sont les associations pour les bacilles?
1 à 2 cellules généralement. Cependant, il peut y avoir des exceptions pour les streptobacillus
Quelles sont les modes d’associations pour les coccus?
Il sont nombreux :
Grappe : Staphylococcus (au niveau des infections de la peau ou des infections très virulentes)
Chaînes : Streptococcus
Diplocoques : Cas de Neisseria qui provoque la méningite chez l’homme
Octades : Cas de Sarcina
Tétrades : Haloquadratum de forme cubique qu’on retrouve dans un environnement avec une concentration de sel élevée
Rosette : Caulobacter qui reste associée lors de la division cellulaire à un crampon
Y’a-t-il un mécanisme de division différent entre les staphylocoques et les streptocoques?
Oui, les staphylos formeront une grappe parce que l’axe de division est en 3 dimensions alors alors que les streptos formeront de longues chaînes parce que l’axe de division est dans le même plan
Où se retrouve la paroi cellulaire?
C’est une structure apposé à l’extérieur de la membrane cytoplasmique
Quel est l’objectif de Christian Gram lorsqu’il invente la coloration de Gram?
Il veut séparer les pneumocoques selon leur différence de paroi cellulaire. Pour ce faire, il va utiliser la rétention du cristal violet pour différencier les deux types de paroi
Quelles sont les étapes de la coloration de gram?
1) On rajoute du cristal violet sur l’échantillon, qu’on vient ensuite laver à l’eau quelques secondes plus tard pour enlever l’excedent
2) On rajoute l’Iode ou lugol (qu’on appelle mordant) dans le but de fixer le cristal violet dans les parois qui ont la capacité de le retenir
3) On élimine tous le violet de cristal qui n’a pas été fixé à l’aide de l’alcool ou acétone
4) On rajoute de la safranine qui va agir comme contre-colorant et se fixer dans les parois qui ne retiennent pas le cristal violet dans le but de les discerner.
Quelles sont les deux fonctions de la paroi cellulaire?
1) Survie : La pression osmotique extérieur est plus petite que la pression osmotique intérieur. La paroi cellulaire permet donc de contrôler l’entrée d’eau.
2) La rigidité permet à la cellule d’avoir une forme défini
Différence de pression entre Gram+ et Gram-?
2-3 atmosphères chez les Gram- alors que 10-15 atm chez les Gram+
Est ce que la paroi cellulaire existe chez toutes les bactéries?
Non, elle n’est pas présente chez Mycoplasma (n’a pas de forme définitive et vie dans un milieu où la pression osmotique de l’extérieur est plus grande) et Thermoplasma.
À quel groupe cellulaire appartiennent Mycoplasma et Thermoplasma?
Mycoplasma est un eucaryote alors que Thermoplasma est un archae
Qu’est ce qui explique l’absence de cette paroi cellulaire chez ces organismes?
Ces organismes vivent dans des environnements où la pression osmotique extérieur est plus importante que la pression osmotique intérieur. L’eau n’a donc pas tendance à rentrer en grande quantité et déformé la cellule. Aussi, la membrane plasmique de ces organismes est plus rigide qu’à l’habitude dû à certaines transformations biochimique et ainsi combler le manque de paroi cellulaire
Quelle est la taille de la paroi?
Entre 10-80 nm, et correspond à 40% de la masse de la cellule
De quoi est composé la paroi cellulaire?
1) Peptidoglycane (muréine) chez les eubactéries
- Il s’agit d’une suite de polysaccharide
(copolymère) de N-acétylglucosamine et Acide N-acétylmuramique relié par des liaisons B1-4
2) De ponts peptidiques qui relient les interchaines de PG, ce qui augmente la rigidité des chaines de peptidoglycanes
Quels a.a se retrouvent souvent dans les chaînes peptidiques?
Ala et Glu en conformation D
Comment agit la pénicilline?
Le site d’action de la pénicilline est au niveau de la transpeptidase dont le rôle est de relier les chaînes de polysaccharide par des A.A en se liant à elle. En inhibant la transpeptidation, la pénicilline fait baisser la rigidité de la paroi cellulaire
Quelle sera l’impact d’une baisse de la paroi cellulaire sur la cellule?
La cellule changera de forme et adoptera une configuration sphérique. Ensuite, une plus grande quantité d’eau rentrera dans la cellule, jusqu’au point d’arriver à la lyse de cette dernière
La structures et les fonctions de la paroi cellulaire chez les archaes est-elle identique que chez les bactéries?
Oui, la fonction (survie et forme) et la structure (rigidité) reste équivalente
Où se trouve alors les différences?
Au niveau de la composition de la paroi. Elle va être formé de glycoprotéines ou polysaccharides qui ne vont pas être équivalents au peptidoglycane. On va appeler ça pseudomuréine)
Comment pourrait-on décrire les parois des Gram+?
Épaisse et uniforme
De quoi est composé la paroi des Gram+?
On va retrouver des acides téichoïques et lipotéichoïques qui sont des polymères de glycérol-P ou ribitol-P
Comment expliquer l’intéraction de ces acides avec le cristal-violet?
Ces deux acides sont chargés négativement et forment un filtre ionique qui fait une sélection au niveau de la paroi cellulaire. Comme le crisral-violet est chargé positivement, se dernier va se lier avec les deux acides
Une expérience a-t-elle prouver cette intéraction?
Oui, on a déjà essayer de supprimer le gène responsable pour la formation de l’acide téichoïque. On a ensuite remarqué que les parois des bactéries ne retenaient pas le cristal violet
Retrouve-t-on autre chose au sein de la paroi?
Oui, d’autres polysaccharides et protéines qui auront un rôle structurale ou dans des réactions enzymatiques et présent beaucoup moins.
De quoi est composé la membrane externe?
- Phospholipides + protéines = OMP
- Porines qui vont sélectionner le transport des molécules hydrophiles avec une limite de taille de 700 Da
- D’autres OMP qui vont avec une fonction structurales et enzymatiques et avec des quantités beaucoup moins importantes
Au sein du la membrane externe, on retrouve le lipopolysaccharide. De quoi est-il formé?
Le LPS est formé d’un lipide A , d’un polysaccharide central (propre aux espèce bactériennes) et d’une chaîne latérale O (propre aux souches bactériennes)
De quoi est formé le lipide A?
Il s’agit d’un lipide associé à deux GlcN
Où est fixé le Lipide A?
Dans le membrane externe et se projette vers l’extérieur
Qu’est ce qui est attaché au Lipide A? Composition?
Le Polysaccharide central constitué d’une suite de 10 résidus de glucide (heptulose)
Particularité du Polysaccharide central?
Composition intra-espèce est constante
Parti attaché au Polysaccharide central?
La chaîne latérale O qui est la plus externe.
Composition de la chaîne latérale O? Particularité?
Chaîne polysaccharidique (abequose) + particulière à chaque souche bactérienne
Pourquoi le LPS peut provoquer un choc septique dans un hôte?
Le Lipide A du LPS peut agir comme une endotoxine et provoqué un choc septique
Qu’est ce qu’une endotoxine?
Il s’agit d’une substance qui reste associer à la cellule bactérienne et qui amène une réaction du système immunitaire lorsque dans un hôte
À quoi faut-il donc faire attention quand on crée un vaccin?
Au fait qu’il n’y a pas de LPS
Que retrouve-t-on dans l’espace periplasmique?
- Lipoprotéine de Braün
- 1-2 couche de peptidoglycanes
- Protéines de transports ou de digestions des nutriments
À quoi servent les lipoprotéine de Braün?
Relier les 1-2 couches de peptidoglycanes à la membrane externe par lien covalent des deux côtés.
Quelle composition a l’espace périplasmique?
Une forme de gel
Quelle est la fonction de la membrane externe?
Sélection et exclusion pour permettre le passage de composés hydrophiles
Paroi gram- plus perméable que gram+?
Non, elle est moins perméable que la paroi des gram+ et donc protège mieux la cellule contre certaines substances toxiques comme les antibiotiques ou sels biliaires.
La membrane plasmique est-elle présente chez toutes les cellules vivantes?
La membrane plasmique est essentielle à la survie de toutes les cellules vivantes. Il s’agit de l’ultime frontière entre l’organisme et l’environnement
Peut-on se débarrasser de la paroi ou de la membrane plasmique?
À l’aide de certains traitements, il est possible de se débarrasser de la paroi et avoir une cellule viable. Dans le cas de la membrane, sa perte signifie la mort de la cellule
De quoi est composé à grande majorité la membrane plasmique?
De lipides, glycérophospholipides en grosse majorité
Quel est le glycérophospholipide le plus fréquemment rencontré?
Il s’agit du phosphatidyléthanolamine
Quel est le dénominateur commun de toutes les membranes?
Le fait que les lipides sont amphipathiques pour composer la bicouche
Quels sont les lipides mineurs retrouvés dans la membrane?
Hopanoïdes (forme de cholestérol qui s’insère dans la membrane)
Impacte de l’insertion des haponoïdes?
Augmente la rigidité de la bicouche
Pourquoi pense-t-on que les microorganismes sont responsables de la production du pétrole?
On retrouve une certaine concentration du cholestérol au sein des combustibles fossiles
La membrane des archaebactéries est-elle semblables?
La structure est équivalente mais la composition n’est pas la même
De quoi est composée la membrane cytoplasmique d’un archaebactérie?
Lipides et alcools à longues chaînes.
Les monocouches chez les archées sont-elles possible?
Oui, la membrane peut être composée d’une seule molécule transmembranaire avec les deux extrémités hydrophiles et le centre hydrophobe
Quelles sont les fonctions passives de la membrane plasmique?
- Séparation du cytoplasme et du milieu à l’aide des phospholipides ou protéines de structure
- Imperméabilité aux ions ou molécules hydrophiles
Qui réalise les fonctions actives de la membrane plasmique?
Les protéines transmembranaires
Quelles sont les fonctions actives?
- Transport des nutriments contre le gradient de concentration comme la concentration cellulaire est plus grande
- Excrétion des déchets comme l’éthanol à l’extérieur de la cellule
- Biosynthèse des structures externes
- Production de l’énergie à l’aide de la chaîne respiratoire et de l’ATP synthase
- Réplication de l’ADN
- Perception de l’environnement par chimiotaxie
Comment se fait la biosynthèse des structures externes?
Il y’a un pré-assemblage intracytoplasmique et qui traverse la membrane par transport membranaire. L’assemblage final se fait de manière extra cytoplasmique
Qu’est ce qu’est la chimiotaxie?
Il s’agit de l’orientation du déplacement à l’aide de protéines senseurs qui détectent les signaux de l’environnement
Pourquoi la mosaïque fluide est sous forme de gel?
Pour permettre le déplacement latéral des protéines
En fonction de quoi les cellules ajustent la composition de lipides?
En fonction des composantes environnementales
Quelles sont les organismes composés de flagelles?
Ceux de forme allongée comme les bacilles, vibrion, spirilles et spirochètes
Exception à ces organismes?
Oui, Sporosarcina
Qu’est ce qu’un flagelle?
Il s’agit d’une structure filamenteuse composé de flagelline sous forme d’empilement hélicoïdal
Quelles sont les dispositions d’un flagèlle?
Monotriphe, Locotriphe, Amphitriphe, Péritriphe
Comment se fait le déplacement lorsqu’il y’a plusieurs flagèlles?
Coordination des mouvements
Mesure des flagelles?
12-20 nm de diamètre sur 15-20 microns de longueur
Fonction du flagelle?
Locomotion
Est ce que le flagelle se voit au microscope photonique?
Non, impossible
Lien du flagelle avec chimiotaxie?
La chimiotaxie utilise des senseurs protéique pour capter les substances environnementales et guider la cellule pour son bien-être. Pour se réaliser, elle a donc besoin d’une source de locomotion qu’on retrouve au niveau du flagelle
À quel point la chimiotaxie est-elle efficace?
La chimiotaxie permet de faire 3000 fois la longueur de la cellule par minute. Équivaut à 648km par heure pour un humain d’1m80
Que sont les fimbriaes et les pillis?
Il s’agit de structure filamenteuse qui vont pouvoir être différencié par leur fonction
De quoi sont-ils constitués?
Il s’agit d’un empillement de fimbrilline ou de pilline avec une protéine de reconnaissance du récepteur sur l’apex
Rôle des fimbriaes?
Il s’agit d’adhérence de manière spécifique aux surfaces (hôte, bactéries, minéral) pour permettre la colonisation + locomotion lors de secousse.
Est-il possible de retrouver plusieurs fimbriaes à la surface d’une bactérie?
Oui, ils auront des fonctions différentes
De quoi est composé la capsule du glycocalyx?
Dans la majorité des cas, il s’agit de polysaccharides. Cependant Bacillus Anthracis est une exception car composé de protéine (D-Glu)
De quoi dépend la présence et la taille du glycocalyx?
Des conditions environnementales
Pourquoi le glycocalyx permet la mise en place de Biofilm?
Pour que les biofilms se constituent, il faut une présence d’adhérence entre les bactéries. Le glycocalyx permet cette adhérence non spécifique
De quoi est composé la couche S?
De protéines ou de glycoprotéines qui forment un réseau protéique enchevêtré
De quoi protège la couche S?
La phagocytose, l’environnement (variation de pH ou enzymes lytiques) et prédateurs comme les protozoaires
Chez quels organismes la couche S est-elle fréquente?
Chez les archaes
Le nucléoïde est-il composé d’une membrane?
Absence de membrane
De quoi est composé un nucléoïde?
On retrouve un seul chromosome circulaire chez la grande majorité des procaryotes qui porte l’ensemble de l’information génétique pour l’activité cellulaire
À quel point l’empaquetage est-il efficace?
Pour E.Coli qui fait 1,5 microns, le chromosome contenu est de 1,4 mm une fois déballé
Où se retrouve les ribosomes des procaryotes?
Attaché à la membrane où au sein du cytoplasme
Les ribosomes sont-ils présents chez tous les organismes bactériens?
Oui, tant que ces organismes produisent des prots
De quoi sont composés les ribosomes?
Ils sont composés d’une protéine et d’un ARNr. De manière structurale, on va retrouver une grande et une petite sous-unité (50S + 30S) pour une taille total de 70S chez les procaryotes et 80S chez les eucaryotes (60s+40s)
De quels antibiotiques les ribosomes 70S eubactéries sont-ils le site d’action? + Effet?
- Chloramphénicol
- Tétracycline
- Streptomycine
La cellule va arrêter de se diviser par manque de protéines et finira par mourir.
Pourquoi les ribosomes des archaes ne sont pas affectés malgré le fait qu’ils soient des procaryotes?
À un moment donné dans l’évolution, les archaes ont subis des modifications au niveau des mécanismes cellulaires qui se sont mis en place et qui se rapprochent de ceux des procaryotes
Qu’est ce qu’un corps d’inclusion?
Il s’agit d’une réserve de carbone (B-hydroxubutyrate + glycogène) qui représente 50% de la masse cellulaire. Les carbones capturés lors de périodes fleurissantes vont être utilisés en cas de disette.
Les corps d’inclusions sont-ils constitués de membrane?
Non, il y’a une absence de membrane au niveau des corps d’inclusions
Comment nomme-t-on les réserves de polyphosphates inorganiques?
Volutines ou grains métachromatiques
Les grains métachromatiques ont-ils un effet sur les colorants?
Oui, la charge négative des phosphates inorganiques aura tendance à changer en rendant le bleu de méthylène rouge ou le toluidine rose
Comment nomme-t-on les réserves d’azotes chez les bactéries et qui les utilise?
La réserve d’azote chez une bactérie se nomme cyanophycine et est généralement retrouvé chez les cyanobactéries.
De quoi sont composées les cyanophycines et masse de la cellule?
Il s’agit de copolymère d’aspartate et d’arginine + représente 10-15% du poids de la cellule
Chez quelle bactérie retrouve-on des réserves de souffres?
Ces réserves venant de l’oxydation de H2S vont être retrouvées chez thiomargarita
Les endospores sont-elles retrouvées chez toutes les espèces bactériennes?
Non, pas toute
À quel moment sont produit les endospores?
Lorsque les conditions ne sont pas propices à la survie de la cellule
L’endospore est un organe de résistance ou de reproduction?
Il s’agit d’un organe de résistance. Il faut la mort cellulaire pour qu’une nouvelle cellule arrive
Quelle est la couche la plus extérieur de l’endospore? Sa composition? Rôle?
Il s’agit de l’exosporium et est composée de lipoprotéines. On ne connait pas encore son rôle.
Quelle est la couche sous l’exosporium? Composition? Rôle? Poids?
Il s’agit de la tunique sporale. Elle est riche en a.a hydrophoble et cystéine ce qui lui permet d’être imperméable aux molécules hydrophiles. Son rôle est de protégé l’endospore des substances toxiques. Va être la zone la plus lourde avec environ 30 à 60 % du poids
Qu’est ce qu’on retrouve après la tunique sporale?
Le cortex moins ponté que le peptidoglycane mais permet une résistance mécanique
Qu’est ce qu’est le protoplaste?
Il s’agit de l’endroit où l’en retrouve la membrane, le chromosomes et les ribosomes. En gros, toutes les structures essentielles à la survie de la nouvelle cellule.
Le protoplaste-a-t-il une activité métabolique?
Non.
À quoi servent les petites protéines qui lient l’ADN dans le protoplaste?
Protéger l’ADN des radiations et déssiccation
De quoi dépend la position de l’endospore dans la cellule?
De l’espèce bactérienne. Il peut être centrale ou terminal
À quoi est résistant l’endospore?
La chaleur, pression élevée et substances toxiques
Comment est la quantité d’eau dans le protoplaste?
Elle est très faible
