mol.bio. Werkzeuge Flashcards
Restriktionsenzyme
Enzyme die Fremd-DNA schneiden(Pallindrome) und eigenDNA modifizieren. Schnitt führt zu Sticky oder Blunt- Ends.
Beispiele: ASP718, KpnI, SalI, XhoI, NcoI, PstI
Isoschizomere
Restriktionsenzyme, die gleiche Sequenz an gleicher Stelle schneiden. Haben unterschiedliche biochemische Parameter, da sie aus unterschiedlichen Organismen stammen
Neoschizomere
Haben selbe Erkennungssequenz, schneiden aber an unterschiedlichen Stellen.
Klenow-Fragment
Teil der DNA-Polymerase, entsteht nach proteolytischer Spaltung mit Subtilisin
Besitzt 5’-3’-Polymerasefunktion und 3’-5’-Exonukleasefunktion: 5’-Überhänge werden aufgefüllt und 3’-Überhänge entfernt
PCR-vermittelte Klonierung PVK
Einbau von Restrictionsschnittstellen in die DNA duch PCR
Reverse Transkriptase
Herstellung eines komplementären DNA-Strangs von der Ziel-RNA
- möglichkeit der RNA-Klonierung
- ds 3’-Ende nötig
- -> Poly-A-Schwanz wird genutzt um dTs zu fusionieren und bildet den Startpunkt der reversen Transkription
Ligase
Verknüpfung von DNA-Fragmenten, benötigt 5’-Phosphat
Alkalische Phosphatase
Modifizierung der DNA:
Entfernt 5’-Phosphat der DNA und verhindert so Ligation
–> Verhindert eingenligation der Fragmente/Vektoren und Verhinderung der Rückligation des Fragments in den Vektor
Polynukleotidkinase
Anhängen von Phosphat ans 5’-Ende
–> Vorbereitung gekaufter dt’s; radioaktive Markierung von Sonden
terminale Desoxynucleotid- Transferase
Anhängen von Nukleotiden ans (5’)-Ende ohne Matritze - beliebiges Ende kann synthetisiert werden
Histon
- kleines basisches Protein
- 4 Aren von Untereinheiten, alle doppelt vorhanden = 8 UE
- Aufbau aus langen und kurzen Helices
- ca 2,5 WIndungen DNA/Histon
Nukleasom
mit DNA umwickeltes Histon