MolBio 1.Termin 2023

Question 1

Für eine Pull-Down Analyse werden eingesetzt: 1) Sepharose beads, 2) Fusionsprotein dass spezifisch an die Beads binden kann, 3) ein Proteingemisch mit Zielprotein oder ein gereinigtes Zielprotein

Answer 1

Richtig

Question 2

Als Fusionsproteine sind GST-Fusionsproteine geeignet. Diese werden an Glutathione-Sepharose gebunden

Answer 2

Richtig

Question 3

Als Fusionsprotein wäre auch ein His-getagtes Fusionsprotein geeignet. Dieses würde über einen 6x Histidin Rest an eine geeignete Sepharose gebunden.

Answer 3

richtig

Question 4

Ein weiteres, oft verwendetes Tag ist das FLAG Tag. Dabei handelt es sich um ein kurzes Phagen Peptid, das an GFP bindet

Answer 4

falsch

Question 5

Bei der Herstellung von rekombinanten Vektoren, die für Fusionsproteine kodieren, muss verifiziert werden, dass der ORF der klonierten DNA im Vektor in frame integriert werden.

Answer 5

Richtig

Question 6

Beim GST Pull Down wird das gebundene Zielprotein nach dem Experiment mit Hilfe einer Proteinase vom Fusionsprotein.

Answer 6

Falsch

Question 7

Lambda-Phagenvektoren besitzen ORI, COS-sites, dsDNA. Das Einbringen des kombinierten Vektors in Wirtszellen erfolgt durch Infektion nach in vitro packaging.

Answer 7

Richtig

Question 8

Plasmide besitzen ORI, COS-sotes, ds-DNA. Das Einbringen des rekombinierten Vektors in Wirtszellen erfolgt durch Infektion nach in vitro packaging-.

Answer 8

Richtig

Question 9

Retrovirale Vektoren besitzen LTRs, ssRNA. Es werden stets replikationskompetente Viruspartikel erzeugt und mit diesen die Zelle infiziert.

Answer 9

falsch

Question 10

Lentiviren-Vektoren besitzen LTRs, ssRNA. Das Einbringen eines rekombinanten Vektors in Wirtszellen erfolgt durch Infektion nach in vivo packaging in 293T-Zellen.

Answer 10

Richtig

Question 11

YAC-Vektorenweisen neben BAC-Vektoren die höchste Klonierungskapazität auf. YACs wurden speziell für die gentechnische Veränderung von Säugerzellen entwickeln.

Answer 11

Falsch

Question 12

… Vektoren besitzen ORI, ein Centromer und Telomer-Regionen. Weiterhin sind… oder LTRs für das in vitro packaging vorhanden.

Answer 12

falsch

Question 13

Die RNAP1 ist ein Komplex aus mehreren Proteinen und interagiert mit basalen Transkriptionsfaktoren. Das TBP ist hierfür nicht relevant.

Answer 13

falsch

Question 14

Die RNAP2 besteht aus 2 großen und mehreren kleinen Untereinheiten . Während der Initiation der TRanskription bindet TBP an die TATA Box im Kernpromotor und entwindet die DNA-Helix.

Answer 14

falsch

Question 15

Die RNAP3 trasnkribiert den tRNA lokus. Hierfür benötigt sie TBP als scaffold Protein. Dies bedeutet: TBP interagiert mit den basalen Transkriptionsfaktoren der RNAP3

Answer 15

Richtig

Question 16

Die RNAP-3 transkribiert auch das RNU6-1Gen. Der zugehörige Promotor trägt eine TATA Box, die TBP bindet. Außerdem bindet das PSE-Element das SNAPC.

Answer 16

Richtig

Question 17

TFIIB ist ein Monomer und bindet an das BRE element im Kernpromotor

Answer 17

Richtig

Question 18

Der “B-ribbon” von TFiiB hakt in die RNAPII ein und rekrutiert damit die RNAP an die zu transkribierende DNA

Answer 18

richtig

Question 19

TFIID ist ein Proteinkomplex, bestehend aus TBP und mehreren TAFs. EInige TAFs etablieren Kontakte mit der DNA

Answer 19

richtig

Question 20

Die TAF250 Untereinheit des TFIID trägt eine Histonacetyltransferase-Aktivität, die z.B histone modifizieren kann.

Answer 20

Richtig

Question 21

TFIIH ist ei Proteinkomplex, bestehend aus mindestens 6 Proteinen, darunter die Kinase CDK9.

Answer 21

falsch

Question 22

TFIIH enthält eine 3´–>5´ und eine 5´–>3´ Helikase. Mutationen dieser Helikasen werden z.B bei Patienten mit Xeroderma Pigmentosum.

Answer 22

richtig

Question 23

Der Histon-Code beschreibt die Summe der post-translationalen Modifizierungen der Kern-Histone.

Answer 23

Richtig

Question 24

Acht Kernhistone assemblieren zum Nukleosom. Dieses besteht aus je zwei Paaren der Dimere H3/H4 und H2A/H2B sowie der dna

Answer 24

richtig

Question 25

PTMs der Histon-tails beeinflussen die Transkription. Die Modifizierungen sind insbesondere an H3 und H4

Answer 25

richtig

Question 26

PTMs der Histone treten nur in der Region des Kernpromotors auf und sind in Genen des Euchromatins stabil

Answer 26

falsch. Sie sind nicht stabil und können sich verändern

Question 27

Die PTMs der Histone werden von Proteinen mit einem Zinkfinger, einer Bromo oder einer Chlorodomäne erkannt.

Answer 27

falsch. keine Chlorodomäne

Question 28

Typische Modifizierungen in inaktiven Genen sind H3K9me3 und H3K27me3. Methylierungen in anderen Lysyl Resten können Marker für aktive Gene sein.

Answer 28

Richtig. H3K4me bewirkt Aktivierung

Question 29

Im Verlauf der Initiation der Transkription werden die RNAP2 und der Mediatorkomplex rekrutiert. Der MED interagiert mit der RNAP2 und phosphoryyliert danach deren CTD in Tyrosyl resten.

Answer 29

Falsch. Er interagiert mit basalen Transkriptionsfaktoren

Question 30

Der Mediatorkomplex ist ein Proteinkomplex, der aus Modulen besteht. Es werden negative und positive Module unterschieden. Die Anwesenheit dieser Module ist variabel.

Answer 30

Ja. Er enthält positive und negative Module.

Question 31

Der Mediatorkomplex kann mit Aktivatoren und Repressoren interagieren. Dabei erfolgen die Kontakte über die Knüpfung von Disulfidbrücken.

Answer 31

Falsch.

Question 32

Der Mediatorkomplex kann über das CCCTC-Motif direkt an die DNA binden. Hierbei kommt es, unter Mitwirkung von Cohesin zur Stabilisierung von Loop-Strukturen des Chromatins.

Answer 32

Falsch.

Question 33

das Auftreten von Mikrosatellitenexpansionen ist nur in der 3´ UTR von prä-mRNAs zu beobachten

Answer 33

Falsch

Question 34

Das Auftretenn von Mikrosatellitenexpansionen ist nur in der 5´ UTR von prä-mrnas zu beobachten

Answer 34

Falsch

Question 35

das Auftreten von mikrosatellitenexpansionen ist sowohl in exonischen, als auch in intronischen Sequenzen der prä-mrna zu beobachten

Answer 35

Richtig

Question 36

Das Auftreten von (CAG)n Mikrosatellitenexpansionen in exonischen Sequenzen führt nach Translation der mutierten mRNA zu Glutamineinschüben in der Proteinsequenz.

Answer 36

Richtig

Question 37

Retinitis Pigmentosa entsteht durch Mutationen in U4-U5-U6 snRNA Komplex

Answer 37

falsch

Question 38

Retinitis Pigmentosa entshet durch Mutationen in Spleißfaktoren PRPF31, PRPF8 oder PRPF3

Answer 38

Richtig

Question 39

Retinitis Pigmentosa entsteht durch Mutation der 5´ Spleißstelle im Exon 1 des Photorezeptor Gens

Answer 39

falsch

Question 40

Mutationen in Retinitis Pigmentosa Genen verringern den Zusammenbau funktioneller U4.U5.U6 tri-snRNP Spleißkomplexe.

Answer 40

richtig

Question 41

Eine Mutation in dem Polyadenylierungssignal führt zu einer verminderten 3´endprozessierung , die aber durch Mutationen im downstream sequence element (DSE) weitestgehend aufgehoben wird, was zu einer erhöhten genexpression führt.

Answer 41

Falsch

Question 42

Eine CG zu CA Mutation der 3´schnittstelle führt zu einer verbeseerten 3´ednprozessierung dieser prä-mrna und damit zu einem effizienteren Export dieser mrna aus dem zellkern in das Zytoplasma

Answer 42

richtig

Question 43

Mutation im DSE (hier einführung zusätzlicher U-Reste) führen zu einer geringeren 3´endprozessierung durch eine schlechtere CstF Bindung (!!!) , die in einer reduzierten mRNA Export udn damit in einer ernierdrigten Prothrombin Proteinexpression resultieren.

Answer 43

falsch.

Question 44

Das upstream sequence element USE von Prothrombin prä-mrna ist durch eine U-reiche sequenz gekennzeichnet und sehr effizient in der 3´endprozessierung. Damit gleicht es die normalerweise schwache 3´endprozessierung der Prothrombin mrna aus.

Answer 44

Keine ahnung

Question 45

Die zunächst in der Transkription gebildete prä-mrna enthält intronische und exonische Sequenzen.

Answer 45

richtig

Question 46

Durch das spleißen werden die exons entfernt entfernt und die angrenzenden Introns miteinander zu fertigen mrna verknüft

Answer 46

falsch

Question 47

Die Proteinkomponenten der Polyadenylierung des 3´endes werden durch die RNA Pol2 rekrutiert. Die Polyadenylierung des 3´endes findet nach der transkription statt, ist also ein posttranskriptionaler vorgang.

Answer 47

Falsch. Wird durch PAP induziert

Question 48

De Modifizierung des 5´endes (Capping) ist ein posttrnaksriptionaler vorgang

Answer 48

Richtig. Es ist der erste Schritt nach der Transkription vom primären Transkript

Question 49

In eukaryonten ist Transkription und Translation gekoppelt

Answer 49

Falsch

Question 50

Zum Schutz vor abbau durch exonucleasen und als erkennnungssequenz für die Translation erhält das 5´ende der prä-mrna einen methylierten GMP-Rest ; zusätzlich können ein bis drei Ribosen des Transkrips....

Answer 50

Richtig

Question 51

In B Zellen kommt es zur Expression der Membran-gebundenen IgM Form, da die Konzentration der CstF-64 gering und die hnRNP-F Konzentration stark erhöht ist. Es folgte die 3´ Endprozessierung an der M2-Stelle

Answer 51

richtig

Question 52

In B Zellen kommt es zur expression der sekretierten IgM Form, da das Fehlen eines zellulären Faktors (PABP) zur Selektion der 3´endprozessierung an der S-Stelle führt.

Answer 52

falsch

Question 53

In Plasmazellen kommt es zur expression der membrangebunden IgM Form, da die Konzentration von CstF-64 gering ist und die hnRNP-F Konzentration stark erhöht ist. Es erfolgt die 3´endprozessierung an M2 Stelle

Answer 53

Falsch

Question 54

In Plasmazellen kommt es zur Expression der sekretierten IgM form, da die Konzentration an CstF-64 hoch und die hnRNP-F Konzentration erniedrigt ist. Es folgt die 3´ Endprozessierung an der S-Stelle.

Answer 54

Richtig

Question 55

Gentherapie Kymriah: -Wird zur Behandlung von Brustkrebs eingesetzt - Wird zur Behandlung von B zell leukämie eingesetzt - wird zur Behanldung von Leberkrebs eingesetzt -nutzt stabile T zelllinien -nutzt tumorspezifischen, chimären CAR Rezeptor -nutztz autologe T-zellen des Patienten

Answer 55

-falsch -richtig -falsch -falsch .richtig -richtig

Question 56

In welchen Geweben sind die jeweiligen Promotoren aktiv ? Albumin-promotor Myosin-light chain DF3/MUC1 Promotor Afetoprotein Promotor

Answer 56

Leber Muskel Tumor Tumor

Question 57

Eine HPV Infektion kann nicht chronisch persistieren

Answer 57

falsch

Question 58

Das HPV genom kann ins Wirtszell genom integerieren

Answer 58

richtig

Question 59

Das HPV vakzin ist ein lebend vakzin

Answer 59

Falsch

Question 60

Durch HPV induzierte Kondylome bilden sich grundsätzlich spontan zurück

Answer 60

falsch

Question 61

Die HPV Vakzine schützt vor der entstehung von Krebsvorstufen

Answer 61

Richtig

Question 62

Seit einführung des HPV Impfung ist de Zahl ungeklärter Todesfälle bei jungen Frauen in deutschland massiv gestiegen

Answer 62

Falsch

Question 63

Ordne die jeweiligen Eigenschaften den Lebend- und Totvakzinen zu: Lang anhaltender Impfschutz Mehrfache Applikation nötig Risiko der Reversion zum wildtyp Effektive Präsentation über MHC Klasse I Weniger temperaturempfindlich Wirkung stark abhängig von Adjuvans

Answer 63

Lebend- vakzin Tot vakzin Lebend vakzin Lebend vakzin Tot vakzin Tot vakzin

Question 64

GAX kommen in der Typ 1 Zellwand vor

Answer 64

Falsch.Kommen in Typ 2 vor

Question 65

Das Polymere Rückgrat der XYGs besteht aus Glucose einheiten

Answer 65

Richtig

Question 66

XYGs tragen zur Kreuzvernetzung von Zellulosemolekülen bei

Answer 66

Richtig

Question 67

Polymeres Rückgrat der GAX besteht aus Glucose einheiten

Answer 67

Falsch

Question 68

Rhamnogalacturonane gehören zu den Pektinen

Answer 68

Richtig

Question 69

Zellulose ist ein Polysaccarid

Answer 69

richtig

Question 70

In der Zellulose sind zuckermoleküle über Peptidbindungen verknüpft

Answer 70

Falsch

Question 71

Zellulose gehört zur Gruppe der Pektine

Answer 71

Falsch

Question 72

Zellulose kommt in Zellwandtypen Typ 1 und 2 vor.

Answer 72

Richtig

Question 73

Am Photosystem 1 wird ATP synthetisiert

Answer 73

falsch

Question 74

Bei den Kohlenstoffreaktionen entstehen aus initial 3 Molekülen Kohlenstoffdioxid und 3 Molekülen 3-Phosphoglycerat 3 Moleküle Ribulose-1,5-bisphosphat.

Answer 74

falsch. 6 Moleküle 3-Phosphoglycerat

Question 75

Chlorophyll absorbiert Licht im blauen und roten bereich

Answer 75

richtig

Question 76

Chlorophyllmooleküle kommen auch in den Photosystemen vor.

Answer 76

richtig

Question 77

Die Dunkelreaktionen /Calvin-Zyklus finden im Stroma der Chloroplasten statt

Answer 77

richtig

Question 78

Bei den Dunkelreaktionen/Calvin Zyklus wird CO2 fixiert

Answer 78

riichtig

Question 79

Bakterien der Spezies Agrobakterium: Das komplette Ti-Plasmid wird bei der Infektion in die Pflanzenzelle transferiert

Answer 79

falsch

Question 80

Bakterien der Spezies Agrobakterium: Ein Teil des Ti-Plasmid wird bei der Infektion in die Pflanzenzelle transferiert

Answer 80

richtig

Question 81

Bakterien der Spezies Agrobakterium: Die Vir-gene des Ti-Plasmids kodieren für Proteine, die beim Transfer in die Pflanzenzelle eine Rolle spielen

Answer 81

richtig

Question 82

Bakterien der Spezies Agrobakterium: Die Vir gene des Ti-plasmids werden in die Pflanzenzelle transferiert

Answer 82

falsch

Question 83

Bakterien der Spezies Agrobakterium: Opin-katabolismus Gene werden in die Pflanzenzelle transferiert

Answer 83

falsch

Question 84

Bakterien der Spezies Agrobakterium: Tumor-induzierende Gene werden in die Pflanzenzelle transferiert

Answer 84

richtig

Question 85

Bei welchem dieser Mechanismen spielen Glykosylasen eine Rolle ? Short Patch BER long patch BER NER Mismatch Repair Non-homologous end joining homology directed repair

Answer 85

Ja Ja Nein Nein Nein Nein

Question 86

Welche dieser Faktoren kommen NUR bei der transkriptionsgekoppelten NER vor ? DNA Pol delta DNA Ligase I XPC/HR23B Heterodimer Helikase XPB CSA/CSB Proteine Nuklease XPG

Answer 86

nein nein nein nein ja nein

Question 87

Welche dieser Zellen besitzen typischerweise eine Telomerase Aktivität ? Epithelzellen Herzmuskelzellen Embryonale Stammzellen Glatte Muskelzellen Tumorzellen Nervenzellen

Answer 87

nein nein ja nein ja nein

Question 88

G2/M Arrest: Der Transkriptionsfaktor p53 ist gar nicht involviert

Answer 88

falsch

Question 89

G2/M Arrest: Die Kinasen Chk1 und Chk2 spielen hierbei keine Rolle

Answer 89

falsch

Question 90

G2/M Arrest: Die Kinase Wee1 phosphoryliert den Cdk4/CyclinD Komplex

Answer 90

Falsch (phosphorylierung von edc2/ cyclin B)

Question 91

G2/M Arrest: Kinase Wee1 phosphoryliert den Cdc2/CyclinB Komplex

Answer 91

Richtig

Question 92

Die Phosphatase Cdc25a dephosphoryliert den cdc2/cyclinB Komplex

Answer 92

Richtig

Question 93

Die Phosphatase Cdc25A dephosphoryliert den Cdk4/cyclinD Komplex

Answer 93

Falsch

Question 94

Riboswitches: Positive oder negative Regulation erfolgt auf der Ebene der Transkription und Translation

Answer 94

Richtig

Question 95

Riboswitches kommen in Prokaryoten und Eukaryoten vor

Answer 95

richtig

Question 96

Riboswitches finden sich meist in 5´ UTRs bakterieller Stoffwechselgene

Answer 96

richtig

Question 97

Sogenannte off-Riboswitches können in der Liganden-freien Konformation eine Anti-terminator haarnadel ausbilden

Answer 97

richtig

Question 98

Die GlmS-genexpresion wird durch ein Riboswitch-Ribozym reguliert. Durch die Ribozym-vermittelte Spaltung der Glms-mRNA entsteht ein 5´Monophosphat, welches durch RNase J1 erkannt wird und zum abbau der mRNA führt.

Answer 98

falsch

Question 99

Die Spezifität von Purin-bindenden Riboswitches (Guanin oder Adenin) beruht auf einem einzigen hoch konservierten Nukleotid in der Aptamer- Domäne

Answer 99

Richtig