MolBio 1.Termin 18-19

Question 1

• RNA Pol2 hat 2 große und 2-5 kleine Untereinheiten
• CTD hat immer 52 repeats
• Ser2 und Ser5 müssen hyperphosphoryliert vorliegen damit es zur Transkription kommen kann
• CDK 7 phosphoryliert Ser2
• die RNA Pol2 ist so lange im Paused-Zustand bis pTEFb NELF und DSIF phosphoryliert
• TFIID hat Untereinheiten TBP und Ubiquintinligase
• Alleinige Aufgabe von TFIID ist die Bindung an TATA-Box in RNAPII core Promotor
• Bindung von TBP induziert Beugung der DNA und bewirkt Dissoziation von Repressoren
• Die Histonemarks können sich ändern während RNAP II aktiv ist

Answer 1

falsch
falsch
richtig
falsch
richtig
richtig
falsch
falsch
richtig

Question 2

Frage 3: Chromatin und assoziierte Komplexe

• Ein Nukleosom setzt sich aus je 2-mal gamma-H2AX, H2B, H3 und H4 zusammen
• Den Histon Code dekodierende Proteine erkennen die Marks über LxxLL
• Euchromatin ist der für Transkription zugängliche Teil des Chromatins
• Heterochromatin wird gebildet durch die massive Bindung von HP1
• Acetylierung ist wichtig für Chromatin Assembly

Answer 2

richtig
falsch (Die LxxLL-Sequenz hingegen ist ein Motiv, das von anderen Proteinen, wie z.B. den Kernrezeptoren, erkannt wird)
richtig
richtig
richtig

Question 3

A) Beschreiben Sie den Aufbau einer Riboswitch-kontrollierten mRNA ausgehend vom 5’-Ende bis zum 3’-Ende der mRNA.

Answer 3

Erst 5´ UTR, dann Riboswitch, dann Startcodon, dann Coding region, dann Stoppcodon, dann 3´ UTR

Question 4

Benennen Sie die wesentlichen Strukturelemente eines Riboswitch.

Answer 4

Aptamer-Domäne, Switching-Sequenz, Expressionsplattform

Question 5

RNA-Thermometer:

• RNA Thermometer kodieren für Stressgene
• Rna-Thermometer für Virulenzgene sind Riboswitches
• cspA ist chaperon ein RNA Chaperon und verhindert die Ausbildung von sekundär und tertiär
  Strukturen in mRNA
• cspA Gen wird über Kissing hairpin stabilisiert

Answer 5

richtig
falsch
richtig
falsch (stabilisierung durch Pseudoknoten)

Question 6

sRNAs:

• haben mehrere mRNAs als Target
• führen zu Transkiptionsaktivierung, Translationsinhibition und/oder mRNA Degradierung
• die PNPase im Degradasom baut die sRNA in 3’-5’ Richtung ab
• RNase 3 generiert Produkte mit 5’ Phosphat und 3’ Ende mit 2nt Übergang

Answer 6

richtig
falsch (keine Transkriptionsaktivierung)
richtig (hfq rekrutiert Rnase E, welches wiederum das restliche Degradosom rekrutiert mit PNPase–> Translationsinhibition)
richtig

Question 7

asRNAs:

• Regulieren unter anderem Plasmid Stabilität
• Gene können auch für Proteine kodieren

Answer 7

richtig
falsch (regulieren Genexpression durch Interaktion mit mRna)

Question 8

siRNA:

• Wurde in Pro- und Eukaryoten beobachtet
• In Säugetieren kann eine unspezifische Immunantwort gegen lange doppelsträngige RNA
  stattfinden
• Dicer erzeugt eine siRNA mit 3’ OH und 5’Phosphat
• die siRNA die an RISC bindet besteht aus guide und passanger strand, der sense bindet an
  mRNA
• die mRNA wird 10 nt von ihrem 3´ Ende entfernt gespalten.

Answer 8

falsch (siRNA nicht in prokaryoten)
richtig
richtig
falsch(antisense bindet)
falsch (10-11 nt vom 5´ Ende)

Question 9

mRNA Vakzine:

• Sind anwendbar gegen krebs
• Werden gegen Influenza A erprobt
• Sind stabiler als Dna
• Können ins Genom integrieren
• Sind leicht modifizierbar

Answer 9

richtig
richtig
falsch
falsch
richtig

Question 10

B-Zell Differenzierung:

• B Zellen produzieren membranständige IgM da wenig CstF und viel hnRNP
• Plasmazellen produzieren membranständige IgM da wenig CstF und viel hnRNP
• B Zellen produzieren sekretorische IgM da viel CstF und wenig hnRNP
• Plasmazellen produzieren sekretorische IgM da viel CstF und wenig hnRNP

Answer 10

richtig
falsch
falsch
richtig

Question 11

Bei der 3´Endprozessierung der Prothrombin-mRNA liegt ein Defekt vor, so dass die Proteinexpression erhöht ist, was zu Thrombophilie führt. Welche Aussagen sind richtig?

• Eine DSE-Mutation (hier: zusätzliche U-Reste) erhöhen die 3´Endprozessierung, was den mRNA-Export verstärkt, wodurch wiederum die Prothrombin-Proteinexpression erhöht ist.
• Das POly-Adenylierungssignal (AAUAAA) ist defekt, so dass die 3´Endprozessierung verringert ist. Dies wird allerdings von einer weiteren DSE Mutation aufgehoben, so dass die Proteinexpression letztendlich erhöht ist.
• Eine Mutation von CG zu CA in der 3´Schnittstelle ermöglicht eine bessere 3´Endprozessierung, was einen effizienteren Export aus dem Nukleus zur Folge hat.

Answer 11

richtig
falsch
richtig

Question 12

Welche Reifungsprozesse finden für eine pre-mRNA statt, bis diese zu einer translatierbaren mRNA prozessiert wurde?

Answer 12

pre-mRNA splicing–> 3´ endprozessierung –> Addition of Poly A tail –> mRNP Packaging –> native mRNA –> Transport ins Zytoplasma

Question 13

Welchen enzymatischen Prozess katalysiert das Enzym Superoxiddismutase?

• Die Umwandlung von Wasserstoffperoxid in Wasser und Sauerstoff
• Die Umwandlung von Wasserstoffperoxid in Wasser
• Die Umwandlung von Wasserstoffperoxid in Wasserstoff und Sauerstoff
• Die Umwandlung des Superoxidanions in Wasserstoffperoxid und Sauerstoff

Answer 13

Umwandlung des Superoxidanions in wasserstoffperoxid und sauerstoff

Question 14

Welche Technik für die Generierung der Flavr-Savr Tomate eingesetzt?

• Überexpression des Gens für Galaktosidase
• Knockout des Gens für Rhamnose
• Überpression des Gens für Cellulase
• Antisense RNA gegen Gen für Polygalacturonase

Answer 14

Antisense RNA gegen Gen für Polygalacturonase

Question 15

Welche Gene des Ti-Plasmids werden übertragen?

• Vir Gene
• Opinsynthese Gene
• Opin-Metabolismus Gene
• Tumor-induzierende Gene

Answer 15

Opinsynthese-Gene, Tumor-induzierende Gene

Question 16

Exlusive Enzyme der BER, also Enzyme die nur in dieser Reperatur vorkommen

• Exonuklease
• Ligase
• Lyase
• Glykosylase
• Polymerase delta

Answer 16

Glykosylasen !! (spalten Bindungen zwischen Desoxyribose und DNA Base)