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Microbiologie générale > Module 7: Caractérisation et classification des microorganismes > Flashcards

Module 7: Caractérisation et classification des microorganismes Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la taxonomie?

A

L’établissement des groups naturels d’organismes présentant des caractères communs.

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Q

Quel est le terme utilisé pour désigner un group taxonomique?

A

Taxon

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Q

Vrai ou faux: La hiérarchie est non chevauchante.

A

Vrai.

Un organisme fait partie d’un seul taxon à un niveau donné de la hiérarchie.

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4
Q

Quels sont les trois volets de la taxonomie?

A
  • Identification (description et caractères)
  • Nomenclature (noms)
  • Classification (systématique, arrangements et relations inter-groupes)
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5
Q

Qu’est-ce qu’une culture pure?

A

Culture (population) de microorganismes où tous les individus ont les mêmes caractéristiques.

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6
Q

Qu’est-ce qu’une souche (isolat)?

A

Tous les descendants (sous-cultures) d’une culture pure.

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7
Q

Qu’est-ce qu’une espèce?

A

Groupes de souches dont les caractéristiques sont (presque) identiques. (Escherichia coli de différents individus). TAXON DE BASE.
C’est un groupe homogène différent des autres groupes.

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8
Q

Qu’est-ce qu’une souche-type?

A

Souche possédant toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce. Elle est souvent la première isolée et sert de référence.

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9
Q

Quel est e préalable pour la description et la caractérisation?

A

Une culture pure.

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10
Q

Quels sont les différentes catégories de caractères qu’on peut observer?

A
  • Morphologie
  • Composition biochimique (membranes, parois cellulaires)
  • Physiologie (exigences nutritionnelles, conditions d’incubation)
  • Métabolisme (produits finaux de la fermentation, enzymes extracellulaires)
  • Génétique (Composition G+C %, nb de chromosomes, plasmides)
  • Interaction avec l’hôte (pathogénicité, symbiose)
  • Écologie (habitat, niche écologique, rôle dans les cycles de la matière)
  • Moléculaire (comparaison des séquences, hybridations ADN-ADN)
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11
Q

Comment pouvons-nous déterminer la composition en G+C? Qu’est-ce qu’elle signifie?

A
  • Spectrophotomètre UV (260 nm)
  • LA densité optique bicaténaire < monocaténaire
  • G+C% ⇑ ⇒ Tm⇑
  • Plantes et animaux: 30 à 50%
  • Microorganismes: 25 à 80%

La valeur est typique de l’espèce mais elle n’est pas exclusive.

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12
Q

Lorsqu’on utilise une approche moléculaire, comment pouvons-nous déterminer une similarité entre deux espèces avec l’hybridation ADN-ADN?

A

La complémentation des séquences d’ADN chromosomiques.

Même espèce si > 80%

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13
Q

Qui a développé le système de nomenclature que nous utilisons aujourd’hui? Quel est son nom?

A
  • Carl von Linné

- Nomenclature linnéenne

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14
Q

Quelles sont les caractéristiques de la nomenclature linnéenne?

A
  • Binomiale
  • Italique ou souligné (si écrit à la main)
  • Genre et espèce
  • Genre: 1ère lettre majuscule, latin ou grec, descriptif ou nommé pour le découvreur
  • Espèce: 1ère lettre minuscule, latin ou grec, descriptif
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15
Q

Qu’est-ce que la classification?

A

L’Arrangement en groupes et les relations intergroupes. Déterminé selon les caractères communs et les liens évolutifs.

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16
Q

Quels sont les différents types de classification?

A
  • Naturelle
  • Phénétique
  • Numérique
  • Phylogénétique
17
Q

Qu’est-ce que la classification naturelle?

A
  • Nature biologique des organismes

- Anatomique

18
Q

Qu’est-ce que la classification phénétique?

A
  • Similarités des caractères phénotypiques
  • Morphologique
  • Métabolique
  • Génétique
19
Q

Qu’est-ce que la classification numérique?

A
  • Comparaison de plusieurs organismes 2 par 2
  • Nombre de caractères minimums = 50
  • Pourcentage: %S
  • Représentation avec dendrogrammes
20
Q

Qu’est-ce que la classification phylogénétique?

A
  • Race, genèse/origine
  • Relations évolutives probables
  • Ancêtres communs
  • Comparaison d’espèces distantes
  • Comparaison de séquences de gènes/protéines conservées (chronomètres moléculaires)
  • Mutations au hasard (effet neutre ou positif)
  • Gène ARN ribosomal (régions conservées sont essentielles à la fonction, régions variables ne le sont pas)

NB des outils informatiques sont utilisés et sont en développement constant.

21
Q

Nommez la limite de la classification numérique.

A
  • Pondération des caractères est uniforme.

- On ne voit pas la pertinence biologique. Certains caractères sont beaucoup plus importants que d’autres.

22
Q

Nommez la limite de la classification phylogénétique.

A

Les fossiles procaryotes sont rares.

23
Q

Qu’elle est la classification contemporaine? Quelles sont ses caractéristiques?

A

La classification polyphasique.

  • Information phénétiques et phylogénétiques
  • Plus complètes, remaniements continus
  • Réévaluation de la notion d’espèce
24
Q

Décrivez l’historique de la classification des microorganismes selon le scientifique suivant: Linnaeus.

A
  • Anatomie

- 2 règnes: Animaux et Plantes

25
Q

Décrivez l’historique de la classification des microorganismes selon le scientifique suivant: Haeckel.

A
  • Ajout du troisième règne: Protistes

- Inclut les bactéries, les levures, les protozoaires, les algues

26
Q

Décrivez l’historique de la classification des microorganismes selon le scientifique suivant: Whittaker.

A
  • Description de la nutrition et l’organisation cellulaire
  • Photosynthèse, absorption (soluble), ingestion (solide)
  • Eucaryotes et procaryotes
  • Unicellulaire ou pluricellulaires
  • 5 règnes
27
Q

Décrivez l’historique de la classification des microorganismes selon le scientifique suivant: Woese.

A
  • Approche phylogénétique/ARNr
  • 3 domaines: Bacteria, Eucarya, Archaea
  • Archaea et Bacteria = procaryotes
  • Voies évolutives
  • LUCA
  • Confirmation par études biochimiques
28
Q

Qu’est-ce que l’origine des organites?

A
  • Mitochondries et Chloroplastes

- Théorie de l’endosymbiose

29
Q

Pourquoi croyions-nous que les mitochondries et les chloroplastes sont d’origine bactérienne?

A
  • Autoréplicatives
  • Chromosomes circulaires, uniques
  • Gènes ARNr (apparentés aux eubactéries)
30
Q

Quelle est l’origine des mitochondries? Chloroplastes?

A

Relation endosymbiose

  • Mitochondrie: la bactérie Rickettsia
  • Chloroplaste: Cyanobactérie Prochloron

Microbiologie générale (11 decks)

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