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Bio intégrative 2 > Module 7 > Flashcards

Module 7 Flashcards

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Biology 101 flashcards
1
Q

Que sont les différents types de selection naturelle

A

Disruptive/ divergente
directionelle
stabilisatrice
Balancée (équilibrante)

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Q

Que sont les 5 observations faites pour amener à la selection nat

A

1- fécondité en exces
3-Ressources limitées
1 et 3 impliquent une competition pour la survie

2- Taille popu sont stables

4- Membre d,une popua ont de nombreuses variations phénotypoques

5- La plupart des caractères sont héritables

Phenotype transmis à progéniture de génération en génération

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3
Q

Que sont les deux inférences faites qui menent à l’idée de l’évolution par la selection naturelle

A

Inférence 1 : Tous les rejetons ne vont pas survivre et se reproduire

Inférence 2 : Certains individus ont plus de chance de survivre et reproduire grace au trait hérité

Inférence 3
Evolution par selection naturelle

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4
Q

Que sont les 3 conditions qui sont necessaire pour que la selection naturelle entraine l’adaptation

A

1- Il existe des variations phenotyopiques chez des individus
2- Qui sont héréditaires
3- Qui sous -tendent des variations de la valeur sélective (survie + reproduction)

Du fait des différences de valeur
sélective entre individus, certains
phénotypes sont passés plus
fréquemment aux descendants, et
augmentent en proportion dans la
génération suivante
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5
Q

Qu’est ce que l’adaptation

A

Processus par lequel une population/une espèce acquiert des traits
(héritables) associés à une meilleure survie dans un environnement
donné ou des conditions nouvelles (apparition d’un prédateur,
modification du climat…).

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6
Q

L’adaptation se joue à l’echelle des individus ou de la population

A

Population

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7
Q

La selection se joue à l’echelle des individus ou de la population

A

Individus

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8
Q

L’adaptation est elle rapide ou lente ?

A

cela dépend, Quelque génération ou quelque plusieurs cetaine millions années

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9
Q

Que sont les méinterprédation souvent faite en adparation

A

Pour la même génération :

1- Pas de variation
Changement individuel de tous les membres

mutation en fonction des besoin et sont benefiques pour mieux suvivre

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10
Q

Que sont les mésinterprétation concernant les nouveaux traits

A

Augmentent avec les besoin, toujorus benefies

les nouveaux né auront des nouveaux raits meme si parents les ont pas
Ces nouveaux très sont en fonction de l’environnement

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11
Q

Que sont les mésinterprétation concernant l’héritabilité

A

Seulement les traits bénéfiques sont passés

La différence heritaire entre parents et rejetons sont due à l’amélioraiton de la réponse à l’environnement

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12
Q

Qu’est ce que la selection stabilisatrice

A

Le phénotype moyen procure la valeur sélective maximale
La moyenne de la population demeure stable de générations en générations
La sélection maintient les fréquences alléliques stables

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13
Q

Qu’est ce que la selection directionelle

A

L’un des phénotypes extremes de la distribution procure la valeur sélective maximale

L’un des phénotypes extremes de la distribution procure le “fitness” maximal

La moyenne de la population se déplace vers l’un des extremes de la distribution

Sélection change les fréquences alléliques

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14
Q

Qu’est ce que la sélection disruptive /Divergnte

A

Les phénotypes extremes de la distribution procurent la valeur sélective maximale

La moyenne de la population se déplace ver sles extremes de la distribution
La sélection change les fréquences alléliques

-Elle peut favoriser la spéciation et l’isoloement reproducter entre les populations

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15
Q

Qu’est ce que la sleection balancée (équilibrante)

A

Il existe plusieurs pics de fitness sous slection stabilisante

Les fréquences alléliques sont stables pour plusieurs allèles

Maintient de la diversité à long terme - au sein de d’une meme espèce

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16
Q

Quel est l’exemple de signature de la selection sur des genes

A

Diversité gene MHC

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17
Q

Quel est le role du gène MHC

Quel est sa particuliriatié

A

Role: Se lier à des protéines du pathogène et les présenter aux acteurs du système
immunitaire pour induire la réponse immune

Chez vertébrés, complexe de plusieurs gènes résultant de duplicaiton, pour lesquels il y a de nombreus allèles.
Au locus HLA, des millions d’allèles existent chez l’uhumain

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18
Q

Comment peut ont explique une diversité importante d’une gène et le role de la sélection dans celui ci

A

-Analyse des séquences et de la structure des protéines:

-Méta-analyses
Estimation du coefficient de sélection sur les gènes du MHC dans 19 études
différentes sur les vertébrés

  • Génétique comparative
    Comparer les séquences des
    allèles du MHC entre espèces

indique si polymorphisme ancien

  • Biologie théorique et modèle
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19
Q

Quand on analyse les séquences et la structure de la protéine, comment savoir si’il y a une slection ? Qu’est ce qu’il l’indique

A

Si :
- Plus de polymorphisme aux positions non-synonymes que synonymes (=
avec impact sur la protéine)

Alors :
Hypothèse d,une forte sélection due au rôle de liaison avec des éléments des
pathogènes

  • Plus de polymorphisme dans les régions qui se lient aux pathogènes
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20
Q

Comment voir si la métanalyses confirme en le role de la séelection

A
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21
Q

Citez un cas de seleciton balancée(equilibrane)

Quelle est l’impact de la selection balancée

Que sont les mécanismes de la sélection balancée

A

diversité du MHC

Permet de maintenir des polymorphismes à long terme et favorise le maintien de la diversité génétique (MHC)

La sélection balancée inclut plusieurs mécanismes (avantage hétérozygote,
selection fréquence dépendance négative, sélection fluctuant dans le temps et l’espace, selection sexuelle antagoniste

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22
Q

Est ce que la selection balancée concerne une partie négligeable du génome

A

L’impact de la sélection balancée concerne
fraction non-négligeable du génome, contribuant au maintien de la
diversité génétique

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23
Q

Citez un exemple de sélection disruptive/divergente , diversifiante

A

Les poissons eau chaude/ froide

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24
Q

De quoi dépend l’importance et la taille de la zone de différentiation génétique

A
  • Dépend recombinaison

- Dépend de la balance Sélection/Flux de gènes

25
Q

Que se passe-t-il s’il y aun flux de gène qui introduit des gènes mal adaptés

A

force de la selection va determiner si les allèles

localement adaptés sont maintenus ou éliminés

26
Q

Si la selection est plus faible que le flux de gène, que se passe-t-il

A

les allèles localement adaptés
sont mixés/remplacés et adaptation
locale est perdue

27
Q

Qu’est ce qui peut causer une perte de l’adaptation locale

A

Si il y a un flux indésirable, selection plus faible que le flux locale

28
Q

Si la selection est plus forte que le flux de gène, que se passe-t-il

A

les alleles localement adaptés
sont maintenus mais le reste du génome
est homogénéisé

29
Q

Quelle est la différence entre l’étude de la sélection et l’étude de l’histoire démographique des population s

A

Etude sélection:
Exclusion des loci neutres pour se concentrer sur les loci d’importance écologique

Etude de l’histoire démographique :
Exclusion des loci sélectionnés pour se concentrer sur les loci neutres

30
Q

Quelle est l’utilité de l’étude la sélection ?

De l’étude de l’histoire démographique des population s

A

. Étude de la diversité écologique
. Meilleure compréhension de l’adaptation par sélection divergente

-Identification de gènes d’importances
(e.g. agriculture, aquaculture,
foresterie, pêcheries)

-Déterminer la structure des
populations:
- Paramètres démographiques
(Ne,m)
- Différentiation des populations
(FST)
31
Q

L’etude du fst et du NEm fait partie de l’étude de la sélection ou de l’étude de l’histoire démographique

A

Histoire démographique

32
Q

Dans un contexte de mis en évidence de la sélection, pur le sphenotypes comment montrer que les traits sont potentiellement adaptatif

iCitez un exemple

A

Etudier la variabilité naturelle
Utiliser des approches experimentales

Polymorphisme des papillos heliconus = mimetisme mullerien

33
Q

On peut mettre la selection en evidence sur quoi

A
  • Traits phenotypique
  • genotype ( gènes candidats ( signature moleculaire)
  • Balayage génomique
34
Q

Comment on fait un test de selection positive

A

dN/dS

on peut avoir sequance du genotype du loci visé vs microsa ( neutre )
comparer leur fst

Donc neutre vs adapa

35
Q

En absence de selection, comment est le rapport Dn/Ds

A

Si pas de selection : =1

SI seletion negtaive , DNdS = >1

36
Q

Si le Fst du gène d’intéret (différenciation) est plus grand que le fst du microsat (=neutre)

A

Signifie quie le marquer est plus différencié que le marqueurs neutre

La sélection directionnelle est
impliquée dans l’adaptation des populations aux différents habitats au sein d’une meme rivière

37
Q

Pour le scan génomique (scan génomique) on parle de quel principe

A

Analyse génomique de population
Les forces évo vont influencé les loci de la mpeme facon alorx que la selection va influencer des loci specifique

Donc ces loci auront une variation différente

38
Q

Que sont les avantages du scan génomique

Désavantage

A

. Estimation de la proportion des marqueurs (du génome) sous l’effet de la sélection
et leur identification sans connaissance a priori des gènes ou traits adaptatifs =
«Aller à la pêche pour les gènes importants au niveau écologique».
. Moins de risque de passer à coté d’un marqueur (gène lié) ayant une importance d’un poin de vu adaptatif
importance au point de vue adaptatif (conservation).

Désavantage
Indique seulement des loci « possiblement adaptatifs ». Il peut être difficile de faire le
lien avec des traits adaptatifs ou des pressions de sélection naturelle

39
Q

Quel est l’objectif du scan génomique

A

Identifier des marqueurs présentant des patrons significativement différents du reste du
génome.

40
Q

Dans le graphique du scan génomique, Les moins différencié , sont du à quel type de selection

A

Balance, stabilisatrice

41
Q

Dans le graphique du scan génomique, Les Fst différenciés de manière intermediaire , sont du à quoi

A

Dérive, migration, mutation

42
Q

Dans le graphique du scan génomique, Les Fst les plus différencié , sont du à quel type de selection

A

directionnelle, divergente.

43
Q

Quel est le principe d’exploiter la liaison génétique dans le Scan génomique

A

–> Saturer le génome avec des marqueurs moléculaires.
On voit gène sliés
Avec le temps et recombinaisons, marqueurs s’errodes.

44
Q

Comment peut on découvrir un gènes candiat

A

Transcriptome
Bamque ESTs
FActeurs de transcription

Détection de variation allélique
de nature fonctionnelle et adaptative
\+
Applications in amélioration
des croisements et conservation
des ressources génétiques
45
Q

Citez un exemple d’analyse de redondance

Dans quel cas on l’utilise

Qu’est ce qu’on doit faire

A

Analyse

Les gènes à effet majeur et la polygénie : plusieur gène avec un effet faible sur le phenotype

Identifier les signaux de covariance entre gènes et phénotypes

46
Q

dans quel cas ont ne pas pas utiliser les scan génomique

On utilise quoi du coup

En quoi consite cela

A

Les gènes à effet majeur et la polygénie : plusieur gène avec un effet faible sur le phenotype

L’analyse de redondance

identifier signaux de
covariance entre gènes et phénotype
avec analyse de composante principale

47
Q

Quel est le but d’une analyse de redondance

A

Utiliser la contribution des marqueurs génétiques sur les différents axes de
redondance pour détecter des loci potentiellement sous sélection

48
Q

Que sont les avantages des axes de redondance dans l’analyse de redondance

A 
- Les axes de redondances sont calculés sous une base multilocus avec plusieurs
variables environnementales
(plus réaliste si on considère la complexité de l'architecture génétique et d'un habitat)
49
Q

Que sont les différentes approches pour mettre en evidence L,adaptation

A

Etude de la variabilité naturelle (entre environnements, entre phénotypes)
- Etude expérimentales (jardin commun, évolution expérimentale, expérience
de sélection, mutants, etc 􏰎)

50
Q

Que sont les différents niveau de mise en evidence de la selection

A
  • Traits
  • Ecotypes, populations, espèces (ensemble de traits)
  • Gènes-candidats
  • Scan génomique (ensemble de loci, locus par locus ou polygénique)
51
Q

Dans quoi peut êtte impliqué la mise en évidence de la slection

A

Applications:
- Description de la diversité écologique et fonctionnelle

Applications:
- Description de la diversité écologique et fonctionnelle
- Comprehension des processus d’adaptation
- identification gènes/traits d’importance
(agriculture, foresterie, pêcheries)

52
Q

Comment expliquer diversité d,un gène ?

Role de la seelction

A

Analyse des séquences et structure proteine ( + de position non syno que syno ?)
Plus de polymorphisme dans région qui se lien taux pathogènes

2-Metanalyse pour voir coefficient de slection

3-Comparer les séquences des alllèles du MHC entre espèces

Polymorphisme transpeciphie si allèles partagés

4-Biologie théorique et modèles, variation de la fréquences des allèles
neutre (stocha, positivif ou negat –> slection et fixation)

5- Biologie experi; hetero ont avantage pour la diversité de pathog;nes

53
Q

Comment repondre à la question :

Les hétérozygotes ont-ils un avantage sélectif face à la diversité de pathogènes?

A

Biologie experimentale
on infect de champignon et on regarde si heterozygote (Mhc) resistent mieux

Croisementi ciblé de guppies + MHC
nouveaux allèle= moins investion aux parasites.

54
Q

Comment repondre à la quesiton

Les allèles rares ont-ils un avantage sélectif due à la co-évolution hôte/parasite?

A

Biologie experi

est ce que Les poissons avec des allèles nouveaux se
débarrassent plus rapidement des parasites

on croise avec popu pour avor allèles rares

55
Q

Comment repondre è la question
Le polymorphisme global (à grande échelle / au cours des temps évolutifs) cache-t-il une
spécialisation locale sous sélection directionnelle?

A

Ecologie des populations naturelles
+ génétique des populations:

Le MHC présente une plus grande diversité,
corrélée à la diversité des communautés de
parasites

56
Q

comment répondre à la question

La sélection sexuelle pour des partenaires portant des allèles différents peut-elle entretenir
le polymorphisme du MHC?

A

􀂟 Dans cette expérience, les humains
􀁕􀁈c􀁒􀁑􀁑a􀁌􀁖􀁖􀁈􀁑􀁗 􀁏􀁈􀁖 d􀁌􀁉􀁉􀁰􀁕􀁈􀁑c􀁈􀁖 d􀂶􀁒d􀁈􀁘􀁕
associées aux MHC.
􀂟 L􀁈􀁖 d􀁌􀁉􀁉􀁰􀁕􀁈􀁑c􀁈􀁖 d􀂶􀁒d􀁈􀁘􀁕 a􀁖􀁖􀁒c􀁌􀁰􀁈􀁖 a􀁘 MHC
pourraient jouer sur le choix de partenaires.

57
Q

Que sont les mécanismes impliqués dans la la seleciton balancée

A

avantage hétérozygote,
selection fréquence dépendance négative, sélection fluctuant dans le temps et
et l’espace, sélection sexuelle antagoniste

58
Q

Comment savoir
quels traits sont potentiellement
adaptatifs?

A

􀂟 Etudier la variabilité naturelle

􀂟 Utiliser des approches expérimentales

Bio intégrative 2 (4 decks)

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