module 5 Flashcards
Quelles sont les 3 causes majeurs des extinction en Amérique du Nord (anthropique)
Destruction et dégradation habitat
Comment est la taille des population despèces ménacées
Petite population ou des populations en déclin démographique
Comment est la diversité génétique des espèces ménacées par rapport aux espèces non menacées
la divrsité génétique est beaucoup plus faible, moins d’hétérozygotie
Que sont les trois points de l’article obligatoire du module
1- Une plus grande diversité génétique provoque une plus grande valeur sélective, survie améliorée
2-Les espèces menacées ont une diversité génétique plus faible que les espèces non menacée
3- La diversité
variation résiduelle est une variaation utle pour s’adapter. Même si neutre maintenant, ce pool peut être utile plus tard ,face à des changements environnmenaux futur
génétique neutre n’a pas d’impact en conservation pour une petite popu
Reproduire Schéma du paradigme des petites population
Ok
Quel est l’impact de la réduction de la taille de la population Sur la génétique ?
expliquez différente étape qui y mene
- Diminution de la taille efficace (Ne)
- augmentation de la dérive génétique
- Diminution génétique
Reducitont taille = reproduction apparenté
- Consanguinité
- Diminution de la diversité génétique
Que sont les impacts de la diminution de la diversité génétique
Perte du potentiel d’adaptation
Augmentation Dépression de consanguinité
Quelle est la différence de la taille efficace et l’abondance de population
Que sont ses caractéristiques
Taille efficace= plus petite que taille de popu
La valeur de N corrigée pour mieux prédire le « patron
génétique » d’une population réelle comme si elle était « idéale » .
Valeur de N :
Nombre constant
génération discrète
nombre égal de mal et de femlle
proba égale de succès reproduction
On corrige pour mieux comprendre
Est ce que le Ne ou le N qui prédit la diversité génétique et le niveau de consanguinité
(= capa popu à maintenir sa diversité génétique)
Ne
Qu’est ce qui détermine la capacité d’une population à maitenir sa diversité génétique intiale
Diversité génétique et niveau de consanguinité
A quoi ressemble el rapport Ne/N ? pourquoi
en dessous de 1 car Ne < N
Que sont les 3 choses qui réduisent le rapport Ne/N
En gros qui réduisent le Ne ou augmente le N
1- Fluctuation temporelle de Ne
2-Variance du succès reproducteur
3-Rapport de sexes inégal
Qu,est ce que la fluctuation temporelle de Ne ( l’un des 2 qui réduisent le Ne)
- Les populations changent naturellement en abondance
Si Goulot étranglement –> baisse subiote
comment calculer le Ne
moyenne harmonique des effectis efficaces de chaque génération
1/Nombre génération
x 1/Nonbre gene 1 x 1/Nombre gene2….etc…
Que explique le Ne ? comment l’interpreter
Nombre d,individus qui ont contribués efficacement à la reproduction sur les trois dernières génération
Qu,est ce que la variance du succès reproducteur
Dans une popu idéale monogame, contribution en gamète de chaqu reproducteur à la géné suivante ; Distribution poisson
un individu donne 2 gamètes à la génération suivante
Est ce que dans les populations sexuées il y a un rapport égal de male femelle
non
Comment calculer le total reproducteur
La taille efficace corrigée qui tient compte des rapports inégaux
N= Nm + Nf
Ne =4 NmNf/Nm+Nf
Si on a 8 male et 2 femlle, quel est l’impact sur L,hétérozygotie
Perte hétérozygotie plus rapide que si composait 5 males 5 femelles
Pour les populations avec un rapport des sexes inégal, les proportions d'hétérozygotes diminuent généralement plus vite que les valeurs théoriques de H(t).
Comment calculer l’hétérozygotie théorique H(t)
Ht ( 1-1/2N) ^t
Donne une définition de la dérive génétique
fluctuations stochastiques de la fréquence allélique qui sont
strictement liées à un échantillonnage au hasard des gamètes à chaque génération.
Peut ont prédire la dérive génétique
De telles fluctuations défient toute prédiction au sein d’une seule population. Cependant, le
patron moyen ou espéré au sein d’un nombre élevé de populations
QUe sont les 4 stipulas qui permettent de prédire les patrons de la dérive génétique
- L’ampleur des fluctuations des fréquences alléliques est inversement
proportionnelle à la taille de la population. - Les populations, toutes identiques au départ, se différencient avec le temps.
- Ce processus s’effectue plus lentement dans les populations de plus grandes tailles.
- En absence de l’effet de d’autres forces évolutives, toute population se dirige
inéluctablement vers un état de fixation d’allèle (s) (fréquence = 1,0) c’est-à-dire
d’hétérozygotie 0…
Comment varient Ht et Ft ( hetero et consanguin ) dans le spopulation
Ht: diminue avec taille popu et est plus prononcée
Ft: augmente avec taille popu et est plus prononcée
Donnez des exemple sde diminution de L’Hétérozygotie qui cause apparition des allèles délétère
Condor de Californie:
Chondrodystrophie - une maladie qui cause des
malformations sévères (‘nanisme’ des os longs) et même
la mort. Due à l’homozygotie d’un allèle récessif.
Lion du Gir (Inde):
Réduction du potentiel reproducteur: réduction de
la densité et de la mobilité des spermatozoides.
Affaiblissement du système immunitaire
Cougar de Floride :
Malformations morphologiques congénitales
Qu’est ce que la depression de consanguinité (DC)
Diminution de la moyenne des caractères
associés à la valeur sélective (fitness) chez la progéniture consanguine
Commune chez une variété d’organismes
Citez 5 composantes du fitness reproducteur sujette à la DC (dépréssion de consanguinité)
nombre de rejetonsà taux de survie des juvéniles, longévité fertilité capacité d’accouplement, quantité,qualité du sperme,
Comment varie la DC
Dépendant de la fréquence des allèles délétères
(élément stochastique)
Allèles délétères peuvent être absents ou
fréquents, dépendamment de la population
Plusieurs loci influencent le fitness reproducteur
Qu’est ce qui explique que les population ont une occuranence d’allàle délétaire du à la dérive différentes
Due à différence de susceptibilité à la DC
Comment on estime le F individuel
Avec la relation de H avec F
Dans l’exemple des moutons, quelle est l’implication de la selection contre individus consanguib
DC - la consanguinité rend les individus plus
susceptibles à la mortalité causée par les variations
environnementales
Comment les effets négatif de la Dc peuvent se faire reversé
Expliquez comment
en croisant avec des population GÉNÉTIQUEMENT DIFFÉRENCIÉ
= > augmentation de la variation génétique
= > masque les allèles à effet néfaste
= > favorise les phénotypes bénéfiques
Qu’est il très importantnt pour voir si un sauvetage génétique a été réussie
Il faut observer une augmentation de l’abondance , il faut que ce soit à long terme
Augmentation de l’abondance
qui reflète une augmentation de la
valeur sélective absolue
Comment voir si un sauvetag ea été réussie
Sauvetage génétique réussi = flux de gènes conduit à une augmentation dans la
croissance de population, au delà de l’effet démographique des immigrants !
De quelle manière le sauvetage génétique peut se produire
- Vigeur hybride (ou hétérosis): valeur sélective élevée de la progéniture issue des
croisements entre individus génétiquement divergents relativement à la population
d”origine - Évolution adaptative: augmentation des phénotypes avantageux dans une population
issue du résultat de la sélection naturelle sur la variation génétique
Est ce que le sauvetage génétique est répendue ?
non
Quelle sont les peurs liées au sauvetage génétique ? Peuvent ils être évités ?
- Dépression hybride (“outbreeding depression” ) = perte de valeur sélective lorsque
deux populations trop différentes génétiquement sont croisées - Perte de l’adaptation locale
= > Grâce aux récentes avancées en génomique on peut désormais évaluer ces
paramètres et largement les éviter
Les bénéfices du sauvetage génétique sont ils différents entre invertébrés, vertébrés et plantes
Non
Jusqu’à quelle génération les effets du sauvetage génétique
3
Dans l’exemple des guppies, que peut on en conclure
les hybrides vivent plus
longtemps
que les résidents ou immigrants
Les hybrides se reproduisent
plus que les résidents ou
immigrants
=> Le flux de gènes a
non seulement permis d’augmenter la diversité génétique
mais la variation génétique apportée par les immigrants combinée aux allèles de
la population puit a résulté en une meilleure valeur sélective des hybrides et de ce
fait en une augmentation de la taille des populations
S’il ya de multiples populations consanguine
que faut il faire
Penser à un sauvetage génétique (optimiser le flux de gène) mais regarder aussi :
- Est que croisement rsulterait en dépréssion hybride
si non :
Est-ce que le croisement résulterait
en un sauvetage génétique utile ?
si oui :
Optimiser flux de gènes en utilisant les relations de parenté si possible, autrement utiliser les principes basique de génétique de la conservation
Si on veut faire un sauvetage génétique mais qu’ya pas d’autres populations isolées
qui peuvent être utilisées pour le
croisement ?
Gérer la population pour maximiser Ne
et la considérer ‘fragile’ et minimiser les
menaces non-génétiques
si on veut faire un sauvetage génétique mais que
le croisement résulterait
en dépression hybride, que faire ?
Pas d’option de gestion génétique
bénéfique. Considérer ‘fragile’ et
minimiser les menaces non-génétiques
donnez une définition du sauvetage évolutif
= adaptation génétique permettant le rétablissement d’une population face
à un changement environnemental induisant des effets démographiques qui auraient pu
causer l’extinction
Qu’est ce que la variation gnétique résidielle
tion génétique résiduelle; ce qu’ona dans une popu à un temps T
Que osnt les trois types de sauvetage
démographique génétique
évolutif
Comment calculer diversité pour haplotype
1- ensemble p^2
Donnez une définition du NE
La taille de population efficace correspond au nombre d’individus qui participe réellement à une population génétiquement parlant. Au sein d’une population tous les individus ne se reproduisent pas et ce n’est finalement pas la taille de population absolue qui détermine la variabilité et la dérive génétique d’une population. La taille de population efficace se note Ne et est généralement inférieure à la taille de population absolue, notée N
Que sont les 4 question à se poser avant de faire un sauvetage génétique
1- Y-a-t’il de multiples populations, consanguines ? 2-2- Y-a-t’il d’autres populations isolées qui peuvent être utilisées pour le croisement ? Ré-évaluer la taxonomie si nécessaire
3- Est-ce que le croisement résulterait
en dépression hybride ?
4- Est-ce que le croisement résulterait
en un sauvetage génétique utile ? ( si pas de depression hybride
Si jamais il n,ya pas d’autres populations isolées
qui peuvent être utilisées pour le
croisement que fait ont
Gérer la population pour maximiser Ne
et la considérer ‘fragile’ et minimiser les
menaces non-génétiques
Quand utiliset-on le sauvetage évolutif
Comment cela doit-il se faire ?
adaptation génétique permettant le rétablissement d’une population face
à un changement environnemental induisant des effets démographiques qui auraient pu
causer l’extinction
Le sauvetage évolutif exige également un changement environnemental et le sauvetage de
l’extinction doit se faire via une évolution adaptative à l’environnement
