MODULE 4 Flashcards
quel est l’organe le plus important des cellules animales et végétales et pourquoi
le noyau pcq il contient l’information génétique stocké sous forme d’ADN
le noyau ne contient pas de
protéines motrices et de ribosomes
les brins d’ADN sont reliés entre eux par une liaison … entre les …
H entre les nucléotides
l’extrémité 5’ de l’ADN contient un … tandis que l’extrémité 3’ contient un …
groupement phosphate
groupement O
quelles protéines rentrent la compaction de l’ADN possible
histones et protéines chromosomiques non histones
de quoi est composé la chromatine
histones + protéines chromosomiques non histones + ADN
quelle est l’unité de base de la structure des chromosomes eucaryotes
les nucléosomes
la formation des nucléosomes permet quoi
la transformation de la molécule d’ADN en filament de chromatine d’un tiers de sa longueur initiale, et représente le premier niveau d’empaquetage de l’ADN
de quoi est composé le nucléosome
ADN enroulé autour d’un noyau protéique de huit molécules d’histones
combine de paires de nucléotides sont nécessaire pour que l’ADN s’enroule environ 2x autour du noyau d’histone
147 paires
qu’est-ce qui aide le rapprochement de nucléosome
histone H1
quels sont les 2 niveaux de condensation de l’ADN dans les chromosomes
1 : chromatine en collier de perle
2 : assemblage des nucléosomes en fibres de 30 nm
quels sont les étapes du cycle cellulaire
interphase + division cellulaire
G1
S
G2
1. prophase
2. prométaphase
3. métaphase
4. anaphase
5. telophase
6. cytocinèse
que permet le cycle cellulaire
la duplication du contenu d’information génétique d’une cellule
processus de duplication de l’information génétique est aussi appelé
réplication de l’ADN
duplication de l’ADN est conservait, semi-conservartif ou non-conservatif
semi-conservatif,
pourquoi les fourches de réplication peuvent-être asymétriques
pcq la synthèse des deux nouveaux brins se fait dans des façons différentes : un est allongé de façon continue (dans le même sens que la fourche) tandis que l’autre a besoin d’une synthèse récurrente d’amorces d’ARN et de brins d’Okazaki (sens opposé à la fourche)
la duplication est catalysée par une …
ADN polymérase
comment la polymérase obtient son énergie
par la dissociation des liaisons phosphate des nucléotides qui entrent dans la réaction
dans quel sens fonctionne l’ADN polymérase
5’-3’ donc ajoute des nucléotides à l’extrémité 3’ en premier
de quoi a besoin la polymérase pour commencer la réplication
une amorce
quelles protéines sont impliqués dans la réplication de l’ADN
polymérase
primase
clamp coulissant
chargeur de clamp
rôle de la primase
synthétiser l’amorce de l’ADN
rôle du clamp coulissant
maintenir l’ADN polymérase attacher à la matrice de l’ADN pendant qu’elle synthétise un nouveau brin
forme un anneau autour de l’hélice de l’ADN et permet à la polymérase d’avancer le long d’un brin matrice sans se détacher
rôle de la protéine chargeur de clamp
hydrolyse ATP chaque fois quelle boucle le clamp
le contrôle du cycle cellulaire est assurée par
les protéines régulatrices
quels sont les trois points de contrôle de la progression cellulaire
point de contrôle en G2 : entrée en mitose
point de contrôle en mitose : séparation des chromosomes dupliqués
point de contrôle en G1 : entrée en phase S
quelles protéines contrôle le cycle cellulaire
- protéines kinases
- protéases
- freins moléculaires (protéines inhibitrices de CdK)
- cohésines
- condensines
mécanisme des protéines kinases
les protéines kinases ont une sous-unité catalytique (protéines kinase dépendante de la cycline) qui se lie à la cycline pour former le complexe cycline-cdK, mais inactif. Pour activer ce complexe, il faut enlever un groupement phosphate.
rôles des complexe cycline/CdK
déclencher différentes étapes du cycle cellulaire (phase S par la cycline S) et (phase M par la cycline M)
éviter une deuxième réplication
qu’est-ce que la protéolyse
processus de dégradation des protéines synthétisées en leur acides aminés.
enzyme responsable de la protéolyse et elles sont où
protéases dans les protéasomes
quelles molécules vont être dégradées par le protéasomes
les protéines qui ont été marquées par une liaison convolent à une petite molécule, l’ubiquitine.
comment peut-on inactiver un complexe cycline-CdK
par le marquant la cycline du’une ubiquitine, le protéasome va ainsi le dégrader
qu’est-ce que sont les freins moléculaires
ce sont des protéines inhibitrices de CdK, ainsi elles arrêtent le cycle au niveau de points de contrôle spécifiques
pourquoi voudrait-on utiliser les freins moléculaires
ex :
dommage à l’ADN
processus cellulaire non terminé
environnement cellulaire défavorable
point de contrôle ne phase M s’assure de
il s’assure que tous les chromosomes sont correctement attachés au fuseau mitotique avant de tirer sur les chromosomes dupliqués pour les éloigner les uns des autres
rôle de Cdc6
s’associe au complexe de reconnaissance de l’origine (ORC) et permet le recrutement d’autres protéines qui vont se lier à l’ADN adjacent, ce qui forme le complexe de pré-réplication
rôle de CdK-S
déclenche le départ de la réplication en provoquant le début de la synthèse d’ADN
phosphorylation Cdc6
à chaque cycle cellulaire seulement 1 seule réplication se fait; comment fait-on pour empêcher une seconde?
CdK-S phosphoryle Cdc6 qui se dissocie alors de l’origine et est dégradé. Le complexe de pré-réplication ne peut donc plus être formé.
qu’est-ce que les cohésines
des complexes protéiques (anneaux) qui maintient les chromatines soeurs ensemble en les entourant.
pourquoi les cohésines sont-elles nécessaires
pcq la cohésion entre les chromatines soeurs est essentielle pour assurer une ségrégation correcte des chromosomes
qu’est-ce que les condensines
un ensemble de protéines qui facilitent la condensation chromosomique, ces protéines ressemble aux cohésines puisqu’elles aussi sous forme d’anneaux
mécanisme des condensines
elles s’assemblent sur chaque chromatine individuelle au début de la phase M et enroulent l’ADN pour faciliter la condensation de chaque chromatine; les chromatines deviennent plus compactes et leurs séparation durant la mitose est plus facile.
quelles sont les 3 classes de microtubules dans le fuseau mitotique
- microtubules de l’aster (liés au pôle du fuseau)
- microtubules du kinétochore (liés au kinétochore)
- microtubules interpolaires (lié entre elles)
description kinétochore
complexe protéique qui s’assemble sur les chromosomes condensés en fin de prophase pour les attacher aux microtubules de fuseau mitotiques
structure des kinétochores
les kinétochores de chaque chromatines sont orientés dans des directions opposées
ils s’attachent aux microtubules venant du côté opposé, ce qui fait en sorte que chaque chromosome est lié aux deux pôle du fuseau + explique le X au milieu des chromosomes
bi-orientation
que permet la bi-orientation
de créer une tension sur les kinétochores + celle-ci informe les deux kinétochores qu’ils sont attachés correctement et prêts à être séparés
combien de microtubules sont attachés à chaque kinétochore
variable
humain : 20 à 40
lever : 1 seul
qu’est-ce que la séparase
une enzyme protéolytique qui permet le passage de la métaphase à l’anaphase. Cependant, à l’état de repos, elle est lié à la sécurine (une protéine inhibitrice). La séparase est donc inactive
rôle du complexe de promotion de l’anaphase (ACP)
- déclencher la séparation des chromatines en favorisant la dégradation des cohésines
- détruire la sécurine, ce qui permet l’activation de la séparasse
- marque la cycline M pour destruction, ce qui rend CDK-M inactif
mécanisme de la séparation des chromatines soeurs
anaphase A : les chromosomes sont tirés vers les pôles opposés
il y a un raccourcissement des microtubules des kinétochores : des forces sont produites au niveau des kinétochores pour tirer les chromosomes vers le pôle du fuseau
anaphase B : les pôles sont repoussés et éloignés l’un de l’autre
une force de glissement produite entre les microtubules interpolaires pousse les pôles en direction opposée : une force de traction agit directement sur les pôles pour les éloignés l’un de l’autre
ces forces dépendent de l’action des protéines motrices associées aux microtubules
quelles protéines interviennent dans la cytocinèse
dans la cellule animale : l’actine et la myosine de l’anneau contractile qui vont s’assembler en anaphase (permettent de séparer les 2 cellules filles)
dans la cellule végétale : les phragmoplastes
qu’est-ce qu’un génome
l’ensemble de l’information génétique contenue dans son ADN
le génome dicte … et indique …
le mode de fonctionnement de la cellule
comment croitre en étant de centaines de types cellulaires différents
la quantité d’ADN dans un génome est stable ou variable
très variable, même dans deux organismes très proches
les gènes déterminent quoi
les caractéristiques d’une espèce donnée et les individus qui la compose
qu’est-ci compose le génome apart les gènes
ADN qui ne code pas pour des protéines ni de molécules d’ARN fonctionnelles, comporte séquence impliquée dans la régulation + séquence indispensable
les gènes sont-ils tous exprimés avec la même efficacité
non, on peut amplifier la synthèse d’une quantité de protéine nécessaire à la cellule selon les besoins de celle-ci
organisation des gènes de protéines chez les procaryotes
ils sont organisés en opérons fournissant des ARN, polygéniques et permettant de fabriquer plusieurs protéines distinctes
organisation des gènes de protéines chez les eucaryotes
organisation complexe, discontinue, mais qui conduit à produire un ARNm monogamique
en quoi consiste l’épiage de l’ARN et par quoi cette rx est-elle catalysée
élimination des introns (se produit en même temps que la transcription)
catalysée par des petits complexes ribonucléoprotiques nucléaires (RNPsn)
où commence la transcritpion
sur des sites d’ADN appelés promoteur
que nécessite l’ARN polymérase pour initier la transcription chez les eucaryotes vs procaryotes
euc : assemblage d’un complexe de facteurs généraux au niveau du promoteur
pro : sous-unité appelée sigma
3 processus de maturation de l’ARN
- ajout coiffe 5’
- polyadénylation
- épissage
le mouvement de l’ARN du noyau vers le cytosol est du à quoi
à la liaison de différentes protéines qui permettent le passage dans le complexe du pore nucléaire
qu’est-ce que l’ARN polymérase produit temporairement
une courte région d’hélice hybride d’ADN/ARN (environ 9 nucléotides) formant une fenêtre qui se déplace le long de l’ADN avec la polymérase
différents types d’ARN produits par les cellules
- ARNm : codent les protéines
- ARNr : fait partie du coeur central des ribosomes et catalysent la biosynthèse des protéines
- ARN mi : contrôlent expression des gènes
- ARNt : adaptateurs spécifiques entre ARNm et acides aminés au cours de la traduction
- autres petits ARNsn : utilisés dans passage des introns, entretien télomères
l’ARNt permet de relier …
les acides aminés aux codons à chaque extrémité de l’ARNt
quelles bases rares dérivent de l’uracil
pseudo-uridine et dihydro-uridine
combien de conversions d’ADN en protéine ont lieu à chaque seconde dans chaque cellule de notre organisme
des milliers
combien de codons différents sont possibles
64
quel acide aminé est toujours codé en premier
méthionine
combien de codon stop et codon d’initiation
1 ini : AUG
3 stop : UAA, UGA, UAG
chaque acides aminés est codé par un seul codon
faux, plusieurs codons peuvent coder un seul acide aminé
les ARNt contiennent quoi
des anticodons complémentaires aux codons de l’ARNm
qui charge l’acide aminé sur l’ARNt
enzyme spécifique : aminoacyl-ARNt synthétase (normalement 20 synthétases par cellule, une pour chaque a.a)
l’ARNm est codé où
sur les ribosomes
quelles sont les composantes d’un ribosome eucaryote
une petite sous-unité qui contient 33 protéines et 1 molécule d’ARN, avec un poids moléculaire de 1 400 000 daltons
une grosse sous-unité qui contient 49 protéines et 3 molécules d’ARN, avec un poids moléculaire de 2 800 000 daltons
donc ribosome complet contient 82 protéines et 4 molécules d’ARN, avec un poids moléculaire de 4 200 000 daltons
quels sont les sites de liaison que contient un ribosome
1 site de liaison à l’ARNm
3 sites de laissions de liaison à l’ARNt :
- site A pour aminoacyl-ARNt
- site P pour peptide-ARNt
- site E pour exit
4 étapes de l’élongation de la traduction d’une molécule d’ARNm
- L’ARNt entre dans le site A par appariement de bases avec le codon complémentaire, positionné sur la molécule ARNm
- son acide aminé est alors relié à la chaine peptique maintenu par l’ARNt sur le site P voisin
- la grosse sous-unité se déplace et l’ARNt qui vient d’être utilisé est déplacé jusqu’au site E d’où il sera éjecté
- le petite sous-unité se déplace de trois nucléotides, ce qui la repositionne en face de la grosse sous-unité
cycle qui recommence
comment se passe l’initiation de la traduction
le petite sous-unité ribosome lie l’Extrémité 5’ d’un ARNm
le complexe se déplace le long de l’ARNm pour chercher le premier AUG; une fois trouvé, l’anticodon se lie au codon ce qui permet l’hydrolyse du GTP par le facteur d’initiation, ce qui change sa conformation
le facteur d’initiation se dissocie, ce qui permet à la grosse sous-unité de se lier
terminaison de la traduction
la protéine terminée est libérée du ribosome lorsque qu’un codon STOP (UGA UAG UAA) est atteint. il y a liaison d’un facteur de libération au site A, ce qui défait le complexe ribosomique-ARN