Module 3C le microbiote humain Flashcards
Il y a énormément de bacté dans notre corp mais à quel point?
L’ensemble de ces cellules bacté contient 100 fois plus de
matériel génétique que notre génome.
Est-ce que microbiote est obligatoire?
Les microorganismes ne sont pas requis pour la vie des mammifères, mais il
n’existe pas de mammifères dépourvus de microorganismes dans la nature.
Human microbiome projet but?
Regroupe des chercheurs de partout
Caractériser la composition et le taux de diversité des communautés
microbiennes « normales » issues d’individus en santé
Dévlopper des poutils pour analyser ça et evaluer les implication moral/légal
Élargir notre compréhension des relations entre le microbiote
humain et diverses maladies
Comment étudier le microbiote (3)? approche?
- une apporche environnementale
séquençage de masse sur ADN 16S et métagénomique, pour identifier les espèces et leur rôle (en analysant les gènes) - expérience fonctionnelle
en testant des hypothèses sur souris etc.
-essais clinique
Qu’est ce que gnotobiotique mean?
c’est lorsqu’on contrôle le microbiote d’organisme, on injectant/insérant exactement les m.o. qu’on veut analyser l’effet.
Est-ce que le microbiote est pareil sur tout le corp? Les m.o. sont nécessaire pour nous? tout les bacté de enviro sont retrouvé?
Non, composition très différente selon endroit et on peut vivre théoriquement 100% stérile sans m.o.
Non pas tout les bacté de enviro vivent sur notre corp, certain co-évolution avec phylums précis
Comment on acquière notre microbiote intestinale? dans placenta?
NO HAY bactéries acquis dans placenta
Le microbiote de la mère durant l’accouchement affecte la diversité et l’abondance des phylums
si voie césarienne ou antibiotique de la mère va affecter l’enfant.
Comment est l’évolution du microbiote chez le bébé? Les caractéristiques des m.o. avec le temps?
Chez nouveau-nés: les m.o. sont anaérobes facultatifs car il y a encore de l’air dans système digestif.
Après 1 sem à 6 mois : anaérobes stricts
à 1 ans (lorsque hay diète solide) : ressemble microbiote adulte
2-3 ans : stabilisation
Comment sont les proportions des phylums dans notre microbiote?
Comment sont les fonctions métaboliques des bacté dans notre corp selon leur proportion?
Pas beaucoup de phylums MAIS proportion très inégale.
PAR CONTRE Les fonctions métaboliques sont conservé à travers les espèces et les proportion de fonctions de suivent PAS le proportions des phylums. Les différentes fonctions métaboliques restent sensiblement les mêmes entre bacté mais si pas même phylums.
dans nos intestins, comment est le gradient de concentration des bacté?
Moins au début dans small intestine
++ de concentration dans colons car meilleur conditions
Comment sont les couches biologiques dans les intestins et où on retrouve donc les bacté?
- cellules épithéliale
- mucus protecteur
- biofilm des bacté s’installe sur ce mucus
Peut-on prédire le microbiote de quelquun? Quels sont les trois grand facteurs?
Non, il y a trop de facteur qui influence cela! même si certains sont connus
- facteur génétique/système immunitaire
- la diète
- Pratique médicale/antibio
Comment la génétique de qqun affecte la composition de leur microbiote?
Des études ont montré que certains gènes explique en partie ce qu’on retrouver dans microbiote. En analysant des locus, jumeaux et souris.
L’effet de la génétique est limité
Des délétions et changement métabolique dut aux gènes affecte m.o.
**Comment la diète affecte microbiote?
Parle des MAC
Parle des différence américaine et rural
La diète peut affecter le microbiote de plusieurs façons, selon ce qu’on mange, certains bactéries sont être plus avantagé que d’autre.
**Les MAC sont des fibres, c’est la sources de nutriment préféré des bactéries. S’il n’y en a pas assez, les bacté vont plutôt se nourrir du mucus de l’intestin et causé problème de santé.
La différence entre l’alimentation western et plus rural cause aussi des différences dans la composition. ***Étant donné que les américains mange moins de fibre et plus de gras, compositon bacté différente, + différence interpersonnel. Aussi moins de diversité bactérienne réside dans leur microbiote que ceux ayant une diète agricole et non transformé.
Le microbiote peut-il est modifier pour s’adapter à la diète? Elle peut contribuer à l’état métabolique de qqun?
**C’est très dur à confirmer que oui car cela vient d’étude sur des souris très contrôler mais il y aurait peut être relation entre microbiote et métabolisme. En s’adaptant au régime, les compositions vont être différente et donc fonctions métablique différente. (vont se rééquilibrer vite)
observer lorsque 2 microbiote diff et même diète