Module 2A communauté dans sol et air

Question 1

Comment la profondeur affecte densité microbienne?

Answer 1

+ profond = - bactérie

Question 2

Le sol étant très hétérogènes et avec beaucoup de microenvironnement, qu’est ce qu’on peut y retrouver comme microorganisme et leur rôle?

Answer 2

bacté, virus, archée, mycètes, protozo, algue

Rôle:
- Cycles biogéochimques
- Recyclages nutriments
- Biodégradation
- Production d’antibiotiques
- Agent biocontrôle
- Structure du sol

Question 3

Pression environnemental du sol?

Answer 3

• pH (le + important)
• Disponibilité nutriments
• Disponibilité O et H2O

Question 4

Conséquences des pressions environnementales sur les microorganismes du sol?

Answer 4

• Peu de survivent suite à une inoculation
  artificielle.
• Seulement 1% de la surface disponible du sol est occupée par des microorganismes.
• Plus de 95% des microorganismes retrouvés dans le sol sont dormants / inactifs.

Question 5

L’effet du pH du sol sur la diversité bactérienne?

Answer 5

+ pH est neutre = + diversité
avec un peak à 7
(pas à 10 et peu à 4)

Question 6

Facteurs environnementaux affectant les mycètes dans le sol?

Answer 6

• pH à moins d’importance
• Historique du site (Qui furent les premiers arrivés)
• disponibilité de l’eau (maison fermé = + humide)
  -Source de carbone

Question 7

L’impact des plantes sur les communautés microbiennes du sol?

Answer 7

***Elles augmentes la biomasse des microorganismes et les concentre autour de leurs racines (+ de carbone = + de bactérie)
MAIS
Les plantes diminuent la diversité dans le sol car certaines bactéries vont être avantagés.

Question 8

Pourquoi le microbiome du sol est partieintégrante de « une
seule santé » ?

Answer 8

-cause patho plantes
-aide croissance plante (agriculture)
-Influence GES
-Dévloppe résistance aux bactéries
-Patho pour le bétail

Question 9

Qu’est ce qu’un bon échantillonnage d’un sol et pourquoi c’est complexe?

Answer 9

car c’est un enviro complexe!!
-Représentatif
-Précis et juste
-Reproductible
-Utile

Question 10

Comment peuvent être les emplacements d’échantillonnage?

Answer 10

-aléatoire
-Transect (une ligne droite)
-Grille systématique (en quadrillé au milieu)

Question 11

Comment assurer la bonne conservation des échantillons du sol?

Answer 11

• rapidité d’analyse est importante, réduire temps entre (faut faire congélation temporaire et méthode pour garder l’humidité)
• S’assurer pas de contaminations sur outils
  (difficile pour en profondeur de stériliser long tube et coute cher)

Question 12

Qu’est-ce qu’un bioaérosol?

Answer 12

Bioaérosols
Cellules ou matériel biologique suspendus dans l’air, souvent en association avec une particule servant de « radeau »

Question 13

Quelles sont les pressions environnementales dans l’air extérieur? (majeur et mineur)

Answer 13

MAJEUR
- humidité, donc l’évaporation des gouttelettes contenant les m.o.
- température

MINEUR
-Radiation (++hauteur)
-Oxygène (++hauteur)

Question 14

Comment échantillonner l’air et bien conserver cela?

Answer 14

-Emprisonnement dans une matrice liquide
-Filtration de l’air
-Centrifugation
-Concentreur d’aérosol sass

CONSERVER
Rapidité d’analyse est importante
Congélation, ou réfrigération temporaire
Conserver l’humidité

Question 15

Pourquoi les dénombrements de m.o. peuvent avoir des résultats différents entre la microscopie et qPCR?

Answer 15

La microscopie sera moins efficace/précise que qPCR car on apporte des biais avec le colorant de matière organique, on ne peut pas être sûr de ce qui est dénombrer, peut colorer plus que juste bacté (sur-estime).

Les amorces S16 (qPCR) aide à être plus précis mais n’isole/représente probablement pas tous les microorganismes, + les erreurs de manipulations d’ADN (sous-estime).

Question 16

Quel groupe de m.o. résiste bien au pressions environnementales de l’air?

Answer 16

Les pathogènes humains (comme influenza)

Question 17

Comment pouvons-nous prévoir de futur pathogènes (mycètes) de plante et oû ils vont être?

Answer 17

Des mycètes à spores peuvent parcourir de grandeeee distance dans l’air donc avec des prédictions de vent on peut savoir quels champs vont être affecté dans le futur par ceux-ci!

Question 18

Pourquoi chauffé à haute temp, certains sols ne peuvent plus faire de nucléation de glace?

Answer 18

Chauffer un sol tue les bacté et la majorité des bactéries produisent des protéines qui permettent la nucléation de la glace.

Question 19

Qu’est ce que la nucléation de glace? Quel lien avec la pluie?Comment une particule biologique affecte cela?

Answer 19

C’est le processus par lequel des cristaux de glace commencent à se former à partir de l’eau (liquide ou vapeur), matériel biologiques (particules) ou minéraux, sous certaines conditions de température. La pluie provient de la nucléation de la glace dans les nuages.

Le matériel biologique permet la nucléation de la glace à température plus élevé, donc pluie + haute temp.

Question 20

Comment les bacté et leur prots peuvent affecter le climat et les pluies?

Answer 20

Un support est nécessaire pour former des cristaux à partir de la vapeur d’eau et ainsi la pluie dans les nuages. S’il y a des bactéries qui produisent des protéines permettant cela dans les nuages (monter là-haut avec l’évaporation), alors la pluie utilisera ces particules organiques pour former cristaux. EN PLUS, cela permet des cristaux à temp + élevé que particules minéral comme support.

Question 21

Phytopathogéniques pourquoi produisent plus de prots permet nucléation de l’eau?

Answer 21

Les théories c’est qu’ils utilisent les précipitations pour se répandre, permettent bien la pluie lorsque monter dans nuages par évaporation et vont infecter d’autres plantes!

Question 22

Échantillonnage d’eau: Facile? Quoi faire pour détecter m.o.? Conservation? Défi?

Answer 22

Oui assez aisé car homogène
Souvent besoins filtration ou concentration pour avoir quantité détectable de m.o.
Rapidité d’analyse est importante comm dab, congélation ou réfrigération temporaire possible
Coûteux car peut être loin en mer et besoins bateau et bon outils