Module 2. La chimie en phase aqueuse Flashcards
Dans quel milieu se déroule les réactions métaboliques de l’organisme?
En milieu aqueux de pH 7.4 (neutre)
Cytoplasme + Matrice mitochondriale
SLIDE 3
Quelles sont les propriétés de l’eau?
- Forme de V avec un angle H-O-H de 104,5°
- Très polaire à cause de la différence d’éléctronégativité importante entre O (S -) et 2x H (S +)
SLIDE 9
Comment s’associent les molécules d’eau?
Via les liaisons hydrogène
Les interactions électrostatiques entre 2x H2O les orientent de sorte que la liaison O-H d’une molécule est dirigée vers le nuage d’électrons non liants de O de l’autre molécule d’eau –> peuvent former des réseaux de plusieurs molécules d’eau
SLIDE 10
Quelle est la propriété singulière de l’eau?
La mobilité de l’ion H est très élevée
SLIDE 11
Quelle est la raison de la mobilité élevée de l’eau?
Capacité des protons H de migrer d’une molécule d’eau à une autre en l’espace d’un déplacement rapide
SLIDE 11
À quels endroits est-il possible de retrouver des liaisons hydrogènes?
- Eau + Alcool
- Eau + Amine
SLIDE 12
Quel facteur détermine la complémentarité des bases azotées entre elles dans la structure de l’ADN / ARN?
Capacité à former des liaisons hydrogènes
SLIDE 12
Quelles sont les 4 liaisons moléculaires en ordre croissant de force?
- Aucune liaison
- Interaction de Van der Waals
- Liaison hydrogène
- Interaction ionique
- Liaisons covalente
SLIDE 13
Quelle est la différence entre l’eau à l’état liquide et l’eau à l’état solide (glace) au niveau des liaisons hydrogènes?
- Eau liquide = réseau de molécules unies par des liaisons hydrogènes qui varie constamment (très mobiles)
- Eau solide = réseau de molécules unies par des liaisons hydrogènes statiques en forme d’hexagone qui laisse beaucoup de vide
SLIDE 14
Que permet la structure physico-chimique de l’eau?
Facilite la dissolution de nombreuses substances importantes dans les systèmes biologiques (ex. sels minéraux, acides aminés, sucres)
–> solvant important pour les solutions hydrophiles
SLIDE 14
Quelle est la raison de la tension très élevée à la surface de l’eau lorsqu’elle est à l’état liquide?
Cohésion des molécules d’eau par les liaisons hydrogènes
SLIDE 15
Quelle est la conséquence de la différence au niveau des liaisons hydrogènes entre l’eau à l’état liquide et l’eau à l’état solide (glace) ?
L’eau est plus dense / compact sous forme liquide (prends moins de place) que sous forme solide (prends plus de place)
SLIDE 15
Quelles sont les 4 propriétés particulières de l’eau?
- Tension de surface très élevée
- Forme liquide plus dense que la forme solide
- Favorise stabilisation de la température de la surface terrestre
- La glace flotte sur l’eau (moins dense) et joue le rôle d’isolant qui protège les organismes d’une congélation fatale
SLIDE 15
Quel facteur détermine la solubilité d’un ion?
La propriété d’un solvant en question d’interagir plus fortement avec les particules d’un soluté que les forces interagissant entre les particules de ce soluté pour former un molécule
SLIDE 16
Pourquoi l’eau est un solvant important?
L’eau forme des liaisons avec les particules de solutés plus fortes (en fonction des pôles positifs et négatifs) que celles formées entre les particules de solutés entre elles dans la plupart des cas en biochimie
SLIDE 16
Que représente l’effet hydrophobe?
Tendance de l’eau à former une couche de molécules d’eau avec des liaisons hydrogènes partielles autour de molécules non polaires jusqu’à former un agrégation de molécules non polaires dans l’eau
SLIDE 17
Quelle est la définition des molécules amphiphiles?
Molécules biologiques avec une partie polaire (hydrophile) et non polaire (hydrophobe)
SLIDE 18
Quelles formations / structures prennent les molécules amphiphiles?
- Micelles
- Bicouches
- Vésicules
SLIDE 18
Quelle est la raison causant les molécules amphiphiles à prendre des formations / structures particulières?
Tendance de l’eau à exclure la partie hydrophobe des amphiphiles qui ont, par conséquent, tendance à former des agrégats structurés dispersés dans l’eau (vésicules, bicouche ou micelle)
SLIDE 19
Quelle est la partie hydrophobe / lipophile des acides gras dans la bicouche formant les membranes cellulaires?
Chaine de carbones aliphatique et apolaire
SLIDE 18
Quelle est la partie hydrophile des acides gras dans la bicouche formant les membranes cellulaires?
Groupements d’acide carboxylique (COOH) polaire et ionisable
SLIDE 18
Quelle fonction importante jouent les molécules amphiphiles dans l’eau?
Maintien l’intégrité des compartiments, organites et structures des cellules eukaryotes et prokaryotes
SLIDE 20
Qu’est-ce qu’un acide selon la définition de BRONSTEDT?
Un acide est une espèce susceptible de libérer un proton H+ (déterminé par le rôle de H+ / H3O+)
DÉMONSTRATION : réaction d’autoprotolyse de l’eau
H2O + H2O = H3O+ (ion hydronium) + HO- (ion hydroxyde)
SLIDE 21
Qu’est-ce qu’une base selon la définition de BRONSTEDT?
Une base est une espèce susceptible de capter un proton H+ (déterminé par le rôle de H+ / H3O+)
SLIDE 22
Quel est le couple acide-base dans la réaction :
AH + H2O = A- + H3O+
Couple AH / A-
SLIDE 21
Quel est le couple acide-base dans la réaction :
B + H2O = BH+ + HO-
Couple BH+ / B
SLIDE 22
Quel est le couple acide-base dans la réaction :
BH+ + H2O = B + H3O+
Couple BH+ / B
SLIDE 22
Est-ce que H+ existe en solution aqueuse?
Non. H+ + H2O –> H3O+
SLIDE 23
Quelle est la définition du pH?
pH = - log [H3O+]
[H3O+] = 1 x 10 ^ -pH
SLIDE 23
Que représente un pH de solution acide?
petit pH = grande [H3O+] = beaucoup de protons H+ libérer en solution
SLIDE 23