Module 12 Flashcards
Quelle est l’histoire de la découverte de l’ADN?
En 1869, Friedrich Miescher, un biologiste suisse, découvrit dans le noyau des cellules une substance inconnue riche en azote et en phosphore qu’il baptisa « nucléine ». Cette nouvelle substance n’était ni d’origine protéique ni d’origine lipidique. Au XXe siècle, cette substance sera identifiée et nommée acide désoxyribonucléique (ADN).
Le terme acide nucléique réfère à quoi?
Le terme « acide nucléique » réfère généralement aux 2 types de polymères linéaires constitués de nucléotides : l’acide désoxyribonucléique (ADN) et l’acide ribonucléique (ARN).
Quels sont les fonctions des nucléotides?
Médiateur chimique (AMPc), source d’énergie et cofacteur dans les réactions enzymatiques.
Quelle est la fonction des nucléosides?
Médiateur chimique (adénosine).
Quelle est la fonction des dinucléotides?
Cofacteur dans les réactions enzymatiques.
Quelles sont les fonctions de l’ARN?
Rôle catalytique à la manière d’enzyme (ribosymes, espèce d’ARN dans ribosome) et expression des caractères héréditaires.
Quelle est la fonction de l’ADN?
Gardienne des caractères héréditaires.
Quelles sont les monomères des acides nucléiques?
Les nucléosides et les nucléotides.
De quoi sont formés les nucléosides?
Les nucléosides sont formés d’une base azotée et d’un ose reliés par un lien β-N-glycosidique.
De quoi sont formés les nucléotides?
Les nucléotides sont des esters phosphoriques de nucléosides; c’est pourquoi on les appelle généralement «nucléosides phosphate». Ainsi, en plus d’une base azotée et d’un ose, un nucléotide contient un ou plusieurs groupements phosphate.
Quelles sont les caractéristiques de l’ose dans les nucléotides et les nucléosides?
Dans les nucléosides et les nucléotides, on retrouve soit le ribose, soit le désoxyribose sous forme de furanose et toujours en configuration anomérique β. Nous avons vu dans le module 7 que le désoxyribose est un dérivé du ribose qui est dépourvu de groupement hydroxyle en C2.
La nomenclature que l’on utilise pour les monomères et les acides nucléiques tient compte de quoi? Donnez des exemples.
La nomenclature que l’on utilise pour les monomères et les acides nucléiques tient compte du type d’ose présent. Ainsi, les ribonucléosides et les ribonucléotides contiennent du ribose, tandis que les désoxyribonucléosides et les désoxyribonucléotides contiennent du désoxyribose.
L’ADN et l’ARN diffèrent à quels niveaux?
L’ADN et l’ARN diffèrent au niveau de l’ose. Les ribonucléotides sont les unités de construction des acides ribonucléiques (ARN), alors que les désoxyribonucléotides sont les monomères des acides désoxyribonucléiques (ADN).
Quels sont le nucléotide, le nucléoside et l’acide nucléique associés au ribose?
Nucléoside : ribonucléoside
Nucléotide : ribonucléotide
Acide nucléique : ARN (acide ribonucléique)
Quels sont le nucléotide, le nucléoside et l’acide nucléique associés au désoxyribose?
Nucléoside : désoxyribonucléoside
Nucléotide : désoxyribonucléotide
Acide nucléique : ADN (acide désoxyribonucléique)
Les bases azotées sont des molécules hétérocycliques qu’est-ce que cela signifie? Par quoi sont caractérisés ces cycles?
Les bases azotées sont des molécules hétérocycliques, c’est-à-dire que ce sont des cycles composés d’atomes de carbone et d’azote. Ces cycles sont caractérisés par la présence de doubles liaisons conjuguées.
Il y a 2 types de bases azotées dans les acides nucléiques. Quelles sont-elles?
Il y a 2 types de bases azotées dans les acides nucléiques : les pyrimidines et les purines.
Quelles sont les 3 principales pyrimidines?
Les 3 principales pyrimidines sont la cytosine, la thymine et l’uracile.
Quelle(s) pyrimidine(s) porte(nt) un groupement amine en position 4?
La cytosine porte un groupement amine en position 4.
Quelle(s) pyrimidine(s) porte(nt) un groupement carboxyle en position 4?
L’uracile et la thymine.
En quoi diffèrent la thymine et l’uracile?
La thymine diffère de l’uracile par la présence d’un groupement méthyle en position 5. La thymine est donc une forme méthylée de l’uracile. C’est pourquoi elle est parfois appelée la 5- méthyluracile.
Où se retrouvent l’uracile, la thymine et la cytosine?
Uracile : ARN
Thymine : ADN
Cytosine : ADN ARN
Comment sont formées les purines?
Les purines sont des bases azotées dérivées de la pyrimidine. Une purine est formée par la fusion d’un cycle pyrimidine et d’un cycle imidazole.
Quelles sont les deux principales purines?
Les deux purines majeures sont l’adénine et la guanine.
Quelles sont les différences de structures entre l’adénine et la guanine?
L’adénine porte un groupement amine en position 6, tandis que la guanine porte un groupement carbonyle à cette position et un groupement amine supplémentaire en position 2.
Où sont présente l’adénine et la guanine?
Ces 2 bases sont présentes dans l’ADN et l’ARN.
Quelles sont les autres bases azotées présentes dans la nature? Où sont-elles présentes et comment sont-elles formées?
Il existe dans la nature d’autres bases azotées, dites « bases rares » ou « bases mineures ». On les retrouve parfois dans l’ADN, mais surtout dans l’ARN. Elles sont formées par la modification chimique (exemple : la méthylation) des bases azotées standards présentes dans les chaînes d’ADN ou d’ARN.
Pourquoi les bases azotées sont-elles des bases faibles?
Les bases azotées sont des bases faibles, car elles peuvent accepter des protons en milieu acide.
Les bases azotées ont-elles une charge au pH physiologique?
Au pH physiologique, elles ne sont pas chargées.
Les bases azotées ont-elles des structures planes? Circulaires?
Ces molécules ont des structures planes ou presque planes.
Comment décrire la solubilité des bases azotées?
Elles sont insolubles dans l’eau.
Les bases azotées sont des structures aromatiques. Quelle capacité cela leur permet-t-il?
Puisque les bases azotées sont des molécules aromatiques, elles ont la capacité d’absorber les rayons UV d’une longueur d’onde de 260 nm.
Le bases azotées ont-elles la possibilité de former des liaisons hydrogène? Si oui, en quoi cela est important?
Toutes les bases azotées présentées dans cette capsule peuvent participer à la formation de liaisons hydrogène. Ces liens H sont importants pour la formation de la double hélice d’ADN
Comment sont formés les nucléosides?
Les nucléosides sont formés par la liaison β-N-glycosidique d’une base azotée et d’une molécule d’ose.
Une liaison glycosidique implique quel carbone?
Une liaison glycosidique implique toujours le carbone anomérique de l’ose, ici le C1 aussi appelé 1’.
Pourquoi la liaison glycosidique dans un nucléoside est toujours en configuration β? Quels sont les différents types de liaison glycosidique?
Comme le résidu d’ose dans un nucléoside est toujours en configuration β, la liaison glycoosidique est elle aussi toujours de configuration β. Selon que la base azotée impliquée dans la liaison est une pyrimidine ou une purine, on sera en présence d’une liaison glycosidique de type β-N1 (pyrimidine) ou de type β- N9 (purine).
Pourquoi les nucléoside sont plus solubles dans l’eau que les bases azotées?
Les nucléosides sont plus solubles dans l’eau que les bases azotées seules, puisque les groupements hydroxyle de l’ose augmentent la solubilité de la molécule.
Comment sont nommés les nucléoside?
Les nucléosides sont nommés selon la base azotée qu’ils contiennent.
Comment nommer les ribonucléosides qui contiennent une pyrimidine? Donnez les exemples.
Pour les ribonucléosides contenant une pyrimidine, il faut ajouter le suffixe –idine au nom de la base. La cytosine devient donc la cytidine, l’uracile devient l’uridine et la thymine devient la thymidine.
Comment nommer les ribonucléosides qui contiennent une purine? Donnez les exemples.
Pour les ribonucléosides contenant une purine, on ajoute plutôt le suffixe –osine. Ainsi, l’adénine devient l’adénosine et la guanine, la guanosine.
À l’aide de la nomenclature, comment indiquer que nous sommes en présence d’un désoxyribonucléioside?
Pour indiquer que nous sommes en présence d’un désoxyribonucléoside, il suffit d’ajouter le préfixe désoxy- à l’avant du nom. Parce que la thymine est rarement retrouvée dans les ribonucléosides, la désoxythymidine est souvent appelée simplement thymidine.
Qu’est-ce qui différencie les nucléoside des nucléotides?
Un nucléotide est un nucléoside portant au moins un groupement phosphoryle (ou phosphate) attachée via un lien ester phosphorique.
Comment se forment les liens esters phosphoriques des nucléotides? Comment cela se passe-t-il pour le ribose et le désoxyribose? Quelle position domine?
Ces liens esters phosphoriques se forment entre l’acide phosphorique et l’un des groupements hydroxyles de l’ose. Pour le ribose, les positions 2’, 3’ et 5’ peuvent être phosphorylées. Le désoxyribose ne peut être phosphorylé qu’en position 3’ et 5’ puisque la position 2’ ne porte plus d’hydroxyle. Dans les nucléotides libres, les liens phosphoester en 5’ dominent.
Est-il possible que le même groupement phosphate forme deux liens ester phosphorique avec deux hydroxyles du même nucléoside?
Il arrive que le même groupement phosphate forme 2 liens esters phosphoriques avec 2 hydroxyles d’un même nucléoside.
Les nucléotides peuvent porter jusqu’à combien de groupements phosphates? Où et comment sont-ils liés?
Les nucléotides peuvent porter jusqu’à 3 groupements phosphates liés entre eux. Le 1ier groupement est lié à l’ose par un lien ester phosphorique. Cependant, les groupements phosphates supplémentaires sont ajoutés au premier via des liens anhydride phosphorique. Ces liens sont très riches en énergie.
Comment est nommé un nucléotide? Donnez un exemple.
Un nucléotide est nommé selon le nucléoside dont il dérive, suivi de la position phosphorylée et du nombre de groupement phosphate. Par exemple, un ribonucléoside phosphorylé en 5’ et contenant une base adénine s’appellera une adénosine 5’-monophosphate, une adénosine 5’-diphosphate ou une adénosine 5’-triphosphate, selon le nombre de groupements phosphate.
Quelles abréviations sont fréquemment utilisées pour nommer les nucléotides?
Les abréviations NMP, NDP et NTP sont fréquemment utilisées. N représente tous les nucléotides, peu importe la base qu’ils contiennent. On peut remplacer le N par la première lettre de la base lorsque l’on veut être plus spécifique. On ajoute un d minuscule à l’avant du nom lorsqu’on est en présence de désoxyribonucléotides.
Les nucléotides sont-ils solubles dans l’eau? Quelle autre capacité ont-ils?
Les nucléotides sont solubles dans l’eau puisqu’ils contiennent plusieurs groupements ioniques et polaires. De plus, compte tenu de la présence de la base azotée, ils ont la capacité d’absorber les ultraviolets.
De quoi sont formés les acides nucléiques?
Les monomères d’acides nucléiques sont donc formés par la liaison de 2 ou 3 constituants :
Une base azotée qui est dérivée d’une purine ou d’une pyrimidine
Pyrimidines (cytosine (ADN, ARN), uracile (ARN) et thymine (ADN)) Purines (adénine (ADN, ARN) et guanine (ADN, ARN)) • Un monosaccharide
Ribose ou désoxyribose
Un à 3 groupements phosphoryle (aucun groupement phosphoryle dans les nucléosides)
Quelles sont les bases et leurs ribonucléosides?
Adénine = adénosine
Guanine = guanosine
Uracile = uridine
Thymine = thymidine
Cytosine = cytidine
Quels sont les ribonucléosides monophosphate?
AMP (Adénosine monophosphate)
GMP (Guanosine monophosphate)
UMP (Uridine monophosphate)
TMP (Thymidine monophosphate)
CMP (Cytidine monophosphate)
Quels sont les ribonucléosides diphosphates?
ADP (Adénosine diphosphate)
GDP (Guanosine diphosphate)
UDP (Uridine diphosphate)
TDP (Thymidine diphosphate)
CDP (Cytidine diphosphate)
Quels sont les ribonucléotides triphosphate?
ATP (Adénosine triphosphate)
GTP (Guanosine triphosphate)
UTP (Uridine triphosphate)
TTP (Thymidine triphosphate)
CTP (Cytidine triphosphate)
Quelle est la nomenclature des désoxyribonucléotides?
Pour la nomenclature des désoxyribonucléosides et des désoxyribonucléotides, il suffit d’ajouter le préfixe désoxy- avant le nom ou la lettre « d » en minuscule avant l’abréviation. Puisque la thymidine est presque toujours un désoxyribonucléoside, le préfixe « désoxy » n’est généralement pas utilisé.
Comment les nucléotides peuvent former des polymères de différentes longueurs? Donnez les exemples.
Les nucléotides peuvent former des polymères de différentes longueurs via la formation de liens phosphodiester.
Dinucléotide = 2 résidus de nucléotides
Trinucléotide = 3 résidus de nucléotides
Décanucléotide = 10 résidus de nucléotides
Oligonucléotide = 10-50 nucléotides
Polynucléotides (ARN ou ADN) = plus de 50 nucléotides
Qu’est-ce qu’on rencontre fréquemment dans les dinucléotides?
Dans les dinucléotides, on rencontre fréquemment un lien entre la position 5’ de l’ose d’un des nucléotides et la position 5’ de l’autre.
Qu’est-ce que les dinucléotides ont comme fonction?
Ils agissent comme coenzymes.
